Clone Name
basd2i19
Clone Library Name
barley_pub
No.
Definition
Score (bits)
E Value
1 emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB
1152
0.0
2 gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisph...
1152
0.0
3 gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bi...
1152
0.0
4 gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bi...
1152
0.0
5 gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carbox...
1144
0.0
6 gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate car...
1136
0.0
7 gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carbox...
1136
0.0
8 gb|AY137451.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulo...
1136
0.0
9 gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carbox...
1136
0.0
10 gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carb...
1136
0.0
11 gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
1136
0.0
12 gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate ca...
1136
0.0
13 gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
1136
0.0
14 gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxy...
1136
0.0
15 gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-b...
1136
0.0
16 gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-vouch...
1136
0.0
17 gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-vouch...
1136
0.0
18 gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-vouch...
1136
0.0
19 gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-vouch...
1136
0.0
20 gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-vouch...
1136
0.0
21 gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-vouch...
1136
0.0
22 gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-vouch...
1136
0.0
23 gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-vouch...
1136
0.0
24 gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-vouch...
1136
0.0
25 gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-b...
1136
0.0
26 gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate ca...
1136
0.0
27 gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulo...
1136
0.0
28 gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate car...
1132
0.0
29 gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate ca...
1132
0.0
30 gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carb...
1130
0.0
31 gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-...
1130
0.0
32 gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxy...
1130
0.0
33 gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose...
1128
0.0
34 gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5...
1128
0.0
35 gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1...
1128
0.0
36 gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisph...
1128
0.0
37 gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-vouch...
1128
0.0
38 gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-vouch...
1128
0.0
39 gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate car...
1128
0.0
40 gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisph...
1128
0.0
41 gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,...
1122
0.0
42 gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisph...
1120
0.0
43 gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-...
1120
0.0
44 gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxy...
1120
0.0
45 gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H880...
1120
0.0
46 gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H880...
1120
0.0
47 gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5...
1120
0.0
48 gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate ca...
1120
0.0
49 gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
1120
0.0
50 gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate ca...
1120
0.0
51 gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosph...
1120
0.0
52 gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphat...
1120
0.0
53 gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carbox...
1114
0.0
54 gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
1114
0.0
55 gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose...
1112
0.0
56 gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H...
1112
0.0
57 gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H...
1112
0.0
58 gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H...
1112
0.0
59 gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H...
1112
0.0
60 gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H...
1112
0.0
61 gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H...
1112
0.0
62 gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxy...
1112
0.0
63 gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose...
1112
0.0
64 gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphat...
1112
0.0
65 gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate ...
1112
0.0
66 gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carb...
1112
0.0
67 gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate car...
1112
0.0
68 gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosph...
1104
0.0
69 gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
1104
0.0
70 gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate car...
1104
0.0
71 dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome
1104
0.0
72 dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ri...
1104
0.0
73 gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis vouc...
1098
0.0
74 gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate car...
1098
0.0
75 gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
1096
0.0
76 gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose...
1096
0.0
77 gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5...
1096
0.0
78 gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher ...
1096
0.0
79 gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher ...
1096
0.0
80 gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose...
1096
0.0
81 gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate car...
1096
0.0
82 gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxy...
1096
0.0
83 gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose...
1094
0.0
84 gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxy...
1090
0.0
85 gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate ca...
1088
0.0
86 emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribul...
1084
0.0
87 gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxy...
1084
0.0
88 emb|Z49844.1|HBCHRBPCX H.brachyantherum chloroplast rbcL gene fo...
1084
0.0
89 emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribul...
1076
0.0
90 gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate...
1076
0.0
91 emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribu...
1076
0.0
92 gb|AY607059.1| Psathyrostachys rupestris subsp. rupestris vouche...
1072
0.0
93 gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
1072
0.0
94 gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carbox...
1065
0.0
95 gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H880...
1065
0.0
96 emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for rib...
1061
0.0
97 emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for rib...
1055
0.0
98 gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate car...
1053
0.0
99 gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-b...
1045
0.0
100 emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribul...
1045
0.0
101 emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribul...
1039
0.0
102 emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for r...
1037
0.0
103 gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate c...
1033
0.0
104 gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydroge...
1033
0.0
105 gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carbox...
1021
0.0
106 emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ...
1021
0.0
107 gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bispho...
1021
0.0
108 gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bispho...
1021
0.0
109 gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
1013
0.0
110 emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene ...
1013
0.0
111 emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for...
1013
0.0
112 emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for r...
1011
0.0
113 gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate...
1007
0.0
114 gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
1005
0.0
115 emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene ...
1005
0.0
116 gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carbox...
997
0.0
117 emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene ...
989
0.0
118 emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ri...
981
0.0
119 gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate...
979
0.0
120 emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ...
973
0.0
121 emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL ge...
969
0.0
122 gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5...
965
0.0
123 emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene fo...
961
0.0
124 emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL...
959
0.0
125 gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica vou...
959
0.0
126 gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carbox...
957
0.0
127 gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-...
957
0.0
128 gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate ca...
957
0.0
129 emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbc...
957
0.0
130 emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL g...
955
0.0
131 emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene fo...
954
0.0
132 emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial ...
952
0.0
133 gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate ca...
950
0.0
134 gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate car...
950
0.0
135 emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene...
946
0.0
136 emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gen...
946
0.0
137 emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL ...
944
0.0
138 gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate car...
942
0.0
139 gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxyl...
942
0.0
140 gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate c...
942
0.0
141 gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate car...
942
0.0
142 gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carb...
942
0.0
143 emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL g...
942
0.0
144 emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ri...
934
0.0
145 emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL ge...
932
0.0
146 gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
930
0.0
147 gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate c...
926
0.0
148 emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL...
924
0.0
149 emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene fo...
922
0.0
150 emb|AJ746279.1| Holcus lanatus chloroplast partial rbcL gene for...
920
0.0
151 gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate car...
918
0.0
152 gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate ca...
918
0.0
153 emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL ge...
918
0.0
154 emb|AJ746280.1| Agrostis stolonifera chloroplast partial rbcL ge...
918
0.0
155 emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gen...
918
0.0
156 gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphat...
918
0.0
157 emb|AJ746255.1| Aira praecox chloroplast partial rbcL gene for r...
914
0.0
158 gb|AF458076.1| Trithuria submersa ribulose 1,5-bisphosphate carb...
914
0.0
159 emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL ...
910
0.0
160 emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene...
910
0.0
161 emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for...
906
0.0
162 gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate c...
906
0.0
163 gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
906
0.0
164 emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL g...
902
0.0
165 emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL g...
902
0.0
166 emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene...
898
0.0
167 gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxyl...
892
0.0
168 emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partia...
892
0.0
169 gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxyl...
890
0.0
170 emb|AJ746294.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene fo...
882
0.0
171 gb|L24073.1|RICCHRBCLA Oryza sativa chloroplast rubisco large su...
882
0.0
172 dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochond...
882
0.0
173 gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxy...
878
0.0
174 emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene fo...
878
0.0
175 gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar N...
874
0.0
176 gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA...
874
0.0
177 gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-1...
874
0.0
178 gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-1...
874
0.0
179 gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA...
874
0.0
180 gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar N...
874
0.0
181 emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chlor...
874
0.0
182 dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clon...
874
0.0
183 dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome
874
0.0
184 gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-b...
874
0.0
185 dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulos...
874
0.0
186 gb|AY632370.1| Phaenosperma globosa ribulose-1,5-bisphosphate ca...
870
0.0
187 gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate c...
868
0.0
188 gb|AY395529.1| Arrhenatherum elatius ribulose-1,5-bisphosphate c...
868
0.0
189 gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome...
866
0.0
190 gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar N...
866
0.0
191 dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic D...
866
0.0
192 dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic D...
866
0.0
193 dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic D...
866
0.0
194 gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate c...
866
0.0
195 dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic D...
866
0.0
196 dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic D...
866
0.0
197 dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic D...
866
0.0
198 gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome...
866
0.0
199 emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL ge...
864
0.0
200 emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene fo...
862
0.0
201 emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL g...
862
0.0
202 emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rb...
862
0.0
203 emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL g...
862
0.0
204 emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene ...
862
0.0
205 gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxyla...
860
0.0
206 emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ...
860
0.0
207 emb|AJ746296.1| Nardus stricta chloroplast partial rbcL gene for...
860
0.0
208 gb|AY632362.1| Buergersiochloa bambusoides ribulose-1,5-bisphosp...
858
0.0
209 gb|AC135419.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome...
858
0.0
210 gb|AC135429.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome...
858
0.0
211 dbj|AP008211.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic D...
858
0.0
212 emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biph...
858
0.0
213 gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bispho...
852
0.0
214 dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic D...
850
0.0
215 gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome...
850
0.0
216 emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa...
850
0.0
217 gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate car...
846
0.0
218 emb|AJ746295.1| Molinia caerulea chloroplast partial rbcL gene f...
846
0.0
219 emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene f...
844
0.0
220 emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for r...
844
0.0
221 gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate car...
842
0.0
222 emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL g...
842
0.0
223 emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL...
842
0.0
224 gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bispho...
842
0.0
225 gb|U31379.1|MPU31379 Monachather paradoxus ribulose-1,5-bisphosp...
842
0.0
226 gb|AY632365.1| Melica cupanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxyl...
841
0.0
227 gb|AY691638.1| Pyrrhanthera exigua ribulose-1,5-bisphosphate car...
839
0.0
228 gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
839
0.0
229 emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for r...
839
0.0
230 emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene ...
839
0.0
231 emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gen...
839
0.0
232 emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gen...
837
0.0
233 emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for r...
835
0.0
234 emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial r...
835
0.0
235 emb|AJ746175.1| Bambusa emeiensis chloroplast partial rbcL gene ...
835
0.0
236 emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for...
835
0.0
237 emb|AJ746170.1| Bambusa multiplex chloroplast partial rbcL gene ...
835
0.0
238 gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carb...
835
0.0
239 gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carb...
835
0.0
240 gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosph...
835
0.0
241 gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate...
835
0.0
242 emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbc...
833
0.0
243 emb|AJ746174.1| Dendrocalamus brandisii chloroplast partial rbcL...
833
0.0
244 emb|AJ746173.1| Dendrocalamus barbatus chloroplast partial rbcL ...
833
0.0
245 ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative...
831
0.0
246 emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial r...
829
0.0
247 gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphos...
827
0.0
248 gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosph...
827
0.0
249 gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphat...
827
0.0
250 gb|AY632364.1| Glyceria grandis ribulose-1,5-bisphosphate carbox...
825
0.0
251 gb|AY691644.1| Zotovia thomsonii ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
823
0.0
252 emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL ge...
823
0.0
253 emb|AJ746177.1| Indocalamus latifolius chloroplast partial rbcL ...
823
0.0
254 emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gen...
821
0.0
255 gb|AY090549.1| Deschampsia antarctica clone Dacor 1.8-1 ribulose...
821
0.0
256 gb|AY632363.1| Distichlis spicata ribulose-1,5-bisphosphate carb...
819
0.0
257 emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL...
819
0.0
258 gb|U88403.1|ASU88403 Amphipogon strictus ribulose-1,5-bisphospha...
819
0.0
259 gb|M91626.1|BAMCPRBCL Bamboo chloroplast ribulosebisphosphate (r...
817
0.0
260 gb|AY691633.1| Microlaena avenacea ribulose-1,5-bisphosphate car...
815
0.0
261 gb|AY632375.1| Zoysia sp. JID-2004 ribulose-1,5-bisphosphate car...
811
0.0
262 gb|AY632366.1| Micraira subulifolia ribulose-1,5-bisphosphate ca...
811
0.0
263 gb|AY622897.1| Olyra latifolia ribulose-1,5-bisphosphate carboxy...
811
0.0
264 gb|AY622891.1| Ehrharta calycina ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
811
0.0
265 gb|U13228.1|LOU13228 Leersia oryzoides chloroplast ribulose-1,5-...
811
0.0
266 gb|U31441.1|RNU31441 Rytidosperma nudiflorum ribulose-1,5-bispho...
811
0.0
267 emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial r...
807
0.0
268 gb|AY626351.1| Eriachne triseta ribulose 1,5-bisphosphate carbox...
805
0.0
269 emb|AJ746283.1| Aristida congesta subsp. barbicollis chloroplast...
803
0.0
270 emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for r...
803
0.0
271 gb|U31359.1|ACU31359 Aristida congesta subsp. barbicollis ribulo...
803
0.0
272 gb|AY618663.1| Streptogyna americana ribulose 1,5-bisphosphate c...
803
0.0
273 gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate c...
803
0.0
274 gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulos...
803
0.0
275 gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosph...
803
0.0
276 emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene fo...
797
0.0
277 gb|AY632371.1| Spartina pectinata ribulose-1,5-bisphosphate carb...
795
0.0
278 gb|AY632369.1| Pariana radiciflora ribulose-1,5-bisphosphate car...
795
0.0
279 dbj|AB088833.1| Phyllostachys bambusoides chloroplast rbcL gene ...
793
0.0
280 gb|U13227.1|CCU13227 Chusquea circinata chloroplast ribulose-1,5...
789
0.0
281 emb|AJ784821.1| Spartina pectinata chloroplast partial rbcL gene...
787
0.0
282 gb|U31103.1|ESU31103 Enneapogon scaber ribulose-1,5-bisphosphate...
787
0.0
283 gb|U31104.1|ECU31104 Eragrostis capensis ribulose-1,5-bisphospha...
787
0.0
284 gb|AY632367.1| Molinia caerulea ribulose-1,5-bisphosphate carbox...
785
0.0
285 dbj|AK058516.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clon...
783
0.0
286 gb|U13231.1|LHU13231 Lithachne humilis chloroplast ribulose-1,5-...
779
0.0
287 gb|AY618662.1| Isachne arundinacea ribulose 1,5-bisphosphate car...
777
0.0
288 gb|AF021875.1|AF021875 Anomochloa marantoidea ribulose 1,5-bisph...
775
0.0
289 emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL g...
773
0.0
290 gb|U13230.1|PBU13230 Phyllostachys bambusoides chloroplast ribul...
749
0.0
291 emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, O...
745
0.0
292 emb|AJ746178.1| Arundinaria oedogonata chloroplast partial rbcL ...
741
0.0
293 emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ...
737
0.0
294 emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF...
737
0.0
295 gb|AF148773.1| Ecdeiocolea monostachya ribulose-1,5-bisphosphate...
735
0.0
296 gb|L01471.1|JOICPRBCL Joinvillea plicata chloroplast ribulose-bi...
735
0.0
297 gb|AY357724.1| Pharus latifolius ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
733
0.0
298 emb|AJ419949.1|SSP419949 Streptochaeta spicata chloroplast parti...
731
0.0
299 emb|AJ784829.1| Bouteloua gracilis chloroplast partial rbcL gene...
729
0.0
300 gb|AY618660.1| Arundinaria gigantea ribulose 1,5-bisphosphate ca...
718
0.0
301 gb|AY632373.1| Uniola paniculata ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
716
0.0
302 emb|AJ286559.1|EMO286559 Ecdeiocolea monostachya chloroplast par...
700
0.0
303 gb|AY123235.1| Ecdeiocolea monostachya ribulose-1,5-bisphosphate...
700
0.0
304 gb|AY632372.1| Streptochaeta sodiroana ribulose-1,5-bisphosphate...
682
0.0
305 gb|M97887.1|PUORBCL Phaulothamnus spinescens ribulose-1,5-bispho...
678
0.0
306 gb|AY044632.1| Butia eriospatha ribulose bisphosphate carboxylas...
672
0.0
307 emb|X15925.1|CHAPRBCL Atriplex patula chloroplast rbcL gene for ...
670
0.0
308 dbj|D17378.1| Maianthemum dilatatum chloroplast rbcL gene for ri...
664
0.0
309 dbj|D17373.1| Disporopsis arisanensis chloroplast rbcL gene for ...
664
0.0
310 dbj|AB029831.1| Heteropolygonatum pendulum chloroplast rbcL gene...
664
0.0
311 emb|X55831.1|CHARRBCL Atriplex rosea chloroplast rbcL gene for t...
662
0.0
312 gb|DQ067450.1| Beta vulgaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxyla...
662
0.0
313 dbj|AB029845.1| Peliosanthes campanulata chloroplast rbcL gene f...
662
0.0
314 emb|AJ577247.1|CSO577247 Cyanixia socotrana plastid partial rbcL...
656
0.0
315 dbj|D28334.1| Convallaria majalis chloroplast gene for ribulose-...
656
0.0
316 dbj|AB029836.1| Rohdea japonica chloroplast rbcL gene for ribulo...
654
0.0
317 gb|AY149364.1| Hemerocallis littorea ribulose 1,5-bisphosphate c...
650
0.0
318 gb|AF036883.1|AF036883 Kunhardtia radiata ribulose 1,5-bisphosph...
650
0.0
319 dbj|AB029847.1| Dasylirion serratifolium chloroplast rbcL gene f...
648
0.0
320 dbj|AB029833.1| Disporopsis longifolia chloroplast rbcL gene for...
648
0.0
321 dbj|D28332.1| Iris ensata chloroplast rbcL gene, partial cds
648
0.0
322 dbj|AB029844.1| Peliosanthes gracilipes chloroplast rbcL gene fo...
646
0.0
323 dbj|AB029838.1| Tupistra grandis chloroplast rbcL gene for ribul...
646
0.0
324 dbj|AB029830.1| Polygonatum oppositifolium chloroplast rbcL gene...
646
0.0
325 dbj|AB029839.1| Tricalistra ochreata chloroplast rbcL gene for ...
644
0.0
326 dbj|AB029832.1| Disporopsis aspera chloroplast rbcL gene for rib...
642
0.0
327 gb|AY968523.1| Gynostemma pentaphyllum ribulose-1,5-bisphosphate...
640
e-180
328 dbj|AB029834.1| Reineckea carnea chloroplast rbcL gene for ribul...
640
e-180
329 dbj|D17380.1| Smilacina hondoensis chloroplast rbcL gene for rib...
640
e-180
330 dbj|AB009947.1| Polygonatum humile chloroplast rbcL gene for rib...
640
e-180
331 gb|AF206790.1| Luzuriaga sp. PSS-2000
638
e-180
332 dbj|AB029840.1| Ophiopogon jaburan chloroplast rbcL gene for rib...
638
e-180
333 emb|Z77300.1|LRZ77300 L.radicans chloroplast rbcL gene
638
e-180
334 gb|AY149376.1| Smilacina racemosa ribulose 1,5-bisphosphate carb...
636
e-179
335 dbj|AB029843.1| Peliosanthes arisanensis chloroplast rbcL gene f...
636
e-179
336 gb|AC134256.4| Oryza sativa (japonica cultivar-group), complete ...
634
e-179
337 dbj|AP008217.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic D...
634
e-179
338 gb|DP000010.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome...
634
e-179
339 dbj|AB029841.1| Ophiopogon japonicus var. japonicus chloroplast ...
632
e-178
340 emb|Z73698.1|SCYLIRBCL S.cylindrica chloroplast rbcL gene
632
e-178
341 emb|Z77272.1|MDZ77272 M.dilatatum chloroplast rbcL gene
632
e-178
342 emb|Z77269.1|AEZ77269 A.elatior chloroplast rbcL gene
632
e-178
343 emb|Y14986.1|CHY14986 Collospermum hastatum chloroplast rbcL gen...
630
e-177
344 emb|AJ400848.1|SOL400848 Spinacia oleracea complete chloroplast ...
630
e-177
345 dbj|AB093558.1| Campylandra watanabei chloroplast rbcL gene for ...
630
e-177
346 dbj|AB089638.1| Campylandra aff. chinensis Tamura et al. 9876 ch...
630
e-177
347 dbj|AB089637.1| Campylandra sp. Tamura et al. 8530 chloroplast r...
630
e-177
348 dbj|AB089636.1| Campylandra fimbriata chloroplast rbcL gene for ...
630
e-177
349 dbj|AB089632.1| Aspidistra longifolia chloroplast rbcL gene for ...
630
e-177
350 dbj|AB089630.1| Aspidistra daibuensis chloroplast rbcL gene for ...
630
e-177
351 dbj|AB089629.1| Aspidistra attenuata chloroplast rbcL gene for r...
630
e-177
352 dbj|AB089628.1| Speirantha gardenii chloroplast rbcL gene for ri...
630
e-177
353 dbj|AB089627.1| Convallaria majalis chloroplast rbcL gene for ri...
630
e-177
354 dbj|AB029846.2| Nolina recurvata chloroplast rbcL gene for ribul...
630
e-177
355 dbj|AB029842.1| Ophiopogon japonicus var. umbrosus chloroplast r...
630
e-177
356 dbj|AB029848.1| Dracaena draco chloroplast rbcL gene for ribulos...
628
e-177
357 dbj|AB029828.1| Polygonatum humile chloroplast rbcL gene for rib...
626
e-176
358 gb|AY149375.1| Chlorophytum comosum ribulose 1,5-bisphosphate ca...
624
e-176
359 emb|Z77276.1|CHZ77276 C.hookeri chloroplast rbcL gene
624
e-176
360 emb|AJ311070.1|TPE311070 Triteleia peduncularis partial rbcL gen...
624
e-176
361 emb|AJ311069.1|TLE311069 Triteleia lemmonae partial rbcL gene fo...
624
e-176
362 emb|AJ311061.1|BTE311061 Bessera tenuiflora partial rbcL gene fo...
624
e-176
363 gb|M96959.1|SVIRBCL Sansevieria cylindrica ribulose-1,5-bisphosp...
624
e-176
364 dbj|AB089633.1| Aspidistra sutepensis chloroplast rbcL gene for ...
624
e-176
365 dbj|AB089631.1| Aspidistra elatior chloroplast rbcL gene for rib...
624
e-176
366 gb|M62571.1|STGCPRBCL S.halimifolium chloroplast ribulose-1,5-bi...
624
e-176
367 emb|Z77275.1|SAZ77275 S.androgyna chloroplast rbcL gene
624
e-176
368 emb|Z77274.1|RAZ77274 R.aculeatus chloroplast rbcL gene
624
e-176
369 emb|Z69198.1|TBRBCL T.bridgesii chloroplast rbcL gene
624
e-176
370 emb|AJ419937.1|MRA419937 Mesanthemum radicans chloroplast partia...
622
e-175
371 gb|AF307481.1|AF307481 Tacca artocarpifolia rbcL gene, partial c...
622
e-175
372 dbj|AB089639.1| Beaucarnea gracilis chloroplast rbcL gene for ri...
622
e-175
373 dbj|AB088821.1| Comospermum yedoense chloroplast rbcL gene for R...
622
e-175
374 dbj|AB029829.1| Polygonatum involucratum chloroplast rbcL gene f...
622
e-175
375 dbj|AB029827.1| Polygonatum cirrhifolium chloroplast rbcL gene f...
622
e-175
376 gb|M62567.1|PTCCPRBCL P.americana chloroplast ribulose-1,5-bisph...
622
e-175
377 gb|M83541.1|ARACPRUBIS A.drummondii chloroplast ribulose-1,5-bis...
622
e-175
378 emb|Z73708.1|DRACERBCL D.racemosa chloroplast rbcL gene
622
e-175
379 emb|V00168.1|CHSORC Spinach chloroplast gene for the large subun...
622
e-175
380 gb|AY216629.1| Juncus maritimus ribulose-1,5-bisphosphate carbox...
618
e-174
381 dbj|AB029837.2| Tupistra albiflora chloroplast rbcL gene for rib...
618
e-174
382 gb|AY149360.1| Asphodelus albus ribulose 1,5-bisphosphate carbox...
617
e-173
383 gb|DQ005610.1| Speirantha convallarioides ribulose-1,5-bisphosph...
617
e-173
384 emb|Z73685.1|BCAUDRBCL B.cauda-felis chloroplast rbcL gene
617
e-173
385 emb|Z69213.1|MMRBCL M.maritima chloroplast rbcL gene
617
e-173
386 emb|Z69211.1|DMRBCL D.multiflorum chloroplast rbcL gene
617
e-173
387 emb|AJ311068.1|TIX311068 Triteleia ixioides partial rbcL gene fo...
617
e-173
388 gb|AF206797.1| Muilla maritima ribulose 1,5-bisphosphate carboxy...
617
e-173
389 emb|AJ311064.1|DID311064 Dichelostemma ida-maia partial rbcL gen...
617
e-173
390 emb|AJ309685.1|GSP309685 Galaxia sp. Goldblatt and Nanni 10254 c...
617
e-173
391 emb|AJ307147.1|MTR307147 Moraea tripetala chloroplast partial rb...
617
e-173
392 emb|AJ307143.1|MSP307143 Moraea spathulata chloroplast partial r...
617
e-173
393 emb|AJ307120.1|MME307120 Moraea melanops chloroplast partial rbc...
617
e-173
394 emb|AJ307111.1|MHU307111 Moraea huttonii chloroplast partial rbc...
617
e-173
395 emb|Z77271.1|LPZ77271 L.platyphylla chloroplast rbcL gene
617
e-173
396 emb|Z69214.1|BCRBCLGN B.crocea chloroplast rbcL gene
617
e-173
397 emb|Z69216.1|MBRBCL M.biflora chloroplast rbcL gene
617
e-173
398 gb|L20128.1|PNBPRBCL Pontederia sagittata chloroplast ribulose 1...
617
e-173
399 gb|AY216638.1| Luzula africana ribulose-1,5-bisphosphate carboxy...
615
e-173
400 gb|DQ424856.1| Vitis vinifera cultivar Maxxa chloroplast, comple...
613
e-172
401 emb|X69748.1|CHPCORBCL P.comosa chloroplast rbcL gene for ribulo...
613
e-172
402 emb|AJ419941.1|MSP419941 Mesanthemum sp. van der Werff and McPhe...
613
e-172
403 emb|AJ311066.1|DVO311066 Dichelostemma volubile partial rbcL gen...
613
e-172
404 dbj|AB088822.1| Ruscus aculeatus chloroplast rbcL gene for RuBis...
613
e-172
405 emb|AJ307140.1|MSC307140 Moraea schimperi chloroplast partial rb...
613
e-172
406 emb|AJ307135.1|MRA307135 Moraea radians chloroplast partial rbcL...
613
e-172
407 gb|AY395548.1| Luzula campestris ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
611
e-171
408 emb|AJ419945.1|LMU419945 Luzula multiflora chloroplast partial r...
611
e-171
409 gb|AY216651.1| Luzula arcuata ribulose-1,5-bisphosphate carboxyl...
611
e-171
410 gb|AY216647.1| Luzula sudetica ribulose-1,5-bisphosphate carboxy...
611
e-171
411 gb|AY216646.1| Luzula divulgata ribulose-1,5-bisphosphate carbox...
611
e-171
412 gb|L05034.2|DANCPRBCL Danae racemosa ribulosebisphosphate carbox...
611
e-171
413 gb|U41588.1|MCU41588 Monochoria cyanea ribulose-1,5-bisphosphate...
611
e-171
414 emb|AJ307121.1|MMI307121 Moraea miniata chloroplast partial rbcL...
611
e-171
415 emb|Z95542.1|TGZ95542 Tephrosia grandiflora chloroplast rbcL gene
609
e-171
416 emb|AJ311065.1|DPU311065 Dichelostemma pulchellum partial rbcL g...
609
e-171
417 emb|AJ311063.1|DCO311063 Dichelostemma congestum partial rbcL ge...
609
e-171
418 emb|AJ307107.1|MGA307107 Moraea gawleri chloroplast partial rbcL...
609
e-171
419 dbj|AB089634.1| Aspidistra aff. fungilliformis Tamura 12801 chlo...
609
e-171
420 emb|AJ309691.1|HCO309691 Homeria cookii chloroplast partial rbcL...
609
e-171
421 emb|AJ307145.1|MTR307145 Moraea tricuspidata chloroplast partial...
609
e-171
422 emb|AJ307139.1|MRI307139 Moraea rivulicola chloroplast partial r...
609
e-171
423 emb|AJ307138.1|MRI307138 Moraea rigidifolia chloroplast partial ...
609
e-171
424 emb|AJ307128.1|MPA307128 Moraea papilionacea chloroplast partial...
609
e-171
425 emb|AJ307122.1|MMI307122 Moraea minor chloroplast partial rbcL g...
609
e-171
426 emb|AJ307099.1|MCO307099 Moraea cookii chloroplast partial rbcL ...
609
e-171
427 emb|AJ307098.1|MCO307098 Moraea collina chloroplast partial rbcL...
609
e-171
428 emb|AJ311067.1|THY311067 Triteleia hyacinthina partial rbcL gene...
607
e-170
429 gb|M62565.1|MIJCPRBCL M.jalapa chloroplast ribulose-1,5-bisphosp...
607
e-170
430 emb|AJ307154.1|MVE307154 Moraea verecunda chloroplast partial rb...
607
e-170
431 emb|AJ311060.1|ACO311060 Androstephium coeruleum partial rbcL ge...
605
e-170
432 gb|AY780259.1| Eucalyptus globulus subsp. globulus chloroplast, ...
605
e-170
433 gb|M77699.1|DINRBCLA Dianthus caryophyllus ribulosebisphosphate ...
603
e-169
434 emb|X51964.1|CHAHRBCL Amaranthus hypochondriacus chloroplast rbc...
603
e-169
435 gb|AY216642.1| Luzula rufa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase...
603
e-169
436 gb|U41577.1|EMU41577 Eichhornia meyeri ribulose-1,5-bisphosphat...
603
e-169
437 gb|DQ006049.1| Chenopodium ambrosioides ribulose-1,5-bisphosphat...
601
e-168
438 emb|Z77305.1|PCZ77305 P.coerulea chloroplast rbcL gene
601
e-168
439 emb|Z77303.1|HNZ77303 H.novae-zelandiae chloroplast rbcL gene
601
e-168
440 emb|Z69232.1|PTRBCL P.tenax chloroplast rbcL gene
601
e-168
441 emb|AJ309697.1|MNA309697 Moraea namaquamontana chloroplast parti...
601
e-168
442 emb|AJ307130.1|MPI307130 Moraea pilifolia chloroplast partial rb...
601
e-168
443 emb|AJ307095.1|MCA307095 Moraea carsonii chloroplast partial rbc...
601
e-168
444 gb|AF116993.1|AF116993 Brodiaea jolonensis ribulose 1,5-bisphosp...
601
e-168
445 emb|AJ512325.1|EUK512325 Bulbinella nana chloroplast rbcL gene f...
601
e-168
446 emb|AJ307144.1|MTH307144 Moraea thomasiae chloroplast partial rb...
601
e-168
447 emb|AJ307117.1|MLU307117 Moraea lurida chloroplast partial rbcL ...
601
e-168
448 emb|AJ307114.1|MIN307114 Moraea incurva chloroplast partial rbcL...
601
e-168
449 emb|AJ307108.1|MGR307108 Moraea graniticola chloroplast partial ...
601
e-168
450 emb|AJ307103.1|MFL307103 Moraea flaccida chloroplast partial rbc...
601
e-168
451 emb|AJ307102.1|MFA307102 Moraea falcifolia chloroplast partial r...
601
e-168
452 emb|AJ307091.1|MBI307091 Moraea bifida chloroplast partial rbcL ...
601
e-168
453 dbj|AB088823.1| Pleomele thalioides chloroplast rbcL gene for Ru...
599
e-168
454 gb|L05036.2|HEQCPRBCL Hemerocallis fulva ribulose 1,5-bisphospha...
599
e-168
455 gb|M98515.1|CIPRBCLS Mesembryanthemum crystallinum chloroplast gene
599
e-168
456 gb|AY149352.1| Cartonema philydroides ribulose 1,5-bisphosphate ...
597
e-167
457 gb|AF312245.1| Weldenia candida ribulose 1,5-bisphosphate carbox...
597
e-167
458 gb|AY216652.1| Luzula campestris ribulose-1,5-bisphosphate carbo...
597
e-167
459 gb|AF081515.1| Ostryopsis davidiana ribulose-1,5-bisphosphate ca...
597
e-167
460 gb|AF074121.1|AF074121 Catasetum expansum ribulose-1,5-bisphosph...
597
e-167
461 gb|M62570.1|SLACPRBCL Stellaria media chloroplast ribulose-1,5-b...
597
e-167
462 emb|AJ307152.1|MVE307152 Moraea ventricosa chloroplast partial r...
597
e-167
463 emb|AJ307150.1|MUN307150 Moraea unguiculata chloroplast partial ...
597
e-167
464 emb|AJ307148.1|MTU307148 Moraea tulbaghensis chloroplast partial...
597
e-167
465 emb|AJ307090.1|MBE307090 Moraea bella chloroplast partial rbcL g...
597
e-167
466 emb|X53980.1|ATRBCL A.tricolor chloroplast rbcL gene for ribulos...
595
e-167
467 emb|AJ235810.1|TCH235810 Tacca chantrieri chloroplast rbcL gene
595
e-167
468 gb|AF132089.1|AF132089 Froelichia floridana ribulose 1,5-bisphos...
595
e-167
469 dbj|AB029835.1| Campylandra sp. Tamura and Yamashita 6033 chloro...
595
e-167
470 gb|U41589.1|MHU41589 Monochoria hastata ribulose-1,5-bisphosphat...
595
e-167
471 emb|Z77270.1|DAZ77270 D.aubreyana chloroplast rbcL gene
593
e-166
472 emb|Z69210.1|BCRBCL B.coronaria chloroplast rbcL gene
593
e-166
473 emb|Y15139.1|BOY15139 Bixa orellana chloroplast rbcL gene
593
e-166
474 gb|AF307914.1| Donatia novae-zelandiae ribulose-1,5-bisphosphate...
593
e-166
475 gb|AF307913.1| Donatia fascicularis ribulose-1,5-bisphosphate ca...
593
e-166
476 emb|AJ307156.1|MVI307156 Moraea villosa chloroplast partial rbcL...
593
e-166
477 emb|AJ307127.1|MOC307127 Moraea ochroleuca chloroplast partial r...
593
e-166
478 emb|AJ307112.1|MIN307112 Moraea inclinata chloroplast partial rb...
593
e-166
479 emb|AJ307086.1|MAL307086 Moraea alticola chloroplast partial rbc...
593
e-166
480 emb|Z77307.1|SGZ77307 S.glauca chloroplast rbcL gene
593
e-166
481 gb|AF022128.1|AF022128 Bixa orellana ribulose 1,5-bisphosphate c...
591
e-165
482 emb|AJ307100.1|MDR307100 Moraea dracomontana chloroplast partial...
591
e-165
483 gb|AY572256.1| Sarcorhachis naranjoana ribulose-1,5-bisphosphate...
589
e-165
484 gb|AF312246.1| Thyrsanthemum sp. Chase 606 ribulose 1,5-bisphosp...
589
e-165
485 gb|AY099908.1| Hololachna songarica ribulose 1,5-bisphosphate ca...
589
e-165
486 gb|AF132091.1|AF132091 Herniaria glabra chloroplast ribulose 1,5...
589
e-165
487 gb|AY308527.1| Hoffmannseggia drepanocarpa isolate 22 ribulose-1...
589
e-165
488 emb|AJ307105.1|MGA307105 Moraea galpinii chloroplast partial rbc...
589
e-165
489 gb|L10227.1|HAURBCLX Hauya elegans ribulose-1,5-bisphosphate car...
587
e-164
490 dbj|AB089635.1| Campylandra aurantiaca chloroplast rbcL gene for...
587
e-164
491 gb|AF127697.1|AF127697 Anisophyllea disticha ribulose 1,5-bispho...
587
e-164
492 gb|U41574.1|ECU41574 Eichhornia crassipes ribulose-1,5-bisphosph...
587
e-164
493 emb|AJ286561.1|TLE286561 Tacca leontopetaloides chloroplast part...
587
e-164
494 gb|AF332099.1| Gymnotheca involucrata ribulose bisphosphate carb...
585
e-164
495 emb|Z95548.1|AUZ95548 Argyrolobium uniflorum chloroplast rbcL gene
585
e-164
496 emb|Z73682.1|AAESTRBCL A.aestivus chloroplast rbcL gene
585
e-164
497 emb|Y15138.1|DHY15138 Diegodendron humberti chloroplast rbcL gene
585
e-164
498 emb|X56619.1|CCRBCL C. cornuta rbcL gene for ribulose-biphosphat...
585
e-164
499 emb|AJ402917.1|AIN402917 Azadirachta indica chloroplast rbcL gen...
585
e-164
500 gb|M77033.1|NELCPRBCOB Nelumbo nucifera ribulose 1,5-bisphosphat...
585
e-164
>emb| X00630.1 |CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB
Length = 2174
Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0
Identities = 609/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 863 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 921
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 922 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 981
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 982 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 1041
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1042 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 1101
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1102 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 1161
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1162 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 1221
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1222 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 1281
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1282 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 1341
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1342 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-ccgtcctt 1400
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 1401 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 1458
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 1459 gtgttatgagtgt 1471
>gb| AY137456.1 | Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1589
Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0
Identities = 609/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-ccgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137453.1 | Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1589
Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0
Identities = 609/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-ccgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY836173.1 | Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 3110
Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0
Identities = 609/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-ccgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY137454.1 | Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
gene for chloroplast product
Length = 1589
Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0
Identities = 608/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137459.1 | Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
gene for chloroplast product
Length = 1612
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137452.1 | Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
gene for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137451.1 | Hordeum brachyantherum subsp. californicum
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1616
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137449.1 | Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
gene for chloroplast product
Length = 1616
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137443.1 | Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
gene for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137442.1 | Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
gene for chloroplast product
Length = 1606
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137440.1 | Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137439.1 | Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
gene for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137438.1 | Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
gene for chloroplast product
Length = 1621
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137434.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1617
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137433.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1617
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137432.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1617
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137431.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1617
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137430.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1616
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137429.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1616
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137427.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1616
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137426.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1617
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137425.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1616
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137423.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1616
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY836171.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 3108
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836170.1 | Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 3102
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836169.1 | Hordeum brachyantherum subsp. californicum
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic
spacer, complete sequence; and photosystem I subunit
VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3089
Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY137450.1 | Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
gene for chloroplast product
Length = 1610
Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0
Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgtyacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137448.1 | Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0
Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgktatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137458.1 | Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
gene for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0
Identities = 607/613 (99%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaagn-gttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137457.1 | Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1615
Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0
Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttncaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137441.1 | Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
gene for chloroplast product
Length = 1589
Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0
Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgnaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137447.1 | Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1614
Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0
Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137446.1 | Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1614
Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0
Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137444.1 | Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1614
Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0
Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137437.1 | Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1628
Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0
Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137428.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1617
Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0
Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatttacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137424.1 | Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1616
Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0
Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatttacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY836176.1 | Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3106
Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0
Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836172.1 | Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 3095
Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0
Identities = 606/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY137445.1 | Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1614
Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0
Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatctnctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137436.1 | Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1619
Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0
Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137435.1 | Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1619
Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0
Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY601671.1 | Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1619
Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0
Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY607053.1 | Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1614
Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0
Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 81 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 139
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 140 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 199
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 200 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 259
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 260 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 319
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 320 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 379
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 439
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 440 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 499
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 500 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 559
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 560 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 618
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 619 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 676
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 677 gtgttatgagtgt 689
>gb| AY607052.1 | Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1614
Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0
Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 81 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 139
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 140 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 199
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 200 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 259
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 260 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 319
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 320 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 379
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 439
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 440 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 499
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 500 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 559
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 560 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 618
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 619 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 676
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 677 gtgttatgagtgt 689
>gb| AY607050.1 | Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast
Length = 1614
Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0
Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 81 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 139
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 140 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 199
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 200 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 259
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 260 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 319
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 320 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 379
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 439
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 440 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 499
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 500 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 559
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 560 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 618
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 619 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 676
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 677 gtgttatgagtgt 689
>gb| AY836177.1 | Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 2752
Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0
Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836167.1 | Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 2372
Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0
Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836165.1 | Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 2366
Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0
Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836159.1 | Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 2373
Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0
Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836158.1 | Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 2365
Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0
Identities = 605/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY137455.1 | Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
gene for chloroplast product
Length = 1612
Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0
Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
|| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aaytcttnattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactkatggacttaccagtcttgatcgtthcaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttacyaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY601672.1 | Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1619
Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgcngaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137460.1 | Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1589
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 136 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 315
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 376 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 436 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb| AY137422.1 | Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1619
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137421.1 | Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1619
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137420.1 | Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1619
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137419.1 | Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1619
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137418.1 | Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1619
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY137417.1 | Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1619
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 136
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 aagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 196
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 197 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 256
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 316
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 376
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tgttcctggggaagaaagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 436
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 437 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 496
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 556
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 557 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 615
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 616 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 673
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 674 gtgttatgagtgt 686
>gb| AY836181.1 | Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3155
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836178.1 | Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 3089
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836168.1 | Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 2371
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agaggggtccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836166.1 | Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 3166
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836164.1 | Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 2374
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccacctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836156.1 | Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 2360
Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0
Identities = 604/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836184.1 | Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 3179
Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0
Identities = 603/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836175.1 | Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 2136
Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0
Identities = 603/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836157.1 | Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3183
Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0
Identities = 603/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>dbj| AB042240.3 | Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome
Length = 134545
Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0
Identities = 603/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54877 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 54935
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54936 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 54995
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54996 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 55055
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 55056 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 55115
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 55116 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 55175
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 55176 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 55235
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 55236 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 55295
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 55296 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 55355
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 55356 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 55414
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 55415 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 55472
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 55473 gtgttatgagtgt 55485
>dbj| D00206.1 |WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete
cds
Length = 1755
Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0
Identities = 603/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 121
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 181
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 241
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 301
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 361
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 421
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 422 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 481
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 541
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 542 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 600
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 601 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 658
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 659 gtgttatgagtgt 671
>gb| AY607054.1 | Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1589
Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0
Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 136 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaactgt 315
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 376 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 436 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 496 cctacgtgctctacgnttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb| AY836183.1 | Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI
intergenic spacer, partial sequence; chloroplast
Length = 2360
Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0
Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcnaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY328025.1 | Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast
gene for chloroplast product
Length = 1519
Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0
Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 27 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 85
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 86 aggtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 145
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 146 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 205
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 206 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 265
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 266 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 325
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 326 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 385
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 386 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 445
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 446 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttgttcaaaaactttcca 505
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 506 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 564
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 565 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 622
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 623 gtgttatgagtgt 635
>gb| AY137461.1 | Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1589
Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0
Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77 aatttttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 136 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaactgt 315
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 376 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 436 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb| AY607060.1 | Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast
Length = 1617
Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0
Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 136 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcatcctggggttcc 255
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 315
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 376 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 436 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-atc 672
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb| AY607056.1 | Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1589
Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0
Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77 aatttttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 136 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaactgt 315
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 376 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 436 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb| AY607055.1 | Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1589
Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0
Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77 aatttttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 136 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaactgt 315
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 376 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 436 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb| AY836179.1 | Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast
Length = 3071
Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0
Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aatttttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttccactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836162.1 | Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3192
Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0
Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtacgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836154.1 | Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3215
Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0
Identities = 602/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacgtggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY607057.1 | Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; chloroplast
Length = 1594
Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0
Identities = 601/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 136 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 315
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 376 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 436 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 555
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 556 aggcccgcctcatggnnnccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb| AY836155.1 | Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3234
Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0
Identities = 601/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaagatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtntgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY836174.1 | Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 3158
Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0
Identities = 601/613 (98%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttcctggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>emb| Z49841.1 |HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase
Length = 1431
Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0
Identities = 574/579 (99%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb| AY836161.1 | Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3171
Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0
Identities = 598/613 (97%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtwagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccaktcttgatcgttacaaasgacgatgctatcacatcsarcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>emb| Z49844.1 |HBCHRBPCX H.brachyantherum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate
carboxylase
Length = 1224
Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0
Identities = 574/579 (99%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb| Z49845.1 |PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase
Length = 1431
Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0
Identities = 573/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb| AY836182.1 | Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete
sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene,
partial cds; chloroplast
Length = 3138
Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0
Identities = 599/613 (97%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttcctggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttnggttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagaganaagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>emb| Z49842.1 |HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate
carboxylase
Length = 1431
Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0
Identities = 573/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtaggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb| AY607059.1 | Psathyrostachys rupestris subsp. rupestris voucher H6701
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1611
Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0
Identities = 599/613 (97%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 77 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 135
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 136 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 195
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 196 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 255
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 256 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 315
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 316 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 375
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 376 tgttcctggggaagaggagcaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 435
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 436 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 495
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct: 496 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcccactgcttattcaaaaactttcca 555
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 556 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 614
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 615 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 672
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 673 gtgttatgagtgt 685
>gb| AY836163.1 | Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI
intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I
subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast
Length = 3190
Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0
Identities = 599/613 (97%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 16 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 74
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 134
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 135 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 194
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 195 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 254
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 255 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 314
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 tgttcctggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 374
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 375 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 434
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 435 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttactcaaaaactttcca 494
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 495 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 553
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 554 tatt-gggatgtactattaaacctaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 611
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 612 gtgttatgagtgt 624
>gb| AY772669.1 | Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast
Length = 1510
Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0
Identities = 598/613 (97%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 19 aattcttaattcaag-agttatagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 77
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 78 aggtgttgggtttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 137
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 138 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 197
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 198 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 257
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 258 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 317
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 318 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 377
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 378 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagc 437
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 438 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttgttcaaaaactttcca 497
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 498 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 556
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 557 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agc 614
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 615 gtgttatgagtgt 627
>gb| AY607051.1 | Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast
Length = 1614
Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0
Identities = 596/613 (97%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 81 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 139
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 140 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 199
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 200 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 259
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 260 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 319
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 320 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 379
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380 tgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 439
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||
Sbjct: 440 agagggttccgttactaacntgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttnaaagc 499
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 500 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 559
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||
Sbjct: 560 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaananntaagttgannnagtatgg-tcgtcctt 618
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 619 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 676
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 677 gtgttatgagtgt 689
>emb| Z49840.1 |EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate
carboxylase
Length = 1431
Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0
Identities = 571/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgcttggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb| Z49843.1 |LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate
carboxylase
Length = 1431
Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0
Identities = 570/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 121 cgagtaagtccacagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgncgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb| AY691640.1 | Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0
Identities = 561/567 (98%), Gaps = 3/567 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acagagactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60
Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 120
Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180
Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240
Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300
Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360
Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 420
Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480
Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538
Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 attatggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb| AY691636.1 | Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0
Identities = 560/567 (98%), Gaps = 3/567 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acagagactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60
Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 120
Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180
Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240
Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 300
Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360
Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 420
Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480
Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538
Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 attatggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>emb| Z49836.1 |BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase
Length = 1434
Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0
Identities = 569/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagtcctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtgtttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctagcaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb| Z49846.1 |PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase
Length = 1431
Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0
Identities = 568/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagan 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb| Z49837.1 |EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate
carboxylase
Length = 1431
Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0
Identities = 568/579 (98%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb| AY691639.1 | Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; chloroplast
Length = 1333
Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0
Identities = 548/553 (99%), Gaps = 3/553 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 60
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 120
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 180
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 240
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 300
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 360
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 420
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 421 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 479
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 480 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agc 537
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 538 gtgttatgagtgt 550
>gb| L15300.1 |ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene,
complete cds
Length = 1623
Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0
Identities = 594/613 (96%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 66 aattcttaattcaag-agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 124
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 125 aagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagta 184
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct: 185 tgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctggggttcc 244
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 245 gccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 304
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 305 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 364
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 tgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 424
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 425 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 484
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct: 485 cctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaactttcca 544
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 545 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 603
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 604 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agc 661
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
|||||||||||||
Sbjct: 662 gtgttatgagtgt 674
>gb| AY691632.1 | Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0
Identities = 557/567 (98%), Gaps = 3/567 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acagagactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60
Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 120
Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180
Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240
Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300
Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtg 360
Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaagatctacgaattccccctacttat 420
Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480
Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538
Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 attatggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>emb| Z49839.1 |ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate
carboxylase
Length = 1431
Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0
Identities = 566/579 (97%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttgggtttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctgcgtttggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb| AY137462.1 | Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; chloroplast gene for chloroplast product
Length = 1477
Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0
Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 61 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagag 60
Query: 121 tatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggtt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggtt 120
Query: 181 ccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaact 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaact 180
Query: 241 gtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgag 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgag 240
Query: 301 cctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctattt 360
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctattt 300
Query: 361 gaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaa 420
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 301 gaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaa 360
Query: 421 gccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttc 420
Query: 481 caaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 421 caaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcc 479
Query: 541 tttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaa 600
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 480 tttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-a 537
Query: 601 gcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||
Sbjct: 538 gcgtgttatgagtgt 552
>gb| AY836180.1 | Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 2309
Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0
Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 61 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagag 60
Query: 121 tatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggtt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggtt 120
Query: 181 ccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaact 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaact 180
Query: 241 gtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgag 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgag 240
Query: 301 cctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctattt 360
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctattt 300
Query: 361 gaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaa 420
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 301 gaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaa 360
Query: 421 gccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttc 420
Query: 481 caaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 421 caaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcc 479
Query: 541 tttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaa 600
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 480 tttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-a 537
Query: 601 gcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||
Sbjct: 538 gcgtgttatgagtgt 552
>gb| AY395531.1 | Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1350
Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0
Identities = 550/559 (98%), Gaps = 3/559 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60
Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 120
Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 121 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacgtggac 180
Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240
Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300
Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggttt 360
Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 420
Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479
Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 538
Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615
|| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb| AJ746287.1 | Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1344
Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0
Identities = 550/559 (98%), Gaps = 3/559 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60
Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 120
Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 121 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacgtggac 180
Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240
Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300
Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggttt 360
Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 420
Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479
Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 538
Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615
|| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb| AJ746286.1 | Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1350
Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0
Identities = 550/559 (98%), Gaps = 3/559 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 taaagcaggtgttggattcaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60
Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 120
Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180
Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240
Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300
Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtgtttggttt 360
Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 420
Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479
Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 538
Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615
|| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb| Z49838.1 |EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate
carboxylase
Length = 1431
Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0
Identities = 564/579 (97%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagannnt 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
|||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagcatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb| AY836160.1 | Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 2268
Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0
Identities = 541/548 (98%), Gaps = 3/548 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 68 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaa 127
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaa 60
Query: 128 ctaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccg 187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ctaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccg 120
Query: 188 aagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgga 247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgga 180
Query: 248 ctgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttg 307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ctgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttg 240
Query: 308 ctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagg 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 241 ctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagg 300
Query: 368 gttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctac 427
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 301 gttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctac 360
Query: 428 gtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcc 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcc 420
Query: 488 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattg 547
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt- 478
Query: 548 gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgtt 607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 479 gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgtt 537
Query: 608 atgagtgt 615
||||||||
Sbjct: 538 atgagtgt 545
>gb| AY395541.1 | Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1299
Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0
Identities = 534/539 (99%), Gaps = 3/539 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 62
Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 122
Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 182
Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 183 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaag 242
Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 302
Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 362
Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 422
Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct: 423 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 480
Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 481 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 538
>emb| AJ746292.1 | Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1299
Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0
Identities = 534/539 (99%), Gaps = 3/539 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 62
Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 122
Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 182
Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 183 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaag 242
Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 302
Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 362
Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 422
Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct: 423 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 480
Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 481 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 538
>gb| AY691642.1 | Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 997 bits (503), Expect = 0.0
Identities = 554/567 (97%), Gaps = 3/567 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acagagactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60
Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 120
Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180
Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240
Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348
||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tattacatcgagcctgttcctggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatcca 300
Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360
Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 420
Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480
Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538
Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 attatggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>emb| AJ746262.1 | Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1370
Score = 989 bits (499), Expect = 0.0
Identities = 562/579 (97%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacactccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb| AJ746257.1 | Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate
carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 981 bits (495), Expect = 0.0
Identities = 561/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
|||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctgcttatacaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb| AY836185.1 | Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and
photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds;
chloroplast
Length = 3054
Score = 979 bits (494), Expect = 0.0
Identities = 536/546 (98%), Gaps = 3/546 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 70 ggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaact 129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaact 60
Query: 130 aaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaa 189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaa 120
Query: 190 gaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggact 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggact 180
Query: 250 gatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgct 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 181 gatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcct 240
Query: 310 ggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggt 369
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 241 ggggaagacaaccaatttatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggt 300
Query: 370 tccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgt 429
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 301 tccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgt 360
Query: 430 gctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccg 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccg 420
Query: 490 cctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggg 549
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct: 421 cctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gg 478
Query: 550 gatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttat 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 479 gatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttat 537
Query: 610 gagtgt 615
||||||
Sbjct: 538 gagtgt 543
>emb| AJ746261.1 | Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 973 bits (491), Expect = 0.0
Identities = 560/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacttatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 cccgttgcttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb| AJ784827.1 | Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1363
Score = 969 bits (489), Expect = 0.0
Identities = 558/577 (96%), Gaps = 3/577 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 39 gtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataa 98
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataa 60
Query: 99 attgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccg 158
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 attgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccg 120
Query: 159 agtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatc 218
||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agtaactcctcaacctggggttcctccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatc 180
Query: 219 ttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaa 278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaa 240
Query: 279 aggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgt 338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgt 300
Query: 339 agcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgt 398
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 agcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgt 360
Query: 399 gggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcc 458
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcc 420
Query: 459 ccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataa 518
||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 tcctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataa 480
Query: 519 gttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggatta 578
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggatta 538
Query: 579 tccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 574
>gb| L14621.1 |PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
complete cds
Length = 1484
Score = 965 bits (487), Expect = 0.0
Identities = 559/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttattacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatactatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagatctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctgcttatgcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb| AJ784831.1 | Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1353
Score = 961 bits (485), Expect = 0.0
Identities = 557/577 (96%), Gaps = 3/577 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 39 gtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataa 98
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggattcaaagctggtgttaaagattataa 60
Query: 99 attgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccg 158
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 attgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccg 120
Query: 159 agtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatc 218
||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatc 180
Query: 219 ttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaa 278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaa 240
Query: 279 aggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgt 338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgt 300
Query: 339 agcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgt 398
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 agcttatccattagatctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgt 360
Query: 399 gggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcc 458
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcc 420
Query: 459 ccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataa 518
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataa 480
Query: 519 gttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggatta 578
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggatta 538
Query: 579 tccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 574
>emb| AJ784835.1 | Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1346
Score = 959 bits (484), Expect = 0.0
Identities = 544/560 (97%), Gaps = 3/560 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 56 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 115
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ctaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 60
Query: 116 cagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 175
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct: 61 cggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctg 120
Query: 176 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 235
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 180
Query: 236 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 240
Query: 296 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 300
Query: 356 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 415
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 301 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 360
Query: 416 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaa 475
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct: 361 tcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaa 420
Query: 476 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcc 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-t 479
Query: 536 cgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 595
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 480 cgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacgg 538
Query: 596 tagaagcgtgttatgagtgt 615
||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tag-agcgtgttatgagtgt 557
>gb| AY607058.1 | Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703
ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1471
Score = 959 bits (484), Expect = 0.0
Identities = 535/548 (97%), Gaps = 3/548 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 68 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaa 127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaa 60
Query: 128 ctaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccg 187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ctaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccg 120
Query: 188 aagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgga 247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgga 180
Query: 248 ctgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttg 307
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ctgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttc 240
Query: 308 ctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagg 367
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 241 ctggggaagaggagcaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagg 300
Query: 368 gttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctac 427
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 301 gttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctac 360
Query: 428 gtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcc 487
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgctctacgtttggaggatctacgaattcccactgcttattcaaaaactttccaaggcc 420
Query: 488 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattg 547
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt- 478
Query: 548 gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgtt 607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 479 gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgtt 537
Query: 608 atgagtgt 615
||||||||
Sbjct: 538 atgagtgt 545
>gb| AY691646.1 | Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 957 bits (483), Expect = 0.0
Identities = 549/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60
Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168
||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 61 tacactccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120
Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 caacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180
Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240
Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 300
Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360
Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctgcttat 420
Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 acaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480
Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaa 538
Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb| AY691645.1 | Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 957 bits (483), Expect = 0.0
Identities = 549/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60
Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168
||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 61 tacactccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120
Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 caacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180
Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240
Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 300
Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360
Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctgcttat 420
Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 acaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480
Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaa 538
Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb| AY691631.1 | Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 957 bits (483), Expect = 0.0
Identities = 549/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60
Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 61 tacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120
Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 caacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180
Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240
Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300
Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcgattgtgggtaacgta 360
Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttat 420
Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 acaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480
Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538
Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 attatggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>emb| AJ746172.1 | Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1362
Score = 957 bits (483), Expect = 0.0
Identities = 558/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggattcaaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcgggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagtcaatatatcgcttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb| AJ784823.1 | Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1360
Score = 955 bits (482), Expect = 0.0
Identities = 545/562 (96%), Gaps = 3/562 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 54 aactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 113
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 aactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 62
Query: 114 cccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 173
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct: 63 cccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacc 122
Query: 174 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 233
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 tggagttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 182
Query: 234 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 242
Query: 294 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 302
Query: 354 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 413
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 cctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 362
Query: 414 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaa 473
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct: 363 tttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaa 422
Query: 474 aactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg 533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 aactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg 482
Query: 534 cccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattat 593
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 483 -tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattac 540
Query: 594 ggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 541 ggtag-agcgtgttatgagtgt 561
>emb| AJ784834.1 | Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1328
Score = 954 bits (481), Expect = 0.0
Identities = 544/561 (96%), Gaps = 3/561 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 62
Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 63 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcct 122
Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 ggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 182
Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 242
Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 atcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagat 302
Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 ctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 362
Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct: 363 ttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaa 422
Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg- 481
Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 482 tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacg 540
Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||||||||||||||
Sbjct: 541 gtag-agcgtgttatgagtgt 560
>emb| AJ784822.1 | Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for
ribulose bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1350
Score = 952 bits (480), Expect = 0.0
Identities = 549/568 (96%), Gaps = 3/568 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 48 aacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgactta 107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 aacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgactta 60
Query: 108 ctacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcc 167
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 61 ctacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcc 120
Query: 168 tcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactgg 227
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tcagcctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactgg 180
Query: 228 tacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatg 287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatg 240
Query: 288 ctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcc 347
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ctatcacatcgagcctgttcctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcc 300
Query: 348 attagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgt 407
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 301 attagacttatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgt 360
Query: 408 atttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctactta 467
|||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct: 361 atttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgctta 420
Query: 468 ttcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaa 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ttcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaa 480
Query: 528 gtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaa 587
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 481 gtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaa 538
Query: 588 aattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 aattacggtag-agcgtgttatgagtgt 565
>gb| AY691630.1 | Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 950 bits (479), Expect = 0.0
Identities = 548/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60
Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 61 tacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120
Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 caacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180
Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgc 240
Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300
Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360
Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttat 420
Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 acaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480
Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538
Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb| AY395527.1 | Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1408
Score = 950 bits (479), Expect = 0.0
Identities = 542/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60
Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctgg 120
Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180
Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgctatcacat 240
Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300
Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggttt 360
Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaac 420
Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479
Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggt 538
Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615
|| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb| AJ784828.1 | Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1358
Score = 946 bits (477), Expect = 0.0
Identities = 543/561 (96%), Gaps = 3/561 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 60
Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct: 61 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacct 120
Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 180
Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 240
Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 atcgagcctgttgctggggacgacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 300
Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 360
Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct: 361 ttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaa 420
Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg- 479
Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 480 tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacg 538
Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 gtag-agcgtgttatgagtgt 558
>emb| AJ784825.1 | Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1349
Score = 946 bits (477), Expect = 0.0
Identities = 543/561 (96%), Gaps = 3/561 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 actaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 62
Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct: 63 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacct 122
Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 ggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 182
Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 242
Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 atcgatcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 302
Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 ctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 362
Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct: 363 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaa 422
Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 423 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg- 481
Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct: 482 tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacg 540
Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||||||||||||||
Sbjct: 541 gtag-agcgtgttatgagtgt 560
>emb| AJ784820.1 | Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1350
Score = 944 bits (476), Expect = 0.0
Identities = 542/560 (96%), Gaps = 3/560 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 56 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 115
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ctaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 60
Query: 116 cagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 175
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct: 61 cggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctg 120
Query: 176 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 235
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 180
Query: 236 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 240
Query: 296 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 355
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 300
Query: 356 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 415
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 301 tatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 360
Query: 416 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaa 475
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct: 361 tcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaa 420
Query: 476 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcc 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-t 479
Query: 536 cgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 595
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 480 cgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacgg 538
Query: 596 tagaagcgtgttatgagtgt 615
||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tag-agcgtgttatgagtgt 557
>gb| AY691643.1 | Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 942 bits (475), Expect = 0.0
Identities = 547/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttat 60
Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 61 tacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120
Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180
Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240
Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300
Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttagatctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360
Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttat 420
Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480
Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538
Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb| AY691641.1 | Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 942 bits (475), Expect = 0.0
Identities = 547/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60
Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 61 tacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120
Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180
Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240
Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300
Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360
Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgcttat 420
Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480
Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538
Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb| AY691635.1 | Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 942 bits (475), Expect = 0.0
Identities = 547/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60
Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 61 tacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120
Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180
Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240
Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300
Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360
Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgcttat 420
Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480
Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538
Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb| AY691634.1 | Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 942 bits (475), Expect = 0.0
Identities = 547/567 (96%), Gaps = 3/567 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acagagactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 60
Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 61 tacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120
Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 caacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 180
Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240
Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatcacatcgagcctgttgctggggacgacaaccaatggatctgttatgtagcttatcca 300
Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 360
Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttat 420
Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 acaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 480
Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 481 tatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattgtccgcaaaaa 538
Query: 589 attatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 attacggtag-agcgtgttatgagtgt 564
>gb| AY395535.1 | Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1349
Score = 942 bits (475), Expect = 0.0
Identities = 541/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60
Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctgg 120
Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180
Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240
Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagatct 300
Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggttt 360
Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaac 420
Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479
Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggt 538
Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615
|| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb| AJ746256.1 | Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 942 bits (475), Expect = 0.0
Identities = 556/579 (96%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaaatgttggatttaaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaacccctcaacctggggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgcctggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ccccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattaggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb| AJ746285.1 | Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate
carboxylase large chain
Length = 1332
Score = 934 bits (471), Expect = 0.0
Identities = 540/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60
Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||
Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacccgg 120
Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180
Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240
Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggacgacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300
Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggttt 360
Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaac 420
Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479
Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggt 538
Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615
|| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb| AJ784824.1 | Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1357
Score = 932 bits (470), Expect = 0.0
Identities = 545/566 (96%), Gaps = 3/566 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 cagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttact 109
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 cagaaactaaagcaagtgttggattcaaagctggtgttaaagattataaattgacttact 60
Query: 110 acaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctc 169
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 61 acaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctc 120
Query: 170 agcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggta 229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggta 180
Query: 230 catggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgct 289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 catggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgct 240
Query: 290 atcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccat 349
|||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct: 241 atcacatcgagcctgttgctggggaagagagtcaatttatcgcttatgtagcttatccat 300
Query: 350 tagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtat 409
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtat 360
Query: 410 ttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttatt 469
|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctacttatt 420
Query: 470 caaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagt 529
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 caaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagt 480
Query: 530 atggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaa 589
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaa 538
Query: 590 ttatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ttacggtag-agcgtgttatgagtgt 563
>gb| AY622890.1 | Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit gene, partial cds; chloroplast
Length = 1342
Score = 930 bits (469), Expect = 0.0
Identities = 532/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1 gttggatttaaagcaggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccc 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 gctggggaagacaatcaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccactgcttattcaaaaactttccaaggc 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb| AY395536.1 | Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 926 bits (467), Expect = 0.0
Identities = 539/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60
Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctgg 120
Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180
Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcatat 240
Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300
Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttctattgtgggtaacgtatttggttt 360
Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgcttattcaaaaac 420
Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct: 421 tttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaataagtatgg-tc 479
Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 538
Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615
|| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb| AJ746258.1 | Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1397
Score = 924 bits (466), Expect = 0.0
Identities = 544/566 (96%), Gaps = 3/566 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 cagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttact 109
|||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 4 cagaaactaaagcaagtgttggattcaaagctggtgttaaagattatagattgacttact 63
Query: 110 acaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctc 169
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 64 acaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctc 123
Query: 170 agcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggta 229
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124 accctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggta 183
Query: 230 catggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgct 289
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184 catggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgct 243
Query: 290 atcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccat 349
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 244 atcacatcgagcctgttgctggggaagacagtcaatggatctgttatgtagcttatccat 303
Query: 350 tagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtat 409
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 304 tagatctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtat 363
Query: 410 ttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttatt 469
|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 364 ttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctacttatt 423
Query: 470 caaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagt 529
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 424 caaaaactttccaaggcccgcctcacggtatccaagtggaaagagataagttgaacaagt 483
Query: 530 atggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaa 589
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 484 atgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaa 541
Query: 590 ttatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 542 ttacggtag-agcgtgttatgagtgt 566
>emb| AJ784832.1 | Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1345
Score = 922 bits (465), Expect = 0.0
Identities = 546/569 (95%), Gaps = 3/569 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 47 aaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgactt 106
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 aaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgactt 60
Query: 107 actacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtc 166
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 61 actacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactc 120
Query: 167 ctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactg 226
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ctcagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactg 180
Query: 227 gtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgat 286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgat 240
Query: 287 gctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatc 346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatc 300
Query: 347 cattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacg 406
|||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 cattagacttatttgaagaaggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacg 360
Query: 407 tatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctactt 466
||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||
Sbjct: 361 tatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgctt 420
Query: 467 attcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaaca 526
|| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 atgcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaaca 480
Query: 527 agtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaa 586
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 481 agtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaa 538
Query: 587 aaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 aaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 566
>emb| AJ746279.1 | Holcus lanatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1301
Score = 920 bits (464), Expect = 0.0
Identities = 530/548 (96%), Gaps = 3/548 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 68 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaa 127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1 ttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaa 60
Query: 128 ctaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccg 187
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 61 ccaaggatactgatatcttggcagcatttcgagtaactcctcagcctggggttccgccgg 120
Query: 188 aagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgga 247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgga 180
Query: 248 ctgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttg 307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ctgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttg 240
Query: 308 ctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagg 367
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct: 241 ctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagaag 300
Query: 368 gttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctac 427
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 301 gttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctac 360
Query: 428 gtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcc 487
||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgctctacgtctggaagatctacgaattccccctgcttattcaaaaactttccaaggcc 420
Query: 488 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattg 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaataagtatgg-tcgtcctttatt- 478
Query: 548 gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgtt 607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct: 479 gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgtt 537
Query: 608 atgagtgt 615
||||||||
Sbjct: 538 atgagtgt 545
>gb| AY395565.1 | Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1323
Score = 918 bits (463), Expect = 0.0
Identities = 523/539 (97%), Gaps = 3/539 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct: 2 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggata 61
Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196
||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 62 ctgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcag 121
Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 181
Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 241
Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 242 acggccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgtta 301
Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctac 361
Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 gtttggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatg 421
Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct: 422 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 479
Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 480 tattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 537
>gb| AY395528.1 | Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL)
gene, partial sequence; chloroplast
Length = 1408
Score = 918 bits (463), Expect = 0.0
Identities = 538/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60
Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctgg 120
Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180
Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgctatcacat 240
Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300
Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggttt 360
Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||
Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgcttatgcaaaaac 420
Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479
Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggt 538
Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615
|| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb| AJ784837.1 | Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1345
Score = 918 bits (463), Expect = 0.0
Identities = 538/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60
Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctgg 120
Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180
Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgctatcacat 240
Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300
Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggttt 360
Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||
Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattcccgttgcttatgcaaaaac 420
Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479
Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggt 538
Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615
|| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb| AJ746280.1 | Agrostis stolonifera chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1316
Score = 918 bits (463), Expect = 0.0
Identities = 538/559 (96%), Gaps = 3/559 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 taaagcaagtgttggattccaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60
Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctgg 120
Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180
Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240
Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccgttagactt 300
Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtcggtaacgtatttggttt 360
Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatgcaaaaac 420
Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479
Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggt 538
Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615
|| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb| AJ746276.1 | Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1323
Score = 918 bits (463), Expect = 0.0
Identities = 523/539 (97%), Gaps = 3/539 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct: 2 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggata 61
Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196
||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 62 ctgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcag 121
Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 181
Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 241
Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 242 acggccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgtta 301
Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctac 361
Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 gtttggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatg 421
Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct: 422 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 479
Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 480 tattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 537
>gb| AY622885.1 | Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds;
chloroplast
Length = 1330
Score = 918 bits (463), Expect = 0.0
Identities = 530/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggastatgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgccc 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcgggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
|||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 gctggggaagacagtcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>emb| AJ746255.1 | Aira praecox chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1126
Score = 914 bits (461), Expect = 0.0
Identities = 530/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccg 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||
Sbjct: 241 gctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccgttagacttatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtcggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatgcaaaaactttccaaggc 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb| AF458076.1 | Trithuria submersa ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit gene, partial cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1333
Score = 914 bits (461), Expect = 0.0
Identities = 529/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaastcctcaacccggggttccgccg 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttataaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 gctggggaagatagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaactttccaaggc 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgkgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>emb| AJ746281.1 | Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1329
Score = 910 bits (459), Expect = 0.0
Identities = 525/543 (96%), Gaps = 3/543 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 73 tttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaag 132
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct: 1 tttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaag 60
Query: 133 gatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaa 192
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct: 61 gatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaa 120
Query: 193 gcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgat 252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgat 180
Query: 253 ggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggg 312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggg 240
Query: 313 gaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttcc 372
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 241 gaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttcc 300
Query: 373 gttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgct 432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgct 360
Query: 433 ctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcct 492
|||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ctacgtctggaggatctacgaattcccgttgcttatgcaaaaactttccaaggcccgcct 420
Query: 493 catggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggat 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct: 421 catggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggat 478
Query: 553 gtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgag 612
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct: 479 gtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgag 537
Query: 613 tgt 615
|||
Sbjct: 538 tgt 540
>emb| AJ746268.1 | Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1388
Score = 910 bits (459), Expect = 0.0
Identities = 522/539 (96%), Gaps = 3/539 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct: 1 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggata 60
Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196
||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 61 ctgatatcttggcagcattccgagtaactcctcaacctggggttccgccggaagaagcag 120
Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 180
Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 240
Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct: 241 acaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagatctatttgaagagggttccgtta 300
Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctac 360
Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496
|| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatg 420
Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct: 421 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 478
Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 536
>emb| X55828.1 |CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large
subunit (EC 4.1.1.39)
Length = 1990
Score = 906 bits (457), Expect = 0.0
Identities = 565/597 (94%), Gaps = 3/597 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 19 agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaa 78
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct: 400 agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaa 459
Query: 79 gctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatact 138
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||
Sbjct: 460 gctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaaaccaaggatact 519
Query: 139 gatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggg 198
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 520 gatatcttggcagcatttcgagtaactcctcagcccggggttccgcctgaagaagcaggg 579
Query: 199 gctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggactt 258
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 580 gctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggactt 639
Query: 259 accagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagac 318
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct: 640 accagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgttcctggggaagaa 699
Query: 319 agccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttact 378
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct: 700 gatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttact 759
Query: 379 aacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgt 438
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 760 aacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgt 819
Query: 439 ttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggt 498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct: 820 ttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcacggt 879
Query: 499 atccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtacta 558
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 880 atccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-gcgtcctttatt-gggatgtacta 937
Query: 559 ttaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 938 ttaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 993
>gb| AY622898.1 | Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds;
chloroplast
Length = 1344
Score = 906 bits (457), Expect = 0.0
Identities = 529/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgccc 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcgggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcatatcgagcctgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaagacagtcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb| AY622896.1 | Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit gene, partial cds; chloroplast
Length = 1344
Score = 906 bits (457), Expect = 0.0
Identities = 529/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgccc 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcgggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggactactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaagacagtcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>emb| AJ746282.1 | Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1408
Score = 902 bits (455), Expect = 0.0
Identities = 536/559 (95%), Gaps = 3/559 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 taaagcaaatgttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 60
Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct: 61 ggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaacccctcaacctgg 120
Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 180
Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240
Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 300
Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct: 301 atttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggttt 360
Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 361 caaagccctacgtgctctacgcctggaggatctacgaattccccctgcttatacaaaaac 420
Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 421 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tc 479
Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattaggattatccgcaaaaaattacggt 538
Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615
|| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb| AJ746260.1 | Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 902 bits (455), Expect = 0.0
Identities = 548/575 (95%), Gaps = 3/575 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttaaagccggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttattacactccagagtacgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcctggggttccccctgaagaagcaggagctgcagtagctgcggaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||| |||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgagcccgttcctggggatgaaggtcaatatatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 421 cctcctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-ccgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatga 611
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatga 572
>emb| X55827.1 |CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large
subunit (EC 4.1.1.39)
Length = 2010
Score = 898 bits (453), Expect = 0.0
Identities = 564/597 (94%), Gaps = 3/597 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 19 agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaa 78
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct: 420 agttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaa 479
Query: 79 gctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatact 138
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||
Sbjct: 480 gctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaaaccaaggatact 539
Query: 139 gatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggg 198
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 540 gatatcttggcagcatttcgagtaactcctcagcccggggttccgcctgaagaagcaggg 599
Query: 199 gctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggactt 258
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 gctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggactt 659
Query: 259 accagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagac 318
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||
Sbjct: 660 accagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgttcctggggaggaa 719
Query: 319 agccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttact 378
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct: 720 gatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttact 779
Query: 379 aacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgt 438
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 780 aacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgt 839
Query: 439 ttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggt 498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct: 840 ttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcacggt 899
Query: 499 atccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtacta 558
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 900 atccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-gcgtcctttatt-gggatgtacta 957
Query: 559 ttaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 958 ttaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 1013
>gb| AY395547.1 | Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1296
Score = 892 bits (450), Expect = 0.0
Identities = 519/538 (96%), Gaps = 3/538 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 78 agctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatac 137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1 agctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatac 60
Query: 138 tgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcagg 197
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 tgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccggaagaagcagg 120
Query: 198 ggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggact 257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggact 180
Query: 258 taccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaaga 317
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 taccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcatatcgagcctgttgctggggaaga 240
Query: 318 cagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttac 377
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 241 caaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttac 300
Query: 378 taacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacg 437
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 taacatgtttacttctattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacg 360
Query: 438 tttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatgg 497
| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 361 tctggaggatctacgaattcccgttgcttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatgg 420
Query: 498 tatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtact 557
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 421 tatccaagttgaaagagataagttgaataagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtact 478
Query: 558 attaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 attaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 535
>emb| AJ746293.1 | Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for
ribulose bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1296
Score = 892 bits (450), Expect = 0.0
Identities = 519/538 (96%), Gaps = 3/538 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 78 agctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatac 137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1 agctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatac 60
Query: 138 tgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcagg 197
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 tgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccggaagaagcagg 120
Query: 198 ggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggact 257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggact 180
Query: 258 taccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaaga 317
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 taccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcatatcgagcctgttgctggggaaga 240
Query: 318 cagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttac 377
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 241 caaccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttac 300
Query: 378 taacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacg 437
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 taacatgtttacttctattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacg 360
Query: 438 tttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatgg 497
| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 361 tctggaggatctacgaattcccgttgcttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatgg 420
Query: 498 tatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtact 557
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 421 tatccaagttgaaagagataagttgaataagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtact 478
Query: 558 attaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 attaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 535
>gb| AY622895.1 | Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit gene, partial cds; chloroplast
Length = 1344
Score = 890 bits (449), Expect = 0.0
Identities = 527/549 (95%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccg 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgctgtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgctgctatcacatcgagcctgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 gctggggaagaaaatcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggt 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccacctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>emb| AJ746294.1 | Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1295
Score = 882 bits (445), Expect = 0.0
Identities = 517/537 (96%), Gaps = 3/537 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 79 gctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatact 138
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1 gctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatact 60
Query: 139 gatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggg 198
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggg 120
Query: 199 gctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggactt 258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaacagtttggactgatggactt 180
Query: 259 accagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagac 318
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 181 accagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagac 240
Query: 319 agccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttact 378
||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 241 ggccaatggatcgcttatgtagcttatccattagatctatttgaagagggttccgttact 300
Query: 379 aacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgt 438
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 aacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgt 360
Query: 439 ttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggt 498
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 361 ctggaagatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggt 420
Query: 499 atccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtacta 558
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 atccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtacta 478
Query: 559 ttaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 ttaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 534
>gb| L24073.1 |RICCHRBCLA Oryza sativa chloroplast rubisco large subunit (rbcL) mRNA,
complete cds
Length = 1355
Score = 882 bits (445), Expect = 0.0
Identities = 575/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 60
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 61 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 120
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 121 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 180
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 240
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 300
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 360
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 361 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 420
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 480
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 481 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 539
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 540 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 597
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 598 atgttatgagtgt 610
>dbj| BA000029.3 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome
Length = 490520
Score = 882 bits (445), Expect = 0.0
Identities = 576/613 (93%), Gaps = 5/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123307 aattcttaattcatg-agttgtaggg-gggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 123364
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 123365 aagtgttggatttcaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 123424
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 123425 cgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 123484
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123485 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 123544
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123545 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 123604
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123605 cgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 123664
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 123665 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 123724
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123725 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 123784
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 123785 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 123843
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||
Sbjct: 123844 tatt-gggatgtactattaaacaaaaatggggattatccgcgataaattatggtag-agc 123901
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 123902 atgttatgagtgt 123914
Score = 882 bits (445), Expect = 0.0
Identities = 576/613 (93%), Gaps = 5/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 28780 aattcttaattcatg-agttgtaggg-gggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 28837
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 28838 aagtgttggatttcaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 28897
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 28898 cgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 28957
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 28958 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 29017
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29018 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 29077
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29078 cgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 29137
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 29138 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 29197
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29198 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 29257
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 29258 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctt 29316
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||
Sbjct: 29317 tatt-gggatgtactattaaacaaaaatggggattatccgcgataaattatggtag-agc 29374
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 29375 atgttatgagtgt 29387
>gb| AY395554.1 | Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1332
Score = 878 bits (443), Expect = 0.0
Identities = 518/539 (96%), Gaps = 3/539 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct: 5 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggata 64
Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct: 65 ctgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagcag 124
Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 125 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 184
Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 185 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 244
Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||
Sbjct: 245 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacttatttgaagaaggttccgtta 304
Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 305 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctac 364
Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496
|| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 365 gtctggaggatctacgaattcccgttgcttatgcaaaaactttccaaggtccgcctcatg 424
Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct: 425 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 482
Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 483 tattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 540
>emb| AJ746298.1 | Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1332
Score = 878 bits (443), Expect = 0.0
Identities = 518/539 (96%), Gaps = 3/539 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 77 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggata 136
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct: 5 aagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggata 64
Query: 137 ctgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcag 196
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct: 65 ctgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagcag 124
Query: 197 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 125 gggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggac 184
Query: 257 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 185 ttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaag 244
Query: 317 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgtta 376
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||
Sbjct: 245 acagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacttatttgaagaaggttccgtta 304
Query: 377 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctac 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 305 ctaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctac 364
Query: 437 gtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatg 496
|| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 365 gtctggaggatctacgaattcccgttgcttatgcaaaaactttccaaggtccgcctcatg 424
Query: 497 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtac 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct: 425 gtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtac 482
Query: 557 tattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 483 tattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 540
>gb| AY522330.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast,
complete genome
Length = 134551
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54070 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 54128
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 54129 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 54188
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 54189 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 54248
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54249 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 54308
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 54309 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 54368
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54369 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 54428
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 54429 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 54488
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54489 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 54548
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 54549 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 54607
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 54608 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 54665
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 54666 atgttatgagtgt 54678
>gb| AY522331.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast,
complete genome
Length = 134551
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54070 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 54128
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 54129 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 54188
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 54189 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 54248
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54249 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 54308
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 54309 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 54368
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54369 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 54428
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 54429 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 54488
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54489 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 54548
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 54549 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 54607
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 54608 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 54665
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 54666 atgttatgagtgt 54678
>gb| AY522329.1 | Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast,
complete genome
Length = 134496
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54018 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 54076
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 54077 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 54136
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 54137 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 54196
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54197 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 54256
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 54257 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 54316
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54317 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 54376
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 54377 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 54436
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54437 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 54496
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 54497 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 54555
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 54556 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 54613
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 54614 atgttatgagtgt 54626
>gb| DQ167399.1 | Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion,
complete genome
Length = 491515
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124359 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 124417
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 124418 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 124477
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 124478 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 124537
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124538 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 124597
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 124598 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 124657
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124658 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 124717
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 124718 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 124777
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124778 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 124837
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 124838 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 124896
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 124897 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 124954
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 124955 atgttatgagtgt 124967
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29299 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 29357
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 29358 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 29417
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 29418 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 29477
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29478 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 29537
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 29538 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 29597
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29598 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 29657
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 29658 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 29717
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29718 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 29777
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 29778 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 29836
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 29837 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 29894
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 29895 atgttatgagtgt 29907
>gb| DQ167807.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion,
complete genome
Length = 490673
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123386 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 123444
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 123445 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 123504
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 123505 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 123564
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123565 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 123624
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 123625 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 123684
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123685 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 123744
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 123745 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 123804
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123805 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 123864
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 123865 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 123923
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 123924 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 123981
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 123982 atgttatgagtgt 123994
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 28805 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 28863
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 28864 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 28923
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 28924 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 28983
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 28984 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 29043
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 29044 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 29103
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29104 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 29163
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 29164 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 29223
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29224 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 29283
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 29284 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 29342
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 29343 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 29400
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 29401 atgttatgagtgt 29413
>gb| DQ167400.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion,
complete genome
Length = 490669
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123386 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 123444
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 123445 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 123504
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 123505 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 123564
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123565 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 123624
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 123625 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 123684
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123685 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 123744
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 123745 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 123804
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123805 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 123864
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 123865 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 123923
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 123924 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 123981
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 123982 atgttatgagtgt 123994
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 28805 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 28863
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 28864 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 28923
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 28924 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 28983
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 28984 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 29043
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 29044 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 29103
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29104 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 29163
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 29164 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 29223
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29224 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 29283
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 29284 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 29342
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 29343 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 29400
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 29401 atgttatgagtgt 29413
>emb| X15901.1 |CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome
Length = 134525
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54062 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 54120
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 54121 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 54180
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 54181 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 54240
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54241 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 54300
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 54301 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 54360
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54361 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 54420
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 54421 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 54480
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54481 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 54540
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 54541 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 54599
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 54600 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 54657
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 54658 atgttatgagtgt 54670
>dbj| AK105600.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full
insert sequence
Length = 2485
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 81
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 82 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 141
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 142 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 201
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 202 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 261
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 262 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 321
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 322 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 381
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 382 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 441
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 442 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 501
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 502 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 560
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 561 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 618
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 619 atgttatgagtgt 631
>dbj| AP006728.1 | Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome
Length = 134494
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 53997 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 54055
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 54056 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 54115
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 54116 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 54175
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54176 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 54235
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 54236 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 54295
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54296 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 54355
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 54356 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 54415
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 54416 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 54475
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 54476 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 54534
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 54535 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 54592
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 54593 atgttatgagtgt 54605
>gb| U31442.1 |SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial
cds
Length = 1344
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 525/549 (95%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 gctggggaagaaactcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccaatgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgcgctctacgtctggaggatctacgaattcccactacttattcaaaaactttccaaggc 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>dbj| D00207.1 |RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate
carboxylase large subunit, complete cds
Length = 2062
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 574/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 388 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 446
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 447 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 506
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 507 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 566
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 567 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 626
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 627 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 686
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 687 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 746
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 747 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 806
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 807 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 866
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 867 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 925
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 926 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 983
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 984 atgttatgagtgt 996
>gb| AY632370.1 | Phaenosperma globosa ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; plastid
Length = 1143
Score = 870 bits (439), Expect = 0.0
Identities = 514/535 (96%), Gaps = 3/535 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 81 tggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactga 140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 1 tggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactga 60
Query: 141 tatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggc 200
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggc 120
Query: 201 tgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttac 260
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tgcagtagctgtcgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttac 180
Query: 261 cagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacag 320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 181 cagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctagggaagacag 240
Query: 321 ccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaa 380
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct: 241 tcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccattactaa 300
Query: 381 catgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgttt 440
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 301 catgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtct 360
Query: 441 ggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtat 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 361 ggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtat 420
Query: 501 ccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactatt 560
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||
Sbjct: 421 ccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtccttt-tttgggatgtactatt 478
Query: 561 aaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 aaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 532
>gb| AY632361.1 | Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; plastid
Length = 1277
Score = 868 bits (438), Expect = 0.0
Identities = 507/526 (96%), Gaps = 3/526 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 90 agattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggc 149
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 agattatagattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggc 60
Query: 150 agcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagc 209
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 agcattccgagtaagtcctcaacctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagc 120
Query: 210 tgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttga 269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 121 tgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttga 180
Query: 270 tcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggat 329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 181 tcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagtcaatggat 240
Query: 330 ctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttac 389
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ctgttatgtagcttatccattagatctatttgaagagggttccgttactaacatgtttac 300
Query: 390 ttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatct 449
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 301 ttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatct 360
Query: 450 acgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttga 509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct: 361 acgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcacggtatccaagtgga 420
Query: 510 aagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaa 569
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 aagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaa 478
Query: 570 ttgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 ttgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 523
>gb| AY395529.1 | Arrhenatherum elatius ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL)
gene, partial sequence; chloroplast
Length = 1259
Score = 868 bits (438), Expect = 0.0
Identities = 501/518 (96%), Gaps = 3/518 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 98 aattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattcc 157
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 aattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattcc 60
Query: 158 gagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaat 217
|||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gagtaactcctcaacctggagttccgccggaagaagcaggggctgcagtagctgccgaat 120
Query: 218 cttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttaca 277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttaca 180
Query: 278 aaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatg 337
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 181 aaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatagatctgttatg 240
Query: 338 tagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattg 397
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattg 300
Query: 398 tgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattc 457
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattc 360
Query: 458 cccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagata 517
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cccctgcttatacaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagata 420
Query: 518 agttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggatt 577
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 agttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggatt 478
Query: 578 atccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 atccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 515
>gb| AC122148.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone
OSJNAb0075K12, complete sequence
Length = 125936
Score = 866 bits (437), Expect = 0.0
Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52272 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 52330
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 52331 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 52390
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 52391 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 52450
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52451 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 52510
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 52511 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 52570
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52571 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 52630
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 52631 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 52690
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 52691 cctacgcgctctacttctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 52750
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 52751 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 52809
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 52810 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 52867
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 52868 atgttatgagtgt 52880
>gb| AC092750.2 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from
chromosome 10, complete sequence
Length = 134933
Score = 866 bits (437), Expect = 0.0
Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 127205 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 127263
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 127264 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 127323
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 127324 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 127383
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 127384 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 127443
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 127444 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 127503
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 127504 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 127563
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 127564 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 127623
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 127624 cctacgcgctctacttctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 127683
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 127684 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 127742
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 127743 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 127800
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 127801 atgttatgagtgt 127813
>dbj| AP008216.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete
sequence
Length = 22685906
Score = 866 bits (437), Expect = 0.0
Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10345880 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 10345938
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 10345939 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 10345998
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 10345999 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 10346058
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10346059 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 10346118
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 10346119 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 10346178
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10346179 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 10346238
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 10346239 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 10346298
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10346299 cctacgcgctctacttctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 10346358
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 10346359 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 10346417
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 10346418 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 10346475
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 10346476 atgttatgagtgt 10346488
>dbj| AP008212.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete
sequence
Length = 30731886
Score = 866 bits (437), Expect = 0.0
Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23205025 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 23204967
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 23204966 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 23204907
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 23204906 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 23204847
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23204846 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 23204787
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 23204786 ttgaactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 23204727
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23204726 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 23204667
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 23204666 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 23204607
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23204606 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 23204547
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 23204546 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 23204488
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 23204487 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 23204430
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 23204429 atgttatgagtgt 23204417
>dbj| AP008207.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete
sequence
Length = 43261740
Score = 866 bits (437), Expect = 0.0
Identities = 560/597 (93%), Gaps = 3/597 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 33547396 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 33547454
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 33547455 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 33547514
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 33547515 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 33547574
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 33547575 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 33547634
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 33547635 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 33547694
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 33547695 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 33547754
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 33547755 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 33547814
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 33547815 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 33547874
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 33547875 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 33547933
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtaga 599
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 33547934 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtaga 33547989
Score = 151 bits (76), Expect = 3e-33
Identities = 100/107 (93%), Gaps = 1/107 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 14122784 aattcttaattcat-tagttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 14122842
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttact 109
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 14122843 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttact 14122889
Score = 105 bits (53), Expect = 2e-19
Identities = 131/155 (84%), Gaps = 4/155 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 149 cagcattccgagtaagtcctcagcctgggg-ttccgcccgaagaagcaggggctgcagta 207
||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||| || |||| || ||
Sbjct: 30075609 cagcattccgagtaactcctcagacggggggttccgcccaaaggaga---ggctacaata 30075553
Query: 208 gctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtctt 267
||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||
Sbjct: 30075552 gctaccaaatcttctactggtacatggacaattgtttggattaatggacttactagtctt 30075493
Query: 268 gatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||| | |||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct: 30075492 gattgctacaaaggcttatgctatcacatcaagcc 30075458
Score = 101 bits (51), Expect = 3e-18
Identities = 91/103 (88%), Gaps = 1/103 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 428 gtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcc 487
||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct: 30075105 gtgctctacgtccagaggat-tacgaattccctctacttattcaaaaacttttcaaggac 30075047
Query: 488 cgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagta 530
| |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||
Sbjct: 30075046 cacctcatggtatctaagttgcaagggataagttcaacaagta 30075004
Score = 79.8 bits (40), Expect = 1e-11
Identities = 70/80 (87%)
Strand = Plus / Minus
Query: 36 tatgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagatta 95
||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||
Sbjct: 30075723 tatgtcaccggaaacagaaactaaagaaaatgttaaatttcaagctggtgtcaagaatta 30075664
Query: 96 taaattgacttactacaccc 115
||||||||||||||||||||
Sbjct: 30075663 taaattgacttactacaccc 30075644
>gb| AY622888.1 | Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds;
chloroplast
Length = 1344
Score = 866 bits (437), Expect = 0.0
Identities = 524/549 (95%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgccc 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacggtgttatcacatcgagcctgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
|||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaagaaagtcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgtgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactacttattcaaaaactttccaaggg 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccacctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-gcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>dbj| AP003280.2 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC
clone:P0557A01
Length = 147201
Score = 866 bits (437), Expect = 0.0
Identities = 560/597 (93%), Gaps = 3/597 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 92593 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 92651
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 92652 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 92711
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 92712 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 92771
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 92772 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 92831
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 92832 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 92891
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 92892 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 92951
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 92952 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 93011
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 93012 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 93071
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 93072 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 93130
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtaga 599
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 93131 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtaga 93186
>dbj| AP004236.3 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC
clone:P0417D05
Length = 165752
Score = 866 bits (437), Expect = 0.0
Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 155673 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 155615
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 155614 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 155555
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 155554 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 155495
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 155494 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 155435
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 155434 ttgaactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 155375
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 155374 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 155315
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 155314 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 155255
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 155254 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 155195
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 155194 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 155136
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 155135 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 155078
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 155077 atgttatgagtgt 155065
>dbj| AP003623.3 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC
clone:P0642B07
Length = 139297
Score = 866 bits (437), Expect = 0.0
Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39787 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 39729
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 39728 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 39669
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 39668 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 39609
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39608 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 39549
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 39548 ttgaactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 39489
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39488 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 39429
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 39428 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 39369
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39368 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 39309
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 39308 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 39250
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 39249 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 39192
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 39191 atgttatgagtgt 39179
>gb| AE016959.3 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence
Length = 22698374
Score = 866 bits (437), Expect = 0.0
Identities = 573/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10351919 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 10351977
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 10351978 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 10352037
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 10352038 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 10352097
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10352098 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 10352157
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 10352158 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 10352217
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10352218 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 10352277
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 10352278 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 10352337
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 10352338 cctacgcgctctacttctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 10352397
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 10352398 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 10352456
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 10352457 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 10352514
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 10352515 atgttatgagtgt 10352527
>emb| AJ784830.1 | Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1346
Score = 864 bits (436), Expect = 0.0
Identities = 529/556 (95%), Gaps = 3/556 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 56 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 115
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct: 1 ctaaagcaggtgttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttattacactc 60
Query: 116 cagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 175
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 cagagtacgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctg 120
Query: 176 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 235
||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gggttccccctgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatgga 180
Query: 236 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 181 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaagggacgatgctatcaca 240
Query: 296 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 355
||||||| ||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tcgagcccgttcctggggaggaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacc 300
Query: 356 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 415
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct: 301 tatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtt 360
Query: 416 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaa 475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaa 420
Query: 476 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcc 535
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct: 421 ctttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-c 479
Query: 536 cgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 595
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 cgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 538
Query: 596 tagaagcgtgttatga 611
||| ||||||||||||
Sbjct: 539 tag-agcgtgttatga 553
>emb| AJ746277.1 | Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 862 bits (435), Expect = 0.0
Identities = 546/579 (94%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttattacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||
Sbjct: 241 aaagggcgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgcttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
|||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtacgg-ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb| AJ746274.1 | Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 862 bits (435), Expect = 0.0
Identities = 546/579 (94%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
|||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggaatacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcccggggttccgcctgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacatcgaacccgttcctggggaagaggatcaatatatctgttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagatctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
|| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 421 cctcctgcttatgcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagtcgaaagggat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcatgttatgagtgt 576
>emb| AJ746270.1 | Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for
ribulose bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 862 bits (435), Expect = 0.0
Identities = 546/579 (94%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttattacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||
Sbjct: 241 aaagggcgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgcttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
|||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtacgg-ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb| AJ746266.1 | Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1392
Score = 862 bits (435), Expect = 0.0
Identities = 546/579 (94%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttattacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||
Sbjct: 241 aaagggcgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgcttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
|||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtacgg-ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb| AJ746179.1 | Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1364
Score = 862 bits (435), Expect = 0.0
Identities = 546/579 (94%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttattacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcagcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||
Sbjct: 241 aaagggcgatgctatcacattgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
|||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtacgg-ccgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>gb| AY395555.1 | Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1287
Score = 860 bits (434), Expect = 0.0
Identities = 503/522 (96%), Gaps = 3/522 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 94 tataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagca 153
|||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tataaattgacttactacactccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagca 60
Query: 154 ttccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgcc 213
|||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ttccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgcc 120
Query: 214 gaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgt 273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgt 180
Query: 274 tacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgt 333
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 181 tacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgt 240
Query: 334 tatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcc 393
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcc 300
Query: 394 attgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacga 453
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 301 attgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacga 360
Query: 454 attccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaaga 513
|||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 attcccgttgcttatgcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaaga 420
Query: 514 gataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgg 573
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgg 478
Query: 574 gattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 gattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 519
>emb| AJ746301.1 | Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1287
Score = 860 bits (434), Expect = 0.0
Identities = 503/522 (96%), Gaps = 3/522 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 94 tataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagca 153
|||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tataaattgacttactacactccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagca 60
Query: 154 ttccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgcc 213
|||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ttccgagtaactcctcagcctggggttcccccggaagaagcaggggctgcagtagctgcc 120
Query: 214 gaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgt 273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgt 180
Query: 274 tacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgt 333
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 181 tacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacaaccaatggatctgt 240
Query: 334 tatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttcc 393
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttcc 300
Query: 394 attgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacga 453
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 301 attgtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacga 360
Query: 454 attccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaaga 513
|||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 attcccgttgcttatgcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaaga 420
Query: 514 gataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgg 573
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgg 478
Query: 574 gattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 gattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 519
>emb| AJ746296.1 | Nardus stricta chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1297
Score = 860 bits (434), Expect = 0.0
Identities = 515/538 (95%), Gaps = 3/538 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 78 agctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatac 137
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1 agctggtgttacagattataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatac 60
Query: 138 tgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcagg 197
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 tgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccgccggaagaagcagg 120
Query: 198 ggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggact 257
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggctgctgtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggact 180
Query: 258 taccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaaga 317
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 taccagtcttgatcgttacaaaggacgctgctatcacatcgagcctgttgctggggaaga 240
Query: 318 cagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttac 377
| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 241 aaatcaatttatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttac 300
Query: 378 taacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacg 437
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 taacatgtttacttccattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacg 360
Query: 438 tttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatgg 497
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct: 361 tttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggtccacctcatgg 420
Query: 498 tatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtact 557
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 421 tatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtact 478
Query: 558 attaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 attaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 535
>gb| AY632362.1 | Buergersiochloa bambusoides ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial
cds; plastid
Length = 1171
Score = 858 bits (433), Expect = 0.0
Identities = 523/549 (95%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtatgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttccgccc 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 gctggggaagaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagctcta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg-ccgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb| AC135419.2 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 5 clone OSJNBa0044P19,
complete sequence
Length = 176917
Score = 858 bits (433), Expect = 0.0
Identities = 572/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 142829 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 142887
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 142888 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccagagta 142947
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 142948 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgaataactcctcagccgggggttcc 143007
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 143008 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgctgaatcttctactggtacatggacaactgt 143067
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 143068 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 143127
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 143128 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 143187
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 143188 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 143247
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct: 143248 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccttacttattcaaaaactttcta 143307
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 143308 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 143366
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 143367 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 143424
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 143425 atgttatgagtgt 143437
>gb| AC135429.2 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 5 clone P0636F09,
complete sequence
Length = 177374
Score = 858 bits (433), Expect = 0.0
Identities = 572/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 85406 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 85464
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 85465 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccagagta 85524
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 85525 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgaataactcctcagccgggggttcc 85584
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 85585 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgctgaatcttctactggtacatggacaactgt 85644
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 85645 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 85704
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 85705 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 85764
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 85765 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 85824
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct: 85825 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccttacttattcaaaaactttcta 85884
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 85885 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 85943
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 85944 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 86001
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 86002 atgttatgagtgt 86014
>dbj| AP008211.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 5, complete
sequence
Length = 29737217
Score = 858 bits (433), Expect = 0.0
Identities = 572/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 20829605 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 20829663
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 20829664 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccagagta 20829723
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 20829724 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgaataactcctcagccgggggttcc 20829783
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 20829784 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgctgaatcttctactggtacatggacaactgt 20829843
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 20829844 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 20829903
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 20829904 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 20829963
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 20829964 agagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 20830023
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct: 20830024 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccttacttattcaaaaactttcta 20830083
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 20830084 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 20830142
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 20830143 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 20830200
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 20830201 atgttatgagtgt 20830213
>emb| X04789.1 |CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase
(clone pCT-1)
Length = 1989
Score = 858 bits (433), Expect = 0.0
Identities = 572/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 413
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 414 aagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 473
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 474 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 533
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 534 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 593
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 594 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 653
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 654 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 713
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 714 agagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagc 773
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 774 cctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 833
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||
Sbjct: 834 aggtccgcctcatggtatggaagttgaaagggataagttgaacaaatacgg-tcgtcctt 892
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 893 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 950
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 951 atgttatgagtgt 963
>gb| U31440.1 |PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial
cds
Length = 1344
Score = 852 bits (430), Expect = 0.0
Identities = 519/545 (95%), Gaps = 3/545 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||
Sbjct: 1 gttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttattacactccagagtacgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct: 61 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccccct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggagctgcagtagctgcngaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaagggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaggaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggc 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-ccgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatga 611
|||||
Sbjct: 538 tatga 542
>dbj| AP008218.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete
sequence
Length = 27566993
Score = 850 bits (429), Expect = 0.0
Identities = 571/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5613110 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 5613168
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 5613169 aaatgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 5613228
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 5613229 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 5613288
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5613289 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 5613348
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 5613349 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 5613408
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5613409 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 5613468
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct: 5613469 agagggttttgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacatatttggtttcaaagc 5613528
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5613529 cctacgtgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 5613588
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||
Sbjct: 5613589 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaata-cgatcgtcctt 5613647
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 5613648 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 5613705
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 5613706 atgttatgagtgt 5613718
>gb| DP000011.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence
Length = 27492551
Score = 850 bits (429), Expect = 0.0
Identities = 571/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5613099 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 5613157
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 5613158 aaatgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 5613217
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 5613218 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 5613277
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5613278 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 5613337
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 5613338 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 5613397
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5613398 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 5613457
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct: 5613458 agagggttttgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacatatttggtttcaaagc 5613517
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5613518 cctacgtgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 5613577
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||
Sbjct: 5613578 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaata-cgatcgtcctt 5613636
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 5613637 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 5613694
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 5613695 atgttatgagtgt 5613707
>emb| BX000560.1 |CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from
chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of
Oryza sativa (rice), complete sequence
Length = 139684
Score = 850 bits (429), Expect = 0.0
Identities = 571/613 (93%), Gaps = 4/613 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 aattcttaattcaagnagttgtagggagggacttatgtcaccacaaacagaaactaaagc 62
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39775 aattcttaattcatg-agttgtagggagggacgtatgtcaccacaaacagaaactaaagc 39717
Query: 63 aggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagta 122
| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 39716 aaatgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagta 39657
Query: 123 tgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttcc 182
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 39656 cgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgggggttcc 39597
Query: 183 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39596 gcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgt 39537
Query: 243 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcc 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 39536 ttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggccgatgctatcacatcgagcc 39477
Query: 303 tgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttga 362
|||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39476 cgttgttggggaggataatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacctatttga 39417
Query: 363 ggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagc 422
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct: 39416 agagggttttgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacatatttggtttcaaagc 39357
Query: 423 cctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttcca 482
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39356 cctacgtgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaaaactttcca 39297
Query: 483 aggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctt 542
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||
Sbjct: 39296 aggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaaata-cgatcgtcctt 39238
Query: 543 tattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagc 602
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 39237 tatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatggtag-agc 39180
Query: 603 gtgttatgagtgt 615
||||||||||||
Sbjct: 39179 atgttatgagtgt 39167
>gb| DQ005609.1 | Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1393
Score = 846 bits (427), Expect = 0.0
Identities = 520/547 (95%), Gaps = 3/547 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 65 gtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatg 124
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
Sbjct: 1 gtgttggatttaaagccggtgttaaagattataaattgacttattacactccagagtacg 60
Query: 125 aaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgc 184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct: 61 aaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttcccc 120
Query: 185 ccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgttt 244
| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ctgaagaagcaggagctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgttt 180
Query: 245 ggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctg 304
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 181 ggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccg 240
Query: 305 ttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgagg 364
|| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 241 ttcctggggatgaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaag 300
Query: 365 agggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccc 424
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 301 agggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagccc 360
Query: 425 tacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaag 484
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaag 420
Query: 485 gcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtccttta 544
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 421 gtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-ccgtccttta 479
Query: 545 ttggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgt 604
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 480 tt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgt 537
Query: 605 gttatga 611
|||||||
Sbjct: 538 gttatga 544
>emb| AJ746295.1 | Molinia caerulea chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1309
Score = 846 bits (427), Expect = 0.0
Identities = 529/559 (94%), Gaps = 3/559 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 taaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacccc 116
||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 taaagcaagtgttggatttaaagccggtgttaaggattataaattgacttactacacccc 60
Query: 117 agagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctgg 176
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct: 61 ggagtacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccgg 120
Query: 177 ggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggac 236
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggttccgcctgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggac 180
Query: 237 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacat 240
Query: 297 cgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacct 356
|||||| ||| ||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cgagcccgttcctggggacgaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacct 300
Query: 357 atttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggtt 416
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 301 atttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggttt 360
Query: 417 caaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaac 476
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 361 caaagccctacgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaac 420
Query: 477 tttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggccc 536
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 421 tttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-cc 479
Query: 537 gtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggt 596
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 480 gtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggt 538
Query: 597 agaagcgtgttatgagtgt 615
|| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ag-agcgtgttatgagtgt 556
>emb| AJ746271.1 | Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1409
Score = 844 bits (426), Expect = 0.0
Identities = 531/562 (94%), Gaps = 3/562 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 54 aactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 113
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 aactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacac 60
Query: 114 cccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 173
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 61 cccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 120
Query: 174 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 233
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gggggttccgcccgaagaagccggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 180
Query: 234 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 240
Query: 294 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 353
||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 catcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattaga 300
Query: 354 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 413
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 cctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 360
Query: 414 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaa 473
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaa 420
Query: 474 aactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg 533
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct: 421 aactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg 480
Query: 534 cccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattat 593
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 -ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattat 538
Query: 594 ggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ggtag-agcgtgttatgagtgt 559
>emb| AJ746269.1 | Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1385
Score = 844 bits (426), Expect = 0.0
Identities = 531/562 (94%), Gaps = 3/562 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 54 aactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 113
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 aactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacac 62
Query: 114 cccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 173
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 63 cccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 122
Query: 174 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 233
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 gggggttccgcccgaagaagccggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 182
Query: 234 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 242
Query: 294 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 353
||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 catcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattaga 302
Query: 354 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 413
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 cctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 362
Query: 414 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaa 473
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 363 tttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaa 422
Query: 474 aactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg 533
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct: 423 aactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg 482
Query: 534 cccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattat 593
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 483 -ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattat 540
Query: 594 ggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 541 ggtag-agcgtgttatgagtgt 561
>gb| AY640153.1 | Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit gene, partial cds; chloroplast
Length = 1344
Score = 842 bits (425), Expect = 0.0
Identities = 521/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 1 gttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
|||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaagaaagtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccacctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 480 gggg-tgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>emb| AJ784836.1 | Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1361
Score = 842 bits (425), Expect = 0.0
Identities = 530/561 (94%), Gaps = 3/561 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 60
Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174
|| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 61 ccggaatacgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccc 120
Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggggttccgcctgaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatgg 180
Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 240
Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354
||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 241 atcgaacccgttcctggggaagacagtcaatatatctgttatatagcttatccattagat 300
Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttcaattgtgggtaacgtatttggt 360
Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||
Sbjct: 361 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctgcttatgcaaaa 420
Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 actttccaaggtccacctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg- 479
Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 480 tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattatg 538
Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 gtag-agcgtgttatgagtgt 558
>emb| AJ746289.1 | Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1344
Score = 842 bits (425), Expect = 0.0
Identities = 521/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaggaaagtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb| U88405.1 |EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial
cds
Length = 1344
Score = 842 bits (425), Expect = 0.0
Identities = 521/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaggaaagtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb| U31379.1 |MPU31379 Monachather paradoxus ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial
cds
Length = 1344
Score = 842 bits (425), Expect = 0.0
Identities = 521/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaagaggatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb| AY632365.1 | Melica cupanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid
Length = 1267
Score = 841 bits (424), Expect = 0.0
Identities = 496/516 (96%), Gaps = 3/516 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 100 ttgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccga 159
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccga 60
Query: 160 gtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatct 219
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggagctgcagtagctgccgaatct 120
Query: 220 tctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaa 279
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tctactggtacatggacaacagtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaa 180
Query: 280 ggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgta 339
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct: 181 ggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagatggccaatggatcgcttatgta 240
Query: 340 gcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtg 399
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgta 300
Query: 400 ggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccc 459
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct: 301 ggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaagatctacgaattccc 360
Query: 460 cctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataag 519
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagataag 420
Query: 520 ttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattat 579
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattat 478
Query: 580 ccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 ccgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 513
>gb| AY691638.1 | Pyrrhanthera exigua ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1347
Score = 839 bits (423), Expect = 0.0
Identities = 531/563 (94%), Gaps = 3/563 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 49 acagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttac 108
||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acagagactaaagcaggtgttggatttaaagccggtgttaaagattataaattgacttat 60
Query: 109 tacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcct 168
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 61 tacactccagagtacgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcct 120
Query: 169 cagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggt 228
|||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 121 cagcctggggttccccctgaagaagcaggagctgcagtagctgcggaatcttctactggt 180
Query: 229 acatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 288
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggacaactgtttggactgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgc 240
Query: 289 tatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatcca 348
|||||||||||||| ||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 tatcacatcgagcccgttcctggggatgaagggcaatatatctgttatgtagcttaccca 300
Query: 349 ttagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgta 408
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 301 ttagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaatgta 360
Query: 409 tttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttat 468
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 361 tttggtttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttat 420
Query: 469 tcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaag 528
||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 421 tcaaaaactttccaaggtccgcctcacggtatccaagttgaaagggataagttgaacaag 480
Query: 529 tatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 588
||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatgg-ccgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaa 538
Query: 589 attatggtagaagcgtgttatga 611
|||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 539 attatggtag-agcgtgttatga 560
>gb| AY395539.1 | Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast
Length = 1309
Score = 839 bits (423), Expect = 0.0
Identities = 501/523 (95%), Gaps = 3/523 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 93 ttataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagc 152
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagc 60
Query: 153 attccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgc 212
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 61 attccgagtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcgggggctgcagtagctgc 120
Query: 213 cgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcg 272
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgaatcttcgactggtacatggacaacagtttggactgacggacttaccagtcttgatcg 180
Query: 273 ttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctg 332
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct: 181 ttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagagggccaatggatcgc 240
Query: 333 ttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttc 392
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttc 300
Query: 393 cattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacg 452
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 301 cattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacg 360
Query: 453 aattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaag 512
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aattccccctacttattcaaaaactttccaagggccgcctcatggtatccaagttgaaag 420
Query: 513 agataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattg 572
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 agataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattg 478
Query: 573 ggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 ggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 520
>emb| AJ746297.1 | Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 839 bits (423), Expect = 0.0
Identities = 543/579 (93%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
|||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcagccgggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||
Sbjct: 241 aaaggccgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaaatacgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct: 539 tatctgcaaaaaattatggtag-agcatgttatgagtgt 576
>emb| AJ746290.1 | Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1309
Score = 839 bits (423), Expect = 0.0
Identities = 501/523 (95%), Gaps = 3/523 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 93 ttataaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagc 152
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttataaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagc 60
Query: 153 attccgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgc 212
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 61 attccgagtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcgggggctgcagtagctgc 120
Query: 213 cgaatcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcg 272
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgaatcttcgactggtacatggacaacagtttggactgacggacttaccagtcttgatcg 180
Query: 273 ttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctg 332
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct: 181 ttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagagggccaatggatcgc 240
Query: 333 ttatgtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttc 392
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ttatgtagcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttc 300
Query: 393 cattgtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacg 452
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 301 cattgtaggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacg 360
Query: 453 aattccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaag 512
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aattccccctacttattcaaaaactttccaagggccgcctcatggtatccaagttgaaag 420
Query: 513 agataagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattg 572
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 agataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattg 478
Query: 573 ggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 ggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 520
>emb| AJ746275.1 | Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1428
Score = 839 bits (423), Expect = 0.0
Identities = 543/579 (93%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttcaagctggtgttaaggattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcagccgggggttccgcccgaagaagctggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
|||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||| ||| ||||
Sbjct: 241 aaaggacgatgctatcacattgagcccgttgttggggaagaaaatcaatatatcgcttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
|| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct: 361 gtaggtaacgtatttggtttcaaagctctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 421 cccactacttactcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
|||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaagtacgg-gcgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tatctgcaaaaaattatggtag-agcgtgttatgagtgt 576
>emb| AJ746272.1 | Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1415
Score = 837 bits (422), Expect = 0.0
Identities = 533/566 (94%), Gaps = 3/566 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 cagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttact 109
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct: 1 cagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttatt 60
Query: 110 acaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctc 169
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 61 acaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctc 120
Query: 170 agcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggta 229
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agcccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggta 180
Query: 230 catggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgct 289
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 181 catggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaagggcgatgct 240
Query: 290 atcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccat 349
||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct: 241 atcacatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgcttatgtagcttatccat 300
Query: 350 tagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtat 409
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtat 360
Query: 410 ttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttatt 469
|||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttatt 420
Query: 470 caaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagt 529
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 421 caaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagt 480
Query: 530 atggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaa 589
| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 acgg-ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaa 538
Query: 590 ttatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 ttacggtag-agcgtgttatgagtgt 563
>emb| AJ746284.1 | Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1344
Score = 835 bits (421), Expect = 0.0
Identities = 520/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaagaggatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccagggt 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>emb| AJ746254.1 | Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for
ribulose bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1376
Score = 835 bits (421), Expect = 0.0
Identities = 529/561 (94%), Gaps = 3/561 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 actaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacc 62
Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct: 63 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcatttcgagtaactcctcagccg 122
Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 123 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 182
Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 183 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 242
Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354
||||||||||||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 243 atcgagcctgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagac 302
Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 303 ctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 362
Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||
Sbjct: 363 ttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactgcttattcaaaa 422
Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct: 423 actttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg- 481
Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 ccgtcctttctt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 540
Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||||||||||||||
Sbjct: 541 gtag-agcgtgttatgagtgt 560
>emb| AJ746175.1 | Bambusa emeiensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 707
Score = 835 bits (421), Expect = 0.0
Identities = 529/561 (94%), Gaps = 3/561 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 actaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacc 60
Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 61 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccg 120
Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 180
Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 240
Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354
|||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 atcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagac 300
Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 360
Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 361 ttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactacttattcaaaa 420
Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct: 421 actttcctaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg- 479
Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 538
Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 gtag-agcgtgttatgagtgt 558
>emb| AJ746171.1 | Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1339
Score = 835 bits (421), Expect = 0.0
Identities = 529/561 (94%), Gaps = 3/561 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 actaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacc 61
Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 62 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccg 121
Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 181
Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 241
Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354
|||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 atcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagac 301
Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 ctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 361
Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 362 ttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactacttattcaaaa 421
Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct: 422 actttcctaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg- 480
Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 539
Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||||||||||||||
Sbjct: 540 gtag-agcgtgttatgagtgt 559
>emb| AJ746170.1 | Bambusa multiplex chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 707
Score = 835 bits (421), Expect = 0.0
Identities = 529/561 (94%), Gaps = 3/561 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 55 actaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacacc 114
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 actaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacacc 60
Query: 115 ccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcct 174
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 61 ccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccg 120
Query: 175 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgg 180
Query: 235 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcac 240
Query: 295 atcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagac 354
|||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 atcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagac 300
Query: 355 ctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggg 414
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggt 360
Query: 415 ttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaa 474
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 361 ttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactacttattcaaaa 420
Query: 475 actttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggc 534
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct: 421 actttcctaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg- 479
Query: 535 ccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 594
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatg 538
Query: 595 gtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 gtag-agcgtgttatgagtgt 558
>gb| U31360.1 |ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit
(rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1344
Score = 835 bits (421), Expect = 0.0
Identities = 520/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaagaggatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccagggt 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb| U13226.1 |ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large
subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for
chloroplast product
Length = 1398
Score = 835 bits (421), Expect = 0.0
Identities = 520/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaagaggatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccagggt 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb| U88406.1 |SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial
cds
Length = 1344
Score = 835 bits (421), Expect = 0.0
Identities = 520/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 1 gttggatttcaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaggaaagtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ctcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggaatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb| U31102.1 |DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding
chloroplast protein, partial cds
Length = 1344
Score = 835 bits (421), Expect = 0.0
Identities = 517/545 (94%), Gaps = 3/545 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||
Sbjct: 1 gttggatttaaagctggtgttaaagattataaattgacttattacactccagagtacgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct: 61 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcctggggttccccct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaggaagcaggagctgcagtagctgcagaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaggaagatcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-ccgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatga 611
|||||
Sbjct: 538 tatga 542
>emb| AJ746265.1 | Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1413
Score = 833 bits (420), Expect = 0.0
Identities = 531/564 (94%), Gaps = 3/564 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 52 gaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactac 111
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 1 gaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttattac 60
Query: 112 accccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcag 171
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 61 accccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcag 120
Query: 172 cctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtaca 231
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cccggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtaca 180
Query: 232 tggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctat 291
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 181 tggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaagggcgatgctat 240
Query: 292 cacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccatta 351
||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cacatcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgcttatgtagcttatccatta 300
Query: 352 gacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtattt 411
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtattt 360
Query: 412 gggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattca 471
|| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ggtttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattca 420
Query: 472 aaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtat 531
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 421 aaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtac 480
Query: 532 ggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaatt 591
|| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gg-ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaatt 538
Query: 592 atggtagaagcgtgttatgagtgt 615
| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 acggtag-agcgtgttatgagtgt 561
>emb| AJ746174.1 | Dendrocalamus brandisii chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 703
Score = 833 bits (420), Expect = 0.0
Identities = 528/560 (94%), Gaps = 3/560 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 56 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 115
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ctaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccc 60
Query: 116 cagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 175
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct: 61 cggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgg 120
Query: 176 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 180
Query: 236 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 240
Query: 296 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 355
||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacc 300
Query: 356 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 415
||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 301 tatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 360
Query: 416 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaa 475
||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 361 tcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactacttattcaaaaa 420
Query: 476 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcc 535
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
Sbjct: 421 ctttcctaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg-c 479
Query: 536 cgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 595
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 cgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 538
Query: 596 tagaagcgtgttatgagtgt 615
||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tag-agcgtgttatgagtgt 557
>emb| AJ746173.1 | Dendrocalamus barbatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose
bisphosphate carboxylase large chain
Length = 702
Score = 833 bits (420), Expect = 0.0
Identities = 528/560 (94%), Gaps = 3/560 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 56 ctaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccc 115
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ctaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttactacaccc 60
Query: 116 cagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctg 175
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct: 61 cggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagccgg 120
Query: 176 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatgga 180
Query: 236 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 caactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcaca 240
Query: 296 tcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacc 355
||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatatatcgcttatgtagcttatccattagacc 300
Query: 356 tatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggt 415
||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 301 tatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtt 360
Query: 416 tcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaa 475
||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 361 tcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattcccactacttattcaaaaa 420
Query: 476 ctttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcc 535
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
Sbjct: 421 ctttcctaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg-c 479
Query: 536 cgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 595
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 cgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatgg 538
Query: 596 tagaagcgtgttatgagtgt 615
||| ||||||||||||||||
Sbjct: 539 tag-agcgtgttatgagtgt 557
>ref| NM_195989.1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large
subunit from chromosome 10 chloroplast insertion
(OSJNBb0075K12.39), mRNA
Length = 1434
Score = 831 bits (419), Expect = 0.0
Identities = 542/579 (93%), Gaps = 3/579 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattat 96
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1 atgtcaccacaaacagaaactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattat 60
Query: 97 aaattgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattc 156
|||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aaattgacttactacaccccggagtacgaaaccaaggacactgatatcttggcagcattc 120
Query: 157 cgagtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 216
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgagtaactcctcagccgggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaa 180
Query: 217 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tcttctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttac 240
Query: 277 aaaggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttat 336
||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| ||||
Sbjct: 241 aaaggccgatgctatcacatcgagcccgttgttggggaggataatcaatatatcgcttat 300
Query: 337 gtagcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccatt 396
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtagcttatccattagacctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccatt 360
Query: 397 gtgggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaatt 456
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||
Sbjct: 361 gtgggtaacgtatttggtttcaaagccctacgcgctctacttctggaggatctgcgaatt 420
Query: 457 ccccctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagat 516
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 421 ccccctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggat 480
Query: 517 aagttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggat 576
||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttgaacaaatacgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggat 538
Query: 577 tatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
|||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct: 539 tatctgcaaaaaattatggtag-agcatgttatgagtgt 576
>emb| AJ746259.1 | Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for
ribulose bisphosphate carboxylase large chain
Length = 1427
Score = 829 bits (418), Expect = 0.0
Identities = 529/562 (94%), Gaps = 3/562 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 54 aactaaagcaggtgttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacac 113
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 17 aactaaagcaagtgttggatttaaagctggtgttaaggattataaattgacttattacac 76
Query: 114 cccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcc 173
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 77 cccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcc 136
Query: 174 tggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 233
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137 cggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatg 196
Query: 234 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatca 293
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 197 gacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaagggcgatgctatca 256
Query: 294 catcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattaga 353
||||||||| |||| |||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 257 catcgagcccgttgttggggaggaaaatcaatttatcgcttatgtagcttatccattaga 316
Query: 354 cctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 413
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 317 cctatttgaagagggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgg 376
Query: 414 gttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaa 473
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 377 tttcaaagccctacgcgctctacgtctggaggatctgcgaattccccctacttattcaaa 436
Query: 474 aactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatgg 533
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct: 437 aactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtacgg 496
Query: 534 cccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattat 593
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 497 -ccgtccttt-tttgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattac 554
Query: 594 ggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 555 ggtag-agcgtgttatgagtgt 575
>gb| U31438.1 |MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial
cds
Length = 1344
Score = 827 bits (417), Expect = 0.0
Identities = 519/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||
Sbjct: 1 gttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttattacactccggaatacgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttactagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaggaaggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb| U31439.1 |MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate
carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene,
chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial
cds
Length = 1344
Score = 827 bits (417), Expect = 0.0
Identities = 519/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 1 gttggatttaaagccggtgttaaggattataaattgacttactacaccccggagtacgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggacgatggtcaatatatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctactacttattcaaaaactttccaaggt 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-ccgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb| U31100.1 |CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding
chloroplast protein, partial cds
Length = 1344
Score = 827 bits (417), Expect = 0.0
Identities = 519/549 (94%), Gaps = 3/549 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 67 gttggatttcaagctggtgttaaagattataaattgacttactacaccccagagtatgaa 126
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct: 1 gttggatttcaagccggtgttaaagattataaattgacttactacactccggagtacgaa 60
Query: 127 actaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaagtcctcagcctggggttccgccc 186
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct: 61 accaaggatactgatatcttggcagcattccgagtaactcctcagcccggggttccgcct 120
Query: 187 gaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 246
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagaagcaggggctgcagtagctgcggaatcttctactggtacatggacaactgtttgg 180
Query: 247 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacatcgagcctgtt 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct: 181 actgatggacttaccagtcttgatcgttacaaaggacgatgctatcacattgagcccgtt 240
Query: 307 gctggggaagacagccaatggatctgttatgtagcttatccattagacctatttgaggag 366
|||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 cctggggaagaaagtcaatatatctgttatatagcttatccattagacctatttgaagag 300
Query: 367 ggttccgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttgggttcaaagcccta 426
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 ggttctgttactaacatgtttacttccattgtgggtaacgtatttggtttcaaagcccta 360
Query: 427 cgtgctctacgtttggaggatctacgaattccccctacttattcaaaaactttccaaggc 486
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgcgctctacgtttggaggatctacgaattcctcctacttattcaaaaactttccaaggt 420
Query: 487 ccgcctcatggtatccaagttgaaagagataagttgaacaagtatggcccgtcctttatt 546
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 421 ccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt 479
Query: 547 ggggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattatggtagaagcgtgt 606
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct: 480 -gggatgtactattaaaccaaaattgggattatctgcaaaaaattacggtag-agcgtgt 537
Query: 607 tatgagtgt 615
|||||||||
Sbjct: 538 tatgagtgt 546
>gb| AY632364.1 | Glyceria grandis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase
large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid
Length = 1267
Score = 825 bits (416), Expect = 0.0
Identities = 494/516 (95%), Gaps = 3/516 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 100 ttgacttactacaccccagagtatgaaactaaggatactgatatcttggcagcattccga 159
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttgacttactacaccccggagtatgaaaccaaggatactgatatcttggcagcattccga 60
Query: 160 gtaagtcctcagcctggggttccgcccgaagaagcaggggctgcagtagctgccgaatct 219
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gtaactcctcagcctggggttccgcccgaagaagcgggggctgcagtagctgccgaatct 120
Query: 220 tctactggtacatggacaactgtttggactgatggacttaccagtcttgatcgttacaaa 279
|| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tcgactggtacatggacaacagtttggactgacggacttaccagtcttgatcgttacaaa 180
Query: 280 ggacgatgctatcacatcgagcctgttgctggggaagacagccaatggatctgttatgta 339
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct: 181 ggacgatgctatcacatcgagcctgttcctggggaagagggccaatggatcgcttatgta 240
Query: 340 gcttatccattagacctatttgaggagggttccgttactaacatgtttacttccattgtg 399
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gcttatccattagacctatttgaagagggttccgttactaacatgtttacttccattgta 300
Query: 400 ggtaacgtatttgggttcaaagccctacgtgctctacgtttggaggatctacgaattccc 459
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ggtaacgtatttggtttcaaagccctacgtgctctacgtctggaggatctacgaattccc 360
Query: 460 cctacttattcaaaaactttccaaggcccgcctcatggtatccaagttgaaagagataag 519
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cctacttattcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagagataag 420
Query: 520 ttgaacaagtatggcccgtcctttattggggatgtactattaaaccaaaattgggattat 579
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ttgaacaagtatgg-tcgtcctttatt-gggatgtactattaaaccaaaattgggattat 478
Query: 580 ccgcaaaaaattatggtagaagcgtgttatgagtgt 615
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 479 ccgcaaaaaattacggtag-agcgtgttatgagtgt 513
Database: nt
Posted date: May 29, 2006 11:10 AM
Number of letters in database: 3,984,495,279
Number of sequences in database: 917,343
Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01
Posted date: May 29, 2006 11:16 AM
Number of letters in database: 3,988,174,986
Number of sequences in database: 835,257
Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02
Posted date: May 29, 2006 11:21 AM
Number of letters in database: 3,991,246,324
Number of sequences in database: 771,481
Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03
Posted date: May 29, 2006 11:27 AM
Number of letters in database: 3,990,718,311
Number of sequences in database: 977,174
Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04
Posted date: May 29, 2006 11:29 AM
Number of letters in database: 1,278,410,368
Number of sequences in database: 400,813
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 4,921,215
Number of Sequences: 3902068
Number of extensions: 4921215
Number of successful extensions: 176934
Number of sequences better than 10.0: 16909
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 16411
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 503
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 123983
Number of HSP's gapped (non-prelim): 34576
length of query: 615
length of database: 17,233,045,268
effective HSP length: 23
effective length of query: 592
effective length of database: 17,143,297,704
effective search space: 10148832240768
effective search space used: 10148832240768
T: 0
A: 0
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 20 (40.1 bits)