Clone Name | rbasd22d14 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 614/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 614/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 614/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 867 tcccccggttaagtag 852
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 613/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 613/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 613/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 613/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 613/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 613/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 613/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 613/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 613/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 613/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 867 tcccccggttaagtag 852
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 612/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctakttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 612/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 612/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 819 tcccccggttaagtag 804
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 612/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 611/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkagstaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 612/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 612/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 929 tcccccagttaagtag 914
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 612/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 929 tcccccagttaagtag 914
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 612/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 929 tcccccagttaagtag 914
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 612/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 929 tcccccagttaagtag 914
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 612/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 929 tcccccagttaagtag 914
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 612/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 867 tcccccggttaagtag 852
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 611/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccy 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 929 tcccccagttaagtag 914
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 611/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccy 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 611/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccaggagc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 611/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 929 tcccccagttaagtag 914
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 611/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 929 tcccccagttaagtag 914
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 611/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 929 tcccccagttaagtag 914
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 611/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 929 tcccccagttaagtag 914
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 611/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 929 tcccccagttaagtag 914
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 611/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 929 tcccccagttaagtag 914
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 610/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnntaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 610/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatatttcgcaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 610/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 610/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 610/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 610/616 (99%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 609/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaacncgaatntgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 anntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 609/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 609/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 609/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 867 tcccccggttaagtag 852
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1150 bits (580), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 867 tcccccggttaagtag 852
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1419 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1418 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1359 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1299 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1239 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1179 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1119 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1059 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 999 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 939 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 879 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 878 tcccccagttaagtag 863
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 607/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 867 tcccccggttaagtag 852
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 607/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 867 tcccccggttaagtag 852
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctactggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 867 tcccccggttaagtag 852
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgatt-gccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 867 tcccccggttaagtag 852
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 867 tcccccggttaagtag 852
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56327 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 56269 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 56268 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 56209 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56208 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 56149 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56148 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 56089 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56088 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 56029 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56028 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 55969 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55968 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 55909 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55908 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 55849 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55848 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 55789 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55788 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 55729 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 55728 tcccccagttaagtag 55713
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 608/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1513 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1455 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1454 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1395 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1394 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1335 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1334 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1275 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1274 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1215 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1214 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1155 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1154 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1095 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1094 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1035 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 975 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 915 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 914 tcccccagttaagtag 899
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 607/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacannctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 819 tcccccggttaagtag 804
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 607/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 607/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1289 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1229 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1169 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1109 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1049 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 989 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 929 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 928 tcccccggttaagtag 913
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 607/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1289 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1229 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1169 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1109 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1049 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 989 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 929 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 928 tcccccggttaagtag 913
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 607/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1289 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1229 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1169 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1109 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1049 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 989 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 929 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 928 tcccccggttaagtag 913
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 607/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1289 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1229 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1169 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1109 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1049 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 989 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 929 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 928 tcccccggttaagtag 913
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 607/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1289 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1229 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1169 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1109 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1049 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 989 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 929 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 928 tcccccggttaagtag 913
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 607/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 606/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 606/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaanntgat-cgccttccatacttcacaagctgcngctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 999 acctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagataa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtc 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 819 tcccccggttaagtag 804
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 605/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 867 tcccccggttaagtag 852
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 606/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnncccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 606/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 819 tcccccagttaagtag 804
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 606/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 819 tcccccggttaagtag 804
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 606/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1255 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1197 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1196 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1137 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1077 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1017 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1016 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 957 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 956 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 897 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 896 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 837 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 836 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 777 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 776 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 717 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 716 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaa 657 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 656 tcccccagttaagtag 641
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 606/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1255 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1197 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1196 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1137 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1077 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1017 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1016 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 957 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 956 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 897 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 896 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 837 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 836 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 777 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 776 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 717 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 716 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaa 657 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 656 tcccccagttaagtag 641
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 605/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1289 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1229 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1169 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1109 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1049 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 989 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 929 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 928 tcccccggttaagtag 913
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 605/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccsscgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 606/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 tctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1473 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1413 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1353 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1293 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1233 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1173 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1113 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1053 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 993 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 933 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 932 tcccccggttaagtag 917
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 606/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1327 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1326 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1267 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1207 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1147 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1087 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1027 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaactt 967 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 966 acctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 907 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 847 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 846 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 787 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 786 tcccccagttaagtag 771
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 606/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 605/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 867 tcccccggttaagtag 852
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 606/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 605/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 867 tcccccggttaagtag 852
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 606/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgccgctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 604/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1527 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1469 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1289 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 grtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1229 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1169 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1168 aaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaactt 1109 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1049 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 989 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 929 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 928 tcccccggttaagtag 913
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 605/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 tctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1473 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1413 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1353 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1293 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1233 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1173 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1113 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1053 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 993 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 933 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 932 tcccccggttaagtag 917
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 tctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1329 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1328 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1269 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1209 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1149 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1089 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 anctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1029 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 969 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 909 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 849 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 789 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 788 tcccccggttaagtag 773
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 605/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 819 tcccccagttaagtag 804
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 605/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 819 tcccccagttaagtag 804
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 605/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1394 tctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1336 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1335 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1276 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1216 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1156 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1096 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1036 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 976 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 916 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 856 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 855 aatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 796 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 795 tcccccggttaagtag 780
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 605/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1394 tctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1336 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1335 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1276 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1216 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1156 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1096 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1036 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 976 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 916 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 856 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 855 aatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 796 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 795 tcccccggttaagtag 780
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 604/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 604/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 605/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 tctaccggcttgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1329 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1328 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1269 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1209 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1149 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1089 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1029 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 969 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 909 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 849 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 848 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaa 789 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 788 tcccccggttaagtag 773
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 602/616 (97%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggctcgaacycgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 604/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 tctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1473 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1413 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1353 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1293 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1233 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1173 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1113 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1053 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 993 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 933 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 932 tcccccggttaagtag 917
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 604/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 604/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggcccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 819 tcccccagttaagtag 804
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 604/616 (98%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1408 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgctgcc 1348 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1228 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1168 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1108 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1048 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 acctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 988 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 928 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 aatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 868 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 867 tcccccagttaagtag 852
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 603/616 (97%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 tctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1473 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1413 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1412 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggtgc 1353 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1293 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1233 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1173 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1113 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1053 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 993 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 933 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 932 tcccccggttaagtag 917
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 603/616 (97%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 819 tcccccggttaagtag 804
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 603/616 (97%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1255 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1197 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1196 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1137 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1136 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggtgc 1077 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1017 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1016 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 957 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 956 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 897 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 896 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 837 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 836 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 777 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 776 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 717 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 716 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgcggtgaa 657 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 656 tcccccagttaagtag 641
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 601/616 (97%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaattnnnn-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 819 tcccccagttaagtag 804
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 599/616 (97%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1528 tctaccggcgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1470 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccc 1410 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaa 1290 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1230 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1170 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1110 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 acctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagctaa 1050 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 990 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 930 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 929 tcccccggttaagtag 914
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 551/552 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 604 ccggttaagtag 615 |||||||||||| Sbjct: 803 ccggttaagtag 792
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 600/616 (97%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1469 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagccgcggctagttc 1411 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1410 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1351 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1291 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1290 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaa 1231 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1171 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1111 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1051 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 991 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacggtg 931 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 871 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| |||| |||| Sbjct: 870 tcccccagttatgtag 855
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 550/552 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 850 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 790 Query: 604 ccggttaagtag 615 |||||||||||| Sbjct: 789 ccggttaagtag 778
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 591/604 (97%), Gaps = 2/604 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 aactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 71 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccattt 1338 Query: 72 gcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagc 131 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1337 gcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagc 1278 Query: 132 ttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagg 191 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1277 ttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagg 1218 Query: 192 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcag 251 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 atgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcag 1158 Query: 252 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgga 311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 agctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatgga 1098 Query: 312 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 tacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcg 1038 Query: 372 caataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 431 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 caataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 978 Query: 432 accggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 491 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 accggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 918 Query: 492 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 858 Query: 552 taagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaa 611 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 857 taagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaa 798 Query: 612 gtag 615 |||| Sbjct: 797 gtag 794
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 557/562 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 770 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 769 ggtgaatcccccggttaagtag 748
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 557/562 (99%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 770 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 769 ggtgaatcccccggttaagtag 748
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 557/564 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 532 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 591 |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtattt 808 Query: 592 gcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 807 gcggtgaatcccccagttaagtag 784
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 598/616 (97%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1398 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagccgcggctagttc 1340 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1339 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1280 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1279 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggtgc 1220 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1219 atttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaa 1160 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1100 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1040 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaactt 980 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 920 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 860 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 859 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 800 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| |||| |||| Sbjct: 799 tcccccagttatgtag 784
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 598/616 (97%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1378 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagccgcggctagttc 1320 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1319 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1260 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgc 1200 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct: 1199 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaa 1140 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1139 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1080 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 acctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1020 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 960 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 900 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 899 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 840 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 839 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 780 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| |||| |||| Sbjct: 779 tcccccagttatgtag 764
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 598/616 (97%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagccgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1239 attcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 accaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| |||| |||| Sbjct: 819 tcccccagttatgtag 804
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 598/616 (97%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagccgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagctt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| |||| |||| Sbjct: 819 tcccccagttatgtag 804
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 598/616 (97%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1516 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagccgcggctagttc 1458 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1457 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1398 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1338 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1337 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1278 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 gatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1218 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 acctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1158 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1157 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagctt 1098 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1038 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 978 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 977 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 918 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| |||| |||| Sbjct: 917 tcccccagttatgtag 902
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 555/562 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtag 784
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 554/561 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 115 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 174 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 175 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 234 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 235 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 295 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 355 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 415 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 475 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 535 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 594 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 805 Query: 595 gtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 804 gtgaatcccccagttaagtag 784
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 597/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagccgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| |||| |||| Sbjct: 819 tcccccagttatgtag 804
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 596/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1401 tctaccggctcgaactcsaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 1343 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || Sbjct: 1342 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtcc 1283 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1223 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct: 1222 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaa 1163 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1162 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1103 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1043 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 983 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 923 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 922 tacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtg 863 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || Sbjct: 862 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaa 803 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 802 tcccccagttaagtag 787
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 553/562 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtag 774
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 588/606 (97%), Gaps = 2/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcgcaagccgcagctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tccccc 605 |||||| Sbjct: 819 tccccc 814
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 545/552 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatccc 804 Query: 604 ccggttaagtag 615 |||||||||||| Sbjct: 803 ccggttaagtag 792
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 566/580 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 36 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 95 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 96 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 155 |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 156 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 215 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 216 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 275 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 276 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 335 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 336 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 396 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 455 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 944 Query: 456 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 884 Query: 516 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 883 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 824 Query: 576 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 823 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtag 784
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 595/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttc 1344 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1343 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1284 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1283 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgc 1224 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct: 1223 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaa 1164 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1163 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1104 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 acctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1044 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 984 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 924 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 923 tacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtg 864 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 804 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 803 tcccccagttaagtag 788
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 597/616 (96%), Gaps = 4/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124754 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 124696 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 124695 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 124636 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124635 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 124576 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 124575 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaa 124516 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 124515 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataac 124457 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124456 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caat 124398 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124397 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 124338 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124337 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 124278 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 124277 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 124218 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124217 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 124158 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 124157 tcccccggttaagtag 124142 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 597/616 (96%), Gaps = 4/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30227 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttc 30169 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 30168 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 30109 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30108 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 30049 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 30048 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaaa 29989 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 29988 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataac 29930 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29929 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caat 29871 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29870 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 29811 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29810 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 29751 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 29750 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 29691 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 29690 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 29631 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 29630 tcccccggttaagtag 29615
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 594/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55468 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 55410 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 55409 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 55350 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55349 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 55290 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 55289 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 55230 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 55229 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 55170 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55169 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 55110 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55109 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 55050 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55049 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 54990 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 54989 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 54930 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 54929 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 54870 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 54869 tcccccggttaagtag 54854
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 553/564 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 532 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 591 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 808 Query: 592 gcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 807 gcggtgaatcccccagttatgtag 784
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 594/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 125809 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 125751 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 125750 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 125691 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125690 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 125631 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 125630 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 125571 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 125570 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 125511 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125510 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 125451 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125450 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 125391 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125390 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 125331 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 125330 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 125271 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 125270 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 125211 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 125210 tcccccggttaagtag 125195 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 594/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30749 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 30691 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 30690 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 30631 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30630 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 30571 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 30570 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 30511 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 30510 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 30451 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30450 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 30391 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30390 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 30331 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30330 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 30271 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 30270 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 30211 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 30210 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 30151 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 30150 tcccccggttaagtag 30135
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 594/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 939 tacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 819 tcccccagttaagtag 804
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 594/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1405 tctaccggctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttc 1347 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1346 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1287 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1286 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgc 1227 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct: 1226 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaa 1167 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1166 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1107 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 acctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1047 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 987 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 acctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 927 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 926 tacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtg 867 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 866 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 807 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 806 tcccccagttaagtag 791
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 594/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tctaccggctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttc 1345 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1344 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1285 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1284 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgc 1225 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct: 1224 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaa 1165 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1164 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1105 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 acctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1045 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 985 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 acctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 925 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 924 tacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtg 865 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 805 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 804 tcccccagttaagtag 789
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 594/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 tctaccggctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttc 1359 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1358 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1299 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1298 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgc 1239 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct: 1238 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaa 1179 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1178 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1119 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 acctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1059 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 999 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 acctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 939 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 938 tacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtg 879 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 878 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 819 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 818 tcccccagttaagtag 803
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 594/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527152 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 33527210 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 33527211 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 33527270 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527271 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 33527330 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 33527331 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 33527390 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 33527391 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 33527450 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527451 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 33527510 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527511 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 33527570 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527571 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 33527630 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 33527631 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 33527690 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 33527691 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 33527750 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 33527751 tcccccggttaagtag 33527766 Score = 91.7 bits (46), Expect = 3e-15 Identities = 52/54 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 562 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 39115419
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 594/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 72349 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 72407 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 72408 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 72467 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72468 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 72527 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 72528 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 72587 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 72588 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 72647 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72648 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 72707 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72708 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 72767 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72768 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 72827 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 72828 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 72887 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 72888 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 72947 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 72948 tcccccggttaagtag 72963
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 594/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55447 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 55389 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 55388 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 55329 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55328 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 55269 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 55268 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 55209 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 55208 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 55149 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55148 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 55089 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55088 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 55029 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55028 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 54969 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 54968 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 54909 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 54908 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 54849 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 54848 tcccccggttaagtag 54833
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 551/562 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 944 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 884 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 883 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 824 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||| |||| |||| Sbjct: 823 ggtgaatcccccagttatgtag 802
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 551/562 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtag 774
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 591/613 (96%), Gaps = 2/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 accggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcagg 62 |||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 accgcctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagctgcggctagttcagg 1357 Query: 63 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1356 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttc 1297 Query: 123 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1237 Query: 183 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 242 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| Sbjct: 1236 tccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagat 1177 Query: 243 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1176 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1117 Query: 303 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1057 Query: 363 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 422 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 atcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaacttacc 997 Query: 423 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 482 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 937 Query: 483 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 542 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 936 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 877 Query: 543 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 602 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 876 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 817 Query: 603 cccggttaagtag 615 ||| ||||||||| Sbjct: 816 ccctgttaagtag 804
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1239 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 819 tcccccggttaagtag 804
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 543/552 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 604 ccggttaagtag 615 || ||||||||| Sbjct: 803 ccagttaagtag 792
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55520 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 55462 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 55461 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 55402 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55401 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 55342 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 55341 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 55282 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 55281 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 55222 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55221 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 55162 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55161 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 55102 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55101 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 55042 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 55041 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 54982 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 54981 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 54922 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| Sbjct: 54921 ccccccggttaagtag 54906
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55520 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 55462 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 55461 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 55402 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55401 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 55342 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 55341 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 55282 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 55281 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 55222 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55221 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 55162 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55161 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 55102 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55101 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 55042 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 55041 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 54982 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 54981 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 54922 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| Sbjct: 54921 ccccccggttaagtag 54906
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 552/564 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 532 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 591 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 868 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 809 Query: 592 gcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 808 gcggtgaatcccccagttatgtag 785
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124836 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 124778 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 124777 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 124718 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124717 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 124658 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 124657 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 124598 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 124597 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 124538 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124537 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 124478 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124477 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 124418 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124417 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 124358 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 124357 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 124298 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124297 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 124238 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| Sbjct: 124237 ccccccggttaagtag 124222 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30255 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 30197 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 30196 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 30137 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30136 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 30077 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 30076 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 30017 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 30016 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 29957 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29956 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 29897 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29896 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 29837 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29836 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 29777 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 29776 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 29717 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 29716 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 29657 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| Sbjct: 29656 ccccccggttaagtag 29641
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124836 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 124778 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 124777 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 124718 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124717 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 124658 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 124657 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 124598 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 124597 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 124538 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124537 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 124478 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124477 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 124418 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124417 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 124358 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 124357 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 124298 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124297 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 124238 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| Sbjct: 124237 ccccccggttaagtag 124222 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30255 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 30197 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 30196 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 30137 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30136 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 30077 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 30076 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 30017 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 30016 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 29957 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29956 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 29897 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29896 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 29837 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29836 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 29777 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 29776 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 29717 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 29716 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 29657 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| Sbjct: 29656 ccccccggttaagtag 29641
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55512 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 55454 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 55453 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 55394 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55393 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 55334 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 55333 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 55274 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 55273 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 55214 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55213 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 55154 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55153 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 55094 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55093 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 55034 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 55033 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 54974 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 54973 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 54914 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| Sbjct: 54913 ccccccggttaagtag 54898
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1239 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| Sbjct: 819 ccccccggttaagtag 804
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactccaatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 939 tacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 819 tcccccagttaagtag 804
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 53722 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 53664 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 53663 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 53604 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53603 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 53544 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 53543 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 53484 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 53483 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 53424 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53423 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 53364 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53363 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 53304 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53303 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 53244 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 53243 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 53184 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 53183 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 53124 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 53123 tcccccggttaagtag 53108
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 128655 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 128597 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 128596 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 128537 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128536 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 128477 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 128476 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 128417 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 128416 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 128357 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128356 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 128297 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128296 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 128237 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128236 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 128177 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 128176 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 128117 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 128116 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 128057 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 128056 tcccccggttaagtag 128041
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347330 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 10347272 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 10347271 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 10347212 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347211 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 10347152 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 10347151 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 10347092 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 10347091 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 10347032 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347031 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 10346972 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346971 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 10346912 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346911 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 10346852 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 10346851 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 10346792 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 10346791 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 10346732 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 10346731 tcccccggttaagtag 10346716
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1415 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1414 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1355 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 1295 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1294 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 1235 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1234 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1175 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1115 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1055 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 995 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 994 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 935 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 934 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 875 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| Sbjct: 874 ccccccggttaagtag 859
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1158 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1157 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1098 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 1038 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1037 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 978 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 977 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 918 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 858 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 857 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 798 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 797 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 738 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 737 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 678 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 677 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 618 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| Sbjct: 617 ccccccggttaagtag 602
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353369 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 10353311 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 10353310 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 10353251 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353250 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 10353191 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 10353190 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 10353131 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 10353130 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 10353071 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353070 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 10353011 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353010 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 10352951 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352950 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 10352891 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 10352890 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 10352831 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 10352830 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 10352771 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 10352770 tcccccggttaagtag 10352755
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1805 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1747 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1746 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1687 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1686 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 1627 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1626 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 1567 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1566 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1507 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1506 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1447 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1446 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1387 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1386 acctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1327 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1326 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 1267 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 1207 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||||||| |||||| Sbjct: 1206 tcccccggtcaagtag 1191
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 593/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1780 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1779 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1720 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1719 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 1660 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1659 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 1600 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1599 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1540 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1539 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1480 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1420 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 1360 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 1300 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1299 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 1240 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| Sbjct: 1239 ccccccggttaagtag 1224 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 81 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 550/562 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||| |||| |||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtag 768
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 550/562 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 866 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 807 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||| |||| |||| Sbjct: 806 ggtgaatcccccagttatgtag 785
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 550/562 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||| |||| |||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtag 768
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 579/598 (96%), Gaps = 2/598 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 77 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 1327 Query: 78 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 137 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 tgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtac 1267 Query: 138 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 197 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1266 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1207 Query: 198 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 257 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1147 Query: 258 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 317 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1146 catatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggataccca 1087 Query: 318 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1027 Query: 378 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggc 967 Query: 438 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 498 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 847 Query: 558 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 846 attgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtag 789
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 547/558 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 118 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 177 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 178 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 237 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 238 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 298 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 358 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 418 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 478 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 537 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 538 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 597 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 822 Query: 598 aatcccccggttaagtag 615 |||||||| ||||||||| Sbjct: 821 aatcccccagttaagtag 804
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 558/573 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 43 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 102 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 103 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 162 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 163 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 222 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 223 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 282 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 283 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 342 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 343 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 402 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 403 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 462 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 939 Query: 463 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 879 Query: 523 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 582 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 878 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 819 Query: 583 gtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 818 ctagtatttgcggtgaatcccccagttatgtag 786
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 542/552 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 604 ccggttaagtag 615 || ||||||||| Sbjct: 803 ccagttaagtag 792
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 551/564 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 935 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 875 Query: 532 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 591 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 874 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 815 Query: 592 gcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 814 gcggtgaatcccccagttaagtag 791
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 563/580 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 36 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 95 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 96 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 155 |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 156 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 215 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 216 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 275 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 276 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 335 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 336 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 396 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccc 455 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1003 catttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccc 944 Query: 456 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatc 884 Query: 516 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 883 aataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatg 824 Query: 576 agccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 823 agccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtag 784
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 592/616 (96%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1333 tctactggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagctgcggcaagttc 1275 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1274 agggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1215 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 1214 ttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgc 1155 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct: 1154 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaa 1095 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1094 gatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataac 1035 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 accaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 975 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 915 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 914 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 855 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 854 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 795 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 794 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 735 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 734 tcccccagttaagtag 719
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 544/556 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaa 808 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| |||| |||| Sbjct: 807 tcccccagttatgtag 792
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 528/534 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 82 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 141 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 142 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 202 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 261 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 262 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 322 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 382 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 442 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 502 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 562 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 766
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 528/534 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 82 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 141 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 142 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 202 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 261 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 262 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 322 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 382 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 442 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 502 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 820 Query: 562 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 766
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 543/554 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 62 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 122 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 182 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 241 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 242 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 302 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 362 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 422 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 481 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 482 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 541 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 848 Query: 542 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 601 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 tgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 788 Query: 602 ccccggttaagtag 615 |||| ||||||||| Sbjct: 787 ccccagttaagtag 774
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 591/616 (95%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1390 tctaccggcgcgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcgcaagctgcggctagttc 1332 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1331 aggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccc 1272 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 1271 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgc 1212 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1211 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaa 1152 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| Sbjct: 1151 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataac 1092 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1091 acctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaat 1032 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaactt 972 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 912 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 911 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 852 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 851 aatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 792 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||| || ||||||||| Sbjct: 791 tcctccagttaagtag 776
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 541/552 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 866 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 806 Query: 604 ccggttaagtag 615 || |||| |||| Sbjct: 805 ccagttatgtag 794
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 550/564 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 933 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 873 Query: 532 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 591 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 872 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtattt 813 Query: 592 gcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 812 gcggtgaatcccccagttatgtag 789
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 591/616 (95%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggcgcgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcgcaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1239 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||| || ||||||||| Sbjct: 819 tcctccagttaagtag 804
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 591/616 (95%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614560 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaagctgcggctagttc 5614502 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 5614501 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 5614442 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614441 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 5614382 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 5614381 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 5614322 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614321 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 5614262 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614261 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 5614202 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614201 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 5614142 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614141 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 5614082 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 5614081 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 5614022 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 5614021 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 5613962 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||| |||||||||| Sbjct: 5613961 tcccctggttaagtag 5613946 Score = 541 bits (273), Expect = e-151 Identities = 304/313 (97%), Gaps = 1/313 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 303 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 363 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 423 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 482 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 483 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 542 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 543 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 602 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 13436805 Query: 603 cccggttaagtag 615 ||||||||||||| Sbjct: 13436804 cccggttaagtag 13436792 Score = 258 bits (130), Expect = 2e-65 Identities = 148/154 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 462 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 522 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 581 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 582 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 13397943 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 106 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 248 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 277 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 328 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 362 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.54 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 246 ggtcagagctggcatatgccaa 267 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 592/616 (96%), Gaps = 3/616 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203576 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 23203634 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 23203635 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 23203694 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203695 tt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 23203753 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 23203754 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 23203813 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 23203814 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 23203873 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203874 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 23203933 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203934 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaactt 23203993 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203994 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 23204053 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 23204054 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 23204113 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 23204114 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 23204173 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 23204174 tcccccggttaagtag 23204189 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 110 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 111 atc 113 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 110 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 111 atc 113 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 592/616 (96%), Gaps = 3/616 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 154224 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 154282 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 154283 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 154342 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154343 tt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 154401 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 154402 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 154461 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 154462 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 154521 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154522 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 154581 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154582 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaactt 154641 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154642 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 154701 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 154702 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 154761 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 154762 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 154821 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 154822 tcccccggttaagtag 154837
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 592/616 (96%), Gaps = 3/616 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38338 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 38396 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 38397 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 38456 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38457 tt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 38515 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 38516 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 38575 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 38576 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 38635 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38636 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 38695 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38696 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaactt 38755 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38756 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 38815 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 38816 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 38875 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 38876 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 38935 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||| Sbjct: 38936 tcccccggttaagtag 38951
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 591/616 (95%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614549 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaagctgcggctagttc 5614491 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 5614490 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 5614431 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614430 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 5614371 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 5614370 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 5614311 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614310 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 5614251 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614250 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 5614191 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614190 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 5614131 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614130 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 5614071 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 5614070 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 5614011 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 5614010 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 5613951 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||| |||||||||| Sbjct: 5613950 tcccctggttaagtag 5613935 Score = 541 bits (273), Expect = e-151 Identities = 304/313 (97%), Gaps = 1/313 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 303 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 363 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 423 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 482 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 483 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 542 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 543 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 602 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 13391079 Query: 603 cccggttaagtag 615 ||||||||||||| Sbjct: 13391078 cccggttaagtag 13391066 Score = 258 bits (130), Expect = 2e-65 Identities = 148/154 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 462 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 522 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 581 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 582 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 13352217 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 51 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 106 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 248 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 277 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 328 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 362 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.54 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 246 ggtcagagctggcatatgccaa 267 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 591/616 (95%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38325 tctaccggctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaagctgcggctagttc 38383 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 38384 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 38443 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38444 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 38503 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 38504 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaaa 38563 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 38564 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 38623 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38624 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 38683 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38684 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 38743 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38744 acctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 38803 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 38804 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 38863 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 38864 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 38923 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||||| |||||||||| Sbjct: 38924 tcccctggttaagtag 38939
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 548/562 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 790 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||| |||| |||| Sbjct: 789 ggtgaatcccccagttatgtag 768
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1003 bits (506), Expect = 0.0 Identities = 577/598 (96%), Gaps = 2/598 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 77 |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 1327 Query: 78 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 137 | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1326 ttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtac 1267 Query: 138 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 197 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1266 acaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1207 Query: 198 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 257 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1206 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1147 Query: 258 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 317 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1146 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccca 1087 Query: 318 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1086 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1027 Query: 378 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggc 967 Query: 438 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 498 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 847 Query: 558 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 846 attgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtag 789
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 559/577 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 39 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 98 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1321 Query: 99 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 158 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1261 Query: 159 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 218 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201 Query: 219 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 278 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141 Query: 279 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 338 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 ccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081 Query: 339 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1021 Query: 399 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1020 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccaga 961 Query: 459 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 518 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 catacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 901 Query: 519 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 578 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 900 aactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841 Query: 579 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 840 caaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtag 804
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 544/557 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 49 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 108 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 109 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 168 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 169 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 228 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 229 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 288 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 289 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 349 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 408 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 409 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 468 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 469 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 528 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgc 891 Query: 529 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagta 588 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagta 831 Query: 589 tttgcggtgaatccccc 605 ||||||||||||||||| Sbjct: 830 tttgcggtgaatccccc 814
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 549/564 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 532 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 591 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 808 Query: 592 gcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 807 gcggtgaatcccccagttatgtag 784
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 554/571 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtag 774
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 542/556 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 808 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| |||| |||| Sbjct: 807 tcccccagttatgtag 792
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 547/562 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 806 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||| |||| |||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttatgtag 784
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 547/562 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgc 796 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatccccctgttaagtag 774
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 537/549 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 57 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 117 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 176 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 177 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 236 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 237 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 296 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 297 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 357 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 416 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 417 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 476 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 477 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 537 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 596 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 784 Query: 597 gaatccccc 605 ||||||||| Sbjct: 783 gaatccccc 775
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 537/549 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 57 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 117 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 176 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 177 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 236 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 237 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 296 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 297 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 357 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 416 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 417 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 476 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 477 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 537 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 596 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 784 Query: 597 gaatccccc 605 ||||||||| Sbjct: 783 gaatccccc 775
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 539/552 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 604 ccggttaagtag 615 || |||| |||| Sbjct: 803 ccagttatgtag 792
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 539/552 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 604 ccggttaagtag 615 || |||| |||| Sbjct: 803 ccagttatgtag 792
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 539/552 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 604 ccggttaagtag 615 || |||| |||| Sbjct: 803 ccagttatgtag 792
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 589/616 (95%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 tctaccggcttgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaagctgcggctagttc 1330 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1329 aggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1270 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1210 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1209 attcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaa 1150 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1149 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1090 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1089 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttcaat 1030 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 970 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 acctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 910 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 909 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 850 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 849 aatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaa 790 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 |||||| ||||||||| Sbjct: 789 tcccccagttaagtag 774
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 553/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtag 774
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 543/558 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 118 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 177 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 178 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 237 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 238 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 298 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 357 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 358 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 418 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 477 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 931 Query: 478 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 537 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 930 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacgg 871 Query: 538 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 597 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 870 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 811 Query: 598 aatcccccggttaagtag 615 |||||||| |||| |||| Sbjct: 810 aatcccccagttatgtag 793
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 575/598 (96%), Gaps = 2/598 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 aatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagc 77 |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1387 aatttgat-cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagc 1329 Query: 78 tgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtac 137 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 tgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtac 1269 Query: 138 acaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcc 197 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1268 acaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcc 1209 Query: 198 taaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctgg 257 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 taaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctgg 1149 Query: 258 catatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccca 317 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1148 catatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccca 1089 Query: 318 gtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 377 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 gtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataa 1029 Query: 378 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgga 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 atcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggc 969 Query: 438 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 497 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 968 gtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 909 Query: 498 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 908 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 849 Query: 558 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 848 attgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtag 791
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 546/562 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttgc 796 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatccccctgttaagtag 774
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 564/585 (96%), Gaps = 1/585 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 cgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 86 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1307 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttgat 1248 Query: 87 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 146 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1247 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 1188 Query: 147 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 206 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 taaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1128 Query: 207 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 266 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 tccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1068 Query: 267 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 326 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 aacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 1008 Query: 327 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 386 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 gaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 948 Query: 387 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 888 Query: 447 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 506 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 828 Query: 507 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcg 566 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 827 ctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcg 768 Query: 567 gcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaa 611 |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 767 gcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaa 723
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 985 bits (497), Expect = 0.0 Identities = 557/577 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 39 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 98 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1305 Query: 99 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 158 ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1304 ttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1245 Query: 159 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 218 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1185 Query: 219 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 278 |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1184 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaatacc 1125 Query: 279 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 338 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1065 Query: 339 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1005 Query: 399 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccaga 945 Query: 459 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 518 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 catacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 885 Query: 519 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 578 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 884 aactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 825 Query: 579 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 824 caaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtag 788
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 538/552 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 929 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgc 870 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 869 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 810 Query: 594 ggtgaatccccc 605 |||||||||||| Sbjct: 809 ggtgaatccccc 798
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 588/616 (95%), Gaps = 2/616 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 tctaccggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttc 59 |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 tctaccggctcgaactcgaatttgatt-gctttccatacttcacaagctgcggctagttc 1360 Query: 60 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 119 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 120 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 179 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggtgc 1240 Query: 180 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1239 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaa 1180 Query: 240 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 299 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1179 gatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataac 1120 Query: 300 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 359 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1119 acctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttcaat 1060 Query: 360 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 419 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 1000 Query: 420 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 999 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgctaa 940 Query: 480 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 939 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtg 880 Query: 540 aatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaa 599 |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| Sbjct: 879 aatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgcggtgaa 820 Query: 600 tcccccggttaagtag 615 ||| || ||||||||| Sbjct: 819 tcctccagttaagtag 804
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 552/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 775 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 774 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 715 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 714 agtatttgcggtgaatcctccggttaagtag 684
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 552/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtag 774
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 552/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtag 774
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 552/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtag 774
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 545/562 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 866 tcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 807 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||| || ||||||||| Sbjct: 806 ggtgaatcctccagttaagtag 785
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 977 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 544/561 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 115 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 174 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 175 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 234 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 235 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 295 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 354 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 355 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 415 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 474 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 475 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 534 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 535 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 594 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 825 Query: 595 gtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccagttaagtag 804
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 537/552 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 874 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 814 Query: 604 ccggttaagtag 615 || |||| |||| Sbjct: 813 ccagttatgtag 802
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 537/552 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaataca 906 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 905 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 846 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 845 tgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 786 Query: 604 ccggttaagtag 615 |||||||||||| Sbjct: 785 ccggttaagtag 774
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 551/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtag 774
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 551/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtag 774
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 580/607 (95%), Gaps = 2/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 tcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 68 |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgat-ctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 69 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 128 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 129 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 188 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 ggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 189 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggt 1171 Query: 249 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 308 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 309 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 368 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 369 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 428 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 429 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 488 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 489 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 548 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 549 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 608 ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagt 811 Query: 609 taagtag 615 ||||||| Sbjct: 810 taagtag 804
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 529/542 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 604 cc 605 || Sbjct: 803 cc 802
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 529/542 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 604 cc 605 || Sbjct: 803 cc 802
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 529/542 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 124 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 183 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 184 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 244 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 303 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 304 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 363 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 364 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 424 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 483 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 484 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 544 tgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccc 603 |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccc 804 Query: 604 cc 605 || Sbjct: 803 cc 802
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 523/534 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 82 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 141 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 142 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 202 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 261 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 262 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 322 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 382 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 442 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 502 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 562 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtag 763
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 523/534 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 82 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 141 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 142 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 202 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 261 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 262 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 322 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 382 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 442 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 502 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 817 Query: 562 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 816 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtag 763
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 544/562 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtag 774
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 545/564 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 112 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 171 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 172 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 231 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 232 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 291 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 292 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 351 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 352 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 412 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 471 ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 472 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 531 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 532 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtattt 591 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtattt 798 Query: 592 gcggtgaatcccccggttaagtag 615 || |||||||| || ||||||||| Sbjct: 797 gcagtgaatccaccagttaagtag 774
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 542/560 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 56 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 116 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 175 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 176 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 235 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 236 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 296 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 355 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 356 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 416 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 475 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 887 Query: 476 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 535 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 886 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 827 Query: 536 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 595 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcgg 767 Query: 596 tgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||| ||||||||| Sbjct: 766 tgaatcccccagttaagtag 747
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 553/572 (96%), Gaps = 2/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 103 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 104 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 163 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 164 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 223 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 224 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 283 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 284 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 343 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 344 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgc 986 Query: 404 gttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatac 463 | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 464 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 523 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 524 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 583 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 584 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtag 774
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 550/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtag 774
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 533/549 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 67 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 126 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 127 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 186 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 187 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 247 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 307 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 367 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 427 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 486 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 487 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 853 Query: 547 agaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccg 606 ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 852 agaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccca 793 Query: 607 gttaagtag 615 |||| |||| Sbjct: 792 gttatgtag 784
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 550/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtag 774
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 550/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtag 774
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 579/607 (95%), Gaps = 2/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 10 tcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 68 |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgat-ctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactcca 1351 Query: 69 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 128 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1350 tttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1291 Query: 129 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 188 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1290 ggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1231 Query: 189 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1230 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggt 1171 Query: 249 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 308 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 cagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcat 1111 Query: 309 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 368 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatc 1051 Query: 369 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 428 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 429 tgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 488 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 489 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 548 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 549 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 608 ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagt 811 Query: 609 taagtag 615 ||||||| Sbjct: 810 taagtag 804
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 540/558 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1284 Query: 118 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 177 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1283 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1224 Query: 178 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 237 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1223 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1164 Query: 238 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1163 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1104 Query: 298 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 357 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1044 Query: 358 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 984 Query: 418 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 477 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 924 Query: 478 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 537 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 923 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 864 Query: 538 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 597 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 804 Query: 598 aatcccccggttaagtag 615 |||||||| ||||||||| Sbjct: 803 aatcccccagttaagtag 786
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 543/562 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtag 774
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 527/541 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 134 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 135 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 194 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 195 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 254 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 255 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 315 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 374 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 375 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 435 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 494 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 495 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 555 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagta 614 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 748 Query: 615 g 615 | Sbjct: 747 g 747
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 527/541 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 134 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 135 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 194 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 195 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 254 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 255 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 314 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 315 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 375 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 969 Query: 435 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 909 Query: 495 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 849 Query: 555 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagta 614 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct: 848 gccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 789 Query: 615 g 615 | Sbjct: 788 g 788
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 527/541 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 134 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 135 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 194 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 195 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 254 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 255 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 315 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 374 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 375 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 435 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 494 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 495 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 555 gccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagta 614 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct: 807 gccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgta 748 Query: 615 g 615 | Sbjct: 747 g 747
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 554/577 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 39 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 98 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120461 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 120402 Query: 99 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 158 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 120401 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 120342 Query: 159 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 218 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120341 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 120282 Query: 219 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 278 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120281 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 120222 Query: 279 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 338 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120221 ccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 120162 Query: 339 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 398 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 120161 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 120102 Query: 399 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 458 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 120101 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 120042 Query: 459 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120041 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 119982 Query: 519 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 578 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 119981 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgaga 119922 Query: 579 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 119921 caaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtag 119885
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 554/577 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 39 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 98 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58834 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 58775 Query: 99 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 158 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 58774 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 58715 Query: 159 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 218 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58714 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 58655 Query: 219 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 278 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58654 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 58595 Query: 279 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 338 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58594 ccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 58535 Query: 339 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 398 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 58534 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 58475 Query: 399 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 458 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 58474 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 58415 Query: 459 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58414 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 58355 Query: 519 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 578 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 58354 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgaga 58295 Query: 579 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 58294 caaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtag 58258
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 516/527 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 89 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 148 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 149 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 208 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 209 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 268 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 269 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 328 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 329 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 388 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 389 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgat 448 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgat 918 Query: 449 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 508 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 858 Query: 509 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 857 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 798 Query: 569 aatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 797 aataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtag 751
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 549/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcccccagttaagtag 774
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 549/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcccccagttaagtag 774
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 549/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| Sbjct: 864 atgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaagt 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtag 774
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 549/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaact 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtag 774
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 549/571 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 45 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 104 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 105 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 164 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 165 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 224 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 225 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 284 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 285 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 344 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 345 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 404 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 405 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 465 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 524 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 525 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 584 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| | Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaact 805 Query: 585 agtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctccagttaagtag 774
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 539/558 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 58 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 117 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 118 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 177 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 178 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 237 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 238 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 298 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 358 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 418 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 922 Query: 478 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 921 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 862 Query: 538 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 597 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 802 Query: 598 aatcccccggttaagtag 615 ||||| || ||||||||| Sbjct: 801 aatcctccagttaagtag 784
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 542/562 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 54 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 114 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 173 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 174 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 233 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 gggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 234 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 293 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccgg 1096 Query: 294 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 353 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 354 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 414 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 473 ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 474 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 533 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 534 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 593 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 796 Query: 594 ggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 795 agtgaatcccccagttaagtag 774
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 553/577 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 39 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 98 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 1321 Query: 99 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 158 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 1261 Query: 159 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 218 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201 Query: 219 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 278 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141 Query: 279 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 338 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 cccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081 Query: 339 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 398 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1080 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 1021 Query: 399 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 458 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1020 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 961 Query: 459 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 901 Query: 519 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 578 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 900 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgaga 841 Query: 579 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 840 caaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtag 804
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 553/577 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 39 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 98 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58253 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 58194 Query: 99 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 158 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 58193 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 58134 Query: 159 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 218 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58133 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 58074 Query: 219 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 278 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58073 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 58014 Query: 279 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 338 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58013 cccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 57954 Query: 339 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 398 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57953 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 57894 Query: 399 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 458 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57893 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 57834 Query: 459 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57833 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 57774 Query: 519 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 578 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 57773 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgaga 57714 Query: 579 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 57713 caaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtag 57677
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 582/613 (94%), Gaps = 2/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 4 accggctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcagg 62 |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1852 accggcgcgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcagg 1794 Query: 63 actccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttc 122 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1793 actccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttc 1734 Query: 123 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 182 |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1733 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatt 1674 Query: 183 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 242 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1673 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagat 1614 Query: 243 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1613 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1554 Query: 303 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 362 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1553 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaa 1494 Query: 363 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1493 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacc 1434 Query: 423 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 482 |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1433 tactactgtaccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatac 1374 Query: 483 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1373 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 1314 Query: 543 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 602 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1313 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagccaaactagtatttgcggtgaatcc 1254 Query: 603 cccggttaagtag 615 || ||||||||| Sbjct: 1253 tccagttaagtag 1241
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 553/577 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 39 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 98 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58263 ttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatttcattacc 58204 Query: 99 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 158 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 58203 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacg 58144 Query: 159 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 218 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58143 attagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 58084 Query: 219 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 278 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58083 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 58024 Query: 279 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 338 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58023 cccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 57964 Query: 339 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 398 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57963 gcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttat 57904 Query: 399 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccaga 458 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 57903 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccga 57844 Query: 459 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57843 catacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaat 57784 Query: 519 aactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 578 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 57783 aactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgaga 57724 Query: 579 caaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 57723 caaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtag 57687
>dbj|AB088833.1| Phyllostachys bambusoides chloroplast rbcL gene for RuBisCO large subunit, partial cds Length = 1356 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 553/575 (96%), Gaps = 2/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 42 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 101 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccntttgcaagctgctcggataatttnattaccttc 1294 Query: 102 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 161 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1293 acgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgatt 1234 Query: 162 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccacc-aaattgta 220 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| Sbjct: 1233 agctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc-tccacccaaattgta 1175 Query: 221 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 280 |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1174 atacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccc 1115 Query: 281 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 340 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1055 Query: 341 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 995 Query: 401 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 994 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagaca 935 Query: 461 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 520 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 tacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 875 Query: 521 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 580 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 874 ctgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 815 Query: 581 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtag 615 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 814 aagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtag 780 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,613,408 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4613408 Number of successful extensions: 121189 Number of sequences better than 10.0: 15302 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15258 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 56 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 90599 Number of HSP's gapped (non-prelim): 21949 length of query: 617 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 594 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 10183118836176 effective search space used: 10183118836176 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)