Clone Name | rbasd23n01 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 537/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 537/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 537/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
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>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 536/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 535/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctakttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 535/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccytt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 535/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccytt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 535/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 535/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 877 tgt 875
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 535/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkagstaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 535/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 535/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1009 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccaggagcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1417 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1416 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1357 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1297 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1237 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1177 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1117 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1057 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 997 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 996 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 937 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 936 tgt 934
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1195 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1194 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1135 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1075 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1074 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1015 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 955 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 895 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 835 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 834 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 775 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 774 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 715 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 714 tgt 712
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1195 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1194 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1135 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1075 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1074 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1015 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 955 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 895 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 835 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 834 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 775 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 774 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 715 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 714 tgt 712
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56326 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 56267 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 56266 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 56207 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56206 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 56147 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56146 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 56087 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56086 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 56027 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56026 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 55967 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55966 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 55907 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 55906 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 55847 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 55846 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 55787 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 55786 tgt 55784
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 534/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1512 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1453 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1452 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1393 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1333 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1273 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1213 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1153 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1093 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1092 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1033 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1032 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 973 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 972 tgt 970
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnntaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 533/543 (98%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 877 tgt 875
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 531/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacan 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 531/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnncccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 877 tgt 875
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1287 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1107 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 986 tgt 984
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1287 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1107 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 986 tgt 984
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1287 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1107 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 986 tgt 984
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1287 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1107 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 986 tgt 984
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1287 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1107 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 986 tgt 984
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1384 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1325 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1324 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1265 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1205 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1145 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1085 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1025 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttac 965 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 964 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 905 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 904 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 845 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 844 tgt 842
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 532/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 531/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 877 tgt 875
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 531/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 877 tgt 875
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 531/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 877 tgt 875
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 531/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1195 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1194 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1135 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1134 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggtgcat 1075 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1074 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1015 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 955 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 895 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 835 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 834 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 775 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 774 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 715 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 714 tgt 712
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 531/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1334 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1333 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1274 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1214 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1154 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1094 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1034 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 974 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 973 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 914 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 913 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 854 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 853 tgt 851
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 530/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1287 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1107 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 986 tgt 984
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 531/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1471 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1411 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1351 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1291 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1231 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1171 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1111 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1051 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1050 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 991 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 990 tgt 988
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 531/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1334 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1333 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1274 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1214 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1154 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1094 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1034 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 974 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 973 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 914 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 913 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 854 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 853 tgt 851
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 530/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 530/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 530/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 531/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1386 ctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1327 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1326 gactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1267 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1207 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1147 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1087 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1027 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 967 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 966 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 907 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 906 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 847 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 846 tgt 844
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 530/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 531/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgctgcctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 529/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1467 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1466 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1407 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1347 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagr 1287 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1227 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1167 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 aatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaacttac 1107 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1106 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1047 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1046 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 987 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 986 tgt 984
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 530/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1471 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1411 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1351 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1291 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1231 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1171 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1111 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1051 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1050 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 991 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 990 tgt 988
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 530/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1406 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1405 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1346 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1286 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1226 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 tttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1166 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1106 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1046 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 986 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 985 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 926 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 925 tgt 923
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 520/531 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagataata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 530/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1386 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1327 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1326 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1267 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1207 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1147 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacan 1087 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1027 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 967 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 966 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 907 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 906 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 847 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 846 tgt 844
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 530/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggcccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 877 tgt 875
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 529/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 529/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1471 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1411 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1351 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1291 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1231 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1171 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1111 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1051 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1050 cacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 991 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 990 tgt 988
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 526/543 (96%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 nnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 528/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1471 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1411 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1410 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggtgcat 1351 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1291 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1231 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1171 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1111 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1051 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1050 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 991 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 990 tgt 988
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 528/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1468 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1409 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1408 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1349 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1289 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1288 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1229 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1169 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1109 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 aatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1049 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 989 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 988 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacggtgaa 929 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 928 tgt 926
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 528/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 877 tgt 875
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 527/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 877 tgt 875
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 527/543 (97%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1237 tcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 caggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaa 878 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 877 tgt 875
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 526/543 (96%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1397 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1338 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1337 gactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1278 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggtgcat 1218 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1217 ttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1158 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1098 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1038 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttac 978 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 977 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 918 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 917 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 858 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 857 tgt 855
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 526/543 (96%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 877 tgt 875
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 526/543 (96%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1515 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1456 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1455 gactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1396 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1336 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1335 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaaga 1276 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 tttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1216 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 ctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1156 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttac 1096 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1095 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1036 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1035 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 976 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 975 tgt 973
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 526/543 (96%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 877 tgt 875
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 523/543 (96%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1468 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1467 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccctt 1408 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1348 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaaga 1288 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1228 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1168 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1108 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1107 ctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagctaata 1048 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 1047 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 988 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 987 tgt 985
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 515/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 ctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1341 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1340 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtcctt 1281 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1221 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1220 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1161 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1160 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1101 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1041 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 981 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 980 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 921 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 920 cacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 870
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 517/532 (97%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 77 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 78 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 137 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 138 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 197 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 198 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 257 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 258 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 318 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 377 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 378 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 437 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 977 Query: 438 ccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgc 497 |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 917 Query: 498 ataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatgt 548 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| Sbjct: 916 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 865
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 525/543 (96%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1377 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1318 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1317 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1258 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1198 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1197 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaaga 1138 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 1078 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 ctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1018 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1017 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 958 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 957 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 898 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 897 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 838 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 837 tgt 835
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 525/543 (96%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 878 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 877 tgt 875
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 515/531 (96%), Gaps = 2/531 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124753 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 124694 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124693 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 124634 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124633 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 124574 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 124573 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaaga 124514 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124513 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacac 124455 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 124454 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaataa 124396 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124395 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 124336 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 124335 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 124276 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124275 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 124225 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 515/531 (96%), Gaps = 2/531 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30226 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 30167 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30166 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 30107 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30106 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 30047 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 30046 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaaga 29987 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 29986 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataacac 29928 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 29927 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaataa 29869 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29868 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 29809 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 29808 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 29749 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29748 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 29698
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55519 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 55460 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 55459 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 55400 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55399 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 55340 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 55339 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 55280 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55279 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 55220 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55219 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 55160 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55159 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 55100 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 55099 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 55040 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 55039 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 54989
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55519 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 55460 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 55459 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 55400 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55399 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 55340 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 55339 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 55280 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55279 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 55220 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55219 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 55160 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55159 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 55100 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 55099 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 55040 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 55039 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 54989
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55467 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 55408 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 55407 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 55348 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55347 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 55288 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 55287 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 55228 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55227 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 55168 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55167 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 55108 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55107 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 55048 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 55047 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 54988 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54987 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 54937
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125808 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 125749 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 125748 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 125689 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125688 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 125629 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 125628 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 125569 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 125568 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 125509 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125508 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 125449 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125448 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 125389 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 125388 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 125329 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 125328 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 125278 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30748 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 30689 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30688 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 30629 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30628 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 30569 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 30568 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 30509 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30508 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 30449 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30448 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 30389 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30388 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 30329 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 30328 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 30269 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 30268 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 30218
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124835 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 124776 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124775 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 124716 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124715 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 124656 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 124655 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 124596 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124595 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 124536 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124535 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 124476 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124475 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 124416 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 124415 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 124356 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124355 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 124305 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 30195 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30194 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 30135 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30134 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 30075 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 30074 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 30015 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30014 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 29955 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29954 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 29895 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29894 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 29835 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 29834 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 29775 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29774 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 29724
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124835 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 124776 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124775 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 124716 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124715 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 124656 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 124655 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 124596 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 124595 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 124536 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124535 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 124476 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124475 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 124416 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 124415 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 124356 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124355 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 124305 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 30195 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30194 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 30135 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30134 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 30075 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 30074 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 30015 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 30014 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 29955 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29954 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 29895 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29894 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 29835 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 29834 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 29775 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29774 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 29724
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55511 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 55452 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 55451 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 55392 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55391 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 55332 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 55331 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 55272 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55271 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 55212 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55211 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 55152 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55151 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 55092 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 55091 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 55032 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 55031 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 54981
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1237 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1342 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1341 gactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1282 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1281 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcat 1222 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1221 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1162 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1161 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1102 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 ctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1042 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 982 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 981 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 922 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 921 cacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 871
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Plus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527153 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 33527212 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 33527213 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 33527272 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527273 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 33527332 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 33527333 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 33527392 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 33527393 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 33527452 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527453 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 33527512 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527513 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 33527572 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 33527573 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 33527632 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 33527633 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 33527683
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Plus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72350 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 72409 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 72410 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 72469 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72470 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 72529 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 72530 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 72589 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 72590 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 72649 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72650 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 72709 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72710 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 72769 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 72770 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 72829 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 72830 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 72880
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1413 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1412 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1353 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 1293 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1292 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 1233 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1232 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1173 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1113 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1053 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 993 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 992 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 942
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1156 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1155 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1096 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 1036 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1035 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 976 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 975 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 916 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 856 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 855 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 796 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 795 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 736 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 735 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 685
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55446 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 55387 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 55386 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 55327 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55326 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 55267 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 55266 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 55207 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55206 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 55147 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55146 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 55087 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55086 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 55027 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 55026 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 54967 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 54966 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 54916
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 512/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1837 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1778 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1777 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1718 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1717 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 1658 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1657 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 1598 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1597 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1538 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1478 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1418 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1358 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 1307 Score = 58.0 bits (29), Expect = 3e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 86 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 484/493 (98%), Gaps = 1/493 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 117 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 176 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 177 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 236 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 237 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 297 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 357 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 417 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgct 476 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 537 g-acggngaatgt 548 | |||| |||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgt 855
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 499/514 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 872
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 511/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcac 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1237 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 499/514 (97%), Gaps = 1/514 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 36 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 95 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 96 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 155 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 156 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 215 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 216 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 275 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 276 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 335 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 336 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 396 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatct 949 Query: 456 cccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgn 515 |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 889 Query: 516 ctatcaataactgcntgcattg-acggngaatgt 548 |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| Sbjct: 888 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 855
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 511/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 937 cacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 511/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 ctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1345 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1344 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1285 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcat 1225 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1224 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1165 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1164 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1105 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1045 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 985 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 984 ctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 925 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 924 cacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 874
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 511/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 ctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1343 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1342 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1283 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1282 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcat 1223 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1222 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1163 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1162 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1103 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1043 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 983 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 982 ctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 923 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 922 cacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 872
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 511/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1357 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1356 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1297 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1296 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcat 1237 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1236 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1177 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1176 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1117 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 ctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1057 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 997 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 996 ctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 937 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 936 cacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 886
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 511/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53721 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcac 53662 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 53661 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 53602 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53601 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 53542 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 53541 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 53482 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 53481 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 53422 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53421 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 53362 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53361 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 53302 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 53301 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 53242 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 53241 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 53191
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 511/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128654 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcac 128595 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 128594 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 128535 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128534 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 128475 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 128474 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 128415 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 128414 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 128355 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128354 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 128295 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128294 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 128235 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 128234 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 128175 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 128174 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 128124
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 511/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347329 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcac 10347270 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 10347269 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 10347210 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347209 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 10347150 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 10347149 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 10347090 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10347089 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 10347030 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347029 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 10346970 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346969 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 10346910 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 10346909 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 10346850 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 10346849 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 10346799
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 511/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353368 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcac 10353309 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 10353308 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 10353249 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353248 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 10353189 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 10353188 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 10353129 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 10353128 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 10353069 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353068 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 10353009 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353008 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 10352949 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 10352948 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 10352889 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 10352888 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 10352838
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 511/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1804 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1745 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1744 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1685 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1684 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 1625 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1624 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 1565 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1564 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1505 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1504 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1445 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1444 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 1385 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1384 ctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 1325 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1324 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 1274
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 474/481 (98%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatg 547 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 548 t 548 | Sbjct: 863 t 863
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 509/529 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 accggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 68 |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 accgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 1356 Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1355 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1296 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1236 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1235 ccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatt 1176 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1175 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1116 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1056 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaacttacct 996 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 995 actactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 936 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 935 cgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 481/491 (97%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 829 acggtgaatgt 819
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 481/491 (97%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 829 acggtgaatgt 819
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 481/491 (97%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 865 acggtgaatgt 855
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 510/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 ctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcag 1330 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 gactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccctt 1270 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct: 1269 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcat 1210 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1209 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaaga 1150 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1149 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacac 1090 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataa 1030 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttac 970 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 969 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 910 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 909 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 859
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 480/490 (97%), Gaps = 1/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 120 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 179 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 180 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 239 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 240 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 300 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 360 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 420 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttta 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-a 538 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 539 cggngaatgt 548 ||| |||||| Sbjct: 864 cggtgaatgt 855
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 510/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1237 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttcaatat 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 510/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 937 cacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 510/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 ctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagttcag 1358 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 gactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccctt 1298 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcat 1238 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1237 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaaga 1178 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1177 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataacac 1118 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaataa 1058 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttac 998 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 938 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 937 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 510/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614559 ctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttcag 5614500 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 5614499 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 5614440 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614439 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 5614380 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 5614379 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 5614320 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5614319 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 5614260 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614259 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 5614200 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614199 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 5614140 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 5614139 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 5614080 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 5614079 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 5614029 Score = 392 bits (198), Expect = e-106 Identities = 222/230 (96%), Gaps = 1/230 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 308 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 368 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 428 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatac 487 |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattg 13436875 Score = 123 bits (62), Expect = 6e-25 Identities = 66/68 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 13398093 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 13398034 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 13398033 atgcattg 13398026 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 111 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 253 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 282 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 333 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 367 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.48 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 251 ggtcagagctggcatatgccaa 272 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 510/531 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614548 ctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttcag 5614489 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 5614488 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 5614429 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614428 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 5614369 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 5614368 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 5614309 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 5614308 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 5614249 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614248 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 5614189 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614188 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 5614129 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 5614128 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 5614069 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 5614068 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 5614018 Score = 392 bits (198), Expect = e-106 Identities = 222/230 (96%), Gaps = 1/230 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 308 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 368 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 428 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatac 487 |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 488 acggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattg 13391149 Score = 123 bits (62), Expect = 6e-25 Identities = 66/68 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 13352367 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 13352308 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 13352307 atgcattg 13352300 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 111 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 253 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 282 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 333 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 367 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.48 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 251 ggtcagagctggcatatgccaa 272 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 510/531 (96%) Strand = Plus / Plus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38326 ctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagttcag 38385 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 38386 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 38445 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38446 cattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 38505 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 38506 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 38565 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38566 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 38625 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38626 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 38685 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38686 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 38745 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 38746 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 38805 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 38806 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 38856
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 473/481 (98%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatg 547 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 850 Query: 548 t 548 | Sbjct: 849 t 849
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 508/529 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 accggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 68 ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1330 accggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 1271 Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1270 ctccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1211 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcattt 1151 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatt 1091 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacct 1031 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaa 971 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 911 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 910 actactgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaataca 851 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 850 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 802
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 510/531 (96%), Gaps = 1/531 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203577 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 23203636 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 23203637 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 23203696 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203697 -gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 23203755 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 23203756 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 23203815 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 23203816 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 23203875 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203876 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 23203935 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203936 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttac 23203995 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 23203996 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 23204055 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 23204056 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 23204106 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 116 atc 118 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 56 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 116 atc 118 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 510/531 (96%), Gaps = 1/531 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154225 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 154284 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 154285 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 154344 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154345 -gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 154403 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 154404 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 154463 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 154464 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 154523 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154524 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 154583 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154584 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttac 154643 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 154644 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 154703 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 154704 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 154754
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 510/531 (96%), Gaps = 1/531 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38339 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 38398 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 38399 gactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 38458 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38459 -gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcat 38517 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct: 38518 taccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaaga 38577 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 38578 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 38637 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38638 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 38697 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38698 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaacttac 38757 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 38758 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 38817 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 38818 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 38868
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 481/493 (97%), Gaps = 1/493 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 117 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 176 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 177 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 236 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 237 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 297 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 356 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 357 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 417 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgct 476 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 537 g-acggngaatgt 548 | |||| |||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgt 855
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 479/491 (97%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 944 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 943 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 884 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 883 acggtgaatgt 873
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 518/543 (95%), Gaps = 1/543 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1332 ctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaagttcag 1273 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1272 ggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1213 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct: 1212 cgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgcat 1153 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1152 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1093 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1092 tttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1033 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 caggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 973 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 913 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 912 ctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 853 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 852 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 793 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 792 tgt 790
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 479/491 (97%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 855 acggtgaatgt 845
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 496/514 (96%), Gaps = 1/514 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 36 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 95 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 96 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 155 ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 156 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 215 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 216 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 275 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 276 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 335 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 336 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 396 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatct 949 Query: 456 cccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgn 515 |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 889 Query: 516 ctatcaataactgcntgcattg-acggngaatgt 548 |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| Sbjct: 888 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 855
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 502/523 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 15 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 74 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 75 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 134 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 135 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 194 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 195 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 254 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 255 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 314 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 315 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 375 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 434 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 435 gtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaa 494 |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 495 tgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 929 tgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 471/481 (97%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatg 547 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 548 t 548 | Sbjct: 863 t 863
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 495/514 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 872
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 478/491 (97%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 849 acggtgaatgt 839
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 478/491 (97%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 866 acggtgaatgt 856
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 478/491 (97%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 849 acggtgaatgt 839
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 486/502 (96%), Gaps = 1/502 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 107 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 108 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 167 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 168 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 227 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 228 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 287 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 288 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 347 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 348 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 407 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 408 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacata 467 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 939 Query: 468 cncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataact 527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 938 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 879 Query: 528 gcntgcattg-acggngaatgt 548 || ||||||| |||| |||||| Sbjct: 878 gcatgcattgcacggtgaatgt 857
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 507/531 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 7 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcag 66 ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 ctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagttcag 1328 Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1207 tcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaaga 1148 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttcaataa 1028 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 501/523 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 15 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 74 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 75 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 134 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 135 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 194 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 195 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 254 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 255 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 314 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 315 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 375 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 434 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 435 gtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaa 494 |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 495 tgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 929 tgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 470/481 (97%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatg 547 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 548 t 548 | Sbjct: 863 t 863
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 479/493 (97%), Gaps = 1/493 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 117 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 176 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 177 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 236 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 237 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 296 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 297 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 356 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 357 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 417 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgct 476 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 537 g-acggngaatgt 548 | |||| |||||| Sbjct: 868 gcacggtgaatgt 856
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 505/529 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 9 accggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 68 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1832 accggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 1773 Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1772 ctccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1713 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1712 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggtgcattt 1653 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1652 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatt 1593 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1592 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1533 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1532 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaa 1473 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacct 1413 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 actactgtaccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagctaataca 1353 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1352 cggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 1304
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 505/529 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 9 accggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 68 |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1852 accggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagga 1793 Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1792 ctccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1733 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1732 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcattt 1673 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1672 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatt 1613 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1612 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1553 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1552 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaa 1493 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1492 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacct 1433 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1432 actactgtaccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaataca 1373 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1372 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 1324
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 477/491 (97%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 855 acggtgaatgt 845
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 469/481 (97%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatg 547 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 866 Query: 548 t 548 | Sbjct: 865 t 865
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 478/493 (96%), Gaps = 1/493 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 117 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 176 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 177 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 236 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 237 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 296 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 297 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 357 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 417 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgct 476 |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 933 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 932 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 873 Query: 537 g-acggngaatgt 548 | |||| |||||| Sbjct: 872 gcacggtgaatgt 860
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 493/514 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 968 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 967 tggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 908 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 907 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 874
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 487/506 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 32 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 91 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 92 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 151 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1273 Query: 152 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 211 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 212 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 271 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 272 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 331 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagt 1093 Query: 332 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 392 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1032 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatg 973 Query: 452 atctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 511 |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 972 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattttt 913 Query: 512 ctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 912 ctgtctatcaataactgcatgcattg 887
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 480/496 (96%), Gaps = 1/496 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 54 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 113 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 114 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 173 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 174 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 233 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 234 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 293 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 294 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 354 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 413 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 414 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaat 473 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 474 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgc 533 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgc 891 Query: 534 attg-acggngaatgt 548 |||| |||| |||||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgt 875
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 471/485 (97%), Gaps = 1/485 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 124 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 125 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 184 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 185 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 244 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 245 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 305 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 364 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 365 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 425 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaa 484 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 485 tacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggng 543 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 544 aatgt 548 ||||| Sbjct: 867 aatgt 863
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 476/491 (96%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 849 acggtgaatgt 839
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 473/487 (97%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 123 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 183 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 242 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 243 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 303 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 363 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 423 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagct 482 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 483 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acgg 541 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 542 ngaatgt 548 |||||| Sbjct: 881 tgaatgt 875
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 473/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 473/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 468/481 (97%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatg 547 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 548 t 548 | Sbjct: 863 t 863
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 477/493 (96%), Gaps = 1/493 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 117 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 176 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 177 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 236 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 237 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 297 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 357 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 416 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 417 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgct 476 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 935 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 934 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 875 Query: 537 g-acggngaatgt 548 | |||| |||||| Sbjct: 874 gcacggtgaatgt 862
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 486/506 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 32 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 91 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 92 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 151 ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1257 Query: 152 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 211 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1197 Query: 212 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 271 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1137 Query: 272 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 331 ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 aacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagt 1077 Query: 332 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1017 Query: 392 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1016 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatg 957 Query: 452 atctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 511 |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 956 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattttt 897 Query: 512 ctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 896 ctgtctatcaataactgcatgcattg 871
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 492/514 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 120062 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120061 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 120002 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 120001 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 119968
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 492/514 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 58435 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58434 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 58375 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 58374 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 58341
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 492/514 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1789 aatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1730 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1729 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1670 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1669 caggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1610 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1609 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1550 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1549 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccag 1490 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1489 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1430 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1429 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 1370 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1369 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1310 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1309 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 1276
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 850 bits (429), Expect = 0.0 Identities = 473/488 (96%), Gaps = 1/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 121 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 122 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 181 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 182 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 241 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 242 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 301 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 302 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 362 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 421 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 422 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagc 481 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 541 gngaatgt 548 | |||||| Sbjct: 843 gtgaatgt 836
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 850 bits (429), Expect = 0.0 Identities = 473/488 (96%), Gaps = 1/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 121 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 122 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 181 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 182 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 241 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 242 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 301 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 302 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 362 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 421 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 422 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagc 481 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acg 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 541 gngaatgt 548 | |||||| Sbjct: 843 gtgaatgt 836
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 470/485 (96%), Gaps = 1/485 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 124 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 125 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 184 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 185 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 244 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 245 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 304 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 305 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 364 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 365 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 425 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaa 484 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 485 tacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggng 543 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 544 aatgt 548 ||||| Sbjct: 867 aatgt 863
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 475/491 (96%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 865 acggtgaatgt 855
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 472/487 (96%), Gaps = 1/487 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 123 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 182 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 183 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 242 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 243 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 303 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 362 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 363 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 423 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagct 482 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 931 Query: 483 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acgg 541 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct: 930 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacgg 871 Query: 542 ngaatgt 548 |||||| Sbjct: 870 tgaatgt 864
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 469/483 (97%), Gaps = 1/483 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 127 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 187 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 247 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 307 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 367 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 427 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaata 486 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaa 545 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 848 Query: 546 tgt 548 ||| Sbjct: 847 tgt 845
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 467/481 (97%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatg 547 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 548 t 548 | Sbjct: 863 t 863
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 467/481 (97%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatg 547 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 548 t 548 | Sbjct: 863 t 863
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 467/481 (97%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatg 547 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 548 t 548 | Sbjct: 863 t 863
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 467/481 (97%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatg 547 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 548 t 548 | Sbjct: 863 t 863
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 476/493 (96%), Gaps = 1/493 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 117 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 176 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 177 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 236 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 237 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 296 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 297 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 356 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 357 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 417 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgct 476 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 537 g-acggngaatgt 548 | |||| |||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgt 855
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 491/514 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 921 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 491/514 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57854 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57853 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57794 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 57793 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 57760
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 491/514 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57864 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57863 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57804 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 57803 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 57770
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 842 bits (425), Expect = 0.0 Identities = 471/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 775 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 774 atgcattg 767
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 474/491 (96%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 929 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgc 870 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 869 acggtgaatgt 859
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 471/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 474/491 (96%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 855 acggtgaatgt 845
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 471/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 471/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 464/479 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 470/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 452/463 (97%), Gaps = 1/463 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 87 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 146 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 147 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 207 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 266 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 267 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 327 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 387 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 447 atatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 506 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 507 tttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatgt 548 |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 837
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 452/463 (97%), Gaps = 1/463 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 87 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 146 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 147 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 207 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 266 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 267 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 327 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 387 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 447 atatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 506 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 507 tttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatgt 548 |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 837
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 470/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>emb|AJ746283.1| Aristida congesta subsp. barbicollis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 470/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 470/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|U31359.1|ACU31359 Aristida congesta subsp. barbicollis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 470/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 473/491 (96%), Gaps = 1/491 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg- 537 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 538 acggngaatgt 548 |||| |||||| Sbjct: 855 acggtgaatgt 845
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 470/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 470/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|AY506529.1| Zea mays strain NB mitochondrion, complete genome Length = 569630 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 489/514 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 349056 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 349115 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349116 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 349175 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 349176 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 349235 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349236 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 349295 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349296 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 349355 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349356 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 349415 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349416 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 349475 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349476 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 349535 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 349536 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 349569
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 465/481 (96%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatg 547 |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 548 t 548 | Sbjct: 863 t 863
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 465/481 (96%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatg 547 |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 548 t 548 | Sbjct: 863 t 863
>gb|DQ490952.1| Zea mays subsp. mays genotype male-fertile NA mitochondrion, complete genome Length = 701046 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 489/514 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 206653 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 206594 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206593 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 206534 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 206533 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 206474 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206473 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 206414 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206413 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 206354 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206353 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 206294 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206293 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 206234 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206233 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 206174 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 206173 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 206140 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 489/514 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 77961 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 77902 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77901 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 77842 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 77841 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 77782 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77781 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 77722 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77721 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 77662 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77661 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 77602 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77601 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 77542 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77541 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 77482 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77481 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 77448
>emb|AJ746253.1| Arthraxon sp. TH-111 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1391 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 489/514 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1387 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1328 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccactggtacaacacctggcatggatacccag 1088 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 968 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 967 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtatacca 908 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 907 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 874
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 468/486 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 530 ntgcat 535 ||||| Sbjct: 864 atgcat 859
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 825 bits (416), Expect = 0.0 Identities = 451/463 (97%), Gaps = 1/463 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 87 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 146 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 147 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 207 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 266 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 267 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 327 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 387 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 447 atatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 506 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 507 tttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatgt 548 |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 834
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 825 bits (416), Expect = 0.0 Identities = 451/463 (97%), Gaps = 1/463 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 87 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 146 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 147 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 207 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 266 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 267 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 327 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 387 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 447 atatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 506 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 507 tttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatgt 548 |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 834
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 825 bits (416), Expect = 0.0 Identities = 469/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|U31104.1|ECU31104 Eragrostis capensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 825 bits (416), Expect = 0.0 Identities = 469/488 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcttgataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 462/479 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 119 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 179 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 238 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 239 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 299 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 358 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 359 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 419 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttt 478 ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 479 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857
>gb|DQ490951.1| Zea mays subsp. mays genotype CMS-S mitochondrion, complete genome Length = 569553 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 488/514 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 83 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 540663 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 540604 Query: 84 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 143 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540603 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 540544 Query: 144 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 203 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 540543 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 540484 Query: 204 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 263 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540483 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 540424 Query: 264 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 323 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540423 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 540364 Query: 324 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 383 ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540363 tccagagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 540304 Query: 384 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 443 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540303 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 540244 Query: 444 tggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 503 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 540243 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 540184 Query: 504 tgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 540183 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 540150
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 464/481 (96%), Gaps = 1/481 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 69 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 129 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 188 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 189 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 249 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 309 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 368 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 369 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 429 actactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaataca 488 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 489 cggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatg 547 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 874 Query: 548 t 548 | Sbjct: 873 t 873
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 461/478 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 60 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 120 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 180 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 239 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 240 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 300 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 359 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 360 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 420 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgcttta 479 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 473/493 (95%), Gaps = 1/493 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 117 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 176 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 177 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 236 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 237 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 296 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 297 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 356 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 357 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 417 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgct 476 ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcatt 536 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 917 ttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 537 g-acggngaatgt 548 | |||| |||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgt 845
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 819 bits (413), Expect = 0.0 Identities = 472/493 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 45 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 104 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 105 tcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcga 164 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaagatctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgg 1242 Query: 165 ttagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 224 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 ttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 1182 Query: 225 aatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacca 284 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccc 1122 Query: 285 cctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccg 344 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1121 cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagataccg 1062 Query: 345 cgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 404 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 cgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 1002 Query: 405 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanac 464 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1001 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagac 942 Query: 465 atacncaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaata 524 |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 941 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaata 882 Query: 525 actgcntgcattg 537 ||||| ||||||| Sbjct: 881 actgcatgcattg 869
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 819 bits (413), Expect = 0.0 Identities = 461/478 (96%), Gaps = 1/478 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 72 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 131 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 132 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 191 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 192 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 252 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 312 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 372 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 432 actgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagctaatacacgg 491 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 492 aaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg-acggngaatgt 548 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 855
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 817 bits (412), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|U31105.1|GSU31105 Gynerium sagittatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 817 bits (412), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccccgacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccataatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|U31103.1|ESU31103 Enneapogon scaber ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 817 bits (412), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccaga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaagataatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|U31101.1|CLU31101 Chasmanthium latifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 817 bits (412), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 50 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 109 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 110 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 169 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 170 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 229 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 230 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 289 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 290 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 349 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 350 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 410 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacn 469 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 470 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgc 529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 530 ntgcattg 537 ||||||| Sbjct: 864 atgcattg 857
>gb|AY626351.1| Eriachne triseta ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1320 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 458/475 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 63 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 122 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1320 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1261 Query: 123 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1201 Query: 183 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 242 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1200 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1141 Query: 243 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1140 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagcaaccggtata 1081 Query: 303 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 362 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1080 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatccttttca 1021 Query: 363 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 422 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 ataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 961 Query: 423 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccanacatacncaatgctttagct 482 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct: 960 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 901 Query: 483 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgnctatcaataactgcntgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 900 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 846 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 3,798,253 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 3798253 Number of successful extensions: 103751 Number of sequences better than 10.0: 15021 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 14979 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 53 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 74625 Number of HSP's gapped (non-prelim): 20679 length of query: 551 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 528 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 9051661187712 effective search space used: 9051661187712 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)