Clone Name | rbasd25g14 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 577/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 577/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 577/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 889
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 576/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 889
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 575/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctakttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 575/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyt 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 575/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyt 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 889
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 575/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 575/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 841
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 575/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 574/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkagstaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 565/568 (99%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1516 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1457 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1456 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 1397 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 1337 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1277 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 1217 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1157 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 1097 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 1037 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 978 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 -taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 575/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taaaccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 575/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taaaccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 575/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taaaccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 575/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taaaccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 575/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taaaccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 575/580 (99%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taaaccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 565/568 (99%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1454 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1395 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1394 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 1335 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1334 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 1275 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1274 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1215 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1214 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 1155 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1154 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1095 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1094 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 1035 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 975 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 974 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 916 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 -taagccattgtcgcggcaatagtgagc 889
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 574/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccaggagca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 573/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnntaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 573/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 573/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 573/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 573/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 573/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 572/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 571/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 nntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 572/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1418 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1417 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1358 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1298 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1238 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1178 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1118 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1058 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 998 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 997 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 939 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 938 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 900
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 571/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaatartgagc 951
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 572/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 572/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 572/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 571/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 572/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 572/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 571/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaatartgagc 889
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 571/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 572/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 572/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 572/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56326 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 56268 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 56267 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 56208 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56207 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 56148 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56147 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 56088 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56087 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 56028 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56027 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 55968 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55967 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 55908 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55907 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 55848 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55847 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 55789 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 55788 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 55750
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 572/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1512 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1454 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1453 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1394 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1334 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1274 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1214 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1154 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1094 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1034 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1033 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 975 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 974 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 936
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 567/574 (98%), Gaps = 3/574 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1254 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1196 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1195 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1136 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1076 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1075 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1016 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 956 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 896 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 836 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 776 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 775 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 717 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaata 574 |||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 716 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaata 684
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 567/574 (98%), Gaps = 3/574 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1254 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1196 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1195 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1136 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1076 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1075 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1016 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 956 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 896 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 836 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 776 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 775 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 717 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaata 574 |||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 716 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaata 684
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 571/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 571/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 571/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 561/568 (98%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1454 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1395 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1394 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1335 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1334 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1275 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1274 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1215 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1214 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 1155 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1154 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1095 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1094 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 1035 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 975 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 974 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 916 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 915 -taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 571/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 569/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnncccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1468 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1467 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1408 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1348 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1288 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1228 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1168 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1108 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1048 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1047 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 989 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 560/568 (98%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1516 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1457 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1456 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1397 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1396 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1337 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1277 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 1217 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1157 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 1097 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 1037 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 978 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 -taggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1468 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1467 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1408 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1348 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1288 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1228 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1168 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1108 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1048 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1047 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 989 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1468 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1467 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1408 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1348 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1288 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1228 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1168 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1108 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1048 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1047 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 989 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1468 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1467 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1408 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1348 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1288 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1228 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1168 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1108 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1048 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1047 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 989 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1468 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1467 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1408 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1348 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1288 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1228 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1168 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1108 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1048 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1047 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 989 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1326 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1325 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1266 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1206 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1146 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1086 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1026 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaactta 966 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 cctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 906 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 905 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 847 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 846 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 808
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 570/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcacggcaataatgagc 889
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 569/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 998 cctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagataat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtc 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 841
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 569/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 559/568 (98%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1347 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1346 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagct 1287 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1286 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1227 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1167 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 1107 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1047 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 987 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 927 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 926 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 868 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 867 -taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 569/580 (98%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 568/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1468 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1467 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1408 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1348 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1288 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1228 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1168 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1108 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1048 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1047 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 989 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 559/568 (98%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1460 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1459 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagct 1400 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1399 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1340 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1280 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 1220 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1160 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 1100 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 1040 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1039 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 981 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 980 -taggccattgtcgcggcaataatgagc 954
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 568/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 568/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 568/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 559/568 (98%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1375 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1316 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1315 caagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1256 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1255 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1196 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1195 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1136 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 1076 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1075 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1016 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 956 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 896 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 895 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 837 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 836 -taggccattgtcgcggcaataatgagc 810
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 568/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 564/574 (98%), Gaps = 3/574 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1254 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1196 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1195 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1136 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1135 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggtgca 1076 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1075 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1016 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 956 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 896 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 836 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 776 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 775 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 717 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaata 574 |||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 716 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaata 684
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 567/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1468 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1467 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1408 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1348 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1288 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 rtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1228 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1168 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaactta 1108 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1048 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1047 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 989 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 558/568 (98%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1460 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1459 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagct 1400 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1399 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1340 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1280 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 1220 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1160 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 aataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 1100 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 1040 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1039 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 981 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 980 -taggccattgtcgcggcaataatgagc 954
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 568/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 558/568 (98%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1375 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1316 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1315 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagct 1256 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1255 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1196 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1195 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1136 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1135 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacanctggcatggat 1076 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1075 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1016 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 956 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 896 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 895 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 837 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 836 -taggccattgtcgcggcaataatgagc 810
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 568/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggcccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 558/568 (98%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1382 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1323 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1322 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagct 1263 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1262 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1203 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1202 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1143 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1142 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 1083 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1023 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1022 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 963 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 903 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 902 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 844 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 843 -tagtccattgtcgcggcaataatgagc 817
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 558/568 (98%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1382 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1323 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1322 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagct 1263 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1262 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1203 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1202 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1143 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1142 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 1083 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1023 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1022 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 963 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 903 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 902 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 844 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 843 -tagtccattgtcgcggcaataatgagc 817
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 568/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1407 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct: 1406 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgctgcct 1347 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1287 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1227 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1167 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1107 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1047 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 987 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 986 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 928 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaag-taggccattgtcacggcaataatgagc 889
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 565/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcg-aacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1469 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1468 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccct 1409 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1349 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1348 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaag 1289 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1229 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 cnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttcaata 1169 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1109 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1049 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1048 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 990 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 557/568 (98%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1460 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1459 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagct 1400 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1399 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1340 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1280 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 1220 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1160 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 1100 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 1040 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1039 ataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 981 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 980 -taggccattgtcgcggcaataatgagc 954
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 556/568 (97%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1460 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1459 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagct 1400 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1399 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggtgcatttccccaagga 1340 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1339 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1280 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 1220 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1160 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 1100 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 1040 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1039 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 981 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 980 -taggccattgtcgcggcaataatgagc 954
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 566/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1468 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttca 1410 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1409 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1350 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1290 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1289 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaag 1230 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1170 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1110 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 aaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1050 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 990 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 989 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcac-ggtg 931 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 930 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 892
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 566/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 565/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 556/568 (97%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 977 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 917 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 916 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 858 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 857 -taagccattgtcgcggcaataatgagc 831
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 552/568 (97%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1516 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1457 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1456 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttacgagct 1397 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1396 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1337 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcaga 1277 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 1217 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1157 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1156 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctannnctgta 1097 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagctaatacacggaaatgc 1037 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 978 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 -taggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 564/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1397 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttca 1339 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1338 ggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1279 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1278 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggtgca 1219 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1218 tttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaag 1159 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1099 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1039 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaactta 979 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 919 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 918 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 860 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 859 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 564/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1238 ttcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcac-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 564/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagctta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 564/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1515 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttca 1457 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1456 ggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1397 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1337 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1336 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaag 1277 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 atttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1217 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 cctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1157 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1156 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagctta 1097 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1037 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1036 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 978 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 977 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 939
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 563/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1377 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttca 1319 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1318 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1259 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgca 1199 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1198 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaag 1139 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1079 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 cctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1019 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 959 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 899 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 898 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 840 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 839 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 801
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 563/580 (97%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 562/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 ctaccggctcg-aactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 1342 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1341 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtcct 1282 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1222 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1221 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1162 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1161 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1102 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1042 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 982 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 922 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 921 acacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc-ccggtg 863 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 862 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 824
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 514/517 (99%), Gaps = 2/517 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 829
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 562/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 atttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-caggccattgtcacggcaataatgagc 841
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 513/517 (99%), Gaps = 2/517 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaat 851 Query: 544 gtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 gtgaagaag-taagccattgtcgcggcaatagtgagc 815
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 520/527 (98%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaatagtgagc 785
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 520/527 (98%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaatagtgagc 785
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 537/550 (97%), Gaps = 2/550 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 90 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 91 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 150 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 151 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 210 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 211 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 270 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 271 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 330 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 331 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 391 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatct 949 Query: 451 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 889 Query: 511 ctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggc 570 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 888 ctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggc 831 Query: 571 aatagtgagc 580 |||| ||||| Sbjct: 830 aataatgagc 821
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 546/562 (97%), Gaps = 2/562 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc-ccggtgaatgtgaagaag-taggc 848 Query: 559 cattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 847 cattgtcgcggcaataatgagc 826
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 521/529 (98%), Gaps = 2/529 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 532 gcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 867 gcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcacggcaataatgagc 821
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 519/527 (98%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 865 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 518/526 (98%), Gaps = 2/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 115 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 174 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 175 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 234 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 235 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 295 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 355 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 415 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 475 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 535 cgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 c-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 549/568 (96%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 aactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1347 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1346 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1287 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1286 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1227 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 1226 tgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcaga 1167 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 gctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggat 1107 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1047 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 aataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaacttacctactactgta 987 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 986 ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgc 927 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 926 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag 868 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 867 -taagccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 559/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttca 1343 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1342 ggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1283 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1282 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgca 1223 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1222 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1163 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1162 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1103 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 cctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1043 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 983 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 923 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 922 acacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc-ccggtg 864 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 863 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 825
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 561/580 (96%), Gaps = 5/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124753 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 124695 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 124694 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 124635 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124634 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 124575 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 124574 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaag 124515 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 124514 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataaca 124456 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 124455 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaata 124397 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124396 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 124337 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124336 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 124277 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 124276 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 124218 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 124217 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 124179 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 561/580 (96%), Gaps = 5/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30226 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 30168 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 30167 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 30108 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30107 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 30048 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 30047 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaag 29988 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 29987 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataaca 29929 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 29928 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaata 29870 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29869 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 29810 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29809 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 29750 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 29749 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 29691 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 29690 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 29652
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 519/529 (98%), Gaps = 2/529 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 532 gcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 867 gcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55519 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 55461 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 55460 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 55401 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55400 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 55341 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 55340 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 55281 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 55280 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 55221 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55220 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 55161 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55160 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 55101 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55100 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 55041 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 55040 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 54982 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 54981 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 54943
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55519 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 55461 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 55460 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 55401 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55400 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 55341 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 55340 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 55281 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 55280 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 55221 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55220 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 55161 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55160 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 55101 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55100 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 55041 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 55040 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 54982 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 54981 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 54943
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55467 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 55409 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 55408 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 55349 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55348 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 55289 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 55288 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 55229 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 55228 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 55169 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55168 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 55109 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55108 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 55049 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55048 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 54989 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 54988 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 54930 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 54929 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 54891
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125808 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 125750 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 125749 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 125690 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125689 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 125630 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 125629 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 125570 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 125569 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 125510 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125509 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 125450 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125449 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 125390 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125389 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 125330 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 125329 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 125271 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 125270 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 125232 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30748 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 30690 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 30689 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 30630 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30629 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 30570 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 30569 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 30510 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 30509 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 30450 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30449 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 30390 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30389 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 30330 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30329 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 30270 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 30269 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 30211 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 30210 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 30172
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124835 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 124777 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 124776 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 124717 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124716 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 124657 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 124656 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 124597 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 124596 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 124537 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124536 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 124477 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124476 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 124417 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124416 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 124357 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 124356 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 124298 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 124297 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 124259 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30254 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 30196 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 30195 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 30136 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30135 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 30076 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 30075 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 30016 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 30015 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 29956 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29955 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 29896 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29895 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 29836 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29835 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 29776 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 29775 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 29717 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 29716 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 29678
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124835 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 124777 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 124776 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 124717 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124716 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 124657 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 124656 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 124597 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 124596 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 124537 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124536 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 124477 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124476 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 124417 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124416 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 124357 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 124356 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 124298 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 124297 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 124259 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30254 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 30196 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 30195 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 30136 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30135 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 30076 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 30075 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 30016 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 30015 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 29956 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29955 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 29896 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29895 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 29836 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29835 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 29776 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 29775 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 29717 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 29716 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 29678
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55511 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 55453 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 55452 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 55393 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55392 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 55333 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 55332 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 55273 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 55272 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 55213 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55212 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 55153 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55152 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 55093 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55092 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 55033 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 55032 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 54974 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 54973 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 54935
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 1238 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 938 acacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc-ccggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 ctaccggctcg-aactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttca 1346 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1345 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1286 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1285 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgca 1226 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1225 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1166 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1165 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1106 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 cctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1046 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 986 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 926 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 925 acacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc-ccggtg 867 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 866 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 828
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 ctaccggctcg-aactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttca 1344 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1343 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1284 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1283 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgca 1224 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1223 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1164 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1104 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1044 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 984 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 cctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 924 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 923 acacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc-ccggtg 865 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 826
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ctaccggctcg-aactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttca 1358 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1357 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1298 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1297 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgca 1238 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1237 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1178 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1177 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1118 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 cctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1058 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 998 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 cctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 938 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 937 acacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc-ccggtg 879 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 878 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 840
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527153 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 33527211 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 33527212 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 33527271 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527272 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 33527331 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 33527332 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 33527391 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 33527392 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 33527451 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527452 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 33527511 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527512 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 33527571 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527572 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 33527631 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 33527632 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 33527690 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 33527691 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 33527729
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72350 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 72408 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 72409 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 72468 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72469 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 72528 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 72529 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 72588 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 72589 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 72648 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72649 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 72708 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72709 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 72768 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72769 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 72828 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 72829 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 72887 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 72888 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 72926
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 1414 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1413 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1354 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 1294 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 1293 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 1234 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1233 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1174 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1114 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1054 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 994 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 993 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 935 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 934 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 896
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 1157 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1156 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1097 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 1037 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 1036 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 977 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 976 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 917 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 857 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 856 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 797 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 737 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 736 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 678 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 677 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 639
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55446 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 55388 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 55387 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 55328 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55327 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 55268 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 55267 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 55208 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 55207 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 55148 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55147 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 55088 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55087 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 55028 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55027 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 54968 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 54967 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 54909 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 54908 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 54870
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1837 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 1779 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1778 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1719 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1718 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 1659 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 1658 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 1599 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1598 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1539 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1479 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1419 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1359 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 1358 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 1300 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 1299 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 1261 Score = 58.0 bits (29), Expect = 3e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 81 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 517/527 (98%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 944 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 884 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 883 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 839
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 517/527 (98%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 855 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 534/550 (97%), Gaps = 2/550 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 90 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 91 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 150 ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 151 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 210 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 211 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 270 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 271 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 330 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 331 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 391 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatct 949 Query: 451 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 889 Query: 511 ctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggc 570 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 888 ctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggc 831 Query: 571 aatagtgagc 580 |||| ||||| Sbjct: 830 aataatgagc 821
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%), Gaps = 2/517 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 539/557 (96%), Gaps = 2/557 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 tgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctc 82 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctt 1252 Query: 83 ggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaag 142 |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1251 tgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacagg 1192 Query: 143 cttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaag 202 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 cttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaag 1132 Query: 203 ttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatat 262 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 ttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatat 1072 Query: 263 gccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcct 322 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 gccaaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcct 1012 Query: 323 gagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaa 382 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 gagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaa 952 Query: 383 caaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgga 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 caaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgga 892 Query: 443 tatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgat 502 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 tatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgat 832 Query: 503 ttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccatt 562 ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 831 ttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccatt 774 Query: 563 gtcgcggcaatagtgag 579 |||||||||||| |||| Sbjct: 773 gtcgcggcaataatgag 757
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 cgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 1238 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 547/568 (96%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1378 aactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcaggactccatttg 1319 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1318 gaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 1259 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1258 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattcccccaagga 1199 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1198 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcaga 1139 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 gctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcatggat 1079 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 acccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1019 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1018 aataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 959 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 899 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 898 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag 840 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 839 -taagccgttgtcgcggcaataatgagc 813
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1238 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 938 acacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgc-ccggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 547/568 (96%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 aactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcaggactccatttg 1347 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 gaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 1287 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattcccccaagga 1227 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1226 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcaga 1167 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 gctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcatggat 1107 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 acccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1047 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 aataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 987 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 927 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 926 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag 868 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 867 -taagccgttgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53721 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 53663 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 53662 cgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 53603 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53602 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 53543 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 53542 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 53483 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 53482 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 53423 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53422 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 53363 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53362 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 53303 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53302 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 53243 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 53242 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 53184 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 53183 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 53145
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128654 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 128596 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 128595 cgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 128536 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128535 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 128476 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 128475 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 128416 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 128415 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 128356 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128355 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 128296 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128295 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 128236 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128235 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 128176 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 128175 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 128117 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 128116 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 128078
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347329 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 10347271 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 10347270 cgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 10347211 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347210 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 10347151 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 10347150 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 10347091 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 10347090 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 10347031 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347030 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 10346971 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346970 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 10346911 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346910 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 10346851 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 10346850 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 10346792 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 10346791 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 10346753
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353368 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 10353310 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 10353309 cgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 10353250 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353249 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 10353190 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 10353189 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 10353130 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 10353129 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 10353070 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353069 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 10353010 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353009 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 10352950 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352949 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 10352890 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 10352889 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 10352831 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 10352830 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 10352792
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1804 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 1746 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1745 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1686 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1685 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 1626 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 1625 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 1566 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1565 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1506 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1505 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1446 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1445 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 1386 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 cctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 1326 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 1325 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 1267 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 1266 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 1228
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 516/527 (97%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 849 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 805
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 516/527 (97%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 866 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 822
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 516/527 (97%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 849 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 805
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 524/538 (97%), Gaps = 2/538 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 43 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 102 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 103 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 162 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 163 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 222 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 223 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 282 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 283 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 342 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 343 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 402 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 403 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 462 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 939 Query: 463 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 879 Query: 523 gcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 878 gcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 823
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 542/562 (96%), Gaps = 2/562 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc-ccggtgaatgtgaagaag-taggc 848 Query: 559 cattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 847 cattgtcgcggcaataatgagc 826
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 517/529 (97%), Gaps = 2/529 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 532 gcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 868 gcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 822
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 546/568 (96%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1321 aactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaagttcagggctccatttg 1262 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1261 caagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1202 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1201 tggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcatttccccaagga 1142 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1141 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtaaga 1082 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1081 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacaccaggcatggat 1022 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 962 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 902 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 842 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 841 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag 783 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 782 -taggccattgtcgcggcaataatgagc 756
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 556/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614559 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttca 5614501 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 5614500 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 5614441 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614440 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 5614381 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 5614380 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 5614321 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 5614320 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 5614261 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614260 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 5614201 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614200 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 5614141 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614140 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 5614081 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 5614080 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 5614022 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 5614021 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 5613983 Score = 448 bits (226), Expect = e-123 Identities = 268/278 (96%), Gaps = 3/278 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 303 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 363 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 423 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 482 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 483 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaa 542 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaa 13436866 Query: 543 tgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 13436865 tgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 13436829 Score = 165 bits (83), Expect = 2e-37 Identities = 112/119 (94%), Gaps = 2/119 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 462 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 522 tgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgc-ttggtgaatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 13397980 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 106 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 248 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 277 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 328 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 362 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.50 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 246 ggtcagagctggcatatgccaa 267 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 556/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614548 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttca 5614490 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 5614489 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 5614430 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614429 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 5614370 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 5614369 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 5614310 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 5614309 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 5614250 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614249 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 5614190 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614189 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 5614130 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614129 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 5614070 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 5614069 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 5614011 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 5614010 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 5613972 Score = 448 bits (226), Expect = e-123 Identities = 268/278 (96%), Gaps = 3/278 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 303 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 363 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 423 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 482 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 483 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaa 542 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaa 13391140 Query: 543 tgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 13391139 tgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 13391103 Score = 165 bits (83), Expect = 2e-37 Identities = 112/119 (94%), Gaps = 2/119 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 462 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 522 tgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgc-ttggtgaatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 13352254 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 106 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 248 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 277 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 328 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 362 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.50 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 246 ggtcagagctggcatatgccaa 267 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 556/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38326 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttca 38384 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 38385 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 38444 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38445 tcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 38504 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 38505 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 38564 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 38565 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 38624 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38625 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 38684 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38685 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 38744 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38745 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 38804 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 38805 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 38863 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 38864 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 38902
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 555/579 (95%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcg-aactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagttca 1359 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1358 ggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 1299 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1298 tcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggtgca 1239 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1238 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaag 1179 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1178 atttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1119 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttcaata 1059 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 taatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 999 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgctaat 939 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 938 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 880 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgag 579 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 879 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgag 842
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 515/527 (97%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 855 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 507/517 (98%), Gaps = 2/517 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaag-taggccattgtcacggcaataatgagc 829
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 507/517 (98%), Gaps = 2/517 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaat 867 Query: 544 gtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 866 gtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 831
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 516/529 (97%), Gaps = 2/529 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 933 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 873 Query: 532 gcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 872 gcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 826
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 518/532 (97%), Gaps = 2/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 108 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 109 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 168 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 169 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 228 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 229 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 288 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 289 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 349 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 408 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 409 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 468 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 469 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgc 891 Query: 529 attgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 890 attgcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 556/580 (95%), Gaps = 4/580 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203577 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 23203635 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 23203636 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 23203695 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203696 t-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 23203754 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 23203755 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 23203814 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 23203815 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 23203874 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203875 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 23203934 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203935 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaactta 23203994 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203995 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 23204054 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 23204055 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 23204113 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 23204114 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 23204152 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 110 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 111 atc 113 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 110 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 111 atc 113 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 556/580 (95%), Gaps = 4/580 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154225 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 154283 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 154284 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 154343 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154344 t-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 154402 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 154403 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 154462 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 154463 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 154522 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154523 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 154582 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 154583 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaactta 154642 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154643 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 154702 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 154703 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 154761 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 154762 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 154800
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 556/580 (95%), Gaps = 4/580 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttca 60 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38339 ctaccggctcg-aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttca 38397 Query: 61 ggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccct 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 38398 ggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccct 38457 Query: 121 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 180 | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38458 t-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgca 38516 Query: 181 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 240 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct: 38517 ttaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaag 38576 Query: 241 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 38577 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 38636 Query: 301 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38637 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 38696 Query: 361 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38697 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaactta 38756 Query: 421 cctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 480 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38757 cctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 38816 Query: 481 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 38817 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtg 38875 Query: 541 aatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 38876 aatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 38914
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 509/521 (97%), Gaps = 2/521 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggt 869 Query: 540 gaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 514/527 (97%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 849 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 805
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 511/523 (97%), Gaps = 2/523 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 118 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 177 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 178 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 237 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 238 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 298 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 358 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 418 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 478 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 537 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-g 883 Query: 538 gtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 544/567 (95%), Gaps = 2/567 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 aactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1347 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct: 1346 caagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggct 1287 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1286 tgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1227 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1226 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcaga 1167 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 gctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggat 1107 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1047 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 aataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 987 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgt 927 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 926 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag 868 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgag 579 || ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 867 -taggccgttgtcgcggcaataatgag 842
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 540/562 (96%), Gaps = 2/562 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 968 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 967 tggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 908 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 907 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc-ccggtgaatgtgaagaag-taggc 850 Query: 559 cattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||| ||||| Sbjct: 849 cattgtcgcggcaataatgagc 828
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 534/554 (96%), Gaps = 2/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 86 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 87 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 146 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1273 Query: 147 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 206 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 207 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 266 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 267 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 326 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagt 1093 Query: 327 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 387 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1032 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatg 973 Query: 447 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 506 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 972 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattttt 913 Query: 507 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcg 566 ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||| Sbjct: 912 ctgtctatcaataactgcatgcattgc-ccggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcg 855 Query: 567 cggcaatagtgagc 580 |||||||| ||||| Sbjct: 854 cggcaataatgagc 841
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 506/517 (97%), Gaps = 2/517 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 515/529 (97%), Gaps = 2/529 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 935 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 875 Query: 532 gcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 874 gcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 828
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 511/524 (97%), Gaps = 2/524 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 117 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 176 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 177 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 236 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 237 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 296 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 297 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 357 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 416 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 417 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 476 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 477 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac- 845 Query: 537 ggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 802
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 511/524 (97%), Gaps = 2/524 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 117 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 176 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 177 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 236 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 237 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 296 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 297 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 357 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 416 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 417 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 476 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 477 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac- 845 Query: 537 ggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 802
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 544/568 (95%), Gaps = 2/568 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 aactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1317 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1316 gaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttgcgagct 1257 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggg 1197 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1196 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcaga 1137 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 gctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggat 1077 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 acccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1017 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1016 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 957 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 956 ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 897 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 896 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag 838 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 837 -taggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 520/536 (97%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taagccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 508/521 (97%), Gaps = 2/521 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggt 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggt 869 Query: 540 gaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 513/527 (97%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 865 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 507/519 (97%), Gaps = 2/519 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 122 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 182 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 241 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 242 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 302 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 362 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 422 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 481 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 482 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtga 541 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtga 849 Query: 542 atgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 848 atgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 543/567 (95%), Gaps = 2/567 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 aactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1347 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct: 1346 caagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggct 1287 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1286 tgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1227 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1226 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcaga 1167 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 gctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggat 1107 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1047 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 aataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactgta 987 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgt 927 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 926 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag 868 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaatagtgag 579 || ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 867 -taggccgttgtcgcggcaataatgag 842
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 533/554 (96%), Gaps = 2/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 86 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 87 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 146 ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1257 Query: 147 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 206 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1197 Query: 207 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 266 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1137 Query: 267 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 326 ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 aacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagt 1077 Query: 327 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1017 Query: 387 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1016 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatg 957 Query: 447 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 506 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 956 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattttt 897 Query: 507 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcg 566 ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||| Sbjct: 896 ctgtctatcaataactgcatgcattgc-ccggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcg 839 Query: 567 cggcaatagtgagc 580 |||||||| ||||| Sbjct: 838 cggcaataatgagc 825
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%), Gaps = 2/517 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%), Gaps = 2/517 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%), Gaps = 2/517 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 514/529 (97%), Gaps = 2/529 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 532 gcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 867 gcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 519/536 (96%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 491/499 (98%), Gaps = 2/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 141 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 142 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 202 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 261 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 262 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 322 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 382 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 442 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 502 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccat 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccat 822 Query: 562 tgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||| Sbjct: 821 tgtcgcggcaatagtgagc 803
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/527 (97%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 929 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgc 870 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 869 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 825
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 509/523 (97%), Gaps = 2/523 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 118 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 177 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 178 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 237 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 238 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 298 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 357 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 358 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 418 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 477 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 931 Query: 478 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 537 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct: 930 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcac-g 872 Query: 538 gtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 830
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 491/499 (98%), Gaps = 2/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 141 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 142 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 202 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 261 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 262 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 322 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 382 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 442 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 502 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccat 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccat 822 Query: 562 tgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||| Sbjct: 821 tgtcgcggcaatagtgagc 803
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 538/562 (95%), Gaps = 2/562 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 72 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1843 aactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1784 Query: 73 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 132 ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1783 caagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 1724 Query: 133 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 192 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1723 tgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1664 Query: 193 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 252 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1663 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcaga 1604 Query: 253 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 312 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1603 gctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggat 1544 Query: 313 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 372 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1543 acccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1484 Query: 373 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 432 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1483 aataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactgta 1424 Query: 433 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 492 |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1423 ccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 1364 Query: 493 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaag 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 1363 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag 1305 Query: 553 ttaagccattgtcgcggcaata 574 || ||| |||||||||||||| Sbjct: 1304 -taggccgttgtcgcggcaata 1284
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 511/526 (97%), Gaps = 2/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgag 579 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 855 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgag 812
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 537/561 (95%), Gaps = 2/561 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 120062 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120061 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 120002 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 120001 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggc 119944 Query: 559 cattgtcgcggcaatagtgag 579 | |||||||||||||| |||| Sbjct: 119943 cgttgtcgcggcaataatgag 119923
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 537/561 (95%), Gaps = 2/561 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 58435 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58434 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 58375 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 58374 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggc 58317 Query: 559 cattgtcgcggcaatagtgag 579 | |||||||||||||| |||| Sbjct: 58316 cgttgtcgcggcaataatgag 58296
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 546/572 (95%), Gaps = 3/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 accggctcgnaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg 62 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1832 accggctcg-aactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg 1774 Query: 63 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 122 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1773 actccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttc 1714 Query: 123 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 182 |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1713 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggtgcatt 1654 Query: 183 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1653 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagat 1594 Query: 243 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1593 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1534 Query: 303 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1533 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaa 1474 Query: 363 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacc 1414 Query: 423 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 482 |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tactactgtaccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagctaatac 1354 Query: 483 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaa 542 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1353 acggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaa 1295 Query: 543 tgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaata 574 |||||||||| || ||| |||||||||||||| Sbjct: 1294 tgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaata 1264
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 518/536 (96%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taagccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 518/536 (96%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taagccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 533/556 (95%), Gaps = 2/556 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1789 aatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1730 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1729 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1670 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1669 caggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1610 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1609 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1550 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1549 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccag 1490 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1489 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1430 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1429 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 1370 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1369 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1310 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 1309 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggc 1252 Query: 559 cattgtcgcggcaata 574 | |||||||||||||| Sbjct: 1251 cgttgtcgcggcaata 1236
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 511/527 (96%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 866 tc-ggtgaatgtgaagaag-taagccgttgtcgcggcaataatgagc 822
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 510/526 (96%), Gaps = 2/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgag 579 || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 855 ac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaatattgag 812
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 503/517 (97%), Gaps = 2/517 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcac-ggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 503/517 (97%), Gaps = 2/517 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcac-ggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 503/517 (97%), Gaps = 2/517 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaat 865 Query: 544 gtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaag-caggccattgtcacggcaataatgagc 829
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 536/561 (95%), Gaps = 2/561 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 921 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggc 863 Query: 559 cattgtcgcggcaatagtgag 579 | |||||||||||||| |||| Sbjct: 862 cgttgtcgcggcaataatgag 842
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 536/561 (95%), Gaps = 2/561 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57854 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57853 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57794 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 57793 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggc 57736 Query: 559 cattgtcgcggcaatagtgag 579 | |||||||||||||| |||| Sbjct: 57735 cgttgtcgcggcaataatgag 57715
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 517/536 (96%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 775 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 774 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 721
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 536/561 (95%), Gaps = 2/561 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57864 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57863 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57804 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 57803 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggc 57746 Query: 559 cattgtcgcggcaatagtgag 579 | |||||||||||||| |||| Sbjct: 57745 cgttgtcgcggcaataatgag 57725
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 517/536 (96%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 489/499 (97%), Gaps = 2/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 141 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 142 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 202 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 261 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 262 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 322 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 382 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 442 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 502 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccat 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccat 819 Query: 562 tgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||| ||||| Sbjct: 818 tgtcgcggcaataatgagc 800
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 489/499 (97%), Gaps = 2/499 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 141 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 142 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 202 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 261 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 262 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 322 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 382 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 442 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 502 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccat 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccat 819 Query: 562 tgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||| ||||| Sbjct: 818 tgtcgcggcaataatgagc 800
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 502/517 (97%), Gaps = 2/517 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaat 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaat 875 Query: 544 gtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 874 gtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 839
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 511/529 (96%), Gaps = 2/529 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 532 gcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 857 gcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 499/514 (97%), Gaps = 2/514 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 126 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 127 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 186 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 187 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 247 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 307 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 367 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 427 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 486 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 487 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtg 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtg 854 Query: 547 aagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 853 aagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 516/536 (96%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taagccattgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 509/527 (96%), Gaps = 2/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 534 acgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 855 tc-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 515/535 (96%), Gaps = 2/535 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgag 579 ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgag 812
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 493/506 (97%), Gaps = 2/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 134 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 135 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 194 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 195 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 254 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 255 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 315 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 374 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 375 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 435 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 494 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 495 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagtt 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag-t 810 Query: 555 aagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 | |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 809 aggccattgtcgcggcaataatgagc 784
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 493/506 (97%), Gaps = 2/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 134 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 135 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 194 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 195 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 254 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 255 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 315 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 374 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 375 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 435 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 494 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 495 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagtt 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag-t 810 Query: 555 aagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 | |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 809 aggccattgtcgcggcaataatgagc 784
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 508/526 (96%), Gaps = 2/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 115 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 174 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 175 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 234 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 235 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 295 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 354 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 355 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 415 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 474 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 475 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 534 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc- 886 Query: 535 cgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 511/530 (96%), Gaps = 2/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaata 574 |||||| || | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcatagctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaata 817
>gb|AY506529.1| Zea mays strain NB mitochondrion, complete genome Length = 569630 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 534/561 (95%), Gaps = 2/561 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 349056 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 349115 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349116 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 349175 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 349176 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 349235 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349236 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 349295 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349296 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 349355 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349356 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 349415 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349416 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 349475 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349476 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 349535 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 349536 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggc 349593 Query: 559 cattgtcgcggcaatagtgag 579 | |||||||||||||| |||| Sbjct: 349594 cgttgtcgcggcaataatgag 349614
>gb|DQ490952.1| Zea mays subsp. mays genotype male-fertile NA mitochondrion, complete genome Length = 701046 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 534/561 (95%), Gaps = 2/561 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 206653 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 206594 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206593 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 206534 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 206533 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 206474 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206473 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 206414 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206413 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 206354 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206353 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 206294 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206293 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 206234 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206233 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 206174 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 206173 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggc 206116 Query: 559 cattgtcgcggcaatagtgag 579 | |||||||||||||| |||| Sbjct: 206115 cgttgtcgcggcaataatgag 206095 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 534/561 (95%), Gaps = 2/561 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 77961 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 77902 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77901 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 77842 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 77841 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 77782 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77781 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 77722 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77721 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 77662 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77661 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 77602 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77601 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 77542 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77541 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 77482 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 77481 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggc 77424 Query: 559 cattgtcgcggcaatagtgag 579 | |||||||||||||| |||| Sbjct: 77423 cgttgtcgcggcaataatgag 77403
>emb|AJ746253.1| Arthraxon sp. TH-111 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1391 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 534/561 (95%), Gaps = 2/561 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1387 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1328 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccactggtacaacacctggcatggatacccag 1088 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 968 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 967 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtatacca 908 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 907 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggc 850 Query: 559 cattgtcgcggcaatagtgag 579 | |||||||||||||| |||| Sbjct: 849 cgttgtcgcggcaataatgag 829
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 518/537 (96%), Gaps = 4/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 103 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 104 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 163 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 164 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 223 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 224 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 283 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 284 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 343 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 344 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgc 986 Query: 404 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 463 | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 464 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 524 catgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 865 catgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag-taggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 515/536 (96%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| ||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccgttatcgcggcaataatgagc 811
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 515/536 (96%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| ||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccgttatcgcggcaataatgagc 811
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 515/536 (96%), Gaps = 2/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 492/506 (97%), Gaps = 2/506 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 134 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 135 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 194 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 195 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 254 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 255 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 314 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 315 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 375 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 969 Query: 435 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 909 Query: 495 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagtt 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | Sbjct: 908 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac-ggtgaatgtgaagaag-t 851 Query: 555 aagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 | |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 850 aggccattgtcgcggcaataatgagc 825
>emb|AJ746283.1| Aristida congesta subsp. barbicollis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 510/530 (96%), Gaps = 2/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaata 574 ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccgttatcgcggcaata 817
>gb|U31359.1|ACU31359 Aristida congesta subsp. barbicollis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 510/530 (96%), Gaps = 2/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaata 574 ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccgttatcgcggcaata 817
>gb|U31104.1|ECU31104 Eragrostis capensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 510/530 (96%), Gaps = 2/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcttgataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaata 574 ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaata 817
>gb|DQ490951.1| Zea mays subsp. mays genotype CMS-S mitochondrion, complete genome Length = 569553 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 533/561 (95%), Gaps = 2/561 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 78 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 540663 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 540604 Query: 79 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 138 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540603 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 540544 Query: 139 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 198 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 540543 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 540484 Query: 199 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540483 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 540424 Query: 259 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 318 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540423 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 540364 Query: 319 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 378 ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540363 tccagagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 540304 Query: 379 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 438 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540303 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 540244 Query: 439 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 498 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540243 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 540184 Query: 499 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagc 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || Sbjct: 540183 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggc 540126 Query: 559 cattgtcgcggcaatagtgag 579 | |||||||||||||| |||| Sbjct: 540125 cgttgtcgcggcaataatgag 540105
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 518/541 (95%), Gaps = 2/541 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 99 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 100 tcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcga 159 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaagatctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgg 1242 Query: 160 ttagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 219 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 ttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 1182 Query: 220 aatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacca 279 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccc 1122 Query: 280 cctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccg 339 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1121 cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagataccg 1062 Query: 340 cgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 399 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 cgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 1002 Query: 400 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagac 459 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagac 942 Query: 460 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 519 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaata 882 Query: 520 actgcatgcattgcacgggtgaatgtgaagaagttaagccattgtcgcggcaatagtgag 579 |||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 881 actgcatgcattgctc-ggtgaatgtgaagaag-taggccgttgtcgcggcaataatgag 824 Query: 580 c 580 | Sbjct: 823 c 823 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,424,097 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4424097 Number of successful extensions: 119849 Number of sequences better than 10.0: 15206 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15124 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 93 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 86433 Number of HSP's gapped (non-prelim): 21103 length of query: 580 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 557 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 9548816821128 effective search space used: 9548816821128 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)