Clone Name | rbasd26c21 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 623/635 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 623/635 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 623/635 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 918 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 622/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 622/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 622/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 622/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 622/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 622/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 622/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 622/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 622/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 622/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 918 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 621/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctakttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 620/633 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1518 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1459 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 1399 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 1339 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1338 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1279 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1219 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1159 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 1099 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 1039 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 1038 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 979 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 978 gtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 919 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 918 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 620/633 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1456 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1397 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 1337 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 1277 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1217 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1157 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1097 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 1037 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 977 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 976 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 917 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 916 gtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 857 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 856 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 621/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 621/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 870 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 620/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkagstaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 621/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 621/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 621/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 621/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 621/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 620/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 620/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 620/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccaggagcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 620/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacgcctaatt 886
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 620/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 980 aagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 620/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 980 aagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 620/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 980 aagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 620/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 980 aagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
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>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 620/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 980 aagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 619/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnntaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 619/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 619/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 619/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 619/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 619/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 618/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacanntggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 618/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 618/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 618/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 618/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1410 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1409 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1350 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1349 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1290 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1230 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1170 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1110 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1050 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 990 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 989 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 930 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 929 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 870 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 869 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 835
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 616/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 616/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcccccggt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56319 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 56260 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 56259 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 56200 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 56199 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 56140 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56139 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 56080 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56079 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 56020 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56019 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 55960 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55959 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 55900 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55899 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 55840 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 55839 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 55780 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 55779 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 55720 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 55719 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 55685
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 617/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1505 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1446 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1445 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1386 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1385 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1326 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1266 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1206 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1146 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1086 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1026 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1025 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 966 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 965 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 906 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 905 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 871
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 616/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 870 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 616/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 616/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1460 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1459 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1400 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1399 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1340 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1280 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1220 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1160 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1100 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1040 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1039 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 980 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 979 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 920 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 919 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 885
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 613/631 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1518 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1459 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1458 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgag 1399 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1398 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1339 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1338 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtca 1279 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1219 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1159 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 1099 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 taccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 1039 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 1038 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 979 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 978 gtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 919 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaa 633 | || |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 918 agtagtcatgcattacaataggaacccctaa 888
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 616/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1460 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1459 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1400 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1399 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1340 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1280 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1220 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1160 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1100 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1040 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1039 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 980 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 979 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 920 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 919 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 885
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 616/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1460 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1459 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1400 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1399 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1340 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1280 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1220 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1160 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1100 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1040 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1039 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 980 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 979 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 920 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 919 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 885
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 616/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1460 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1459 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1400 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1399 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1340 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1280 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1220 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1160 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1100 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1040 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1039 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 980 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 979 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 920 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 919 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 885
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 616/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1460 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1459 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1400 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1399 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1340 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1280 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1220 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1160 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1100 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1040 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1039 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 980 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 979 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 920 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 919 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 885
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 616/635 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 615/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 615/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagataatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtcaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 870 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 614/633 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1349 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1348 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1289 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1288 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1229 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1169 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1109 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1049 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 989 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 taccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 929 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 928 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 869 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 868 gtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 809 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 808 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 614/633 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1462 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1461 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1402 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1401 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1342 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1282 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1222 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1162 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 1102 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 taccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 1042 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 1041 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 982 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 981 gtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 922 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 921 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 889
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 614/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcccccggt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 615/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnncccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 615/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 870 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 615/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1188 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1187 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1128 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1127 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1068 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1008 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 948 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 888 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 828 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 768 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 767 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 708 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 707 aagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 648 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 647 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 613
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 615/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1188 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1187 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1128 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1127 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1068 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1008 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 948 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 888 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 828 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 768 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 767 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 708 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 707 aagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 648 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 647 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 613
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 614/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1460 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1459 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1400 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1399 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1340 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1280 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1220 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1160 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 gcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1100 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1040 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1039 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 980 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 979 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 920 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 919 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 885
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 613/633 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1462 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1461 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1402 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1401 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1342 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1282 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1222 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1162 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 gcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 1102 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 taccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 1042 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 1041 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 982 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 981 gtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 922 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 921 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 889
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 615/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1377 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1318 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1317 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1258 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1257 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1198 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1197 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1138 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1078 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1018 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1017 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactac 958 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 tgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 898 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 897 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 838 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 837 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 778 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 777 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 743
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 615/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 614/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 615/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 614/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 615/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || | |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcgtgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 613/633 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1377 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1318 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1317 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1258 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1257 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1198 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1197 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1138 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1137 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacanctggcatgg 1078 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1018 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1017 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 958 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 taccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 898 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 897 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 838 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 837 gtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 778 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 777 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 745
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 613/633 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1325 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1324 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1265 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1264 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1205 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1145 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1085 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1025 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 965 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 taccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 905 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 904 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 845 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||| |||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 844 gtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 785 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 784 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 752
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 613/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1460 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1459 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacg 1400 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1399 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1340 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1339 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagrtttcggt 1280 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1220 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1160 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 gcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaacttacctactac 1100 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1040 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1039 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 980 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 979 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 920 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 919 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 885
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 613/633 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1325 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1324 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1265 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1264 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1205 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1145 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1085 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1025 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 965 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 taccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 905 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 904 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 845 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||| |||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 844 gtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 785 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 784 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 752
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 612/632 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 4 gaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 63 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 gaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 1317 Query: 64 gcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagc 123 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1316 gcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagc 1257 Query: 124 ttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagg 183 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1256 ttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagg 1197 Query: 184 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcag 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcag 1137 Query: 244 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgga 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgga 1077 Query: 304 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcg 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcg 1017 Query: 364 caataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1016 caataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 957 Query: 424 accggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 483 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 956 accggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 897 Query: 484 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaag 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct: 896 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 837 Query: 544 taagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaa 603 || ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| Sbjct: 836 taggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcccccggttaa 777 Query: 604 ntanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 776 gtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 745
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 614/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcccccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 870 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 612/633 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1462 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1461 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1402 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1401 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1342 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1282 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1222 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1162 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 1102 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 taccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 1042 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 1041 gcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 982 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 981 gtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 922 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 921 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 889
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 613/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 613/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 611/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1520 ctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacg 1401 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1341 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacnnngcat 1221 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1041 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1040 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 981 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 980 aagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 921 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 920 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 613/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcagt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 caaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 824
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 611/633 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1521 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1462 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1461 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgag 1402 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1401 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggtgcatttccccaag 1342 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 1282 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1222 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1162 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 1102 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 taccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 1042 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 1041 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 982 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 981 gtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 922 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 921 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 889
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 613/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 870 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || | |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcgtgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 613/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggccccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 870 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 613/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1458 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1399 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct: 1398 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgctgccttcgttacg 1339 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1338 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1279 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1219 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1159 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1099 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1039 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 979 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 978 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 919 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 918 aagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 859 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || | |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 858 taagtagtcgtgcattacaataggaacccctaatt 824
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 612/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttaca 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 gacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 870 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 612/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1188 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1187 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1128 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| Sbjct: 1127 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggtgcatttcccca 1068 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1008 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 948 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 888 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 828 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 768 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 767 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 708 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 707 aagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 648 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 647 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 613
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 607/633 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1518 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1459 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1458 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttacgag 1399 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1398 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1339 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1338 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtca 1279 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 1219 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 1159 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1158 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctannnctg 1099 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1098 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagctaatacacggaaat 1039 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 1038 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 979 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 978 gtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggtta 919 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 918 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 886
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 610/635 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcccccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 870 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 608/631 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 5 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 65 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 124 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 125 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 184 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 185 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 245 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 305 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 364 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 365 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 424 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 977 Query: 425 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 484 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 917 Query: 485 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagt 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 916 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 857 Query: 545 aagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaan 604 ||||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| Sbjct: 856 aagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaag 797 Query: 605 tanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 796 tagtcatgcattacaataggaacccctaatt 766
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 609/635 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1461 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcca 1402 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1401 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1342 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1341 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1282 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1281 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggt 1222 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1162 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1102 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 gcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1042 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 982 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 981 atgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 922 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 921 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagt 862 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 861 tatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 827
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 567/580 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 803 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 764
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 566/580 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 850 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 849 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 790 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 789 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 750
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 607/635 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1390 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcca 1331 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1330 tttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1271 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1270 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggtgcatttcccca 1211 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1210 aggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggt 1151 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1091 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1031 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactac 971 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 911 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 910 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 851 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 850 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagt 791 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 790 tatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 756
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 607/635 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcca 1311 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1310 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1251 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1250 agcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1191 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1190 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggt 1131 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaa 1071 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 ggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1011 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 951 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 891 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 890 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 831 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 830 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 771 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 770 tatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 736
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 607/635 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataacaccaggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 870 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 tatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 607/635 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcagt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 870 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 tatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 607/635 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcca 1449 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1448 tttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1389 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1388 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1329 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1328 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcagt 1269 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1209 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 ggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1149 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1148 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacctactac 1089 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1029 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1028 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 969 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 968 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagt 909 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 908 tatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 874
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 573/590 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 770 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 720
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 573/590 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 770 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 720
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 606/635 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcag 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 870 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 tatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 573/592 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 524 gcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantattt 583 |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtattt 808 Query: 584 gcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||| ||||||||| | ||| || | |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 807 gcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaatt 756
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 605/635 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttctgt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||| | ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 870 aagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 gatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 604/635 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 ctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1334 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 1333 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacg 1274 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1273 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1214 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1213 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggt 1154 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1094 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1034 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 974 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 973 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaa 914 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 913 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaag 854 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| | Sbjct: 853 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagt 794 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 793 taagtagtcatgcattacaataggagcccctaatt 759
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 569/589 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 106 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 107 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 166 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 167 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 226 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 227 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 286 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 287 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 346 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 347 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 407 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 467 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 527 cggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcg 586 ||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 805 Query: 587 gngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| | ||| || | |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 804 gtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaatt 756
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 604/635 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 990 tgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 870 aagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccctgt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 604/635 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1394 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1335 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1334 tttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1275 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1274 agcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccca 1215 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1214 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggt 1155 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1154 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1095 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1094 agatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1035 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 975 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 974 tgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaa 915 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 914 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaag 855 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 854 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 795 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 794 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 760
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 606/635 (95%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124746 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 124687 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124686 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 124627 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 124626 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 124567 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 124566 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaagatttcggt 124507 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124506 cagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacacctggcat 124448 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 124447 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaataaaatcatc 124389 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124388 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 124329 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124328 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 124269 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 124268 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 124209 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124208 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 124149 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124148 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 124114 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 606/635 (95%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30219 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 30160 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 30159 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 30100 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 30099 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 30040 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 30039 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaagatttcggt 29980 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29979 cagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacacctggcat 29921 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 29920 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaataaaatcatc 29862 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29861 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 29802 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29801 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 29742 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 29741 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 29682 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29681 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 29622 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 29621 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 29587
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 570/590 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | ||| || | |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaatt 756
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 603/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55460 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 55401 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 55400 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 55341 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 55340 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 55281 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 55280 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 55221 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55220 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 55161 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55160 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 55101 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55100 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 55041 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55040 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 54981 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 54980 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 54921 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54920 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 54861 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54860 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 54826
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 603/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125801 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 125742 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 125741 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 125682 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 125681 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 125622 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 125621 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 125562 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125561 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 125502 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125501 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 125442 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125441 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 125382 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125381 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 125322 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 125321 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 125262 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 125261 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 125202 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 125201 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 125167 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 603/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30741 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 30682 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 30681 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 30622 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 30621 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 30562 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 30561 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 30502 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30501 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 30442 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30441 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 30382 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30381 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 30322 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30321 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 30262 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 30261 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 30202 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30201 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 30142 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 30141 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 30107
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 603/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 agatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 990 tgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 870 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 603/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 ctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1338 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1337 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1278 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1277 agcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccca 1218 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1217 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggt 1158 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1098 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 agatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1038 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 978 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 977 tgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaa 918 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 917 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaag 858 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 857 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 798 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 797 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 763
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 603/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 ctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1336 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1335 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1276 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1275 agcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccca 1216 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1215 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggt 1156 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1096 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 agatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1036 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 976 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 975 tgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaa 916 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 915 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaag 856 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 855 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 796 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 795 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 761
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 603/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1350 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1290 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1289 agcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccca 1230 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1229 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggt 1170 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1110 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 agatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1050 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 990 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 989 tgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaa 930 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 929 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaag 870 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 869 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 810 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 809 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 775
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 603/635 (94%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527160 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 33527219 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 33527220 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 33527279 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 33527280 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 33527339 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 33527340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 33527399 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527400 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 33527459 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527460 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 33527519 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527520 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 33527579 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527580 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 33527639 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 33527640 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 33527699 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 33527700 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 33527759 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 33527760 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 33527794 Score = 93.7 bits (47), Expect = 7e-16 Identities = 69/79 (87%) Strand = Plus / Minus Query: 557 cggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcatt 616 ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| Sbjct: 39115469 cggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatt 39115410 Query: 617 acaatangaacccctaatt 635 |||||| |||||||||||| Sbjct: 39115409 acaataggaacccctaatt 39115391
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 603/635 (94%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72357 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 72416 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 72417 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 72476 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 72477 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 72536 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 72537 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 72596 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72597 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 72656 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72657 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 72716 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72717 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 72776 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72777 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 72836 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 72837 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 72896 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 72897 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 72956 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 72957 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 72991
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 603/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55439 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 55380 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 55379 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 55320 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 55319 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 55260 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 55259 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 55200 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55199 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 55140 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55139 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 55080 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55079 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 55020 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55019 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 54960 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 54959 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 54900 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54899 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 54840 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54839 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 54805
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 569/590 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 586/613 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 23 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 82 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 83 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 142 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 143 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 202 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 203 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 262 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 263 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 322 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 323 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 383 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatct 949 Query: 443 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 889 Query: 503 ctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaa 562 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| || Sbjct: 888 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaa 829 Query: 563 tagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaata 622 || ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||| Sbjct: 828 taatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaata 769 Query: 623 ngaacccctaatt 635 |||| ||||||| Sbjct: 768 ggaactcctaatt 756
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 595/625 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 11 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 431 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 491 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagcca 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 846 Query: 551 ttgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantannca 610 ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||| || || Sbjct: 845 ttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtagtca 786 Query: 611 tgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 785 tgcattacaataggagcccctaatt 761
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 561/580 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatccc 804 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 803 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 764
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55512 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 55453 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 55452 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 55393 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 55392 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 55333 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 55332 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 55273 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55272 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 55213 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55212 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 55153 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55152 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 55093 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55092 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 55033 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 55032 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 54973 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 54972 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccggt 54913 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54912 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 54878
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55512 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 55453 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 55452 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 55393 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 55392 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 55333 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 55332 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 55273 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55272 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 55213 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55212 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 55153 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55152 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 55093 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55092 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 55033 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 55032 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 54973 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 54972 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccggt 54913 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54912 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 54878
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124828 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 124769 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124768 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 124709 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 124708 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 124649 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 124648 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 124589 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124588 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 124529 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124528 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 124469 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124468 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 124409 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124408 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 124349 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 124348 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 124289 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 124288 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccggt 124229 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124228 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 124194 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30247 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 30188 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 30187 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 30128 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 30127 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 30068 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 30067 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 30008 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30007 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 29948 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29947 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 29888 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29887 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 29828 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29827 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 29768 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 29767 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 29708 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 29707 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccggt 29648 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 29647 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 29613
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124828 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 124769 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124768 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 124709 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 124708 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 124649 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 124648 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 124589 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124588 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 124529 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124528 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 124469 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124468 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 124409 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124408 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 124349 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 124348 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 124289 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 124288 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccggt 124229 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124228 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 124194 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30247 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 30188 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 30187 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 30128 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 30127 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 30068 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 30067 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 30008 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30007 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 29948 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29947 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 29888 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29887 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 29828 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29827 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 29768 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 29767 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 29708 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 29707 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccggt 29648 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 29647 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 29613
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55504 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 55445 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 55444 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 55385 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 55384 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 55325 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 55324 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 55265 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55264 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 55205 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55204 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 55145 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55144 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 55085 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55084 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 55025 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 55024 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 54965 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 54964 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccggt 54905 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54904 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 54870
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccggt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 agatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 990 tgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 870 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1325 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaagttcagggctcca 1266 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1265 tttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1206 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1205 agcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcatttcccca 1146 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1145 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggt 1086 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 1085 aagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacaccaggcat 1026 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 966 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 906 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 846 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 845 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 786 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 785 aagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagt 726 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 725 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 691
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 53714 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcca 53655 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 53654 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 53595 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 53594 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 53535 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 53534 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 53475 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53474 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 53415 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53414 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 53355 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53354 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 53295 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53294 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 53235 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 53234 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 53175 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 53174 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 53115 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 53114 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 53080
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 128647 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcca 128588 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 128587 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 128528 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 128527 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 128468 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 128467 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 128408 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128407 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 128348 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128347 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 128288 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128287 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 128228 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128227 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 128168 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 128167 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 128108 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 128107 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 128048 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 128047 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 128013
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 10347322 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcca 10347263 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 10347262 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 10347203 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 10347202 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 10347143 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 10347142 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 10347083 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347082 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 10347023 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347022 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 10346963 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346962 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 10346903 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346902 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 10346843 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 10346842 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 10346783 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10346782 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 10346723 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10346722 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 10346688
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1406 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1405 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1346 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1345 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 1286 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1285 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 1226 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1166 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1106 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1046 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 986 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 985 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 926 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 925 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccggt 866 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 865 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 831
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1149 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1148 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1089 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1088 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 1029 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1028 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 969 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 968 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 909 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 849 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 789 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 788 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 729 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 728 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 669 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 668 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccggt 609 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 608 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 574
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 10353361 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcacgactcca 10353302 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 10353301 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 10353242 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 10353241 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 10353182 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 10353181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 10353122 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353121 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 10353062 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353061 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 10353002 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353001 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 10352942 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352941 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 10352882 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 10352881 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 10352822 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10352821 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 10352762 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10352761 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 10352727
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1797 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1738 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1737 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1678 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1677 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 1618 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1617 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 1558 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1557 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1498 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1497 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1438 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1437 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1378 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1377 tgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1318 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 1317 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 1258 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1257 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 1198 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1197 caagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 1163
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 602/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1830 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1771 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1770 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1711 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1710 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 1651 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1650 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 1591 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1590 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1531 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1471 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1411 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 1351 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 1350 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 1291 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 1290 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaaccccccggt 1231 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1230 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 1196 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 73 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 594/625 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 11 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 431 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 490 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 491 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagcca 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 846 Query: 551 ttgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantannca 610 ||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || || Sbjct: 845 ttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtca 786 Query: 611 tgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 785 tgcattacaataggaacccctaatt 761
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 569/592 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 524 gcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantattt 583 |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 808 Query: 584 gcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||| ||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 807 gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 756
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 567/590 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 944 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 884 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 883 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 824 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 823 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 774
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 599/633 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 cgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcaggactccatt 1321 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1320 tggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgag 1261 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1260 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattcccccaag 1201 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1200 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtca 1141 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 gagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcatgg 1081 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 atacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatcgc 1021 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 gcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 961 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 901 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || Sbjct: 900 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 841 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||||||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||||| || | || Sbjct: 840 gtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcctccagtta 781 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 780 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 748
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 584/613 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 23 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 82 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 83 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 142 ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 143 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 202 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 203 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 262 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 263 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 322 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 323 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 383 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatct 949 Query: 443 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 889 Query: 503 ctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaa 562 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| || Sbjct: 888 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaa 829 Query: 563 tagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaata 622 || ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||| Sbjct: 828 taatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaata 769 Query: 623 ngaacccctaatt 635 |||||||||||| Sbjct: 768 ggaacccctaatt 756
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 599/633 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 cgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcaggactccatt 1349 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 tggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgag 1289 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattcccccaag 1229 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1228 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtca 1169 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcatgg 1109 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 atacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatcgc 1049 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 gcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 989 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 929 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || Sbjct: 928 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 869 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||||||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||||| || | || Sbjct: 868 gtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcctccagtta 809 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 808 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 559/580 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || | ||| || | |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 803 ccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaatt 764
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 568/592 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 524 gcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantattt 583 |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||| Sbjct: 868 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 809 Query: 584 gcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||| ||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 808 gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 757
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 600/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614552 ctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 5614493 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 5614492 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcattacg 5614433 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 5614432 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 5614373 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 5614372 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 5614313 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614312 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 5614253 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614252 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 5614193 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614192 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 5614133 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614132 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 5614073 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 5614072 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 5614013 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| || Sbjct: 5614012 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccctggt 5613953 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 5613952 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 5613918 Score = 525 bits (265), Expect = e-146 Identities = 320/341 (93%), Gaps = 1/341 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 295 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 355 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 414 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(117), Expect = 1e-57 Identities = 159/177 (89%) Strand = Plus / Minus Query: 454 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 513 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 514 tgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaa 573 |||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||| | ||| |||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 574 agtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccc 630 | || ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 98 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 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>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 601/635 (94%), Gaps = 1/635 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203584 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 23203643 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 23203644 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt-gttacg 23203702 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 23203703 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 23203762 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 23203763 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 23203822 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203823 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 23203882 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203883 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 23203942 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203943 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttacctactac 23204002 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204003 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 23204062 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 23204063 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 23204122 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 23204123 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 23204182 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 23204183 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 23204217 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 102 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 103 atc 105 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 102 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 103 atc 105 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 601/635 (94%), Gaps = 1/635 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154232 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 154291 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 154292 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt-gttacg 154350 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 154351 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 154410 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 154411 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 154470 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154471 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 154530 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154531 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 154590 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154591 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttacctactac 154650 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154651 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 154710 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 154711 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 154770 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 154771 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 154830 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 154831 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 154865
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 601/635 (94%), Gaps = 1/635 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38346 ctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 38405 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 38406 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt-gttacg 38464 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 38465 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 38524 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 38525 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 38584 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38585 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 38644 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38645 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 38704 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38705 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttacctactac 38764 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38765 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 38824 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 38825 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 38884 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38885 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 38944 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 38945 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 38979
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 600/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614541 ctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 5614482 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 5614481 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcattacg 5614422 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 5614421 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 5614362 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 5614361 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 5614302 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614301 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 5614242 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614241 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 5614182 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614181 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 5614122 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614121 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 5614062 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 5614061 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 5614002 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| || Sbjct: 5614001 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccctggt 5613942 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 5613941 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 5613907 Score = 525 bits (265), Expect = e-146 Identities = 320/341 (93%), Gaps = 1/341 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 295 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 355 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 414 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(117), Expect = 1e-57 Identities = 159/177 (89%) Strand = Plus / Minus Query: 454 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 513 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 514 tgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaa 573 |||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||| | ||| |||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 574 agtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccc 630 | || ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13352194 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 43 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 98 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 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>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 600/635 (94%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38333 ctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactcca 38392 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 38393 tttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcattacg 38452 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 38453 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 38512 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 38513 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaagatttcggt 38572 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38573 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 38632 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38633 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 38692 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38693 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 38752 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38753 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 38812 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 38813 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 38872 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| || Sbjct: 38873 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccctggt 38932 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 38933 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 38967
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 566/590 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 740
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 566/590 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 866 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 807 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 806 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 757
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 566/590 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 740
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 563/586 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 110 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 169 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 170 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 229 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 230 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 290 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 350 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 410 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 469 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 470 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 529 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 530 ngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggng 589 ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 590 aatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 566/590 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaatt 746
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 574/601 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 94 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 95 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 154 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 155 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 214 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 215 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 274 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 275 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 334 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 335 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 394 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 395 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 939 Query: 455 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 879 Query: 515 gcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaa 574 ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| Sbjct: 878 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 819 Query: 575 gtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 634 || ||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 818 ctagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 759 Query: 635 t 635 | Sbjct: 758 t 758
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 592/625 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 11 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 968 Query: 431 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 490 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 967 tggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 908 Query: 491 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagcca 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 907 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 848 Query: 551 ttgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantannca 610 ||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || || Sbjct: 847 ttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtca 788 Query: 611 tgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 787 tgcattacaataggaacccctaatt 763
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 586/617 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 19 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 78 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 79 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 138 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1273 Query: 139 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 198 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 199 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 258 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 259 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 318 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagt 1093 Query: 319 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 379 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1032 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatg 973 Query: 439 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 498 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 972 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattttt 913 Query: 499 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncg 558 ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| | || Sbjct: 912 ctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcg 853 Query: 559 gnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattac 618 | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||| Sbjct: 852 gcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattac 793 Query: 619 aatangaacccctaatt 635 |||| |||||||||||| Sbjct: 792 aataggaacccctaatt 776
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 589/621 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 15 tgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctc 74 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctt 1252 Query: 75 ggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaag 134 |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1251 tgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacagg 1192 Query: 135 cttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaag 194 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 cttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaag 1132 Query: 195 ttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatat 254 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 ttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatat 1072 Query: 255 gccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcct 314 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 gccaaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcct 1012 Query: 315 gagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaa 374 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 gagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaa 952 Query: 375 caaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgga 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 caaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgga 892 Query: 435 tatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgat 494 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 tatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgat 832 Query: 495 ttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgn 554 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 831 ttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgt 772 Query: 555 cncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgca 614 | ||| |||| |||| |||| || ||||||||| |||||| || | ||| || |||||| Sbjct: 771 cgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaaatagtcatgca 712 Query: 615 ttacaatangaacccctaatt 635 |||||||| |||||||||||| Sbjct: 711 ttacaataggaacccctaatt 691
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 803 ccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 764
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 560/584 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 52 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 111 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 112 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 171 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 172 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 231 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 232 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 292 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 351 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 352 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 412 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 471 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 472 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggng 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 532 aatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaa 591 |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 808 Query: 592 tcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 807 tcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 764
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 544/562 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 74 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 133 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 134 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 194 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 253 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 254 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 314 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 374 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 434 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 494 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 554 ncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgc 613 | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 760 Query: 614 attacaatangaacccctaatt 635 ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 759 attacaataggaacccctaatt 738
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 544/562 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 74 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 133 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 134 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 194 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 253 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 254 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 314 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 374 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 434 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 494 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 554 ncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgc 613 | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 760 Query: 614 attacaatangaacccctaatt 635 ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 759 attacaataggaacccctaatt 738
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 559/582 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 114 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 173 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 174 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 233 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 234 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 294 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 354 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 414 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 473 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 474 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaa 533 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 848 Query: 534 tgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatc 593 |||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 847 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 788 Query: 594 ccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 787 ccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 866 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 865 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 806 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 805 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 766
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 566/592 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 935 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 875 Query: 524 gcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantattt 583 |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||| Sbjct: 874 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 815 Query: 584 gcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 814 gcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaatt 763
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 566/592 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 933 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 873 Query: 524 gcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantattt 583 |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||| Sbjct: 872 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 813 Query: 584 gcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||| ||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 812 gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 761
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 596/632 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 4 gaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 63 |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1377 gaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 1318 Query: 64 gcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagc 123 | ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1317 ggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttgcgagc 1258 Query: 124 ttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagg 183 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 ttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagg 1198 Query: 184 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcag 243 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1197 gtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcag 1138 Query: 244 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgga 303 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 agctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatgga 1078 Query: 304 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcg 363 ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 tacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcg 1018 Query: 364 caataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1017 caataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 958 Query: 424 accggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 483 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 accggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 898 Query: 484 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaag 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| Sbjct: 897 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838 Query: 544 taagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaa 603 || ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||| Sbjct: 837 taggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttaa 778 Query: 604 ntanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 777 gtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 564/590 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 740
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 597/634 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaana 541 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | Sbjct: 929 tgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 870 Query: 542 agtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnt 601 |||| ||| ||| | ||| |||| |||| |||| || ||||||||| |||||| || | | Sbjct: 869 agtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagtt 810 Query: 602 aantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 809 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 565/592 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 524 gcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantattt 583 |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 808 Query: 584 gcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||| ||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 807 gcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 756
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 597/635 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1290 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggtgcattccccca 1231 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggt 1171 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 caaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttcaatataatcatc 1051 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgctaatacacggaa 931 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 930 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| |||| ||| || ||||||||| |||||| || | Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgcggtgaatcctccagt 811 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 567/595 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 41 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 100 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 101 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 160 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 161 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 220 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 221 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 280 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 281 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 341 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 400 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 401 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 460 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 461 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 520 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgc 891 Query: 521 attgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtanta 580 ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || || Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta 831 Query: 581 tttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||||||| ||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 830 tttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 570/599 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 558/584 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 52 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 111 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 112 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 171 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 172 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 231 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 232 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 291 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 292 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 351 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 352 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 412 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 471 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 472 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggng 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 532 aatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaa 591 |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 808 Query: 592 tcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 807 tcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 764
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 563/590 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 806 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 756
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 563/590 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||| ||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgc 796 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 596/634 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 61 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 62 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 121 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 122 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 181 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 182 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 242 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 301 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 302 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 362 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 421 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 422 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 481 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 482 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaana 541 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | Sbjct: 929 tgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 870 Query: 542 agtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnt 601 |||| ||| ||| | ||| |||| |||| |||| || ||||||||| |||||| || | | Sbjct: 869 agtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagtt 810 Query: 602 aantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 809 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 583/617 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 19 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 78 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 79 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 138 ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1257 Query: 139 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 198 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1197 Query: 199 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 258 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1137 Query: 259 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 318 ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 aacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagt 1077 Query: 319 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1017 Query: 379 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1016 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatg 957 Query: 439 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 498 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 956 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattttt 897 Query: 499 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncg 558 ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| | || Sbjct: 896 ctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcg 837 Query: 559 gnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattac 618 | |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||| Sbjct: 836 gcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattac 777 Query: 619 aatangaacccctaatt 635 |||| || ||||||||| Sbjct: 776 aataggagcccctaatt 760
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 555/580 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 764
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 555/580 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 764
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 555/580 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 764
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 560/587 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 108 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 109 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 168 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 169 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 228 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 229 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 288 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 289 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 349 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 408 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 409 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 468 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 469 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 529 gngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggn 588 | ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 784 Query: 589 gaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 783 gaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 737
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 560/587 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 49 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 108 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 109 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 168 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 169 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 228 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 229 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 288 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 289 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 349 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 408 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 409 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 468 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 469 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 529 gngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggn 588 | ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 784 Query: 589 gaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 783 gaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 737
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 569/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 559/586 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 50 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 110 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 169 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 170 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 229 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 230 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 290 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 349 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 350 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 410 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 931 Query: 470 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 930 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacgg 871 Query: 530 ngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggng 589 ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| | Sbjct: 870 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 811 Query: 590 aatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 810 aatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 765
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 562/590 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||| ||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttgc 796 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 588/625 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 11 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 430 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 120062 Query: 431 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 490 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120061 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 120002 Query: 491 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagcca 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| Sbjct: 120001 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 119942 Query: 551 ttgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantannca 610 ||| | ||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| || | ||| || || Sbjct: 119941 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 119882 Query: 611 tgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 119881 tgcattacaataggaacccctaatt 119857
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 588/625 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 11 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 430 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 58435 Query: 431 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 490 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58434 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 58375 Query: 491 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagcca 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| Sbjct: 58374 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 58315 Query: 551 ttgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantannca 610 ||| | ||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| || | ||| || || Sbjct: 58314 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 58255 Query: 611 tgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 58254 tgcattacaataggaacccctaatt 58230
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 568/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 775 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| | Sbjct: 774 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 715 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 714 agtatttgcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 656
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 568/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 568/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 561/590 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 ||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 866 tcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 807 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || |||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 806 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 757
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 561/590 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 929 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgc 870 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 869 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 810 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 809 ggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 760
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 587/625 (93%) Strand = Plus / Minus Query: 11 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 430 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 431 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 490 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 921 Query: 491 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagcca 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 861 Query: 551 ttgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantannca 610 ||| | ||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| || | ||| || || Sbjct: 860 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 801 Query: 611 tgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 800 tgcattacaataggaacccctaatt 776
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 587/625 (93%) Strand = Plus / Minus Query: 11 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 430 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57854 Query: 431 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 490 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57853 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57794 Query: 491 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagcca 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| Sbjct: 57793 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57734 Query: 551 ttgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantannca 610 ||| | ||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| || | ||| || || Sbjct: 57733 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 57674 Query: 611 tgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 57673 tgcattacaataggaacccctaatt 57649
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 593/633 (93%) Strand = Plus / Minus Query: 3 cgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 62 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1845 cgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatt 1786 Query: 63 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 122 ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1785 tgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgag 1726 Query: 123 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 182 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1725 cttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1666 Query: 183 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1665 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtca 1606 Query: 243 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 302 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1605 gagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatgg 1546 Query: 303 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 362 |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 atacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaatcatcgc 1486 Query: 363 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 422 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 gcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactg 1426 Query: 423 taccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 482 |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 taccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 1366 Query: 483 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaa 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || Sbjct: 1365 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 1306 Query: 543 gtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggnta 602 ||| ||| ||| | ||| |||| ||||||| || ||||||||| |||||| || | || Sbjct: 1305 gtaggccgttgtcgcggcaatacatagccaaactagtatttgcggtgaatcctccagtta 1246 Query: 603 antanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1245 agtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 1213
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 106 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 107 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 166 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 167 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 226 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 227 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 286 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 287 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 346 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 347 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 407 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 466 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 467 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 526 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 527 cggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcg 586 ||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 587 gngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 776
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 587/625 (93%) Strand = Plus / Minus Query: 11 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 430 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57864 Query: 431 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 490 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57863 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57804 Query: 491 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagcca 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| Sbjct: 57803 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57744 Query: 551 ttgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantannca 610 ||| | ||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| || | ||| || || Sbjct: 57743 ttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtca 57684 Query: 611 tgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 57683 tgcattacaataggaacccctaatt 57659
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 553/580 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||| | ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || | | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 764
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 553/580 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 874 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 814 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || | || || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 813 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 774
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 553/580 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaataca 906 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| Sbjct: 905 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 846 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||||||||| ||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 845 tgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 786 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 785 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 567/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 539/562 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 74 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 133 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 134 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 194 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 253 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 254 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 314 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 374 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 434 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 494 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 554 ncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgc 613 | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || ||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgc 757 Query: 614 attacaatangaacccctaatt 635 ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 756 attacaataggaacccctaatt 735
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 539/562 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 74 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 133 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 134 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 194 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 253 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 254 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 314 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 374 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 434 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 494 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattg 553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 554 ncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgc 613 | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || ||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgc 757 Query: 614 attacaatangaacccctaatt 635 ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 756 attacaataggaacccctaatt 735
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 586/625 (93%) Strand = Plus / Minus Query: 11 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 70 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1789 aatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1730 Query: 71 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 130 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1729 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1670 Query: 131 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 190 || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1669 caggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1610 Query: 191 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 250 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1609 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1550 Query: 251 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 310 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1549 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccag 1490 Query: 311 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 370 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1489 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1430 Query: 371 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 430 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1429 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 1370 Query: 431 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 490 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1369 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1310 Query: 491 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagcca 550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1309 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 1250 Query: 551 ttgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantannca 610 ||| | ||| |||| | || |||| || ||||||||| |||||| || | ||| || || Sbjct: 1249 ttgtcgcggcaataataagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtca 1190 Query: 611 tgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1189 tgcattacaataggaacccctaatt 1165
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || | | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 764
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 115 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 116 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 175 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 176 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 235 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 236 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 295 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 296 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 356 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 415 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 416 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 475 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 476 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 536 tgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 595 |||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 596 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || | | || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 764
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 561/592 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 44 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 104 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 163 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 164 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 223 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 224 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 283 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 284 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 343 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 344 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 404 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 463 ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 464 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 523 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 524 gcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantattt 583 |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 798 Query: 584 gcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || | |||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 797 gcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/588 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 48 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 108 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 167 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 168 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 227 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 228 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 287 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 288 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 347 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 348 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 408 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 467 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 887 Query: 468 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 527 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 886 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 827 Query: 528 ggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcgg 587 || ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 826 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 767 Query: 588 ngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 766 tgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 719
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 593/635 (93%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 60 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1827 ctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1768 Query: 61 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 120 ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1767 tttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacg 1708 Query: 121 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 180 |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1707 agcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggtgcatttcccca 1648 Query: 181 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1647 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggt 1588 Query: 241 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1587 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1528 Query: 301 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 360 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaatcatc 1468 Query: 361 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 420 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactac 1408 Query: 421 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 480 |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 tgtaccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagctaatacacggaa 1348 Query: 481 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 540 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 1347 atggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 1288 Query: 541 aagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 600 ||||| ||| ||| | ||| |||| || |||| || ||||||||| |||||| || | Sbjct: 1287 aagtaggccgttgtcgcggcaatacatagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagt 1228 Query: 601 taantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1227 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 1193
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 566/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| |||||| || | ||| || ||||||||| |||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattataataggagcccctaatt 746
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 566/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaatt 746
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 556/586 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 50 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1284 Query: 110 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 169 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1283 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1224 Query: 170 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 229 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1223 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1164 Query: 230 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 289 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1163 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1104 Query: 290 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 349 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1044 Query: 350 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 984 Query: 410 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 469 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 924 Query: 470 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 529 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 923 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 864 Query: 530 ngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggng 589 ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 863 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 804 Query: 590 aatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 803 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 758
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 559/590 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 ||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaatt 746
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 559/590 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 ||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 543/569 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 67 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 126 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 127 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 186 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 187 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 246 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 247 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 307 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 366 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 367 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 427 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 486 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 487 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaa 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 547 gccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaanta 606 ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 748 Query: 607 nncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 747 gtcatgcattacaataggaacccctaatt 719
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 543/569 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 67 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 126 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 127 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 186 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 187 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 246 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 247 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 307 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 367 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 969 Query: 427 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 486 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 909 Query: 487 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaa 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 908 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 849 Query: 547 gccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaanta 606 ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || || Sbjct: 848 gccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 789 Query: 607 nncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 788 gtcatgcattacaataggaacccctaatt 760
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 543/569 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 67 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 126 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 127 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 186 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 187 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 246 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 247 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 307 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 366 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 367 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 427 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 486 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 487 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaa 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 547 gccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaanta 606 ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 748 Query: 607 nncatgcattacaatangaacccctaatt 635 |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 747 gtcatgcattacaataggaacccctaatt 719
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 568/600 (94%), Gaps = 2/600 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 95 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 96 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 155 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 156 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 215 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 216 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 275 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 276 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 335 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 336 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgc 986 Query: 396 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 455 | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 456 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 516 catgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaag 575 |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 576 tantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 || ||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattactataggaacccctaatt 746
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 532/555 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 81 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 140 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 141 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 201 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 260 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 261 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 320 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 321 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 380 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 381 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgat 440 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgat 918 Query: 441 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 858 Query: 501 gtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggn 560 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| Sbjct: 857 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 798 Query: 561 aatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaa 620 |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||||| Sbjct: 797 aataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaa 738 Query: 621 tangaacccctaatt 635 || |||||||||||| Sbjct: 737 taggaacccctaatt 723
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 565/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| || | ||| |||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| |||||| || | ||| || ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 548/577 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 59 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 118 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 119 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 178 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 179 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 239 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 299 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 359 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 419 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 478 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 479 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtga 538 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 853 Query: 539 anaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccg 598 | ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| Sbjct: 852 agaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccca 793 Query: 599 gntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | || || |||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct: 792 gttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaatt 756
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 565/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 565/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| || | ||| |||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| |||||| || | ||| || ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 565/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 565/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||| | ||| |||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaatt 746
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 565/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 |||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| | || |||||| Sbjct: 864 atgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaagt 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 565/599 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 97 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 156 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 157 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 216 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 217 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 276 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 277 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 336 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 337 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 396 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 397 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 457 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 516 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 517 atgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagt 576 ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||| | ||| |||| |||| |||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaact 805 Query: 577 antatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 555/586 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 50 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 109 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 110 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 169 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 170 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 229 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 230 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 289 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 290 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 350 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 410 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 469 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 922 Query: 470 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 529 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 921 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 862 Query: 530 ngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgcggng 589 ||||||||| ||||| ||| ||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 861 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 802 Query: 590 aatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 ||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 801 aatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 756
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 558/590 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 106 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 165 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 166 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 225 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 gggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 226 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 285 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccgg 1096 Query: 286 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 345 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 346 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 406 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 465 ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 466 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 525 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 526 acggngaatgtgaanaagtaagccattgncncggnaatagtgagccaaagtantatttgc 585 |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 586 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaatt 635 | ||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 795 agtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,274,218 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4274218 Number of successful extensions: 112722 Number of sequences better than 10.0: 15243 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15193 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 62 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 83433 Number of HSP's gapped (non-prelim): 21239 length of query: 637 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 614 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 10525984790256 effective search space used: 10525984790256 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)