Clone Name | rbasd24m23 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 604/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 604/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 604/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 603/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 603/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 603/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 603/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 603/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 603/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 603/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 603/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 603/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 603/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 603/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 603/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 602/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctakttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 602/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcng 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 602/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 601/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkagstaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 602/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 602/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 602/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 602/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 602/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 601/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1088 bits (549), Expect = 0.0 Identities = 601/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccyttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 601/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccaggagcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 601/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| |||| |||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacgcctaat 887
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 601/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 601/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 601/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 601/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 601/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 601/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 599/621 (96%), Gaps = 1/621 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctgct 62 |||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1506 tgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcngct 1448 Query: 63 cggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacacaa 122 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1447 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacag 1388 Query: 123 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 182 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 gcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 1328 Query: 183 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1268 Query: 243 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1208 Query: 303 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1148 Query: 363 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 1088 Query: 423 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 1028 Query: 483 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1027 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 968 Query: 543 tcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgc 602 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| Sbjct: 967 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 908 Query: 603 attacaatangaacccctaat 623 ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 907 attacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 600/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnntaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 575/589 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 1056 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 996 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 995 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 936 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 935 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 600/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1389 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 600/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1389 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 600/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1389 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 600/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1389 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacanntggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 566/579 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 803 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 765
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 599/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 599/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 599/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 599/623 (96%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 597/621 (96%), Gaps = 1/621 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctgct 62 |||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 tgatcgccttccatacttcacaag-ctgcngctagttcaggactccatttgcaagctgct 1338 Query: 63 cggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacacaa 122 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1337 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacag 1278 Query: 123 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 182 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1277 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1218 Query: 183 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1158 Query: 243 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1098 Query: 303 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1038 Query: 363 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1037 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagagtgg 978 Query: 423 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagataatacacggaaatgcataccatga 918 Query: 483 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 917 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtcaatgtgaagaagtaagccattg 858 Query: 543 tcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgc 602 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| Sbjct: 857 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 798 Query: 603 attacaatangaacccctaat 623 ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 797 attacaataggaacccctaat 777
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 565/579 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 850 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 849 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 790 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 789 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 751
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1457 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1399 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1398 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1339 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1338 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1279 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1219 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1159 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1099 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1039 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 979 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 978 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 919 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 918 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 859 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 858 gcattacaataggaacccctaat 836
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||| | ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgattgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcccccggttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56307 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 56249 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 56248 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 56189 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 56188 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 56129 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56128 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 56069 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56068 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 56009 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56008 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 55949 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55948 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 55889 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55888 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 55829 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 55828 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 55769 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 55768 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 55709 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55708 gcattacaataggaacccctaat 55686
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 598/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1493 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1435 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1434 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1375 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1374 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1315 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1314 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1255 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1254 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1195 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1194 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1135 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1075 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1074 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1015 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1014 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 955 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 954 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 895 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 894 gcattacaataggaacccctaat 872
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 597/622 (95%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaa 622 ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaa 888
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 572/589 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 770 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 769 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 721
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 572/589 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1306 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1186 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 885 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 777
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 572/589 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 770 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 769 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 721
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 597/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 597/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcng 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 597/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 597/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1449 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1448 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1389 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1388 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1329 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1269 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1209 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1149 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1148 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1089 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1029 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1028 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 969 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 968 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 909 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 908 gcattacaataggaacccctaat 886
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 597/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1449 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1448 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1389 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1388 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1329 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1269 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1209 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1149 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1148 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1089 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1029 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1028 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 969 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 968 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 909 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 908 gcattacaataggaacccctaat 886
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 597/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1449 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1448 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1389 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1388 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1329 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1269 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1209 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1149 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1148 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1089 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1029 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1028 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 969 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 968 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 909 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 908 gcattacaataggaacccctaat 886
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 597/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1449 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1448 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1389 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1388 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1329 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1269 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1209 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1149 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1148 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1089 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1029 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1028 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 969 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 968 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 909 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 908 gcattacaataggaacccctaat 886
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 597/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1449 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1448 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1389 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1388 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1329 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1269 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1209 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1149 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1148 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1089 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1029 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1028 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 969 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 968 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 909 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 908 gcattacaataggaacccctaat 886
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 597/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1511 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1453 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1452 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1393 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1392 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1333 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1273 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1213 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1153 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1152 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1093 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1033 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1032 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 973 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 972 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 913 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 912 gcattacaataggaacccctaat 890
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 597/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgtaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 yaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcccccggttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1511 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1453 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1452 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1393 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1392 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1333 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1273 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1213 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1153 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1152 yaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1093 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1033 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1032 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 973 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 972 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 913 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 912 gcattacaataggaacccctaat 890
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnncccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1047 bits (528), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1309 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1308 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1249 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1248 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1189 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1129 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacanctggcatggatacccagt 1069 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1009 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1008 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 949 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 889 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 888 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 829 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 828 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 769 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 768 gcattacaataggaacccctaat 746
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcccccttcgttacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1177 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1176 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1117 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1116 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1057 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 997 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 937 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 877 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 876 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 817 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 816 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 757 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 756 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 697 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 696 tgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 637 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 636 gcattacaataggaacccctaat 614
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1177 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1176 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1117 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1116 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1057 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 997 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 937 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 877 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 876 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 817 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 816 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 757 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 756 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 697 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 696 tgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 637 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 636 gcattacaataggaacccctaat 614
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1374 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1316 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1315 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1256 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1255 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1196 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1195 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1136 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1076 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1075 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1016 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1015 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 956 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 896 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 895 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccat 836 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 835 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 776 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 775 gcattacaataggaacccctaat 753
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 595/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1449 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1448 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1389 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1388 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1329 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1269 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1209 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1208 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaat 1149 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1148 yaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1089 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1029 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1028 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 969 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 968 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 909 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 908 gcattacaataggaacccctaat 886
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1307 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1306 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1247 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1246 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1187 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1127 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1067 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1007 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 947 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 887 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 886 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 827 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 826 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 767 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 766 gcattacaataggaacccctaat 744
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1374 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1316 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1315 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1256 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1255 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1196 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1195 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1136 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1076 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1075 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1016 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1015 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 956 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 896 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| Sbjct: 895 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccat 836 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 835 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 776 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 775 gcattacaataggaacccctaat 753
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 595/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1087 yaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctt 1309 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1308 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1249 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1248 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1189 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1129 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1069 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1009 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1008 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 949 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 889 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 888 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 829 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| || ||| Sbjct: 828 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcccccggttaagtagtcat 769 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 768 gcattacaataggaacccctaat 746
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 596/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgccgctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || | | Sbjct: 907 tgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgt 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 594/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacnnngcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 594/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1449 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1448 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1389 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1388 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1329 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1328 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagrtttcggtcagagctggca 1269 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1209 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1149 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1148 yaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1089 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1029 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1028 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 969 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 968 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 909 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 908 gcattacaataggaacccctaat 886
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 595/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1511 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1453 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1452 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1393 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1392 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1333 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1273 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1213 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1153 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1152 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1093 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1033 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1032 gattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 973 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 972 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 913 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 912 gcattacaataggaacccctaat 890
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 595/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 595/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 595/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggccccttcgttacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 568/588 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 36 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatca 95 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 96 cncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 155 | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 156 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 215 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 216 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 276 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 336 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 396 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 456 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 516 cggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcg 575 ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 805 Query: 576 gngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 | ||||||||| | ||| || | |||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 804 gtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaat 757
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 594/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1511 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1453 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1452 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacac 1393 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1392 aggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1333 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1273 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1213 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1153 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1152 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1093 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1033 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1032 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 973 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 972 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 913 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 912 gcattacaataggaacccctaat 890
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 569/589 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || | |||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaat 757
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 588/614 (95%), Gaps = 1/614 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 cttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 69 ||| ||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 cttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 1331 Query: 70 tttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacacaagcttcta 129 ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1330 tttcattaccttcgcgagcaagatcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1271 Query: 130 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 189 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1211 Query: 190 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1151 Query: 250 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1091 Query: 310 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 1031 Query: 370 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgat 429 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1030 ctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgat 971 Query: 430 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 911 Query: 490 gtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggc 549 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 910 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggc 851 Query: 550 aatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaa 609 |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||||| Sbjct: 850 aataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaa 791 Query: 610 tangaacccctaat 623 || ||||||||||| Sbjct: 790 taggaacccctaat 777
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 569/589 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || | |||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaat 757
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 594/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcagtcaaagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 cnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 907 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 594/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || | | Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgt 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 594/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1388 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgctgccttcgttacgagcttgtacac 1328 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1327 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1268 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1208 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1148 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1088 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1087 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggaat 1028 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 968 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 967 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 908 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || | | Sbjct: 907 tgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgt 848 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 gcattacaataggaacccctaat 825
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 568/589 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 591/623 (94%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1450 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1449 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacac 1390 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1389 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1330 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1270 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1210 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1150 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1149 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctannnctgtaccggagt 1090 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagctaatacacggaaatgcataccat 1030 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1029 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 970 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 969 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 910 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gcattacaataggaacccctaat 887
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 560/579 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatccc 804 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 803 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 765
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 593/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacagacttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 593/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1177 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1176 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1117 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1116 aggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1057 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 997 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 937 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 877 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 876 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 817 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 816 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 757 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 756 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 697 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 696 tgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 637 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 636 gcattacaataggaacccctaat 614
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 593/623 (95%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1330 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1270 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1269 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1210 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggca 1150 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagt 1090 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 cctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1030 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1029 caacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 970 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 910 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 909 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 850 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 849 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 790 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 789 gcattacaataggaacccctaat 767
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 566/589 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1225 aggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1166 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 806 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 757
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 566/589 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 944 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 884 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 883 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 824 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 823 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 775
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 591/623 (94%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1449 tttgatcgccttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1391 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1390 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1331 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1330 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1271 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggca 1211 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1151 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1091 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 caccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1031 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 971 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 970 gatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 911 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || ||| Sbjct: 910 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcat 851 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 850 gcattacaataggaacccctaat 828
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 565/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 741
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 565/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 866 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 807 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 806 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 758
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 565/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 866 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 807 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 806 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 758
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 565/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 741
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 562/585 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 39 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacnc 98 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 99 ccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 158 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 159 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 218 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 219 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 279 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 338 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 339 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 399 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 458 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 459 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 518 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 519 ngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggng 578 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 579 aatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 |||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 777
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 565/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaat 747
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 581/610 (95%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 14 catacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttn 73 ||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 catacttcacaag-cagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttc 1307 Query: 74 attaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagc 133 ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1306 attaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagc 1247 Query: 134 cactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccacc 193 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 cactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccacc 1187 Query: 194 aaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatg 253 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 aaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatg 1127 Query: 254 aataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaa 313 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 aataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaa 1067 Query: 314 gataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 gataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaa 1007 Query: 374 agtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1006 agtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcc 947 Query: 434 cccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtct 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 cccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtct 887 Query: 494 atcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaata 553 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 886 atcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaata 827 Query: 554 gtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatang 613 ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||| | Sbjct: 826 atgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg 767 Query: 614 aacccctaat 623 ||| |||||| Sbjct: 766 aactcctaat 757
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 557/579 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 803 ccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 765
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 557/579 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || | ||| || | |||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 803 ccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaat 765
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 559/583 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 41 aggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacnccc 100 ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 101 ttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 160 || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 161 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 220 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 221 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 280 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 281 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 340 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 341 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 401 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 460 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 461 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggng 520 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 521 aatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaa 580 |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 808 Query: 581 tcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 |||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 807 tcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 765
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 543/561 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 63 cggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacacaa 122 |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 123 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 182 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 183 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 242 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 243 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 303 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 363 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 423 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 483 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 543 tcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgc 602 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 760 Query: 603 attacaatangaacccctaat 623 ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 759 attacaataggaacccctaat 739
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 564/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1347 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1288 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1228 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1227 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1168 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1167 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1108 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1048 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 988 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 928 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 868 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 867 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 808 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 807 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 759
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 543/561 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 63 cggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacacaa 122 |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 123 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 182 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 183 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 242 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 243 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 303 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 363 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 423 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 483 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 543 tcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgc 602 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 760 Query: 603 attacaatangaacccctaat 623 ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 759 attacaataggaacccctaat 739
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 558/581 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 43 gactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacnccctt 102 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 103 ngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 162 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 163 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 222 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 223 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 282 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 283 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 343 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 402 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 403 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 462 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 463 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaa 522 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 848 Query: 523 tgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatc 582 |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 847 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 788 Query: 583 ccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 |||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 787 ccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 589/623 (94%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1378 tttgatcgccttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactccatttgcaagctt 1320 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1319 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1260 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1259 aggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1200 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1199 aagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggca 1140 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1139 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1080 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1020 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 caacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 960 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 900 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 899 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 840 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || ||| Sbjct: 839 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcat 780 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 779 gcattacaataggaacccctaat 757
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 556/579 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| | Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 866 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 865 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 806 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 805 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 767
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 589/623 (94%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 tttgatcgccttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1300 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1240 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1239 aggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1180 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagctggca 1120 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 1119 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaacccagt 1060 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1000 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 999 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 940 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 880 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 879 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 820 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || || ||| Sbjct: 819 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcat 760 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 759 gcattacaataggaacccctaat 737
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 589/623 (94%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgccttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1279 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgcccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataacaccaggcatggatgcccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 589/623 (94%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| || ||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgctttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactccatttgcaagctt 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcagtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacctactactgtaccggagt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 589/623 (94%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| || ||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1496 tttgatcgctttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactccatttgcaagctt 1438 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1437 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1378 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1377 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1318 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1317 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcagtcagagctggca 1258 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1198 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1197 cctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1138 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacctactactgtaccggagt 1078 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1018 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1017 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 958 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || ||| Sbjct: 957 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcat 898 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 897 gcattacaataggaacccctaat 875
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 563/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1293 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1233 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1232 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1173 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1172 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1113 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1053 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 993 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 933 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 873 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 872 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 813 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 812 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaat 764
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 563/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1350 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1291 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1231 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1230 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1171 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1111 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1051 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 991 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 931 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 871 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 870 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 811 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 810 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 762
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 563/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 741
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 579/610 (94%), Gaps = 1/610 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 14 catacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttn 73 ||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 catacttcacaag-cagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttc 1307 Query: 74 attaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagc 133 ||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1306 attaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagc 1247 Query: 134 cactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccacc 193 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 cactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccacc 1187 Query: 194 aaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatg 253 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 aaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatg 1127 Query: 254 aataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaa 313 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 aataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaa 1067 Query: 314 gataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 gataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaa 1007 Query: 374 agtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1006 agtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcc 947 Query: 434 cccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtct 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 cccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtct 887 Query: 494 atcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaata 553 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 886 atcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaata 827 Query: 554 gtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatang 613 ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||| | Sbjct: 826 atgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagg 767 Query: 614 aacccctaat 623 |||||||||| Sbjct: 766 aacccctaat 757
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 588/623 (94%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| || ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgctttccatacttcacaagcc-gcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 588/623 (94%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| |||||||| |||| | | || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgccttccatacttcgcaagcc-gcagctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttctgtcagagccggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 gaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagcaggccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | | || ||| Sbjct: 859 tgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 557/583 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 41 aggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacnccc 100 ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 101 ttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 160 || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 161 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 220 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 221 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 280 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 281 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 340 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 341 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 401 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 460 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 461 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggng 520 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 521 aatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaa 580 |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 808 Query: 581 tcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 |||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 807 tcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 765
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 562/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 accaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 757
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 562/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 806 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 757
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 562/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 554/579 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 765
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 554/579 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 765
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 554/579 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 803 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 765
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 559/586 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacn 97 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 98 cccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 157 ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 158 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 217 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 218 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 277 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 278 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 338 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 397 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 398 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 457 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 458 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 518 gngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggn 577 | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 784 Query: 578 gaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||| | | || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 783 gaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 738
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 559/586 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 38 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacn 97 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 98 cccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 157 ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 158 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 217 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 218 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 277 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 278 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 338 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 397 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 398 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 457 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 458 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 518 gngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggn 577 | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 784 Query: 578 gaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||| | | || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 783 gaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 738
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 558/585 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 39 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacnc 98 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 99 ccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 158 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 159 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 218 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 219 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 279 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 338 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 339 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 399 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 931 Query: 459 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 518 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 930 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacgg 871 Query: 519 ngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggng 578 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | Sbjct: 870 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 811 Query: 579 aatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 |||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 810 aatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 766
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 561/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1306 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1186 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgc 886 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 885 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 826 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | | || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 777
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 969 bits (489), Expect = 0.0 Identities = 561/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 586/623 (94%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1381 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1323 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1322 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacac 1263 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1262 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1203 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1202 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1143 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1142 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagt 1083 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1023 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1022 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 963 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 962 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 903 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 902 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccat 843 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||| || ||| Sbjct: 842 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtagtcat 783 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| || |||||||| Sbjct: 782 gcattacaataggagcccctaat 760
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 586/623 (94%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1325 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1324 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacac 1265 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1264 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1205 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1145 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 tatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagt 1085 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1025 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1024 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 965 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 964 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 905 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 904 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccat 845 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||| || ||| Sbjct: 844 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtagtcat 785 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| || |||||||| Sbjct: 784 gcattacaataggagcccctaat 762
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 866 tcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 807 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 806 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 758
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 929 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgc 870 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 869 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 810 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | | || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 809 ggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 761
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 560/589 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1275 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 559/588 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 36 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatca 95 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 96 cncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 155 | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 156 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 215 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 216 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 276 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 335 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 336 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 396 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 455 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 456 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 515 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 516 cggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcg 575 ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 576 gngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 | ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 777
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 552/579 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| | Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 874 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 814 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || | || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 813 ccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 775
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 585/623 (93%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| |||| |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 tttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctt 1325 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1324 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1265 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1264 aagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1205 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1145 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1144 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagt 1085 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1025 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1024 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 965 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 964 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 905 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 904 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccat 845 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 844 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 785 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 784 gcattacaataggaacccctaat 762
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 585/623 (93%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| |||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 979 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 585/623 (93%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| || ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgctttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataagt 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 979 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccctgttaagtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 585/623 (93%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| |||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 tttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1327 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1267 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1266 aagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1207 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1147 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1146 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagt 1087 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1027 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1026 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 967 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 966 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 907 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 906 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccat 847 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 846 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 787 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 786 gcattacaataggaacccctaat 764
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 585/623 (93%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| |||| |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1382 tttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctt 1324 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1323 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1264 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1263 aagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1204 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1203 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1144 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1143 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagt 1084 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1024 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1023 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 964 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 963 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 904 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 903 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccat 844 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 843 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 784 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 783 gcattacaataggaacccctaat 761
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 585/623 (93%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| |||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 tttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1325 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1324 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1265 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1264 aagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1205 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1145 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1144 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagt 1085 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1025 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1024 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 965 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 964 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 905 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 904 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccat 845 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 844 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 785 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 784 gcattacaataggaacccctaat 762
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 585/623 (93%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| |||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 tttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1339 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1338 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1279 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1278 aagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1219 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1159 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1158 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagt 1099 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1039 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1038 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 979 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 978 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 919 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 918 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccat 859 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 858 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 799 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 798 gcattacaataggaacccctaat 776
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 552/579 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| | Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaataca 906 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| Sbjct: 905 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 846 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 845 tgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 786 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 785 ccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 587/623 (94%), Gaps = 3/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124734 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 124676 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 124675 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 124616 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124615 aggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtccta 124556 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124555 aagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggca 124496 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124495 tatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagt 124437 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124436 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaaatcatcgcgcaataaat 124378 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || Sbjct: 124377 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgt 124318 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124317 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 124258 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| | Sbjct: 124257 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgt 124198 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 124197 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 124138 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124137 gcattacaataggaacccctaat 124115 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 587/623 (94%), Gaps = 3/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30207 tttgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 30149 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 30148 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 30089 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 30088 aggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattaccccaaggatgtccta 30029 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30028 aagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggca 29969 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29968 tatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagt 29910 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29909 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaaatcatcgcgcaataaat 29851 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || Sbjct: 29850 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagcgt 29791 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29790 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 29731 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| | Sbjct: 29730 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgt 29671 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 29670 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 29611 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29610 gcattacaataggaacccctaat 29588
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55415 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 55356 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 55355 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 55296 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 55295 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 55236 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 55235 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 55176 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55175 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 55116 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55115 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 55056 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55055 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 54996 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54995 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 54936 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 54935 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 54876 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54875 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 54827
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 538/561 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 63 cggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacacaa 122 |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 123 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 182 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 183 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 242 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 243 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 303 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 363 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 423 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 483 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 543 tcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgc 602 ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || ||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgc 757 Query: 603 attacaatangaacccctaat 623 ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 756 attacaataggaacccctaat 736
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 125756 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 125697 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 125696 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 125637 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 125636 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 125577 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 125576 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 125517 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125516 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 125457 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125456 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 125397 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125396 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 125337 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125336 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 125277 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 125276 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 125217 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 125216 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 125168 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30696 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 30637 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 30636 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 30577 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 30576 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 30517 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 30516 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 30457 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30456 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 30397 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30396 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 30337 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30336 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 30277 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30276 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 30217 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 30216 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 30157 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30156 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 30108
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 538/561 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 63 cggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacacaa 122 |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 123 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 182 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 183 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 242 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 243 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 303 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 363 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 423 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 483 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 543 tcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgc 602 ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || ||||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgc 757 Query: 603 attacaatangaacccctaat 623 ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 756 attacaataggaacccctaat 736
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1306 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1246 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1186 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 777
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/589 (94%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 33527205 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 33527264 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 33527265 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 33527324 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 33527325 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 33527384 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 33527385 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 33527444 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527445 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 33527504 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527505 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 33527564 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527565 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 33527624 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527625 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 33527684 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 33527685 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 33527744 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 33527745 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 33527793 Score = 103 bits (52), Expect = 7e-19 Identities = 72/81 (88%) Strand = Plus / Minus Query: 543 tcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgc 602 ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 39115413 Query: 603 attacaatangaacccctaat 623 ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 39115412 attacaataggaacccctaat 39115392
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/589 (94%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 72402 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 72461 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 72462 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 72521 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 72522 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 72581 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 72582 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 72641 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72642 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 72701 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72702 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 72761 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72762 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 72821 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72822 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 72881 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 72882 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 72941 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 72942 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 72990
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55394 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 55335 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 55334 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 55275 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 55274 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 55215 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 55214 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 55155 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 55095 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55094 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 55035 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55034 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 54975 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54974 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 54915 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 54914 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 54855 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54854 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 54806
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 tggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 559/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1275 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 551/579 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || | | || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 765
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 551/579 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || | | || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 765
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 551/579 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| Sbjct: 863 tgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || | | || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 803 ccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaat 765
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 584/623 (93%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| |||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 979 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 919 gttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccat 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 557/587 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 37 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcac 96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 97 ncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 156 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 157 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 216 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 217 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 276 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 277 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 336 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 337 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 397 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 456 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 887 Query: 457 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 516 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 886 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 827 Query: 517 ggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcgg 576 || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 826 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 767 Query: 577 ngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 766 tgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 720
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1245 tagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1186 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1126 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1125 aggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacngaatcgtc 1066 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1065 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagcaaccgg 1006 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1005 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcctt 946 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 886 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 885 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 826 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 766 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 765 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 706 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 705 ggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 657
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1306 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1246 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1245 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 1186 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 885 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 826 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 777
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55467 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 55408 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 55407 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 55348 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 55347 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 55288 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 55287 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 55228 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55227 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 55168 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55167 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 55108 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55107 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 55048 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55047 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 54988 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 54987 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 54928 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54927 ggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 54879
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55467 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 55408 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 55407 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 55348 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 55347 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 55288 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 55287 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 55228 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55227 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 55168 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55167 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 55108 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55107 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 55048 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55047 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 54988 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 54987 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 54928 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54927 ggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 54879
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124783 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 124724 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 124723 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 124664 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 124663 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 124604 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 124603 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 124544 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124543 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 124484 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124483 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 124424 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124423 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 124364 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124363 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 124304 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 124303 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 124244 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124243 ggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 124195 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30202 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 30143 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 30142 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 30083 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 30082 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 30023 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 30022 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 29963 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29962 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 29903 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29902 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 29843 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29842 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 29783 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29782 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 29723 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 29722 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 29663 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29662 ggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 29614
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124783 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 124724 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 124723 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 124664 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 124663 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 124604 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 124603 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 124544 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124543 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 124484 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124483 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 124424 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124423 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 124364 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124363 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 124304 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 124303 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 124244 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124243 ggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 124195 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30202 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 30143 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 30142 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 30083 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 30082 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 30023 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 30022 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 29963 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29962 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 29903 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29902 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 29843 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29842 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 29783 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29782 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 29723 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 29722 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 29663 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29662 ggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 29614
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 55459 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 55400 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 55399 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 55340 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 55339 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 55280 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 55279 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 55220 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55219 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 55160 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55159 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 55100 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55099 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 55040 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55039 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 54980 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 54979 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 54920 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54919 ggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 54871
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1306 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1246 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1245 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 1186 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 885 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 826 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 777
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 582/621 (93%), Gaps = 1/621 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctgct 62 |||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1311 tgatcgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgct 1253 Query: 63 cggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacacaa 122 |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1252 ttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1193 Query: 123 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 182 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1192 gcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1133 Query: 183 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 242 ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1132 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcata 1073 Query: 243 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 302 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 tgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1013 Query: 303 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 362 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1012 tgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 953 Query: 363 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 893 Query: 423 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 482 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 892 atatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 833 Query: 483 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 832 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattg 773 Query: 543 tcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgc 602 ||||||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||| || | ||| || ||||| Sbjct: 772 tcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaaatagtcatgc 713 Query: 603 attacaatangaacccctaat 623 ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 712 attacaataggaacccctaat 692
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 555/585 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 39 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacnc 98 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1284 Query: 99 ccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 158 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1283 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1224 Query: 159 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 218 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1223 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1164 Query: 219 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 278 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1163 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1104 Query: 279 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 338 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1044 Query: 339 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 984 Query: 399 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 458 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 924 Query: 459 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 518 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 923 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 864 Query: 519 ngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggng 578 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 863 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 804 Query: 579 aatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 |||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 803 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 759
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 53669 tagttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 53610 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 53609 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 53550 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 53549 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 53490 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 53489 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 53430 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53429 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 53370 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53369 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 53310 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53309 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 53250 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53249 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 53190 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 53189 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 53130 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 53129 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 53081
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 128602 tagttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 128543 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 128542 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 128483 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 128482 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 128423 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 128422 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 128363 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128362 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 128303 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128302 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 128243 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128242 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 128183 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128182 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 128123 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 128122 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 128063 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 128062 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 128014
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10347277 tagttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 10347218 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 10347217 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 10347158 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 10347157 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 10347098 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 10347097 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 10347038 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347037 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 10346978 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346977 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 10346918 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346917 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 10346858 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346857 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 10346798 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 10346797 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 10346738 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10346737 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 10346689
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 cgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 | |||||| || | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 agtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaat 747
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1420 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1361 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1360 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1301 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1300 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 1241 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1240 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1181 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1121 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1061 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 1001 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 941 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 940 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 881 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 880 ggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 832
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1163 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1104 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1044 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1043 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 984 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 983 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 924 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 864 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 804 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 744 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 684 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 683 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 624 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 623 ggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 575
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10353316 tagttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 10353257 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 10353256 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 10353197 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 10353196 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 10353137 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 10353136 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 10353077 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353076 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 10353017 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353016 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 10352957 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352956 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 10352897 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352896 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 10352837 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 10352836 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 10352777 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10352776 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 10352728
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1752 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1693 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1692 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1633 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1632 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 1573 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1572 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1513 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1512 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1453 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1452 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1393 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 taacttacctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 1333 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 1273 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1272 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 1213 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1212 ggtgaatcccccggtcaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 1164
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1785 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1726 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1725 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1666 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1665 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 1606 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1605 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1546 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1486 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1426 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 1366 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 1306 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 1305 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 1246 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1245 ggtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 1197 Score = 52.0 bits (26), Expect = 0.002 Identities = 31/33 (93%) Strand = Plus / Minus Query: 62 tcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 542/568 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 56 agctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttg 115 |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 116 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 175 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 176 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 235 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 236 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 296 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 355 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 356 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 416 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 475 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 476 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaa 535 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 536 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaanta 595 |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 748 Query: 596 nncatgcattacaatangaacccctaat 623 |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 747 gtcatgcattacaataggaacccctaat 720
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 542/568 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 56 agctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttg 115 ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 116 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 175 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 176 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 235 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 236 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 296 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 356 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 969 Query: 416 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 909 Query: 476 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaa 535 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 908 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 849 Query: 536 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaanta 595 |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || || Sbjct: 848 gccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 789 Query: 596 nncatgcattacaatangaacccctaat 623 |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 788 gtcatgcattacaataggaacccctaat 761
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 494/503 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1875 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1874 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1815 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1814 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 1755 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| Sbjct: 1754 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcat 1695 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1694 gcattacaataggaacccctaat 1672
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 542/568 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 56 agctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttg 115 |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 116 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 175 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 176 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 235 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 236 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 296 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 355 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 356 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 416 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 475 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 476 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaa 535 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 536 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaanta 595 |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || || Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 748 Query: 596 nncatgcattacaatangaacccctaat 623 |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 747 gtcatgcattacaataggaacccctaat 720
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 557/588 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 36 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatca 95 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1279 agttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1220 Query: 96 cncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 155 | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1219 cgcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcaccc 1160 Query: 156 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 215 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1159 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcc 1100 Query: 216 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 275 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1099 ccaaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggt 1040 Query: 276 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 335 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 ataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 980 Query: 336 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 920 Query: 396 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 455 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 aacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 860 Query: 456 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 800 Query: 516 cggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcg 575 ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 799 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 740 Query: 576 gngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 | ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 739 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 692
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 583/623 (93%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| |||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1370 tttgatcgccttccatacttcgcaag-ctgcggctagttcaggactccatttggaagctt 1312 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1311 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1252 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 aagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtccta 1192 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggca 1132 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1131 tatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcatggatacccaat 1072 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 cctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1012 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 caacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 952 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 892 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 891 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgt 832 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| || | ||| || ||| Sbjct: 831 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcat 772 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 771 gcattacaataggaacccctaat 749
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 583/623 (93%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| |||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1385 tttgatcgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgctagctg 1327 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1267 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1266 aagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1207 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1147 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1146 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagt 1087 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 cctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1027 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1026 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 967 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 966 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 907 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 906 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccat 847 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||| Sbjct: 846 tgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcat 787 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 786 gcattacaataggaacccctaat 764
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 583/623 (93%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 |||||||| ||| |||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1398 tttgatcgccttccatacttcgcaag-ctgcggctagttcaggactccatttggaagctt 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1339 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 aagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacacctggcatggatacccaat 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgt 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| || | ||| || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 531/554 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 70 tttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacacaagcttcta 129 ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 130 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 189 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 190 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 249 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 250 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 309 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 310 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 369 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 370 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgat 429 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgat 918 Query: 430 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 858 Query: 490 gtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggc 549 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 857 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 798 Query: 550 aatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaa 609 |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||||| Sbjct: 797 aataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaa 738 Query: 610 tangaacccctaat 623 || ||||||||||| Sbjct: 737 taggaacccctaat 724
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 547/576 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 48 catttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngtta 107 |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 108 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 167 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 168 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 228 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 288 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 348 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 408 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 467 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 468 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtga 527 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 853 Query: 528 anaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccg 587 | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| Sbjct: 852 agaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccca 793 Query: 588 gntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 | || || |||||||||||||| |||| |||||| Sbjct: 792 gttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaat 757
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 557/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 tggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 554/585 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 39 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacnc 98 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 99 ccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 158 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 159 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 218 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 219 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 278 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 279 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 338 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 339 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 399 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 458 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 922 Query: 459 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 921 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 862 Query: 519 ngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggng 578 ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 861 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 802 Query: 579 aatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 ||||| || | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 801 aatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 757
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 557/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614507 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 5614448 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 5614447 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 5614388 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 5614387 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 5614328 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 5614327 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 5614268 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614267 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 5614208 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614207 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 5614148 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614147 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 5614088 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614087 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 5614028 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 5614027 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 5613968 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||||| || ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5613967 ggtgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 5613919 Score = 541 bits (273), Expect = e-151 Identities = 322/340 (94%), Gaps = 1/340 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 284 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 344 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 404 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 463 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 464 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaat 523 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 524 gtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcc 583 ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 13436805 Query: 584 cccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 13436804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 13436765 Score = 250 bits (126), Expect = 5e-63 Identities = 162/177 (91%) Strand = Plus / Minus Query: 443 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 503 tgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 562 |||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 563 agtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccc 619 | || ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920 Score = 83.8 bits (42), Expect = 6e-13 Identities = 50/53 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgag 87 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 13424430 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 229 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 258 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 309 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 343 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.54 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 227 ggtcagagctggcatatgccaa 248 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 557/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 gggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 | ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 agtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 557/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614496 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 5614437 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 5614436 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 5614377 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 5614376 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 5614317 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 5614316 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 5614257 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614256 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 5614197 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614196 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 5614137 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614136 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 5614077 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614076 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 5614017 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 5614016 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 5613957 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||||| || ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5613956 ggtgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 5613908 Score = 541 bits (273), Expect = e-151 Identities = 322/340 (94%), Gaps = 1/340 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 284 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 344 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 404 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 463 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 464 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaat 523 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 524 gtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcc 583 ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 13391079 Query: 584 cccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 13391078 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 13391039 Score = 250 bits (126), Expect = 5e-63 Identities = 162/177 (91%) Strand = Plus / Minus Query: 443 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 503 tgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 562 |||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 563 agtantatttgcggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccc 619 | || ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13352194 Score = 83.8 bits (42), Expect = 6e-13 Identities = 50/53 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgag 87 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 13378704 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 229 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 258 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 309 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 343 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.54 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 227 ggtcagagctggcatatgccaa 248 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 557/589 (94%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38378 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 38437 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 38438 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 38497 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 38498 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 38557 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 38558 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 38617 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38618 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 38677 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38678 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 38737 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38738 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 38797 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38798 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 38857 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 38858 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 38917 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||||| || ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38918 ggtgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 38966
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%), Gaps = 1/589 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 23203629 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 23203688 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 23203689 gcgccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 23203747 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 23203748 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 23203807 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 23203808 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 23203867 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203868 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 23203927 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 23203928 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttc 23203987 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203988 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 23204047 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204048 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 23204107 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 23204108 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 23204167 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 23204168 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 23204216 Score = 105 bits (53), Expect = 2e-19 Identities = 58/60 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 26711497 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 26711438 Score = 105 bits (53), Expect = 2e-19 Identities = 58/60 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 26711389 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%), Gaps = 1/589 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 154277 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 154336 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 154337 gcgccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 154395 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 154396 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 154455 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 154456 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 154515 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154516 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 154575 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 154576 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttc 154635 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154636 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 154695 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154696 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 154755 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 154756 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 154815 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 154816 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 154864
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 558/589 (94%), Gaps = 1/589 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38391 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 38450 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 38451 gcgccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 38509 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 38510 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatc 38569 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 38570 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 38629 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38630 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 38689 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 38690 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttc 38749 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38750 taacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 38809 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38810 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 38869 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 38870 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 38929 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38930 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 38978
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 556/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1289 gcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1230 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1170 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1169 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaataccccctgaagccaccgg 1110 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1050 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 870 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 869 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 810 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 809 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaat 761
>gb|AY622897.1| Olyra latifolia ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 556/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaactgtaatacggaatcatc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatcccccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 855 tcgatgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 556/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || ||||||||| |||| || |||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattataataggagcccctaat 747
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 556/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1275 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacataggcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || |||||||||||||| |||| |||||| Sbjct: 795 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaat 747
>emb|AJ746178.1| Arundinaria oedogonata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1274 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 546/576 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 48 catttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngtta 107 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| Sbjct: 1274 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1215 Query: 108 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 167 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct: 1214 cgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccc 1155 Query: 168 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct: 1154 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcg 1095 Query: 228 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 287 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1094 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1035 Query: 288 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 347 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 atagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 975 Query: 348 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 915 Query: 408 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 467 |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 914 actgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacga 855 Query: 468 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtga 527 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 854 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtga 795 Query: 528 anaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccg 587 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 794 agaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccca 735 Query: 588 gntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 734 gttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 699
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 548/579 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1279 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattt 1219 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1218 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1159 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1158 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1099 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1039 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 979 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 919 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| Sbjct: 918 cgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatg 859 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||| Sbjct: 858 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcagtgaatccc 799 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || | ||| || |||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 798 ccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaat 760
>gb|M91626.1|BAMCPRBCL Bamboo chloroplast ribulosebisphosphate (rbcL) gene, partial cds Length = 1324 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 547/579 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 45 ctccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttng 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| Sbjct: 1324 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1265 Query: 105 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 164 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatty 1205 Query: 165 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 224 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1204 ycccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1145 Query: 225 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 284 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1144 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1085 Query: 285 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1025 Query: 345 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 965 Query: 405 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 464 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 905 Query: 465 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatg 524 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| Sbjct: 904 cgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatg 845 Query: 525 tgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatccc 584 |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||| Sbjct: 844 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcagtgaatccc 785 Query: 585 ccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || | ||| || |||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 784 ccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaat 746
>gb|U13228.1|LOU13228 Leersia oryzoides chloroplast ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds Length = 1320 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 544/574 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 50 tttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacg 109 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| Sbjct: 1320 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1261 Query: 110 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 169 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1260 agcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattacccca 1201 Query: 170 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 229 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct: 1200 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatttcggt 1141 Query: 230 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 289 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1081 Query: 290 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1021 Query: 350 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 409 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 gcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 961 Query: 410 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 469 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 tgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 901 Query: 470 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaan 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 900 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 841 Query: 530 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggn 589 ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 840 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggt 781 Query: 590 taantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 ||| || |||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 780 taagtagtcatgcattacaataggagcccctaat 747
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 558/590 (94%), Gaps = 2/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttnattaccttcgcgagcaagat 93 |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcacgagcaagat 1277 Query: 94 cacncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 153 | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 154 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 213 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 ctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 214 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 273 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 274 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 334 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 393 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgctcccctt 977 Query: 394 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 453 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 454 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 513 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 514 cacggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttg 573 ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 574 cggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 ||| |||||| || | ||| || |||||||||| ||| ||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattactataggaacccctaat 747
>gb|AY626351.1| Eriachne triseta ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1320 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 552/585 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 39 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacnc 98 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | Sbjct: 1320 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1261 Query: 99 ccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 158 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1201 Query: 159 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 218 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1200 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1141 Query: 219 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 278 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1140 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagcaaccggtata 1081 Query: 279 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 338 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1080 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatccttttca 1021 Query: 339 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 398 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 ataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 961 Query: 399 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 901 Query: 459 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 900 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 841 Query: 519 ngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggng 578 ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| | || |||| || ||||||||| | Sbjct: 840 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataattagacaaactagtatttgcggtg 781 Query: 579 aatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 ||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 780 aatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 736
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 555/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaat 747
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 555/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 555/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaat 747
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 555/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 555/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|AY622891.1| Ehrharta calycina ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 555/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcacgctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccgaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 915 tgctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctaacaaaaactgcatgcattgt 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 855 cgggtgaatgtgaaaaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 | ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 agtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 555/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || |||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaat 747
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 555/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 acggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 tggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagcatgcatagc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaagtagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|U31101.1|CLU31101 Chasmanthium latifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 555/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 aggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 555/589 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1216 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1215 tggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1156 Query: 215 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 275 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 335 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 394 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 395 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 455 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 514 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 515 acggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgc 574 ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgc 796 Query: 575 ggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 || |||||| || | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 747
>dbj|AB088833.1| Phyllostachys bambusoides chloroplast rbcL gene for RuBisCO large subunit, partial cds Length = 1356 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 558/590 (94%), Gaps = 2/590 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatc 94 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1341 tagttcaggactccntttgcaagctgctcggataatttnattaccttcacgagcaagatc 1282 Query: 95 acncccttngttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 154 | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1281 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1222 Query: 155 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccacc-aaattgtaatacagaatcgt 213 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | Sbjct: 1221 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc-tccacccaaattgtaatacggaatcat 1163 Query: 214 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 273 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1162 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1103 Query: 274 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 333 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 gtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1043 Query: 334 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 983 Query: 394 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 453 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 923 Query: 454 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 513 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 863 Query: 514 cacggngaatgtgaanaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttg 573 | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| Sbjct: 862 cccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 803 Query: 574 cggngaatcccccggntaantanncatgcattacaatangaacccctaat 623 ||| ||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 802 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaat 753
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 580/623 (93%), Gaps = 1/623 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tttgatcgncttncatacttcacaagncngaagntagttcaggactccatttgcaagctg 60 ||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 tttgatctccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 61 ctcggataatttnattaccttcgcgagcaagatcacncccttngttacgagcttgtacac 120 || |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| Sbjct: 1339 ctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtacac 1280 Query: 121 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 180 | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 181 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 241 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 300 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagt 1100 Query: 301 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 360 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 361 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 420 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 980 Query: 421 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 979 ggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccat 920 Query: 481 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggngaatgtgaanaagtaagccat 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| | Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgt 860 Query: 541 tgtcgcggcaatagtgagccaaagtantatttgcggngaatcccccggntaantanncat 600 ||||||||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||| || | ||| || ||| Sbjct: 859 tgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcat 800 Query: 601 gcattacaatangaacccctaat 623 ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 799 gcattacaataggaacccctaat 777 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 3,899,469 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 3899469 Number of successful extensions: 109013 Number of sequences better than 10.0: 15107 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15076 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 41 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 78169 Number of HSP's gapped (non-prelim): 20981 length of query: 623 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 600 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 10285978622400 effective search space used: 10285978622400 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)