Clone Name | rbasd26j11 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 553/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 553/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 553/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 920 agaagtaagccattg 906
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 920 agaagtaagccattg 906
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctakttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 550/553 (99%), Gaps = 2/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1518 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 551 aagtaagccattg 563 ||||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattg 968
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 920 agaagtaagccattg 906
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 550/553 (99%), Gaps = 2/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1456 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1339 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1279 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 551 aagtaagccattg 563 ||||||||||||| Sbjct: 918 aagtaagccattg 906
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 872 agaagtaagccattg 858
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 550/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkagstaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 |||||||| |||||| Sbjct: 982 agaagtaaaccattg 968
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 |||||||| |||||| Sbjct: 982 agaagtaaaccattg 968
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 |||||||| |||||| Sbjct: 982 agaagtaaaccattg 968
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 |||||||| |||||| Sbjct: 982 agaagtaaaccattg 968
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 |||||||| |||||| Sbjct: 982 agaagtaaaccattg 968
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 |||||||| |||||| Sbjct: 982 agaagtaaaccattg 968
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 550/555 (99%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccaggagcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnntaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1412 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1411 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1352 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1351 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1292 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1232 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1172 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1112 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1052 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 992 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 932 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 931 agaagtaggccattg 917
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1190 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1189 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1130 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1129 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1070 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1010 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 950 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 890 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 830 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 770 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 769 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 710 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 709 agaagtaggccattg 695
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1190 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1189 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1130 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1129 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1070 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1010 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 950 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 890 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 830 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 770 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 769 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 710 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 709 agaagtaggccattg 695
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatatttcgcaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 982 agaagtaggccattg 968
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 982 agaagtaggccattg 968
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 982 agaagtaggccattg 968
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 982 agaagtaggccattg 968
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 56319 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 56262 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 56261 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 56202 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 56201 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 56142 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56141 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 56082 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56081 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 56022 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56021 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 55962 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55961 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 55902 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55901 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 55842 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55841 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 55782 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 55781 agaagtaggccattg 55767
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1505 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1448 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1447 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1388 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1387 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1328 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1268 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1208 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1148 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1088 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1028 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 968 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 967 agaagtaggccattg 953
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaacncgaatntgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacanntggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 982 agaagtaagccattg 968
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 982 agaagtaggccattg 968
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 982 agaagtaggccattg 968
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 982 agaagtaggccattg 968
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 982 agaagtaggccattg 968
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcatta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatt-gccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgccgctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacann-ctgcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 872 agaagtaggccattg 858
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnncccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 872 agaagtaggccattg 858
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1462 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1461 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcatta 1402 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1401 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1342 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1282 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1222 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1162 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1042 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 982 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 981 agaagtaggccattg 967
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1462 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1461 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcatta 1402 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1401 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1342 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1282 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1222 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1162 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1042 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 982 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 981 agaagtaggccattg 967
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1462 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1461 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcatta 1402 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1401 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1342 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1282 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1222 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1162 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1042 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 982 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 981 agaagtaggccattg 967
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1462 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1461 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcatta 1402 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1401 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1342 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1282 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1222 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1162 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1042 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 982 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 981 agaagtaggccattg 967
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1462 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1461 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcatta 1402 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1401 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1342 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1282 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1222 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1162 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1042 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 982 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 981 agaagtaggccattg 967
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1377 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1320 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1319 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1260 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1259 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1200 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1199 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1140 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1139 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1080 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1020 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctact 960 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 actgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 900 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 899 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 840 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 839 agaagtaggccattg 825
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 545/553 (98%), Gaps = 2/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1291 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1171 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1111 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 551 aagtaagccattg 563 ||||| ||||||| Sbjct: 870 aagtaggccattg 858
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 545/553 (98%), Gaps = 2/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1518 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1401 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1341 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 551 aagtaagccattg 563 ||||| ||||||| Sbjct: 980 aagtaggccattg 968
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 545/553 (98%), Gaps = 2/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1464 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1463 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1404 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1403 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1344 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1284 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1224 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1164 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1104 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1044 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 984 Query: 551 aagtaagccattg 563 ||||| ||||||| Sbjct: 983 aagtaggccattg 971
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 544/552 (98%), Gaps = 2/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 gaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccat 71 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 gaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccat 1319 Query: 72 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 131 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1318 ttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacga 1259 Query: 132 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 191 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1258 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1199 Query: 192 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1198 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 1139 Query: 252 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 1079 Query: 312 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 1019 Query: 372 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 959 Query: 432 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 491 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 gtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 899 Query: 492 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 898 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 839 Query: 552 agtaagccattg 563 |||| ||||||| Sbjct: 838 agtaggccattg 827
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 872 agaagtaggccattg 858
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcccccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 872 agaagtaggccattg 858
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1190 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1189 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1130 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| Sbjct: 1129 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggtgcatttccc 1070 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1010 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 950 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 890 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 830 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 770 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 769 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 710 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 709 agaagtaggccattg 695
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1462 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1461 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcatta 1402 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1401 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1342 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1282 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1222 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1162 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 tcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1042 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 982 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 981 agaagtaggccattg 967
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 544/553 (98%), Gaps = 2/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1464 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1463 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1404 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1403 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1344 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1284 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1224 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1164 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 gcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1104 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1044 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 984 Query: 551 aagtaagccattg 563 ||||| ||||||| Sbjct: 983 aagtaggccattg 971
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcatta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgctgccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 544/553 (98%), Gaps = 2/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1377 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1320 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1319 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1260 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1259 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1200 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1199 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1140 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1139 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacanctggcat 1080 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1020 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 960 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 900 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 899 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 840 Query: 551 aagtaagccattg 563 ||||| ||||||| Sbjct: 839 aagtaggccattg 827
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaanntgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcngctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 992 actgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagataatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtcaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 872 agaagtaagccattg 858
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 538/545 (98%), Gaps = 2/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1327 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1326 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1267 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1266 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1207 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1147 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1087 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1027 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 967 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 907 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 847 Query: 551 aagta 555 ||||| Sbjct: 846 aagta 842
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 544/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1462 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1461 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcatta 1402 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1401 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1342 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1341 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagrtttcg 1282 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1222 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1162 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 tcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaacttacctact 1102 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1042 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 982 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 981 agaagtaggccattg 967
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 538/545 (98%), Gaps = 2/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1327 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1326 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1267 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1266 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1207 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1147 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1087 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1027 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 967 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 907 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 847 Query: 551 aagta 555 ||||| Sbjct: 846 aagta 842
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1401 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1400 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1341 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1340 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1281 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttca 1221 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 gtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1161 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1101 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1041 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 981 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 921 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 920 agaagtaggccattg 906
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggccccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 872 agaagtaggccattg 858
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 543/553 (98%), Gaps = 2/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1464 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1463 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1404 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1403 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1344 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1284 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1224 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1164 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1104 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1044 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 atgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 984 Query: 551 aagtaagccattg 563 ||||| ||||||| Sbjct: 983 aagtaggccattg 971
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 542/553 (98%), Gaps = 2/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1464 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1463 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1404 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| Sbjct: 1403 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggtgcatttcccca 1344 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1284 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1224 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1164 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1104 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1044 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 984 Query: 551 aagtaagccattg 563 ||||| ||||||| Sbjct: 983 aagtaggccattg 971
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 541/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaacycgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1463 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1462 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgtta 1403 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1402 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1343 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcg 1283 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1282 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacnnngc 1223 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 atggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1163 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1103 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1043 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 983 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 982 agaagtaggccattg 968
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 528/536 (98%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 cgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 87 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 88 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 147 |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcgcgagcaagatcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1274 Query: 148 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 207 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 208 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 267 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 268 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1094 Query: 328 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 388 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 447 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1033 aacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacat 974 Query: 448 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 914 Query: 508 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 858
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 543/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1461 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactc 1404 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1403 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1344 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1343 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1284 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1283 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcg 1224 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1164 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1104 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 tcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1044 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 984 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 aaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacggtgaatgtga 924 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 923 agaagtaggccattg 909
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 543/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 872 agaagtaggccattg 858
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 540/551 (98%), Gaps = 2/551 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatt 72 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatt 1339 Query: 73 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 132 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1338 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgag 1279 Query: 133 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 192 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1278 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1219 Query: 193 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtca 1159 Query: 253 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatgg 1099 Query: 313 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 372 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgc 1039 Query: 373 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 432 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 gcaataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 979 Query: 433 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 492 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 taccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 919 Query: 493 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 859 Query: 553 gtaagccattg 563 ||||||||||| Sbjct: 858 gtaagccattg 848
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 497/498 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaagccattg 846
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 506/510 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 414 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 474 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 534 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 838
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 537/553 (97%), Gaps = 2/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1518 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttacg 1401 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1341 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctannnc 1101 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagctaatacacggaa 1041 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 551 aagtaagccattg 563 ||||| ||||||| Sbjct: 980 aagtaggccattg 968
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 541/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1390 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactc 1333 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 catttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcg 1153 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1093 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 853 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 852 agaagtaggccattg 838
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 541/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataacaccaggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 872 agaagtaggccattg 858
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 541/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 872 agaagtaggccattg 858
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 541/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1508 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactc 1451 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1450 catttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1391 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1390 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1331 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1330 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1271 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1211 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 atggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1151 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1150 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacctact 1091 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1031 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 971 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 970 agaagtaggccattg 956
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 496/498 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 850 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||| Sbjct: 849 tgaagaagtaagccattg 832
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 503/508 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 802
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 503/508 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 802
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 503/508 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 838
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 502/507 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 57 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 117 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 176 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 177 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 236 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 237 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 297 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 357 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 417 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 476 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 477 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 537 cggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaagtaggccattg 838
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 540/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1370 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactc 1313 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1312 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1253 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1252 cgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1193 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct: 1192 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcg 1133 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1132 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1073 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 aaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1013 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1012 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 953 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 893 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 892 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 833 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 832 agaagtaggccattg 818
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 540/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 agggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 872 agaagtaggccattg 858
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 540/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcgcaagcc-gcagctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttct 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||| | ||||||| Sbjct: 872 agaagcaggccattg 858
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 539/555 (97%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 ctcgaactcsaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1336 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1335 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgtta 1276 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1275 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1216 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct: 1215 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcg 1156 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1155 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1096 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1036 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 976 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacga 916 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 915 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtga 856 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 855 agaagtaggccattg 841
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 521/532 (97%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 32 ttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataat 91 |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaag-cagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataat 1310 Query: 92 ttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 151 |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1309 ttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 152 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 211 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 212 accaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 271 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 272 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 331 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 332 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 392 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatc 451 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatc 950 Query: 452 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 511 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 512 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 838
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 503/510 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 414 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 474 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 534 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 838
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 501/508 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 944 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 884 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 883 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 856
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 501/508 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 828
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 493/498 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattg 846
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 530/545 (97%), Gaps = 2/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaag 78 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaag 1328 Query: 79 ctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgta 138 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 ctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgta 1268 Query: 139 cacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtc 198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1267 cacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtc 1208 Query: 199 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctg 258 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctg 1148 Query: 259 gcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccc 318 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 gcatatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggataccc 1088 Query: 319 agtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaata 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 agtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaata 1028 Query: 379 aatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgg 968 Query: 439 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 967 cgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 908 Query: 499 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 907 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 848 Query: 559 cattg 563 ||||| Sbjct: 847 cattg 843
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 500/508 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 822
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 500/508 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 866 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 839
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 500/508 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 822
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 537/555 (96%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacga 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||||||||||| Sbjct: 872 agaagtaagccattg 858
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 492/498 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattg 846
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 501/510 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1349 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1290 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1230 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1170 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1110 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1050 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccct 990 Query: 414 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 473 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 930 Query: 474 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 870 Query: 534 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 869 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 840
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 501/510 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 414 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 473 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 474 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 534 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 868 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 839
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 518/532 (97%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 32 ttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataat 91 |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaag-cagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataat 1310 Query: 92 ttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 151 |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1309 ttcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 152 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 211 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 212 accaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 271 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 272 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 331 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 332 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 392 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatc 451 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatc 950 Query: 452 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 511 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 512 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 838
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 499/508 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 828
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 536/555 (96%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1394 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1337 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1336 catttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1277 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct: 1276 cgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccc 1217 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct: 1216 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcg 1157 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1097 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 atagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1037 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 977 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacga 917 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 916 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtga 857 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 856 agaagtaggccattg 842
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 532/547 (97%), Gaps = 4/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124746 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 124689 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124688 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 124629 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124628 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 124569 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 124568 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaagatttcg 124509 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 124508 gtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacacctggc 124450 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 124449 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaataaaatca 124391 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124390 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 124331 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124330 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 124271 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124270 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 124211 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 124210 agaagta 124204 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 532/547 (97%), Gaps = 4/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30219 ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 30162 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 30161 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 30102 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 30101 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 30042 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 30041 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaagatttcg 29982 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 29981 gtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacacctggc 29923 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 29922 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaataaaatca 29864 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29863 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 29804 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29803 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 29744 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 29743 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 29684 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 29683 agaagta 29677
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 491/498 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 866 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||| ||||||| Sbjct: 865 tgaagaagtaggccattg 848
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 500/510 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 414 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 473 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 933 Query: 474 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 873 Query: 534 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 872 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 843
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 502/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 51 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 110 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 111 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 170 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 171 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 230 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 231 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 290 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 291 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 351 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 410 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 411 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 470 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 471 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 530 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgc 891 Query: 531 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 ||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 858
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 493/502 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 62 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 121 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 122 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 181 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 182 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 241 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 242 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 302 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 361 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 362 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 422 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 481 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 482 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 542 aatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattg 846
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 498/508 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 822
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 520/536 (97%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 cgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 87 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1307 cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttga 1249 Query: 88 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 147 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1248 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1189 Query: 148 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 207 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1129 Query: 208 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 267 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1069 Query: 268 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 327 ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1009 Query: 328 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 387 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 tgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 949 Query: 388 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 889 Query: 448 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 507 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 gatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 829 Query: 508 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 828 tctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattg 773
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 495/504 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattg 858
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55512 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 55455 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 55454 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 55395 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55394 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 55335 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 55334 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 55275 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55274 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 55215 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 55155 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 55095 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55094 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 55035 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 55034 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 54975 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 54974 agaagta 54968
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55512 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 55455 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 55454 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 55395 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55394 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 55335 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 55334 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 55275 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55274 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 55215 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 55155 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 55095 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55094 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 55035 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 55034 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 54975 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 54974 agaagta 54968
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55460 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 55403 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 55402 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 55343 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55342 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 55283 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 55282 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 55223 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55222 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 55163 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 55103 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 55043 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55042 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 54983 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54982 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 54923 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 54922 agaagta 54916
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125801 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 125744 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 125743 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 125684 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 125683 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 125624 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 125623 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 125564 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 125563 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 125504 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125503 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 125444 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125443 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 125384 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125383 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 125324 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 125323 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 125264 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 125263 agaagta 125257 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30741 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 30684 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 30683 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 30624 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 30623 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 30564 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 30563 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 30504 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 30503 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 30444 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30443 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 30384 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30383 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 30324 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30323 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 30264 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 30263 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 30204 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 30203 agaagta 30197
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124828 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 124771 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124770 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 124711 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124710 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 124651 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 124650 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 124591 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 124590 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 124531 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124530 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 124471 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124470 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 124411 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124410 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 124351 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124350 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 124291 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 124290 agaagta 124284 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30247 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 30190 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 30189 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 30130 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 30129 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 30070 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 30069 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 30010 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 30009 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 29950 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29949 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 29890 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29889 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 29830 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29829 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 29770 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 29769 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 29710 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 29709 agaagta 29703
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124828 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 124771 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124770 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 124711 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124710 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 124651 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 124650 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 124591 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 124590 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 124531 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124530 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 124471 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124470 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 124411 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124410 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 124351 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124350 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 124291 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 124290 agaagta 124284 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30247 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 30190 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 30189 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 30130 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 30129 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 30070 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 30069 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 30010 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 30009 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 29950 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29949 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 29890 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29889 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 29830 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29829 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 29770 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 29769 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 29710 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 29709 agaagta 29703
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55504 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 55447 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 55446 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 55387 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55386 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 55327 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 55326 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 55267 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55266 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 55207 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55206 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 55147 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55146 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 55087 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55086 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 55027 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 55026 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 54967 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 54966 agaagta 54960
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 872 agaagta 866
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 535/555 (96%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacga 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 872 agaagtaggccattg 858
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 535/555 (96%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1340 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1339 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1280 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct: 1279 cgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccc 1220 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct: 1219 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcg 1160 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1159 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1100 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 atagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1040 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 980 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 actgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacga 920 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 919 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtga 860 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 859 agaagtaggccattg 845
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 535/555 (96%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1338 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1337 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1278 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct: 1277 cgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccc 1218 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct: 1217 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcg 1158 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1157 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1098 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 atagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1038 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 978 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 actgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacga 918 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 917 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtga 858 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 857 agaagtaggccattg 843
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 535/555 (96%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1352 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1292 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct: 1291 cgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccc 1232 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct: 1231 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcg 1172 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1171 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1112 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 atagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1052 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 992 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 actgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacga 932 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 931 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtga 872 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 871 agaagtaggccattg 857
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527160 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 33527217 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 33527218 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 33527277 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 33527278 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 33527337 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 33527338 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 33527397 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 33527398 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 33527457 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527458 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 33527517 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527518 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 33527577 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527578 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 33527637 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 33527638 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 33527697 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 33527698 agaagta 33527704
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72357 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 72414 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 72415 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 72474 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 72475 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 72534 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 72535 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 72594 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 72595 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 72654 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72655 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 72714 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72715 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 72774 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72775 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 72834 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 72835 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 72894 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 72895 agaagta 72901
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1408 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1407 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1348 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1347 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 1288 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 1287 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 1228 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1168 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1108 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1048 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 988 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 987 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 928 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 927 agaagta 921
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1151 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1150 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1091 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1090 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 1031 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 1030 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 971 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 970 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 911 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 851 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 791 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 731 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 730 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 671 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 670 agaagta 664
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55439 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 55382 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 55381 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 55322 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55321 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 55262 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 55261 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 55202 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55201 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 55142 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55141 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 55082 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55081 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 55022 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55021 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 54962 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54961 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 54902 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 54901 agaagta 54895
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 529/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1830 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1773 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1772 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1713 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1712 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 1653 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 1652 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 1593 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1592 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1533 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1473 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1413 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1353 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 1293 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 1292 agaagta 1286 Score = 58.0 bits (29), Expect = 3e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 490/498 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattg 846
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 499/510 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 414 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 473 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 935 Query: 474 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 875 Query: 534 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 874 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 845
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 cgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcgcaag-ctgcggctagttcaggactcca 1323 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1322 tttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacg 1263 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1262 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattccccca 1203 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1202 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggt 1143 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1142 cagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcat 1083 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 ggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatc 1023 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1022 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactac 963 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 903 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 902 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 843 Query: 551 aagtaagcc 559 ||||||||| Sbjct: 842 aagtaagcc 834
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 495/505 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 419 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 478 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 479 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 539 gtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattg 819
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 495/505 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 419 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 478 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 479 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 539 gtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattg 819
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 cgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcgcaag-ctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 tttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacg 1291 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattccccca 1231 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggt 1171 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 551 aagtaagcc 559 ||||||||| Sbjct: 870 aagtaagcc 862
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 492/502 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 62 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 121 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 122 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 181 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 182 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 241 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 242 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 302 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 361 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 362 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 422 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 481 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 482 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 542 aatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattg 846
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 497/508 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 838
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 491/500 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 64 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 124 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 184 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 244 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 304 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 364 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 424 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 483 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 484 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 543 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 848 Query: 544 tgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||| ||||||| Sbjct: 847 tgtgaagaagtaggccattg 828
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 528/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcacgactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 872 agaagta 866
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 534/555 (96%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactccaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacga 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 872 agaagtaggccattg 858
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 534/555 (96%), Gaps = 2/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1325 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaag-ctgcggcaagttcagggctc 1268 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1267 catttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1208 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1207 cgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcatttccc 1148 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1147 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcg 1088 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct: 1087 gtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacaccaggc 1028 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 968 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 908 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 848 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 788 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 787 agaagtaggccattg 773
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 528/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 53714 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcacgactc 53657 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 53656 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 53597 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 53596 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 53537 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 53536 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 53477 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 53476 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 53417 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53416 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 53357 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53356 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 53297 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53296 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 53237 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 53236 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 53177 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 53176 agaagta 53170
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 528/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 128647 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcacgactc 128590 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 128589 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 128530 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 128529 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 128470 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 128469 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 128410 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 128409 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 128350 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128349 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 128290 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128289 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 128230 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128229 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 128170 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 128169 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 128110 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 128109 agaagta 128103
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 528/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 10347322 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcacgactc 10347265 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10347264 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 10347205 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10347204 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 10347145 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 10347144 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 10347085 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 10347084 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 10347025 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347024 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 10346965 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346964 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 10346905 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346904 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 10346845 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10346844 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 10346785 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 10346784 agaagta 10346778
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 528/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 10353361 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcacgactc 10353304 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10353303 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 10353244 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10353243 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 10353184 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 10353183 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 10353124 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 10353123 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 10353064 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353063 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 10353004 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353003 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 10352944 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352943 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 10352884 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10352883 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 10352824 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 10352823 agaagta 10352817
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 499/511 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 559 ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagcc 832
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 528/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1797 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1740 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1739 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1680 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1679 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 1620 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 1619 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 1560 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1559 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1500 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1499 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1440 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1439 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 1380 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1379 actgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 1320 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1319 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 1260 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 1259 agaagta 1253
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 489/498 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattg 846
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 489/498 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattg 846
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 489/498 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattg 846
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 498/510 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 414 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 473 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 474 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 534 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 838
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 526/545 (96%), Gaps = 2/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaag 78 |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaag 1328 Query: 79 ctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgta 138 || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 cttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgta 1268 Query: 139 cacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtc 198 ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1267 cacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtc 1208 Query: 199 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctg 258 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctg 1148 Query: 259 gcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccc 318 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1147 gcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccc 1088 Query: 319 agtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaata 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 agtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaata 1028 Query: 379 aatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgg 968 Query: 439 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 967 cgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 908 Query: 499 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 907 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 848 Query: 559 cattg 563 ||||| Sbjct: 847 cattg 843
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 496/508 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 929 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgc 870 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 869 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 842
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 493/504 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 931 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 930 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacgg 871 Query: 540 tgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 870 tgaatgtgaagaagtaggccattg 847
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 518/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 cgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 87 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 88 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 147 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1274 Query: 148 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 207 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 208 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 267 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 268 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 327 ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgag 1094 Query: 328 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 388 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacat 974 Query: 448 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 914 Query: 508 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattg 858
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 496/508 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 828
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 527/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatt-gctttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1353 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggtgcattcccc 1233 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttcaatataatca 1053 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 932 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 872 agaagta 866
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 527/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614552 ctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 5614495 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 5614494 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcatta 5614435 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614434 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 5614375 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 5614374 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 5614315 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 5614314 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 5614255 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614254 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 5614195 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614194 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 5614135 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614134 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 5614075 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 5614074 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 5614015 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 5614014 agaagta 5614008 Score = 450 bits (227), Expect = e-123 Identities = 246/251 (98%), Gaps = 1/251 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 545 gtgaagaagta 555 ||||||||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaagta 13436854 Score = 167 bits (84), Expect = 5e-38 Identities = 90/92 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 464 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 524 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagta 13398005 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 250 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 279 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.49 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 248 ggtcagagctggcatatgccaa 269 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 527/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614541 ctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 5614484 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 5614483 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcatta 5614424 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614423 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 5614364 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 5614363 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 5614304 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 5614303 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 5614244 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614243 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 5614184 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614183 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 5614124 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614123 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 5614064 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 5614063 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 5614004 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 5614003 agaagta 5613997 Score = 450 bits (227), Expect = e-123 Identities = 246/251 (98%), Gaps = 1/251 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 425 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 484 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 545 gtgaagaagta 555 ||||||||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaagta 13391128 Score = 167 bits (84), Expect = 5e-38 Identities = 90/92 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 464 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 524 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagta 13352279 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 250 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 279 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.49 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 248 ggtcagagctggcatatgccaa 269 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 527/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38333 ctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 38390 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 38391 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcatta 38450 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38451 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 38510 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 38511 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 38570 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 38571 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 38630 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38631 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 38690 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38691 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 38750 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38751 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 38810 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 38811 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 38870 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 38871 agaagta 38877
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 495/507 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagta 836
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 488/498 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||| | ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagcaggccattg 846
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 526/546 (96%), Gaps = 2/546 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 tcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcc 69 |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgat-ctccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 70 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 129 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 130 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 189 | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 190 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcgg 1172 Query: 250 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 309 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 310 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 370 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 429 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 430 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 489 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 490 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 549 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 550 gaagta 555 |||||| Sbjct: 871 gaagta 866
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 474/480 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 384 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 444 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 504 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 492/504 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagcc 559 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 866 tcggtgaatgtgaagaagtaagcc 843
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 474/480 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 384 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 444 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 504 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 517/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 cgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 87 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 1318 Query: 88 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 147 |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1317 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1258 Query: 148 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 207 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1198 Query: 208 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 267 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1197 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1138 Query: 268 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 327 |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 aaacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgag 1078 Query: 328 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1018 Query: 388 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1017 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 958 Query: 448 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 957 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 898 Query: 508 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 897 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattg 842
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 495/508 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattg 828
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 527/547 (96%), Gaps = 3/547 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203584 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 23203641 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| Sbjct: 23203642 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt-gtta 23203700 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 23203701 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 23203760 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 23203761 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 23203820 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 23203821 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 23203880 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203881 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 23203940 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203941 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttacctact 23204000 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204001 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 23204060 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 23204061 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 23204120 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 23204121 agaagta 23204127 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 112 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 113 atc 115 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 112 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 113 atc 115 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 527/547 (96%), Gaps = 3/547 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154232 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 154289 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| Sbjct: 154290 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt-gtta 154348 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 154349 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 154408 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 154409 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 154468 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 154469 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 154528 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154529 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 154588 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154589 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttacctact 154648 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154649 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 154708 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 154709 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 154768 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 154769 agaagta 154775
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 527/547 (96%), Gaps = 3/547 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38346 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 38403 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| Sbjct: 38404 catttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt-gtta 38462 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38463 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccc 38522 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 38523 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcg 38582 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 38583 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 38642 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38643 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 38702 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38703 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttacctact 38762 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38763 actgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 38822 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 38823 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 38882 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 38883 agaagta 38889
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 497/511 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 559 ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagcc 832
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 497/511 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 559 ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagcc 832
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 487/498 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattg 846
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 487/498 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattg 846
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 525/546 (96%), Gaps = 2/546 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 tcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcc 69 |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgat-ctccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 70 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 129 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 130 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 189 | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 190 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcgg 1172 Query: 250 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 309 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 310 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 370 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 429 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 430 ctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 489 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 490 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 549 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 550 gaagta 555 |||||| Sbjct: 871 gaagta 866
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 524/545 (96%), Gaps = 2/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaag 78 |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1387 aatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgctag 1330 Query: 79 ctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgta 138 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgta 1270 Query: 139 cacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtc 198 ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1269 cacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtc 1210 Query: 199 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctg 258 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctg 1150 Query: 259 gcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccc 318 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1149 gcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccc 1090 Query: 319 agtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaata 378 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 agtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaata 1030 Query: 379 aatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 aatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgg 970 Query: 439 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 498 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 969 cgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 910 Query: 499 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 909 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggc 850 Query: 559 cattg 563 ||||| Sbjct: 849 cattg 845
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 473/480 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 384 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 444 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 504 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 473/480 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 143 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 144 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 204 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 263 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 264 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 324 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 384 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 444 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 504 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 493/507 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1252 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1193 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1192 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctg 1133 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1132 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacng 1073 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1072 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1013 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1012 caaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 953 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 gatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 893 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 892 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 833 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 832 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 773 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 772 gcattgctcggtgaatgtgaagaagta 746
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 529/552 (95%), Gaps = 2/552 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 gaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccat 71 ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1377 gaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccat 1320 Query: 72 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 131 ||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1319 ttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttgcga 1260 Query: 132 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 191 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 gcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 1200 Query: 192 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 251 || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1199 gggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtc 1140 Query: 252 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 311 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1139 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1080 Query: 312 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 371 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 gatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1020 Query: 372 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 960 Query: 432 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 491 ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 gtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 900 Query: 492 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 899 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840 Query: 552 agtaagccattg 563 |||| ||||||| Sbjct: 839 agtaggccattg 828
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 493/507 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagta 836
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 486/498 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 874 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgaagaagtaggccattg 856
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 495/510 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 114 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 173 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 174 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 233 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 234 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 294 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 353 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 354 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 414 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 473 ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 474 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 533 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 534 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 828
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 523/545 (95%), Gaps = 2/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 cgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactcca 70 ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1845 cgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1788 Query: 71 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 130 ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1787 tttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacg 1728 Query: 131 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 190 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1727 agcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1668 Query: 191 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1667 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggt 1608 Query: 251 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 310 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1607 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1548 Query: 311 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 370 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 ggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaatcatc 1488 Query: 371 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 430 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactac 1428 Query: 431 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 490 |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 tgtaccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1368 Query: 491 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1367 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 1308 Query: 551 aagta 555 ||||| Sbjct: 1307 aagta 1303
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 483/495 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 853 Query: 549 agaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||| Sbjct: 852 agaagtaggccattg 838
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 493/508 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 416 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 475 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 476 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattg 828
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 492/507 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagta 836
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 477/487 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 136 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 137 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 196 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 197 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 256 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 257 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 317 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 376 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 377 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 437 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 496 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 497 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 556 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 557 gccattg 563 ||||||| Sbjct: 807 gccattg 801
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 524/547 (95%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 ctcgaactcgaatttgatacgccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactc 68 ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1827 ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1770 Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 128 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1769 catttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgtta 1710 Query: 129 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 188 |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct: 1709 cgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggtgcatttccc 1650 Query: 189 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1649 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcg 1590 Query: 249 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 308 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1589 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1530 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 368 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 atggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaatca 1470 Query: 369 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 428 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctact 1410 Query: 429 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 488 |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 actgtaccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagctaatacacgg 1350 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1349 aaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 1290 Query: 549 agaagta 555 ||||||| Sbjct: 1289 agaagta 1283
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 477/487 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 136 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 137 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 196 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 197 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 256 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 257 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 317 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 376 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 377 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 437 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 496 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 497 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 556 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 557 gccattg 563 ||||||| Sbjct: 807 gccattg 801
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 492/507 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagta 836
>emb|AJ746283.1| Aristida congesta subsp. barbicollis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 492/507 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagta 836
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 492/507 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 57 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 117 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 176 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 177 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 236 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 237 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 297 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 356 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 357 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 417 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 476 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 477 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 536 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 537 cggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattg 858
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 492/507 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagta 836
>gb|U31359.1|ACU31359 Aristida congesta subsp. barbicollis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 492/507 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagta 836
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 492/507 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagta 836
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 498/515 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||| || ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 862 gcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattg 828
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 498/515 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacataggca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattg 828
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 492/507 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagta 836
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 507/526 (96%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggata 89 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 120471 ccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgata 120413 Query: 90 atttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 120412 atttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 120353 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120352 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 120293 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120292 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 120233 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120232 acatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 120173 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120172 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 120113 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 449 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120112 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 120053 Query: 450 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 509 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120052 tctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 119993 Query: 510 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 119992 tgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagta 119947
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 507/526 (96%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggata 89 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 58844 ccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgata 58786 Query: 90 atttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 58785 atttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 58726 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58725 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 58666 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58665 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 58606 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58605 acatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 58546 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58545 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 58486 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 449 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58485 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 58426 Query: 450 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 509 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58425 tctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 58366 Query: 510 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 58365 tgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagta 58320
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 507/526 (96%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggata 89 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1779 ccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttgata 1721 Query: 90 atttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1720 atttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtacacaggcttct 1661 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1660 aaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 1601 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1600 ccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1541 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1540 acatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtg 1481 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 1421 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 449 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 1361 Query: 450 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 509 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1360 tctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1301 Query: 510 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 tgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagta 1255
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 500/516 (96%), Gaps = 2/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgcga 107 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcacga 1284 Query: 108 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 167 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 168 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 227 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 228 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 287 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgc 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 828
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 476/487 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 136 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 137 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 196 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 197 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 256 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 257 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 316 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 317 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 377 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 969 Query: 437 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 909 Query: 497 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 556 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 849 Query: 557 gccattg 563 ||||||| Sbjct: 848 gccattg 842
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 491/507 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagta 836
>gb|U31104.1|ECU31104 Eragrostis capensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 491/507 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1342 ctgcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 1283 Query: 109 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 168 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 169 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 228 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 229 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 288 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 289 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaac 1043 Query: 349 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 408 |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcttgataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 409 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 923 Query: 469 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 863 Query: 529 gcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gcattgctcggtgaatgtgaagaagta 836
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 506/526 (96%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggata 89 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1390 ccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgata 1332 Query: 90 atttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1331 atttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 1272 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 1212 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1211 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1152 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 acatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 1092 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 1032 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 449 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 972 Query: 450 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 509 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 tctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912 Query: 510 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 911 tgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagta 866
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 506/526 (96%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggata 89 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 58263 ccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgata 58205 Query: 90 atttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 58204 atttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 58145 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58144 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 58085 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58084 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 58025 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58024 acatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 57965 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57964 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 57905 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 449 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57904 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 57845 Query: 450 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 509 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57844 tctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 57785 Query: 510 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 57784 tgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagta 57739
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 484/498 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1279 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattt 1219 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1218 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1159 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1158 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1099 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1039 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 979 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 919 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 918 cgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatg 859 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||| ||||||| Sbjct: 858 tgaagaagtaggccattg 841
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 506/526 (96%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagtctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggata 89 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 58273 ccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgata 58215 Query: 90 atttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 58214 atttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 58155 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58154 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 58095 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58094 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 58035 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58034 acatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 57975 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57974 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 57915 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 449 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57914 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 57855 Query: 450 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 509 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57854 tctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 57795 Query: 510 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 57794 tgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagta 57749
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/494 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaataca 906 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 905 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 846 Query: 546 tgaagaagtaagcc 559 |||||||||||||| Sbjct: 845 tgaagaagtaagcc 832
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 490/506 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 118 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 177 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 178 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 237 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 238 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 298 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 357 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 358 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 418 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 477 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 887 Query: 478 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 537 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 886 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 827 Query: 538 ggtgaatgtgaagaagtaagccattg 563 |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 826 ggtgaatgtgaagaagtaggccattg 801
>gb|M91626.1|BAMCPRBCL Bamboo chloroplast ribulosebisphosphate (rbcL) gene, partial cds Length = 1324 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 483/498 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1324 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1265 Query: 126 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 185 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatty 1205 Query: 186 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1204 ycccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1145 Query: 246 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 305 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1144 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1085 Query: 306 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1025 Query: 366 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 965 Query: 426 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 485 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 905 Query: 486 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 545 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 904 cgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatg 845 Query: 546 tgaagaagtaagccattg 563 |||||||||| ||||||| Sbjct: 844 tgaagaagtaggccattg 827
>gb|AY626351.1| Eriachne triseta ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1320 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 482/496 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1320 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1261 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1201 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1200 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1141 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1140 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagcaaccggtata 1081 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1080 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatccttttca 1021 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 ataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 961 Query: 420 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 901 Query: 480 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 900 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 841 Query: 540 tgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||||||| Sbjct: 840 tgaatgtgaagaagta 825 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,346,496 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4346496 Number of successful extensions: 118510 Number of sequences better than 10.0: 15269 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15199 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 79 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 85605 Number of HSP's gapped (non-prelim): 21382 length of query: 564 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 541 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 9274524057864 effective search space used: 9274524057864 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)