Clone Name | rbasd25m15 |
---|---|
Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 553/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 553/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 553/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 552/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 551/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctaktt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 551/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 551/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 cyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 551/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 551/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 551/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkagst 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 551/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 551/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccagga 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1420 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1419 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1361 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1360 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1301 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1241 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1181 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1121 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1061 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1001 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 941 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 940 tgaatgtgaagaag 927
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1198 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1197 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1139 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1079 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1019 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 959 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 899 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 839 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 838 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 779 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 719 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 718 tgaatgtgaagaag 705
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1198 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1197 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1139 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1079 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1019 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 959 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 899 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 839 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 838 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 779 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 719 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 718 tgaatgtgaagaag 705
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgssc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaar-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56329 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 56270 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 56269 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 56211 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56210 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 56151 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56150 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 56091 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56090 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 56031 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56030 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55971 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55970 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55911 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55910 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55851 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55850 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 55791 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 55790 tgaatgtgaagaag 55777
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 550/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1515 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1456 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1455 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1397 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1337 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1277 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1217 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1157 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1097 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1037 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 977 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 976 tgaatgtgaagaag 963
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnnt 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsssc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsssc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 549/554 (99%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 547/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 547/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsssc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaag 977
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaag 977
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaag 977
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaag 977
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaag 977
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1328 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1327 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1269 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1209 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1149 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1089 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1029 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 969 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 909 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 849 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 848 tgaatgtgaagaag 835
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 548/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 547/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 547/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 547/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgccc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 547/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1198 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1197 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1139 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggt 1079 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1019 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 959 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 899 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 839 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 838 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 779 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 719 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 718 tgaatgtgaagaag 705
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 547/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1337 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1336 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1278 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1218 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1158 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1098 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1038 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 978 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 918 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 858 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 857 tgaatgtgaagaag 844
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 546/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1111 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaag 977
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 547/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1533 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1474 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1473 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1415 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1355 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1115 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1055 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 995 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 994 tgaatgtgaagaag 981
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 547/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1337 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1336 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1278 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1218 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1158 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1098 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1038 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 978 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 918 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 858 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 857 tgaatgtgaagaag 844
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 546/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 546/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsssc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 546/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgssc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 547/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 tatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1330 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1329 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1271 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1211 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1151 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1091 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1031 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 971 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 911 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 851 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 850 tgaatgtgaagaag 837
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 546/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsssc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 547/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgctg 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 545/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1529 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1470 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1469 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1411 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1351 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1291 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 aagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1231 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1171 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 ataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaac 1111 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1051 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 991 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 990 tgaatgtgaagaag 977
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 546/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1533 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1474 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1473 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1415 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1355 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1115 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1055 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 995 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 994 tgaatgtgaagaag 981
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 546/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1409 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1408 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1350 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1290 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1230 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 aagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1170 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1110 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1050 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 990 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 930 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 929 tgaatgtgaagaag 916
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 546/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1330 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1329 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1271 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1211 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1151 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1091 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 acanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1031 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 971 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 911 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 851 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 850 tgaatgtgaagaag 837
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 546/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcggcc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 545/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 545/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagat 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 | |||||||||||| Sbjct: 881 tcaatgtgaagaag 868
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 545/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1533 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1474 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1473 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1415 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1355 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1115 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1055 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 aatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 995 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 994 tgaatgtgaagaag 981
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 542/554 (97%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsssc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 544/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1533 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1474 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1473 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1415 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1414 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggt 1355 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1295 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1235 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1175 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1115 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1055 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 995 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 994 tgaatgtgaagaag 981
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 544/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1471 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagtt 1412 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1411 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1353 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1293 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1292 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1233 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1173 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1113 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1053 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 993 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 992 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacgg 933 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 932 tgaatgtgaagaag 919
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 544/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 543/554 (98%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgccc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 542/554 (97%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1400 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagtt 1341 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1340 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1282 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggt 1222 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1221 gcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1162 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1102 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1042 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 922 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 862 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 861 tgaatgtgaagaag 848
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 542/554 (97%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 542/554 (97%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagc 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 542/554 (97%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1518 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagtt 1459 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1458 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1400 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1340 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1339 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccca 1280 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1220 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1160 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1159 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagc 1100 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1040 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 980 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 979 tgaatgtgaagaag 966
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 542/554 (97%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 539/554 (97%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1471 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgssc 1412 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1351 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccca 1292 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1111 ttacctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagct 1052 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 992 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 991 tgaatgtgaagaag 978
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 541/554 (97%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1380 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagtt 1321 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1320 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1262 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggt 1202 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1201 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcacca 1142 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1082 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 acacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1022 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 962 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 902 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 842 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 841 tgaatgtgaagaag 828
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 541/554 (97%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 540/554 (97%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgt 1285 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1225 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1224 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1165 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1164 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1105 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1045 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 985 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 925 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 924 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 865 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 864 tgaatgtgaagaag 851
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 530/540 (98%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 74 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 75 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagc 134 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagc 1278 Query: 135 ttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagg 194 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1277 ttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagg 1218 Query: 195 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcag 254 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcag 1158 Query: 255 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgga 314 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatgga 1098 Query: 315 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcg 374 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcg 1038 Query: 375 caataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 434 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 caataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 978 Query: 435 accggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 494 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 accggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 918 Query: 495 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 858
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 540/554 (97%), Gaps = 3/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 124638 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124637 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124578 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 124577 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcccca 124518 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124517 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtata 124459 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124458 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-ca 124400 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124399 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124340 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124339 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124280 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124279 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124220 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 124219 tgaatgtgaagaag 124206 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 540/554 (97%), Gaps = 3/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30111 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30110 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30051 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 30050 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcccca 29991 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 29990 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtata 29932 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29931 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-ca 29873 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29872 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29813 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29812 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29753 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29752 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29693 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 29692 tgaatgtgaagaag 29679
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55404 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55403 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55344 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55343 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55284 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55283 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55224 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55223 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55164 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55163 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaagaag 54970
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55404 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55403 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55344 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55343 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55284 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55283 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55224 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55223 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55164 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55163 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaagaag 54970
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55352 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55351 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55292 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55291 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55232 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55231 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55172 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55171 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55112 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55111 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55052 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55051 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54992 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54991 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54932 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 54931 tgaatgtgaagaag 54918
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 125693 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 125692 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 125633 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 125632 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 125573 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 125572 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 125513 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125512 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 125453 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125452 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 125393 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125392 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 125333 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 125332 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 125273 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 125272 tgaatgtgaagaag 125259 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30633 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30632 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30573 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30572 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30513 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30512 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 30453 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30452 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 30393 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30392 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 30333 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30332 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 30273 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 30272 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 30213 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 30212 tgaatgtgaagaag 30199
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 124720 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124719 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124660 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 124659 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 124600 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124599 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 124540 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124539 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 124480 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124479 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124359 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124300 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 124299 tgaatgtgaagaag 124286 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30139 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30079 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30078 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30019 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 29959 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 29899 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29779 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29719 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 29718 tgaatgtgaagaag 29705
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 124720 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124719 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124660 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 124659 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 124600 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124599 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 124540 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124539 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 124480 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124479 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124359 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124300 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 124299 tgaatgtgaagaag 124286 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30139 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30079 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30078 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30019 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 29959 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 29899 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29779 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29719 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 29718 tgaatgtgaagaag 29705
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55396 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55395 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55336 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55335 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55276 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55275 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55216 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55215 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55156 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55155 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55096 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55095 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55036 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55035 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54976 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 54975 tgaatgtgaagaag 54962
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1241 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1286 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1226 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1225 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1166 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1165 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1106 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1046 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 986 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 926 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 925 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 866 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 865 tgaatgtgaagaag 852
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 33527268 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527269 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 33527328 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 33527329 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 33527388 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 33527389 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 33527448 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527449 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 33527508 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527509 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 33527568 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527569 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 33527628 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 33527629 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 33527688 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 33527689 tgaatgtgaagaag 33527702
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 72465 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 72466 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 72525 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 72526 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 72585 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 72586 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 72645 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72646 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 72705 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72706 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 72765 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72766 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 72825 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 72826 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 72885 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 72886 tgaatgtgaagaag 72899
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1357 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1297 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1296 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1237 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1236 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1177 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1117 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1057 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 997 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 996 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 937 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 936 tgaatgtgaagaag 923
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1100 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1040 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1039 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 980 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 979 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 920 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 860 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 800 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 799 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 740 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 739 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 680 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 679 tgaatgtgaagaag 666
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55331 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55330 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55271 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55270 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55211 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55210 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55151 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55150 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55091 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55090 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55031 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55030 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54971 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54970 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54911 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 54910 tgaatgtgaagaag 54897
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 537/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1722 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1721 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1662 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1661 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1602 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1601 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1542 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1541 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1482 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1481 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1422 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1362 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1302 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 1301 tgaatgtgaagaag 1288 Score = 52.0 bits (26), Expect = 0.002 Identities = 29/30 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 83 tcggataatttcattaccttcgcgagcaag 112 ||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaag 1917
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 497/501 (99%), Gaps = 1/501 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagg 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag- 1289 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaag 848
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1241 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 512/522 (98%), Gaps = 1/522 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 33 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 92 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 93 tcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 152 ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 153 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 212 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 213 accaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 272 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 273 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 332 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 333 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 393 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatc 452 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatc 950 Query: 453 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 513 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 848
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 tatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1348 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1347 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1289 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1288 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1229 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1228 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1169 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1168 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1109 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1049 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 989 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 929 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 928 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 869 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 868 tgaatgtgaagaag 855
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 521/534 (97%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtccttcgttacgagcttgtac 1267 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1266 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1207 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1147 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 catatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggataccca 1087 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1027 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggc 967 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaag 853
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1405 tatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1346 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1345 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1287 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1286 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1227 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1226 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1167 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1166 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1107 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1047 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 987 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 927 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 926 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 867 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 866 tgaatgtgaagaag 853
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1360 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1359 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1301 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1300 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1241 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1240 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1181 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1180 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1121 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1061 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1001 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 941 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 940 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 881 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 880 tgaatgtgaagaag 867
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 53606 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 53605 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 53546 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 53545 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 53486 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 53485 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 53426 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53425 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 53366 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53365 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 53306 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53305 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 53246 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 53245 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 53186 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 53185 tgaatgtgaagaag 53172
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 128539 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 128538 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 128479 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 128478 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 128419 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 128418 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 128359 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128358 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 128299 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128298 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 128239 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128238 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 128179 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 128178 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 128119 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 128118 tgaatgtgaagaag 128105
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 10347214 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347213 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 10347154 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 10347153 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 10347094 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10347093 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 10347034 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347033 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 10346974 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346973 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 10346914 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346913 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10346854 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10346853 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10346794 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 10346793 tgaatgtgaagaag 10346780
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 10353253 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353252 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 10353193 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 10353192 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 10353133 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10353132 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 10353073 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353072 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 10353013 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353012 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 10352953 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352952 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10352893 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10352892 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10352833 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 10352832 tgaatgtgaagaag 10352819
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 536/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1689 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1688 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1629 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1628 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1569 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1568 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1509 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1449 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1448 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1389 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 ttacctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1329 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1328 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1269 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 1268 tgaatgtgaagaag 1255
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 487/489 (99%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttc 125 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaag 856
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 494/499 (98%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1251 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaag 812
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 494/499 (98%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1251 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaag 812
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 494/499 (98%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1287 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1227 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1167 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 987 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaag 848
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1392 tatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagtt 1333 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1332 caggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgc 1274 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 974 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 914 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 913 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 854 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 853 tgaatgtgaagaag 840
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 493/498 (98%), Gaps = 1/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atc 1286 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1166 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 417 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 476 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 477 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 537 acggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaag 848
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 atataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagtt 1361 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1360 caggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaag 868
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 5614444 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614443 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 5614384 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 5614383 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 5614324 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614323 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 5614264 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614263 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 5614204 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614203 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 5614144 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614143 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614084 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614083 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 5614024 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 5614023 tgaatgtgaagaag 5614010 Score = 446 bits (225), Expect = e-122 Identities = 244/249 (97%), Gaps = 1/249 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaag 13436856 Score = 163 bits (82), Expect = 8e-37 Identities = 88/90 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 465 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 525 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaag 13398007 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 251 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 280 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 331 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.48 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 249 ggtcagagctggcatatgccaa 270 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 5614433 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614432 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 5614373 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 5614372 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 5614313 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614312 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 5614253 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614252 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 5614193 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614192 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 5614133 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614132 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614073 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614072 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 5614013 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 5614012 tgaatgtgaagaag 5613999 Score = 446 bits (225), Expect = e-122 Identities = 244/249 (97%), Gaps = 1/249 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaag 13391130 Score = 163 bits (82), Expect = 8e-37 Identities = 88/90 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 465 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 525 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaag 13352281 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 108 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 251 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 280 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 331 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.48 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 249 ggtcagagctggcatatgccaa 270 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 38441 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38442 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 38501 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 38502 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 38561 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38562 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 38621 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38622 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 38681 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38682 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 38741 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38742 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38801 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38802 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38861 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 38862 tgaatgtgaagaag 38875
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 486/489 (99%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttc 125 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcccttc 1271 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1211 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1151 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1091 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1031 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 971 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 911 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 851 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 850 gtgaagaag 842
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 534/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1276 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1275 caggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1217 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1157 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1097 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtata 1037 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1036 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttca 977 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagct 857 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 856 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 797 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 796 tgaatgtgaagaag 783
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 534/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1335 tatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaagtt 1276 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1275 cagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1217 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1157 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1097 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1037 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 acaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 977 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 857 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 856 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 797 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 796 tgaatgtgaagaag 783
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 2/554 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 23203692 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203693 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 23203751 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 23203752 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 23203811 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 23203812 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 23203871 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203872 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 23203931 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 23203932 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 23203991 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203992 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 23204051 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 23204052 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 23204111 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 23204112 tgaatgtgaagaag 23204125 Score = 111 bits (56), Expect = 2e-21 Identities = 59/60 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 112 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Score = 111 bits (56), Expect = 2e-21 Identities = 59/60 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 112 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 2/554 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 154340 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 154341 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 154399 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 154400 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 154459 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 154460 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 154519 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154520 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 154579 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 154580 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 154639 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154640 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 154699 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 154700 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 154759 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 154760 tgaatgtgaagaag 154773
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 535/554 (96%), Gaps = 2/554 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 38454 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38455 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 38513 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 38514 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 38573 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38574 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 38633 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38634 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 38693 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 38694 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 38753 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38754 ttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38813 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38814 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38873 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 38874 tgaatgtgaagaag 38887
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 494/501 (98%), Gaps = 1/501 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagg 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1289 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaag 848
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 492/499 (98%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1305 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1245 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1244 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1185 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1125 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1065 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1064 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctcccctt 1005 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaag 866
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 492/499 (98%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1097 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaag 838
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 509/522 (97%), Gaps = 1/522 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 33 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 92 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 93 tcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 152 ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 153 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 212 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 213 accaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 272 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 273 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 332 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 333 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 393 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatc 452 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatc 950 Query: 453 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 513 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 848
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 484/489 (98%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttc 125 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaag 856
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 491/499 (98%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaag 832
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 491/499 (98%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1288 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1228 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1227 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1168 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1167 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactg 1108 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaag 849
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 491/499 (98%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaag 832
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 524/543 (96%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 71 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 72 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacg 131 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 132 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 191 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 ggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 192 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 251 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggt 1171 Query: 252 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 311 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 312 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 371 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 372 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 431 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 432 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 491 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 492 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 551 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 552 aag 554 ||| Sbjct: 870 aag 868
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 499/510 (97%), Gaps = 1/510 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 104 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 105 cgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 164 |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1240 Query: 165 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 224 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1180 Query: 225 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 284 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1120 Query: 285 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 344 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1060 Query: 345 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1059 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttc 1000 Query: 405 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 940 Query: 465 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 880 Query: 525 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 850
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 517/534 (96%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtac 1267 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1266 acaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1207 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1147 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1146 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccca 1087 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1027 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggc 967 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaag 853
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 532/554 (96%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1390 tatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1331 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1330 caggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1272 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 ccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1212 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1211 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1152 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1151 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1092 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1091 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttca 1032 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 972 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 912 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 911 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 852 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 851 tgaatgtgaagaag 838
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttc 125 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgtccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaag 856
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 492/501 (98%), Gaps = 1/501 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagg 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1290 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1230 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1170 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1110 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1050 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 990 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaag 849
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 490/499 (98%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccg 1097 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctt 1037 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaag 838
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 523/543 (96%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 71 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 72 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacg 131 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 132 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 191 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 ggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 192 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 251 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggt 1171 Query: 252 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 311 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 312 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 371 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 372 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 431 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 432 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 491 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 492 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 551 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 552 aag 554 ||| Sbjct: 870 aag 868
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 531/554 (95%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1837 tatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1778 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1777 caggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgc 1719 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1718 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggt 1659 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1658 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1599 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1598 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1539 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1538 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1479 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1478 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1419 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1418 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagct 1359 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1358 aatacacggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1299 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 1298 tgaatgtgaagaag 1285
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 531/554 (95%), Gaps = 1/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 60 |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1857 tatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1798 Query: 61 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgc 120 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1797 caggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgc 1739 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1738 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1679 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1678 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1619 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1618 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1559 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1558 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1499 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1498 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1439 Query: 421 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1438 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagct 1379 Query: 481 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1378 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1319 Query: 541 tgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||| Sbjct: 1318 tgaatgtgaagaag 1305
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 482/489 (98%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1287 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1227 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1226 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1167 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1107 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1047 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 987 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 927 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 867 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 866 gtgaagaag 858
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 491/501 (98%), Gaps = 1/501 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagg 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1294 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1234 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1233 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1174 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 atccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1114 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1054 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 994 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaag 853
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 493/504 (97%), Gaps = 1/504 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 51 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 110 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 111 aggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 170 || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 ag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1252 Query: 171 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 230 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1192 Query: 231 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 290 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 atcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1132 Query: 291 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1072 Query: 351 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 410 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1012 Query: 411 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 470 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 471 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 531 cattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaag 868
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 484/493 (98%), Gaps = 1/493 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcc 121 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1289 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1229 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1228 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1169 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1109 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 422 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 481 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 482 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 542 gaatgtgaagaag 554 ||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaag 856
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 489/499 (97%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaag 832
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 486/495 (98%), Gaps = 1/495 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 540 gtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaag 868
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 515/534 (96%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtac 1269 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1268 acaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1209 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1149 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1148 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccca 1089 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 gtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1029 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggc 969 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 968 gtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 909 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 908 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaag 855
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 509/526 (96%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 88 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 89 aatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 148 ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1274 Query: 149 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 208 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 209 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 268 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 269 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 328 ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgag 1094 Query: 329 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 389 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 448 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacat 974 Query: 449 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 508 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 914 Query: 509 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaag 868
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttc 125 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatata 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaag 856
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 490/501 (97%), Gaps = 1/501 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagg 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1296 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1236 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1235 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1176 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1175 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1116 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1056 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 996 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaag 855
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 486/496 (97%), Gaps = 1/496 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcac 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcac 1265 Query: 119 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 178 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1205 Query: 179 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 238 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1204 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1145 Query: 239 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 298 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 299 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 359 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 418 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 419 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 479 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 539 ggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaag 829
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 486/496 (97%), Gaps = 1/496 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcac 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcac 1265 Query: 119 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 178 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1205 Query: 179 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 238 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1204 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1145 Query: 239 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 298 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 299 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 359 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 418 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 419 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 479 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 539 ggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaag 829
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 495/508 (97%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 495/508 (97%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 483/493 (97%), Gaps = 1/493 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcc 121 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1289 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1229 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1228 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1169 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataa 1109 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 422 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 481 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 482 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 542 gaatgtgaagaag 554 ||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaag 856
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 488/499 (97%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1287 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcac 1227 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcat 1167 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 987 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaag 848
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 482/491 (98%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgccct 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgccct 1269 Query: 124 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1209 Query: 184 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 243 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1208 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaag 1149 Query: 244 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1148 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataaca 1089 Query: 304 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1029 Query: 364 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 969 Query: 424 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 483 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 484 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 543 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849 Query: 544 atgtgaagaag 554 ||||||||||| Sbjct: 848 atgtgaagaag 838
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 508/526 (96%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 88 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 89 aatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 148 ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1258 Query: 149 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 208 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1198 Query: 209 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 268 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1197 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1138 Query: 269 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 328 |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 aaacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgag 1078 Query: 329 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1018 Query: 389 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 448 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1017 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatat 958 Query: 449 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 508 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 957 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 898 Query: 509 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 897 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaag 852
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 514/534 (96%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtac 120363 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 120362 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 120303 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120302 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 120243 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120242 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggataccca 120183 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120182 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 120123 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120122 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 120063 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120062 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 120003 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 120002 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaag 119949
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 514/534 (96%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtac 58736 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 58735 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 58676 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58675 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 58616 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58615 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggataccca 58556 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58555 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 58496 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58495 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 58436 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58435 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 58376 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 58375 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaag 58322
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 514/534 (96%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1789 aatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1730 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1729 gctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgggcttgtac 1671 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1670 acaggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1611 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1610 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctgg 1551 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1550 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgccca 1491 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1431 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 1371 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 1311 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1310 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaag 1257
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaag 856
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaag 856
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaag 856
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaag 856
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 489/501 (97%), Gaps = 1/501 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagg 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1289 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1229 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1169 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaag 848
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 487/499 (97%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1291 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1231 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1230 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1171 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1111 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1110 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatctt 1051 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 tttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 991 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaag 852
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 484/495 (97%), Gaps = 1/495 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1292 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1232 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1231 tgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1172 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1171 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtat 1112 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 aacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1052 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 992 Query: 420 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932 Query: 480 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872 Query: 540 gtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaag 857
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 487/499 (97%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 ctggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaag 838
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 513/534 (96%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtac 1282 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1281 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1222 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1162 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 catatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggataccca 1102 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1042 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 982 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 922 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 921 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaag 868
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 513/534 (96%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtac 58155 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 58154 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 58095 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58094 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 58035 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58034 catatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggataccca 57975 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57974 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 57915 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57914 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 57855 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57854 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 57795 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 57794 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaag 57741
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 513/534 (96%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtac 58165 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 58164 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 58105 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58104 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 58045 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58044 catatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggataccca 57985 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57984 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 57925 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57924 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 57865 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57864 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 57805 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 57804 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaag 57751
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 493/508 (97%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1194 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1136 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1076 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1075 cngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1016 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 aagcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 956 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 cacgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 896 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 836 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 776 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 775 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 748
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 493/508 (97%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 493/508 (97%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 493/508 (97%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 465/471 (98%), Gaps = 1/471 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 143 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1241 Query: 144 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1240 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1181 Query: 204 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 263 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 264 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 324 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 384 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 941 Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 830
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 486/499 (97%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1288 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcac 1228 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1227 ccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1168 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1167 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccg 1108 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 | ||||||||||||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaag 849
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 465/471 (98%), Gaps = 1/471 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 143 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1241 Query: 144 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1240 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1181 Query: 204 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 263 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 264 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 324 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 384 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 941 Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 830
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 486/499 (97%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatctt 1037 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaag 838
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttc 125 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaag 856
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttc 125 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaag 856
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 492/508 (96%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 492/508 (96%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>emb|AJ746283.1| Aristida congesta subsp. barbicollis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 492/508 (96%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 492/508 (96%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|U31359.1|ACU31359 Aristida congesta subsp. barbicollis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 492/508 (96%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 492/508 (96%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 492/508 (96%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 464/471 (98%), Gaps = 1/471 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 143 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1238 Query: 144 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1178 Query: 204 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 263 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 264 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 324 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 384 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 938 Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 827
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 464/471 (98%), Gaps = 1/471 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 cggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 143 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1238 Query: 144 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1178 Query: 204 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 263 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 264 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 324 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 384 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 938 Query: 444 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 504 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 827
>gb|AY506529.1| Zea mays strain NB mitochondrion, complete genome Length = 569630 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 511/534 (95%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 349056 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 349115 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349116 gctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtac 349174 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 349175 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 349234 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349235 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 349294 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349295 catatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggataccca 349354 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349355 gtcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 349414 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349415 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 349474 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349475 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 349534 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 349535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaag 349588
>gb|DQ490952.1| Zea mays subsp. mays genotype male-fertile NA mitochondrion, complete genome Length = 701046 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 511/534 (95%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 206653 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 206594 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206593 gctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtac 206535 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 206534 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 206475 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206474 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 206415 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206414 catatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggataccca 206355 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206354 gtcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 206295 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206294 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 206235 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206234 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 206175 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 206174 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaag 206121 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 511/534 (95%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 77961 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 77902 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77901 gctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtac 77843 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 77842 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 77783 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77782 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 77723 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77722 catatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggataccca 77663 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77662 gtcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 77603 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77602 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 77543 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77542 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 77483 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 77482 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaag 77429
>emb|AJ746253.1| Arthraxon sp. TH-111 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1391 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 511/534 (95%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1387 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1328 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtac 1269 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1268 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1209 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1149 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 catatgccaaacatgaataccccctgaagccactggtacaacacctggcatggataccca 1089 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1029 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 969 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 968 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtatacc 909 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 908 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaag 855
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 477/489 (97%), Gaps = 1/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttc 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1295 Query: 126 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 185 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1235 Query: 186 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| Sbjct: 1234 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagat 1175 Query: 246 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1115 Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1055 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 995 Query: 426 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 485 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 935 Query: 486 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 875 Query: 546 gtgaagaag 554 ||||||||| Sbjct: 874 gtgaagaag 866
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 486/501 (97%), Gaps = 1/501 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagg 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1279 Query: 114 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 173 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 174 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 233 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 234 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1158 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1099 Query: 294 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 353 |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1039 Query: 354 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 414 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 473 |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 474 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 533 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 534 tgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaag 838
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 474/486 (97%), Gaps = 1/486 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgtt 128 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgtt 1274 Query: 129 acgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccc 188 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1273 acgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcc 1214 Query: 189 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttc 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1213 ccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttc 1154 Query: 249 ggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctgg 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1153 agtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctgg 1094 Query: 309 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1034 Query: 369 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 974 Query: 429 tactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 488 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 tactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 489 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 549 aagaag 554 |||||| Sbjct: 853 aagaag 848
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 491/508 (96%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcatagctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 491/508 (96%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|U31104.1|ECU31104 Eragrostis capensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 491/508 (96%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aacgatctttttcttgataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 484/499 (96%), Gaps = 1/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggat 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 116 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1217 Query: 176 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 235 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 236 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 295 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 296 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 355 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 356 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 416 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 476 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 535 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 536 cacggtgaatgtgaagaag 554 | ||||||||||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|DQ490951.1| Zea mays subsp. mays genotype CMS-S mitochondrion, complete genome Length = 569553 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 510/534 (95%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 80 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 540663 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 540604 Query: 81 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtac 140 ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540603 gctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtac 540545 Query: 141 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 200 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 540544 acaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 540485 Query: 201 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 260 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540484 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 540425 Query: 261 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 320 ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540424 catatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggataccca 540365 Query: 321 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 380 |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540364 gtccagagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 540305 Query: 381 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 440 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540304 atcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 540245 Query: 441 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 500 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540244 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 540185 Query: 501 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 540184 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaag 540131
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 468/478 (97%), Gaps = 1/478 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagctt 136 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagctt 1229 Query: 137 gtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 196 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1228 gtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1169 Query: 197 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagag 256 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagag 1109 Query: 257 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 1049 Query: 317 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 376 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 cccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 989 Query: 377 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 929 Query: 437 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 496 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 497 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 811
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 468/478 (97%), Gaps = 1/478 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 77 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagctt 136 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagctt 1229 Query: 137 gtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggat 196 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1228 gtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggat 1169 Query: 197 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagag 256 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagag 1109 Query: 257 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 1049 Query: 317 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 376 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 cccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 989 Query: 377 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 929 Query: 437 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 496 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 497 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 811
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 483/498 (96%), Gaps = 1/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaggatc 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atc 1306 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1246 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1186 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 417 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 476 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 477 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 536 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 537 acggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaag 868
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 494/513 (96%), Gaps = 1/513 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 42 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 101 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 102 tcgcgagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 161 || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaag-atctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccg 1243 Query: 162 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 221 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 gttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1183 Query: 222 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 281 |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 taatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1123 Query: 282 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 341 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1122 ccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagatacc 1063 Query: 342 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 401 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 gcgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1003 Query: 402 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccaga 943 Query: 462 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 521 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaat 883 Query: 522 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 882 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaag 850
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 493/509 (96%), Gaps = 3/509 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 105 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 106 gagcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 165 ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 1227 Query: 166 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 225 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 gctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1167 Query: 226 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 285 || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1166 acggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccct 1107 Query: 286 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 345 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1047 Query: 346 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 405 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1046 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 987 Query: 406 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 465 || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 cgctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 525 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 526 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 838
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 490/508 (96%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttccc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatag 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838
>gb|U31105.1|GSU31105 Gynerium sagittatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 490/508 (96%), Gaps = 1/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 47 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 106 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 107 agcaaggatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 407 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccccgacatac 926 Query: 467 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccataatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 527 catgcattgcacggtgaatgtgaagaag 554 |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaag 838 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,276,216 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4276216 Number of successful extensions: 123480 Number of sequences better than 10.0: 15324 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15277 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 58 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 84199 Number of HSP's gapped (non-prelim): 21607 length of query: 554 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 531 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 9103091080824 effective search space used: 9103091080824 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)