Clone Name | rbasd25a02 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 546/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 546/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 546/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 545/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 544/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctakttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 544/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccytt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 544/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccytt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 544/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 544/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 544/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkagstaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 544/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 544/549 (99%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccaggagcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1417 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1416 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1357 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1297 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1237 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1177 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1117 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1057 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 997 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 937 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 936 tgtgaagaa 928
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1195 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1194 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1135 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1075 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1074 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1015 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 955 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 895 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 835 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 775 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 774 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 715 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 714 tgtgaagaa 706
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1195 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1194 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1135 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1075 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1074 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1015 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 955 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 895 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 835 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 775 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 774 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 715 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 714 tgtgaagaa 706
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56326 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 56267 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 56266 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 56207 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56206 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 56147 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56146 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 56087 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56086 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 56027 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56026 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 55967 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55966 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 55907 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55906 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 55847 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55846 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 55787 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 55786 tgtgaagaa 55778
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 543/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1512 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1453 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1452 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1393 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1333 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1273 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1213 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1153 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1093 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1033 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 973 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 972 tgtgaagaa 964
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnntaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 542/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 540/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacan 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 540/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnncccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1287 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1107 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 986 tgtgaagaa 978
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1287 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1107 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 986 tgtgaagaa 978
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1287 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1107 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 986 tgtgaagaa 978
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1287 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1107 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 986 tgtgaagaa 978
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1287 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1107 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 986 tgtgaagaa 978
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1325 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1324 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1265 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1205 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1145 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1085 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1025 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttac 965 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 905 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 845 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 844 tgtgaagaa 836
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 541/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 540/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 540/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 540/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 540/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1195 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1194 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1135 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1134 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggtgcat 1075 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1074 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1015 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 955 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 895 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 835 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 775 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 774 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 715 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 714 tgtgaagaa 706
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 540/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1334 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1333 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1274 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1214 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1154 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1094 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1034 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 974 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 914 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 854 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 853 tgtgaagaa 845
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 539/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1287 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1107 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 986 tgtgaagaa 978
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 540/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1471 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1411 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1351 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1291 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1231 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1171 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1111 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1051 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 991 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 990 tgtgaagaa 982
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 540/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1334 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1333 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1274 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1214 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1154 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1094 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1034 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 974 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 914 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 854 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 853 tgtgaagaa 845
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 539/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 539/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 539/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 540/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1386 ctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1327 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1326 gactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1267 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1207 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1147 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1087 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1027 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 967 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 907 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 847 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 846 tgtgaagaa 838
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 539/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 540/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgctgcctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 538/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagr 1287 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaacttac 1107 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 986 tgtgaagaa 978
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 539/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1471 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1411 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1351 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1291 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1231 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1171 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1111 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1051 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 991 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 990 tgtgaagaa 982
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 539/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 925 tgtgaagaa 917
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 539/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1386 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1327 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1326 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1267 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1207 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1147 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacan 1087 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1027 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 967 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 907 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 847 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 846 tgtgaagaa 838
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 539/549 (98%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggcccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 538/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 538/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagataata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtcaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 538/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1471 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1411 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1351 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1291 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1231 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1171 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1111 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1051 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 991 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 990 tgtgaagaa 982
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 538/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 535/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 nnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 537/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1471 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1411 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1410 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggtgcat 1351 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1291 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1231 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1171 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1111 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1051 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 991 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 990 tgtgaagaa 982
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 537/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1468 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1409 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1408 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1349 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1289 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1288 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1229 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1169 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1109 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 aatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1049 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 989 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacggtgaa 929 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 928 tgtgaagaa 920
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 537/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 496/499 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 49 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 109 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 168 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 169 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 228 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 229 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 289 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 349 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 409 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 469 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 529 gcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaa 849
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 535/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1397 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1338 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1337 gactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1278 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggtgcat 1218 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1217 ttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1158 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1098 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1038 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttac 978 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 918 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 858 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 857 tgtgaagaa 849
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 535/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1237 tcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 caggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 535/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 535/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1515 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1456 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1455 gactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1396 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1336 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaaga 1276 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 tttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1216 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 ctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1156 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttac 1096 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1036 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 976 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 975 tgtgaagaa 967
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 535/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 532/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccctt 1408 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1107 ctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagctaata 1048 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 987 tgtgaagaa 979
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 520/531 (97%), Gaps = 1/531 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 atttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 76 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1330 Query: 77 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 136 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1270 Query: 137 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1269 aggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1210 Query: 197 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 256 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggca 1150 Query: 257 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 316 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagt 1090 Query: 317 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 376 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 cctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1030 Query: 377 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 436 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1029 caacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 970 Query: 437 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 910 Query: 497 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 859
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 486/487 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 863 tgaagaa 857
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 534/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1377 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1318 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1317 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1258 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1198 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1197 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaaga 1138 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1078 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 ctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1018 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1017 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 958 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 898 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 897 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 838 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 837 tgtgaagaa 829
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 534/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 493/497 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaa 813
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 493/497 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaa 813
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 493/497 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaa 849
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 492/496 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 52 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 111 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 112 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 171 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 172 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 231 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 292 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 352 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 412 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 471 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 472 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 532 cggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaa 849
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 533/549 (97%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 ctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1341 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1340 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtcctt 1281 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1221 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1220 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1161 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1160 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1101 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1041 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 981 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 921 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 920 cacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaa 861 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 860 tgtgaagaa 852
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 485/487 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 850 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 849 tgaagaa 843
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 506/515 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 33 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 92 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 93 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 152 |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 153 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 212 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 213 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 272 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 273 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 332 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 333 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 393 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 452 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 944 Query: 453 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 884 Query: 513 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 849
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 493/499 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 49 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 109 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 168 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 169 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 228 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 229 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 289 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 348 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 349 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 409 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 469 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 529 gcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaa 849
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 491/497 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 944 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 884 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 883 acggtgaatgtgaagaa 867
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 491/497 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaa 839
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 517/531 (97%), Gaps = 1/531 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 atttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 76 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1325 Query: 77 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 136 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1324 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacac 1265 Query: 137 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 196 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1264 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1205 Query: 197 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 256 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1145 Query: 257 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 316 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 tatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagt 1085 Query: 317 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1025 Query: 377 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 436 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1024 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 965 Query: 437 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 964 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 905 Query: 497 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 904 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaa 854
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 483/487 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 863 tgaagaa 857
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 533/549 (97%), Gaps = 4/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124753 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 124694 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124693 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 124634 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124633 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 124574 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 124573 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaaga 124514 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124513 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacac 124455 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 124454 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaataa 124396 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124395 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 124336 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124335 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 124276 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124275 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 124216 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 124215 tgtgaagaa 124207 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 533/549 (97%), Gaps = 4/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30226 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 30167 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30166 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 30107 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30106 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 30047 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 30046 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaaga 29987 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29986 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacac 29928 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 29927 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaataa 29869 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29868 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 29809 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29808 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 29749 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29748 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 29689 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 29688 tgtgaagaa 29680
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 490/497 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaa 833
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 490/497 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 866 acggtgaatgtgaagaa 850
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 490/497 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaa 833
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 498/508 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 40 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 99 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 100 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 159 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 160 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 219 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 220 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 279 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 280 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 339 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 340 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 399 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 400 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 939 Query: 460 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 519 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 879 Query: 520 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 878 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 851
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 482/487 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 863 tgaagaa 857
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 491/499 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 49 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 109 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 168 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 169 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 228 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 229 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 288 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 289 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 348 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 349 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 409 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 468 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 469 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 529 gcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||| Sbjct: 868 gcacggtgaatgtgaagaa 850
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 503/515 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 33 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 92 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 93 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 152 |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 153 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 212 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 213 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 272 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 273 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 332 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 333 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 393 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 452 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 944 Query: 453 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 884 Query: 513 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 849
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55519 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 55460 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 55459 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 55400 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55399 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 55340 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 55339 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 55280 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55279 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 55220 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55219 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 55160 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55159 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 55100 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55099 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 55040 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 55039 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 54980 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 54979 tgtgaagaa 54971
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55519 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 55460 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 55459 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 55400 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55399 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 55340 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 55339 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 55280 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55279 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 55220 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55219 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 55160 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55159 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 55100 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55099 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 55040 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 55039 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 54980 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 54979 tgtgaagaa 54971
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55467 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 55408 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 55407 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 55348 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55347 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 55288 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 55287 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 55228 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55227 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 55168 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55167 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 55108 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55107 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 55048 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55047 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 54988 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54987 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 54928 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 54927 tgtgaagaa 54919
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125808 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 125749 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 125748 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 125689 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125688 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 125629 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 125628 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 125569 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 125568 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 125509 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125508 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 125449 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125448 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 125389 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125388 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 125329 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 125328 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 125269 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 125268 tgtgaagaa 125260 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30748 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 30689 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30688 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 30629 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30628 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 30569 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 30568 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 30509 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30508 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 30449 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30448 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 30389 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30388 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 30329 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30328 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 30269 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 30268 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 30209 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 30208 tgtgaagaa 30200
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124835 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 124776 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124775 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 124716 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124715 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 124656 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 124655 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 124596 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124595 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 124536 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124535 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 124476 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124475 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 124416 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124415 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 124356 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124355 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 124296 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 124295 tgtgaagaa 124287 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 30195 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30194 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 30135 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30134 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 30075 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 30074 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 30015 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30014 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 29955 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29954 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 29895 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29894 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 29835 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29834 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 29775 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29774 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 29715 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 29714 tgtgaagaa 29706
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124835 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 124776 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124775 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 124716 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124715 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 124656 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 124655 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 124596 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124595 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 124536 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124535 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 124476 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124475 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 124416 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124415 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 124356 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124355 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 124296 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 124295 tgtgaagaa 124287 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 30195 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30194 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 30135 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30134 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 30075 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 30074 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 30015 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30014 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 29955 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29954 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 29895 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29894 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 29835 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29834 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 29775 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29774 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 29715 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 29714 tgtgaagaa 29706
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55511 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 55452 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 55451 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 55392 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55391 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 55332 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 55331 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 55272 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55271 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 55212 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55211 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 55152 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55151 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 55092 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55091 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 55032 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 55031 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 54972 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 54971 tgtgaagaa 54963
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1237 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1342 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1341 gactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1282 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1281 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcat 1222 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1221 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1162 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1161 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1102 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1042 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 982 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 922 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 921 cacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaa 862 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 861 tgtgaagaa 853
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527153 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 33527212 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 33527213 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 33527272 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527273 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 33527332 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 33527333 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 33527392 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 33527393 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 33527452 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527453 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 33527512 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527513 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 33527572 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527573 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 33527632 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 33527633 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 33527692 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 33527693 tgtgaagaa 33527701
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72350 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 72409 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 72410 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 72469 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72470 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 72529 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 72530 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 72589 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 72590 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 72649 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72650 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 72709 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72710 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 72769 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72770 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 72829 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 72830 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 72889 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 72890 tgtgaagaa 72898
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1413 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1412 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1353 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 1293 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1292 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 1233 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1232 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1173 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1113 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1053 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 993 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 992 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 933 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 932 tgtgaagaa 924
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1156 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1155 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1096 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 1036 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1035 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 976 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 975 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 916 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 856 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 855 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 796 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 795 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 736 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 735 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 676 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 675 tgtgaagaa 667
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55446 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 55387 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 55386 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 55327 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55326 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 55267 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 55266 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 55207 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55206 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 55147 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55146 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 55087 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55086 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 55027 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55026 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 54967 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54966 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 54907 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 54906 tgtgaagaa 54898
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1837 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1778 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1777 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1718 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1717 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 1658 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1657 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 1598 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1597 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1538 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1478 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1418 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1358 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 1298 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 1297 tgtgaagaa 1289 Score = 58.0 bits (29), Expect = 3e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 78 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 489/497 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaa 839
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 481/487 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 866 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 865 tgaagaa 859
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 490/499 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 49 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 109 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 168 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 169 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 228 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 229 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 288 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 289 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 349 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 409 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 468 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 933 Query: 469 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 873 Query: 529 gcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||| Sbjct: 872 gcacggtgaatgtgaagaa 854
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcac 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1237 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 937 cacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 ctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1345 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1344 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1285 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcat 1225 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1224 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1165 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1164 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1105 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1045 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 985 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 925 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 924 cacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaa 865 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 864 tgtgaagaa 856
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 ctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1343 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1342 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1283 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1282 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcat 1223 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1222 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1163 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1162 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1103 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1043 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 983 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 923 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 922 cacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaa 863 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 862 tgtgaagaa 854
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 492/502 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 46 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 105 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 106 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 165 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 166 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 225 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 226 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 285 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 286 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 346 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 405 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 406 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 465 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 466 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 525 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgc 891 Query: 526 attgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaa 869
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1357 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1356 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1297 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1296 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcat 1237 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1236 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1177 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1117 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 ctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1057 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 997 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 ctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 937 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 936 cacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaa 877 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 876 tgtgaagaa 868
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53721 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcac 53662 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 53661 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 53602 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53601 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 53542 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 53541 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 53482 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 53481 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 53422 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53421 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 53362 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53361 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 53302 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53301 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 53242 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 53241 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 53182 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 53181 tgtgaagaa 53173
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128654 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcac 128595 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 128594 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 128535 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128534 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 128475 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 128474 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 128415 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 128414 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 128355 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128354 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 128295 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128294 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 128235 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128234 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 128175 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 128174 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 128115 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 128114 tgtgaagaa 128106
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347329 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcac 10347270 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 10347269 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 10347210 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347209 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 10347150 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 10347149 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 10347090 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10347089 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 10347030 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347029 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 10346970 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346969 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 10346910 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346909 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 10346850 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 10346849 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 10346790 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 10346789 tgtgaagaa 10346781
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353368 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcac 10353309 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 10353308 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 10353249 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353248 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 10353189 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 10353188 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 10353129 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10353128 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 10353069 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353068 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 10353009 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353008 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 10352949 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352948 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 10352889 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 10352888 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 10352829 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 10352828 tgtgaagaa 10352820
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1804 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1745 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1744 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1685 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1684 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 1625 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1624 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 1565 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1564 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1505 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1504 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1445 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1444 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1385 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 ctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1325 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1324 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 1265 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 1264 tgtgaagaa 1256
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 483/491 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 57 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 116 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 117 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 176 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 177 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 236 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 237 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 297 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 356 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 357 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 417 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 476 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 477 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 537 aatgtgaagaa 547 ||||||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaa 857
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 488/497 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaa 833
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 510/525 (97%), Gaps = 1/525 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 tcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 82 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1308 tcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttga 1249 Query: 83 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 142 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1248 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1189 Query: 143 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 202 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1129 Query: 203 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 262 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1069 Query: 263 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 322 ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1009 Query: 323 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 382 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 tgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 949 Query: 383 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatat 889 Query: 443 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 502 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 gatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 829 Query: 503 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 828 tctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 784
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 485/493 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 115 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 175 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 234 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 235 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 295 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 355 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 415 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 474 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 475 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 534 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 535 tgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaa 869
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 527/547 (96%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 accggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcagga 60 |||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 accgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 1356 Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1355 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1296 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1236 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1235 ccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatt 1176 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1175 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1116 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1056 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaacttacct 996 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 actactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 936 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 935 cgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 876 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 875 tgaagaa 869
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 480/487 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 863 tgaagaa 857
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 489/499 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 109 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 168 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 169 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 228 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 229 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 289 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 349 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 408 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 409 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 468 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 935 Query: 469 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 875 Query: 529 gcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||| Sbjct: 874 gcacggtgaatgtgaagaa 856
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 528/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 ctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcag 1330 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 gactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccctt 1270 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct: 1269 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcat 1210 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1209 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaaga 1150 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1149 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacac 1090 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataa 1030 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttac 970 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 910 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 909 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 850 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 849 tgtgaagaa 841
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 485/494 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 54 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 114 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 173 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 174 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 233 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 234 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 293 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 294 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 354 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 413 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 414 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 473 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 474 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 534 gtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaa 830
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 485/494 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 54 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 114 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 173 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 174 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 233 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 234 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 293 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 294 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 354 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 413 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 414 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 473 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 474 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 534 gtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaa 830
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 528/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1237 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttcaatat 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 528/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 937 cacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 528/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcag 1358 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 gactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccctt 1298 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcat 1238 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1237 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaaga 1178 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacac 1118 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataa 1058 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 878 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 877 tgtgaagaa 869
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 528/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| || | |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614559 ctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttcag 5614500 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 5614499 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 5614440 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614439 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 5614380 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 5614379 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 5614320 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5614319 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 5614260 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614259 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 5614200 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614199 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 5614140 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614139 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 5614080 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 5614079 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 5614020 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 5614019 tgtgaagaa 5614011 Score = 444 bits (224), Expect = e-121 Identities = 243/248 (97%), Gaps = 1/248 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 300 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 360 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 420 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 479 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 480 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 539 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 540 gtgaagaa 547 |||||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaa 13436857 Score = 161 bits (81), Expect = 3e-36 Identities = 87/89 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 459 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 519 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaa 13398008 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 103 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 245 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 274 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 325 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 359 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.47 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 243 ggtcagagctggcatatgccaa 264 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 528/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| || | |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614548 ctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttcag 5614489 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 5614488 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 5614429 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614428 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 5614369 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 5614368 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 5614309 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5614308 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 5614249 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614248 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 5614189 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614188 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 5614129 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614128 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 5614069 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 5614068 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 5614009 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 5614008 tgtgaagaa 5614000 Score = 444 bits (224), Expect = e-121 Identities = 243/248 (97%), Gaps = 1/248 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 300 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 360 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 420 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 479 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 480 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 539 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 540 gtgaagaa 547 |||||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaa 13391131 Score = 161 bits (81), Expect = 3e-36 Identities = 87/89 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 459 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 519 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaa 13352282 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 103 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 245 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 274 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 325 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 359 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.47 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 243 ggtcagagctggcatatgccaa 264 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 528/549 (96%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| || | |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38326 ctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttcag 38385 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 38386 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 38445 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38446 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 38505 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 38506 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 38565 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38566 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 38625 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38626 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 38685 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38686 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 38745 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38746 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 38805 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 38806 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 38865 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 38866 tgtgaagaa 38874
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 494/506 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 494/506 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 482/491 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 57 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 116 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 117 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 176 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 177 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 236 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 237 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 296 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 297 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 356 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 357 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 417 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 476 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 477 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 537 aatgtgaagaa 547 ||||||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaa 857
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 487/497 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaa 849
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 848 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 847 tgtgaagaa 839
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 513/531 (96%), Gaps = 1/531 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 atttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 76 ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 atttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctt 1325 Query: 77 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 136 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1324 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1265 Query: 137 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 196 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1264 aagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1205 Query: 197 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 256 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1145 Query: 257 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 316 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1144 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagt 1085 Query: 317 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1025 Query: 377 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 436 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1024 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 965 Query: 437 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 964 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 905 Query: 497 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 904 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaa 854
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 479/487 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 863 tgaagaa 857
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 479/487 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 863 tgaagaa 857
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 479/487 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 863 tgaagaa 857
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 479/487 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 863 tgaagaa 857
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 488/499 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 109 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 168 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 169 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 228 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 229 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 288 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 289 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 348 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 349 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 409 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 468 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 469 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 529 gcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaa 849
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 527/549 (95%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||| ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1332 ctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaagttcag 1273 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1272 ggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1213 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct: 1212 cgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcat 1153 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1152 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1093 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1092 tttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1033 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 caggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 973 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 913 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 853 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 852 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 793 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 792 tgtgaagaa 784
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 528/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203577 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 23203636 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 23203637 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 23203696 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203697 -gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 23203755 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 23203756 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 23203815 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 23203816 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 23203875 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203876 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 23203935 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203936 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttac 23203995 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203996 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 23204055 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 23204056 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 23204115 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 23204116 tgtgaagaa 23204124 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 108 atc 110 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 108 atc 110 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 528/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154225 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 154284 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 154285 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 154344 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154345 -gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 154403 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 154404 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 154463 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 154464 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 154523 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154524 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 154583 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154584 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttac 154643 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154644 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 154703 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 154704 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 154763 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 154764 tgtgaagaa 154772
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 528/549 (96%), Gaps = 3/549 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38339 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 38398 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 38399 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 38458 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38459 -gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 38517 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 38518 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 38577 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38578 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 38637 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38638 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 38697 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38698 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttac 38757 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38758 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 38817 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 38818 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 38877 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 38878 tgtgaagaa 38886
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 486/497 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 929 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgc 870 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 869 acggtgaatgtgaagaa 853
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 483/493 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 115 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 174 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 175 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 234 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 235 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 295 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 354 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 355 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 415 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 931 Query: 475 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 534 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 930 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacgg 871 Query: 535 tgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||| Sbjct: 870 tgaatgtgaagaa 858
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 486/497 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaa 839
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 497/512 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 36 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 95 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1321 Query: 96 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 155 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1261 Query: 156 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 215 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201 Query: 216 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 275 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141 Query: 276 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 335 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 ccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081 Query: 336 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1021 Query: 396 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1020 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccaga 961 Query: 456 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 515 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 catacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 901 Query: 516 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 900 aactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaa 869
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%), Gaps = 1/531 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 atttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 76 ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 77 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 136 || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1339 ctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtacac 1280 Query: 137 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 196 | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 197 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 257 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 316 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagt 1100 Query: 317 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 376 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 377 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 436 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 980 Query: 437 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 496 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 979 ggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccat 920 Query: 497 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 869
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 492/506 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 775 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 774 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 749
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 492/506 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 492/506 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 492/506 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 464/469 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 79 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 138 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 139 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 198 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 199 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 258 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 259 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 319 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 379 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 439 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 499 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 831
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 485/497 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||| Sbjct: 866 tcggtgaatgtgaagaa 850
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 464/469 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 79 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 138 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 139 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 198 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 199 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 258 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 259 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 319 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 379 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 439 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 499 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 831
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 485/497 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaa 839
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 511/531 (96%), Gaps = 1/531 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 atttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 76 ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1386 atttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagctg 1327 Query: 77 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 136 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacac 1267 Query: 137 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 196 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1266 aagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1207 Query: 197 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 256 ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggca 1147 Query: 257 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 316 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1146 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagt 1087 Query: 317 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 376 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 cctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1027 Query: 377 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 436 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1026 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 967 Query: 437 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 496 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 966 ggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccat 907 Query: 497 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 906 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaa 856
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 496/512 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 36 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 95 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1305 Query: 96 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 155 ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1304 ttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1245 Query: 156 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 215 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1185 Query: 216 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 275 |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1184 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaatacc 1125 Query: 276 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 335 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1065 Query: 336 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1005 Query: 396 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccaga 945 Query: 456 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 515 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 catacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 885 Query: 516 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 884 aactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaa 853
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 511/531 (96%), Gaps = 1/531 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 atttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 76 ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 atttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1340 Query: 77 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 136 || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1339 ctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtacac 1280 Query: 137 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 196 | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1279 aggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1220 Query: 197 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggca 1160 Query: 257 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 316 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagt 1100 Query: 317 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 376 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 cctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1040 Query: 377 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 436 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 caacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 980 Query: 437 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 496 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 979 ggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccat 920 Query: 497 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 919 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 869
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 477/487 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 863 tgaagaa 857
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 477/487 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 863 tgaagaa 857
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 491/506 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 491/506 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>emb|AJ746283.1| Aristida congesta subsp. barbicollis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 491/506 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 491/506 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|U31359.1|ACU31359 Aristida congesta subsp. barbicollis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 491/506 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 525/549 (95%), Gaps = 2/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcag 58 ||||||||| |||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1328 Query: 59 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 118 ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 119 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 178 |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 179 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 238 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1207 tcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaaga 1148 Query: 239 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 299 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 358 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttcaataa 1028 Query: 359 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 419 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 478 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 479 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 848 Query: 539 tgtgaagaa 547 ||||||||| Sbjct: 847 tgtgaagaa 839
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 491/506 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 491/506 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 463/469 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 79 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 138 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 139 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 198 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 199 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 258 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 259 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 319 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 379 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 439 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 499 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 828
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 463/469 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 79 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 138 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 139 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 198 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 199 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 258 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 259 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 319 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 379 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 439 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 499 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 828
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 523/547 (95%), Gaps = 2/547 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 accggctcgaactcga-tttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcagga 60 |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1832 accggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 1773 Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1772 ctccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1713 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1712 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggtgcattt 1653 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1652 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatt 1593 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1592 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1533 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1532 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaa 1473 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacct 1413 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 actactgtaccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagctaataca 1353 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 cggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 1293 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 1292 tgaagaa 1286
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 510/531 (96%), Gaps = 1/531 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 atttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 76 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1836 atttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1777 Query: 77 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 136 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1776 ctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 1717 Query: 137 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 196 | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1716 aggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1657 Query: 197 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 256 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1656 aagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggca 1597 Query: 257 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 316 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1596 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagt 1537 Query: 317 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 376 ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1536 cctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1477 Query: 377 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 436 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1476 caacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgt 1417 Query: 437 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 496 ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1357 Query: 497 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1356 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 1306
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 495/512 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 36 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 95 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120461 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 120402 Query: 96 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 155 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 120401 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 120342 Query: 156 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 215 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120341 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 120282 Query: 216 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 275 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120281 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 120222 Query: 276 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 335 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120221 ccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 120162 Query: 336 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 395 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 120161 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 120102 Query: 396 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 455 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 120101 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 120042 Query: 456 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120041 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 119982 Query: 516 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 119981 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 119950
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 495/512 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 36 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 95 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58834 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 58775 Query: 96 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 155 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 58774 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 58715 Query: 156 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 215 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58714 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 58655 Query: 216 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 275 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58654 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 58595 Query: 276 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 335 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58594 ccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 58535 Query: 336 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 395 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 58534 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 58475 Query: 396 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 455 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 58474 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 58415 Query: 456 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58414 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 58355 Query: 516 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58354 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 58323
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 510/531 (96%), Gaps = 1/531 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 atttgntcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 76 ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1788 atttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctg 1729 Query: 77 ctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacac 136 || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1728 ctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtacac 1669 Query: 137 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 196 | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1668 aggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtccta 1609 Query: 197 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1608 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggca 1549 Query: 257 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 316 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1548 tatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccagt 1489 Query: 317 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 376 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1488 cctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1429 Query: 377 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 436 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 caacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1369 Query: 437 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 496 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1309 Query: 497 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1308 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 1258
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 476/487 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 121 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 180 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 181 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 241 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 301 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 360 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 361 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 421 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 480 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 481 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 874 Query: 541 tgaagaa 547 ||||||| Sbjct: 873 tgaagaa 867
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 485/499 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 109 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 168 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 169 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 228 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 229 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 288 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 289 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 348 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 349 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 409 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 468 ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 469 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 528 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 529 gcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaa 839
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 473/484 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 123 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 124 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 183 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 184 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 244 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 304 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 364 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 424 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 483 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 484 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 853 Query: 544 agaa 547 |||| Sbjct: 852 agaa 849
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 490/506 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||| || |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcatagctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 490/506 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|U31104.1|ECU31104 Eragrostis capensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 490/506 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcttgataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 483/497 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 51 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 111 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 170 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 171 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 230 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 231 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 291 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 350 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 351 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 411 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 470 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 471 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 530 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 531 acggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 467/476 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 72 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 131 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 132 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 191 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 192 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 251 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 252 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 312 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 371 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 372 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 432 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 491 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 492 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 812
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 494/512 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 36 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 95 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 1321 Query: 96 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 155 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 1261 Query: 156 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 215 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201 Query: 216 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 275 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141 Query: 276 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 335 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 cccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081 Query: 336 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 395 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1080 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 1021 Query: 396 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 455 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1020 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 961 Query: 456 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 901 Query: 516 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 900 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 869
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 494/512 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 36 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 95 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58253 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 58194 Query: 96 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 155 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 58193 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 58134 Query: 156 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 215 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58133 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 58074 Query: 216 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 275 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58073 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 58014 Query: 276 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 335 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58013 cccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 57954 Query: 336 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 395 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57953 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 57894 Query: 396 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 455 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57893 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 57834 Query: 456 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57833 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 57774 Query: 516 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 57773 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 57742
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 467/476 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 72 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 131 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 132 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 191 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 192 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 251 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 252 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 312 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 371 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 372 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 432 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 491 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 492 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 812
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 482/496 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 52 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 111 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 112 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 171 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 172 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 231 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 292 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 351 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 352 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 412 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 471 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 472 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 531 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 532 cggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaa 869
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 494/512 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 36 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 95 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58263 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 58204 Query: 96 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 155 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 58203 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 58144 Query: 156 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 215 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58143 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 58084 Query: 216 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 275 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58083 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 58024 Query: 276 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 335 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58023 cccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 57964 Query: 336 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 395 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57963 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 57904 Query: 396 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 455 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57903 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 57844 Query: 456 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57843 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 57784 Query: 516 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 57783 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 57752
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 493/511 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 37 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 96 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 97 tcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcga 156 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaagatctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgg 1242 Query: 157 ttagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 216 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 ttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 1182 Query: 217 aatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacca 276 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccc 1122 Query: 277 cctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccg 336 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1121 cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagataccg 1062 Query: 337 cgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 396 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 cgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 1002 Query: 397 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagac 456 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagac 942 Query: 457 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 516 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaata 882 Query: 517 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 881 actgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaa 851
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 492/507 (97%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 100 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 101 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 160 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 161 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 220 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 221 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 280 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 281 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 340 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 341 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgc 986 Query: 401 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 460 | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 461 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 520 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 521 catgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 865 catgcattgcacggtgaatgtgaagaa 839
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 489/506 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|U31105.1|GSU31105 Gynerium sagittatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 489/506 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccccgacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccataatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|U31103.1|ESU31103 Enneapogon scaber ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 489/506 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccaga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaagataatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|U31101.1|CLU31101 Chasmanthium latifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 489/506 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 42 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 101 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 102 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 161 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 162 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 221 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 222 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 281 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 282 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 341 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 342 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 402 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 461 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 462 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 522 atgcattgcacggtgaatgtgaagaa 547 ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaa 839
>gb|AY626351.1| Eriachne triseta ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1320 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 479/493 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 114 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1320 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1261 Query: 115 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1201 Query: 175 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 234 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1200 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1141 Query: 235 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 294 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1140 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagcaaccggtata 1081 Query: 295 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 354 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1080 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatccttttca 1021 Query: 355 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 414 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 ataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 961 Query: 415 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 901 Query: 475 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 900 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 841 Query: 535 tgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||| Sbjct: 840 tgaatgtgaagaa 828
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 479/493 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 114 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 115 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 174 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 175 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 234 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 235 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 294 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 295 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 355 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 415 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 474 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 922 Query: 475 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 921 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 862 Query: 535 tgaatgtgaagaa 547 ||||||||||||| Sbjct: 861 tgaatgtgaagaa 849 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,214,933 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4214933 Number of successful extensions: 112260 Number of sequences better than 10.0: 15268 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15221 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 58 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 82830 Number of HSP's gapped (non-prelim): 21309 length of query: 547 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 524 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 8983087996896 effective search space used: 8983087996896 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)