Clone Name | rbasd21k23 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 669/675 (99%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 669/675 (99%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1253 bits (632), Expect = 0.0 Identities = 669/675 (99%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 668/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 668/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 668/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 668/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 668/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 668/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 668/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 668/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 668/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1245 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 668/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1239 bits (625), Expect = 0.0 Identities = 667/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 667/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 767 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctcttaa 752
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 665/673 (98%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1530 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1474 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1473 kttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 1414 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1354 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 1294 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1234 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1174 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1114 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 935 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 875 Query: 662 acagctctcttaa 674 ||||||||||||| Sbjct: 874 acagctctcttaa 862
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 666/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 kagstaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 667/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 667/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 667/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 667/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 667/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 667/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1237 bits (624), Expect = 0.0 Identities = 667/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 666/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1233 bits (622), Expect = 0.0 Identities = 666/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1231 bits (621), Expect = 0.0 Identities = 666/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggagcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 666/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aagtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 666/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 666/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 666/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 666/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 666/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 666/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 665/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tnnntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 665/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatatttcgcaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 665/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1355 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 665/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1355 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 665/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1355 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 665/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1355 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1219 bits (615), Expect = 0.0 Identities = 664/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaacncgaatntgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1217 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 663/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 663/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 664/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1355 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 664/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1355 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 664/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1355 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 663/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0 Identities = 663/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 662/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 ssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 663/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgatt-gccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 663/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1205 bits (608), Expect = 0.0 Identities = 663/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 662/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacann-ctgcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 767 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctcttaa 752
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 662/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 662/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1481 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1425 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1365 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1305 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1245 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1185 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1125 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1065 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1006 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 946 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 945 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 886 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 885 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 826 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 825 atacagctctcttaa 811
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 661/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gsscccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 662/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 662/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 662/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 56331 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 56275 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56274 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 56215 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56214 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 56155 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56154 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 56095 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56094 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 56035 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56034 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 55975 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55974 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 55915 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55914 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 55856 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55855 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 55796 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55795 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 55736 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55735 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 55676 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 55675 atacagctctcttaa 55661
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 662/675 (98%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1517 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1461 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1460 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1401 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1341 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1281 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1221 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1161 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1101 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1042 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 982 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 981 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 922 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 921 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 862 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 861 atacagctctcttaa 847
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1195 bits (603), Expect = 0.0 Identities = 661/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| || Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactcgaanntgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcngc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cacggtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 767 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctcttaa 752
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 661/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctactgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 | || |||||||||| Sbjct: 814 anacngctctcttaa 800
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 660/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 ssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1191 bits (601), Expect = 0.0 Identities = 661/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 661/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 767 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctcttaa 752
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 661/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1475 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1415 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1355 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1295 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1235 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1175 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1115 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 996 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 995 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 936 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 935 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 876 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 875 atacagctctcttaa 861
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 661/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1475 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1415 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1355 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1295 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1235 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1175 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1115 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 996 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 995 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 936 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 935 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 876 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 875 atacagctctcttaa 861
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 661/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1475 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1415 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1355 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1295 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1235 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1175 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1115 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 996 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 995 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 936 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 935 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 876 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 875 atacagctctcttaa 861
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 661/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1475 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1415 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1355 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1295 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1235 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1175 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1115 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 996 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 995 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 936 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 935 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 876 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 875 atacagctctcttaa 861
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 661/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1389 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1333 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1273 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1213 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1153 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1152 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1093 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1033 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1032 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 973 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 taacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 914 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 854 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 853 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 794 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 734 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 733 atacagctctcttaa 719
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 661/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 661/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 660/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 ssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 661/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 660/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 ssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 660/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnn 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 648/660 (98%), Gaps = 4/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 16 cgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactcca 74 |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1518 cgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcca 1461 Query: 75 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacg 134 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1460 tttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcgttacg 1401 Query: 135 agcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccca 194 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1400 agcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttcccca 1341 Query: 195 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggt 254 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 aggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggt 1281 Query: 255 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 cagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcat 1221 Query: 315 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 ggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatc 1161 Query: 375 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 gcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactac 1101 Query: 435 tgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 494 |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 1042 Query: 495 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 982 Query: 555 gaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 614 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccgg 922 Query: 615 ntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 674 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 ttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaactctctcgcaaatacagctctcttaa 862
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 660/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1475 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1415 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1355 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1295 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1235 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1175 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1115 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 996 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 995 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 936 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 935 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 876 Query: 660 atacagctctcttaa 674 |||||||||| |||| Sbjct: 875 atacagctctnttaa 861
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 660/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 767 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctcttaa 752
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 660/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 767 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctcttaa 752
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 660/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1203 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1202 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1143 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1142 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1083 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1023 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1022 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 963 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 903 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 902 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 843 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 842 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 784 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 783 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 724 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 723 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttg 664 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 663 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 604 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 603 atacagctctcttaa 589
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 660/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1203 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1202 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1143 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1142 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1083 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1023 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1022 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 963 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 903 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 902 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 843 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 842 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 784 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 783 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 724 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 723 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttg 664 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 663 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 604 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 603 atacagctctcttaa 589
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 660/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1479 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1419 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1359 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1299 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1239 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1179 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1119 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1060 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 1000 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 999 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 940 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 939 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 880 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 879 atacagctctcttaa 865
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 659/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 ssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 659/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 660/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1391 agtatctaccgg-cttgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1335 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1334 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1275 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1274 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1215 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1214 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1155 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1154 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1095 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1094 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1035 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 975 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 916 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 856 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 855 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 796 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 795 cggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 736 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 735 atacagctctcttaa 721
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 657/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-ctcgaacycgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 ssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1355 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1179 bits (595), Expect = 0.0 Identities = 658/673 (97%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1391 agtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1335 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1334 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1275 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1274 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1215 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1214 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1155 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1154 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1095 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1094 tataacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1035 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 975 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 916 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 856 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 855 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 796 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 795 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 736 Query: 660 atacagctctctt 672 ||||||||||||| Sbjct: 735 atacagctctctt 723
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 658/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1475 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1415 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1355 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1295 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 cccaaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1235 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1175 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1174 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttc 1115 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 996 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 995 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 936 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 935 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 876 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 875 atacagctctcttaa 861
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 659/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1479 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1419 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1359 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1299 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1239 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1179 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1119 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1060 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 1000 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 999 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 940 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 939 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 880 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 879 atacagctctcttaa 865
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 658/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1475 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1415 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1355 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1295 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1235 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1175 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1115 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1056 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 996 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 995 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 936 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 935 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 876 Query: 660 atacagctctcttaa 674 |||||||||| |||| Sbjct: 875 atacagctctnttaa 861
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 658/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 |||||||||| |||| Sbjct: 814 atacagctctnttaa 800
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 659/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 ggccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 767 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctcttaa 752
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 659/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1398 agtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1342 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1282 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1222 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1162 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1102 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1042 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 982 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 923 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 863 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 cacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 803 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 802 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 743 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 742 atacagctctcttaa 728
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 659/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1398 agtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1342 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1341 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1282 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1222 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1221 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1162 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1161 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1102 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1042 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 982 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 923 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 922 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 863 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 cacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 803 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 802 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 743 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 742 atacagctctcttaa 728
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 658/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 659/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgccgc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 602/605 (99%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 744 cttaa 740
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 658/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1479 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1419 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1359 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1299 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1239 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1179 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1119 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1060 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tagctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattg 1000 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 999 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 940 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 939 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 880 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 879 atacagctctcttaa 865
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 658/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 767 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctcttaa 752
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 658/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 767 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctcttaa 752
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 657/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1479 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1419 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1418 gcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnacc 1359 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1299 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1239 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1179 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1119 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1060 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 1000 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 999 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 940 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 939 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 880 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 879 atacagctctcttaa 865
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 601/605 (99%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 911 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 851 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 791 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 731 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 730 cttaa 726
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 608/615 (98%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaa 696
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 656/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactcgaattnnnn-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 767 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctcttaa 752
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 657/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1203 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1202 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1143 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1142 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgacc 1083 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1023 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1022 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 963 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 903 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 902 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 843 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 842 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 784 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 783 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 724 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 723 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttg 664 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 663 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 604 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 603 atacagctctcttaa 589
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 608/615 (98%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaa 696
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 657/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1414 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1354 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 gctgccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1294 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1234 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1174 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1114 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1054 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 taacttacctactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 995 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 935 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 934 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttg 875 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 874 cggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 815 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 814 atacagctctcttaa 800
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 654/675 (96%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccgg-cgcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggc 1476 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1416 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 gsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1356 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1355 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1296 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1236 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1176 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1116 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taacttacctannnctgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnn 1057 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 nagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 997 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 937 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 877 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 876 atacagctctcttaa 862
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 655/675 (97%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| Sbjct: 1473 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagcc-gcggc 1417 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1416 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1357 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1297 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1296 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1237 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1177 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1117 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1057 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 998 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 997 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattg 938 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 937 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 878 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 818 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 817 atacagctctcttaa 803
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 606/617 (98%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 118 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 177 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 178 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 237 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 238 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 298 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 358 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 418 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 477 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 478 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 538 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 597 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 598 tgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 657 ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagc 749 Query: 658 aaatacagctctcttaa 674 ||||||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaa 732
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 603/614 (98%), Gaps = 1/614 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 121 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 180 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 181 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 240 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 241 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 301 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 361 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 421 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 480 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 481 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 541 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 600 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 601 ggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 660 |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaa 746 Query: 661 tacagctctcttaa 674 |||||||||||||| Sbjct: 745 tacagctctcttaa 732
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 653/675 (96%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| Sbjct: 1382 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagcc-gcggc 1326 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1325 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1266 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcacc 1206 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1205 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1146 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 accaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1086 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1026 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 966 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 907 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 906 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 847 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 846 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 787 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 786 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 727 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 726 atacagctctcttaa 712
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 653/675 (96%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagcc-gcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1245 aggtgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 886 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 767 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctcttaa 752
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 638/656 (97%), Gaps = 4/656 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 aactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatt 76 |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatt 1339 Query: 77 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgag 136 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1338 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgag 1279 Query: 137 cttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 196 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1278 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1219 Query: 197 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtca 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtca 1159 Query: 257 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatgg 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 gagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatgg 1099 Query: 317 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgc 376 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 atacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgc 1039 Query: 377 gcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 436 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 gcaataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactg 979 Query: 437 tacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 496 || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 920 Query: 497 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 860 Query: 557 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggnt 616 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct: 859 agtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagtt 800 Query: 617 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct: 799 aagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaaaatagctctctt 744
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 653/675 (96%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagcc-gcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 tagcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 886 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 767 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctcttaa 752
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 653/675 (96%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||| Sbjct: 1520 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagcc-gcggc 1464 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1463 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1404 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1344 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1343 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1284 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1224 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1164 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1104 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 tagcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 1045 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 985 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 984 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 925 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 865 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 864 atacagctctcttaa 850
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 604/615 (98%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 747 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaa 732
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 596/605 (98%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcc 805 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 744 cttaa 740
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 602/613 (98%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 737 Query: 660 atacagctctctt 672 ||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctctt 724
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 652/675 (96%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| Sbjct: 1402 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaagcc-gcggc 1346 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 747 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaa 732
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 604/617 (97%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 118 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 177 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 178 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 237 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 238 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 298 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 357 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 358 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 418 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 477 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 478 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 538 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 597 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809 Query: 598 tgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 657 ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 658 aaatacagctctcttaa 674 ||||||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaa 732
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 602/615 (97%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 825 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 765 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 764 atacagctctcttaa 750
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 650/674 (96%), Gaps = 5/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggct 60 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | |||||| Sbjct: 1421 gtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaagcc-gcggct 1365 Query: 61 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcg 1305 Query: 121 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 180 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 181 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 240 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcc 1185 Query: 241 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggt 1125 Query: 301 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 360 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 361 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 421 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 480 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 481 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 541 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 600 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 885 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 660 |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaa 766 Query: 661 tacagctctcttaa 674 |||||||||||||| Sbjct: 765 tacagctctcttaa 752
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 601/615 (97%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaa 716
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 601/615 (97%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaa 716
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 648/673 (96%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccgg-ctcgaactcsaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 1347 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1346 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1287 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1227 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1226 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1167 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1166 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1107 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1047 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 987 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 928 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 868 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 867 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 808 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 807 gtaaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaat 748 Query: 662 acagctctcttaa 674 ||||||||||||| Sbjct: 747 acagctctcttaa 735
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 593/605 (98%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 744 cttaa 740
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 602/617 (97%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1349 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1290 Query: 118 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 177 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1230 Query: 178 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 237 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1170 Query: 238 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1110 Query: 298 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1050 Query: 358 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccct 990 Query: 418 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 477 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 931 Query: 478 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 871 Query: 538 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 597 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 870 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 811 Query: 598 tgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 657 ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 751 Query: 658 aaatacagctctcttaa 674 ||||||||||||||||| Sbjct: 750 aaatacagctctcttaa 734
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1098 bits (554), Expect = 0.0 Identities = 602/617 (97%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 118 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 177 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 178 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 237 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 238 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 298 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 357 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 358 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 418 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 477 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 478 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 538 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 597 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 810 Query: 598 tgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 657 ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 750 Query: 658 aaatacagctctcttaa 674 |||||||||||| |||| Sbjct: 749 aaatacagctcttttaa 733
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1096 bits (553), Expect = 0.0 Identities = 649/675 (96%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | || || Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcgcaagcc-gcagc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 cccaaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 886 cacggtgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 767 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctcttaa 752
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 595/609 (97%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 125 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 126 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 185 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 186 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 245 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 246 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 306 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 365 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 366 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 426 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 485 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 486 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 546 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 605 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 809 Query: 606 atcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 665 ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749 Query: 666 ctctcttaa 674 ||||||||| Sbjct: 748 ctctcttaa 740
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 579/587 (98%), Gaps = 1/587 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 147 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 148 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 207 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 208 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 267 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 268 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 328 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 388 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 448 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 508 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 567 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 568 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatg 627 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 628 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 674 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 714
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 600/615 (97%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 748 Query: 660 atacagctctcttaa 674 |||||||||| |||| Sbjct: 747 atacagctcttttaa 733
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 579/587 (98%), Gaps = 1/587 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 147 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 148 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 207 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 208 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 267 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 268 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 328 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 388 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 448 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 508 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 567 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 568 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatg 627 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 628 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 674 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 714
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 597/611 (97%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 124 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 184 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 243 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 244 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 304 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 364 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 424 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 483 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 484 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 543 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 544 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 603 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 604 gaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 663 ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 763 Query: 664 agctctcttaa 674 ||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaa 752
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0 Identities = 600/615 (97%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaa 722
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 615/634 (97%), Gaps = 2/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 41 tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcat 100 ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaag-cagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcat 1305 Query: 101 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 160 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1304 taccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcca 1245 Query: 161 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 220 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 ctcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1185 Query: 221 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 280 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 attgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1125 Query: 281 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 340 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 taccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1065 Query: 341 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1005 Query: 401 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccc 460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 1004 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccc 946 Query: 461 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 520 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 886 Query: 521 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatag 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 885 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataa 826 Query: 581 tgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaatagga 640 ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 tgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagga 766 Query: 641 acccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 674 || |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 765 actcctaattctctcgcaaatacagctcttttaa 732
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 592/605 (97%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctct 745 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 744 cttaa 740
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 592/605 (97%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 927 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 867 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 807 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 747 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 746 cttaa 742
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 601/617 (97%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 118 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 177 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 178 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 237 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 238 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 297 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 298 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 358 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 418 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 477 |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 478 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 538 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 597 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 814 Query: 598 tgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 657 ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 754 Query: 658 aaatacagctctcttaa 674 ||||||||||||||||| Sbjct: 753 aaatacagctctcttaa 737
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 649/673 (96%), Gaps = 7/673 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 124700 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 124699 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 124640 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 124639 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 124580 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124579 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccc 124520 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 124519 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggta 124461 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124460 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-tttt 124402 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124401 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 124342 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124341 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 124283 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124282 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 124223 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124222 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 124163 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 124162 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 124103 Query: 662 acagctctcttaa 674 ||||||||||||| Sbjct: 124102 acagctctcttaa 124090 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 649/673 (96%), Gaps = 7/673 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggcta 30173 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 30172 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 30113 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 30112 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 30053 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30052 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccc 29993 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 29992 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggta 29934 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29933 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-tttt 29875 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29874 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 29815 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29814 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 29756 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29755 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 29696 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29695 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 29636 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 29635 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 29576 Query: 662 acagctctcttaa 674 ||||||||||||| Sbjct: 29575 acagctctcttaa 29563
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 599/615 (97%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaa 716
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1086 bits (548), Expect = 0.0 Identities = 593/607 (97%), Gaps = 1/607 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 128 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 187 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 188 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 248 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 308 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 368 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 428 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 487 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 488 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 547 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849 Query: 548 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 607 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 789 Query: 608 cccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 667 ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 788 cccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagct 729 Query: 668 ctcttaa 674 ||||||| Sbjct: 728 ctcttaa 722
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1084 bits (547), Expect = 0.0 Identities = 637/662 (96%), Gaps = 4/662 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 14 ctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactc 72 |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactc 1353 Query: 73 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1352 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1293 Query: 133 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1292 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1233 Query: 193 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 252 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct: 1232 caaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcg 1173 Query: 253 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 312 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1113 Query: 313 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 373 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 432 ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 433 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 492 |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 actgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 934 Query: 493 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 552 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 933 aaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtg 874 Query: 553 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 612 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 aagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 814 Query: 613 ggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 672 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 813 tgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctctt 754 Query: 673 aa 674 || Sbjct: 753 aa 752
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 1082 bits (546), Expect = 0.0 Identities = 600/617 (97%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 118 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 177 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 178 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 237 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 238 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 297 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 298 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 357 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 358 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 418 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 477 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 478 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 538 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 597 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 598 tgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 657 ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 658 aaatacagctctcttaa 674 ||||||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaa 732
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1080 bits (545), Expect = 0.0 Identities = 602/620 (97%), Gaps = 1/620 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 114 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 115 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 174 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 175 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 234 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 235 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 294 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 295 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 355 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 414 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 415 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 474 ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 475 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 535 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 594 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 595 atttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 654 |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 772 Query: 655 cgcaaatacagctctcttaa 674 |||||||||||||||||||| Sbjct: 771 cgcaaatacagctctcttaa 752
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1078 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 644/671 (95%), Gaps = 5/671 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggcta 1348 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1347 gttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1288 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1287 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1228 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1227 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1168 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1167 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1108 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1048 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 988 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 929 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 869 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 809 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 808 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 749 Query: 662 acagctctctt 672 | ||||||||| Sbjct: 748 atagctctctt 738
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 613/634 (96%), Gaps = 2/634 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 41 tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcat 100 ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaag-cagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcat 1305 Query: 101 taccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagcca 160 ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1304 taccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcca 1245 Query: 161 ctcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 220 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 ctcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaa 1185 Query: 221 attgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 280 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 attgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaa 1125 Query: 281 taccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaaga 340 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 taccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaaga 1065 Query: 341 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 taccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaag 1005 Query: 401 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccc 460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 1004 tcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccc 946 Query: 461 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 520 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 886 Query: 521 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatag 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 885 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataa 826 Query: 581 tgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaatagga 640 ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 tgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaatagga 766 Query: 641 acccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 674 |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 765 acccctaattctcttgcaaatacagctctcttaa 732
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 590/605 (97%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 744 cttaa 740
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 55414 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 55413 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 55354 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55353 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 55294 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 55293 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 55234 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 55233 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 55174 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55173 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 55114 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55113 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 55054 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55053 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 54995 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54994 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 54935 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54934 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 54875 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 54874 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 54815 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 54814 acagctcttttaa 54802
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 125755 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 125754 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 125695 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 125694 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 125635 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 125634 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 125575 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 125574 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 125515 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125514 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 125455 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125454 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 125395 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125394 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 125336 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125335 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 125276 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 125275 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 125216 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 125215 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 125156 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 125155 acagctcttttaa 125143 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 30695 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 30694 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 30635 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 30634 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 30575 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 30574 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 30515 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 30514 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 30455 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30454 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 30395 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30394 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 30335 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30334 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 30276 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30275 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 30216 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 30215 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 30156 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 30155 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 30096 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 30095 acagctcttttaa 30083
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 767 Query: 660 atacagctctctt 672 ||| ||||||||| Sbjct: 766 atatagctctctt 754
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| Sbjct: 1409 agtatctaccgg-ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggc 1353 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1293 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1292 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1233 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1232 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1173 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1172 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1113 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1053 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 993 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 934 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 874 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 873 cccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 814 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 813 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 754 Query: 660 atacagctctctt 672 ||| ||||||||| Sbjct: 753 atatagctctctt 741
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| Sbjct: 1407 agtatctaccgg-ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggc 1351 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1350 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1291 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1290 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1231 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1230 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1171 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1170 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1111 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1051 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 991 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 932 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 872 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 871 cccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 812 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 811 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 752 Query: 660 atacagctctctt 672 ||| ||||||||| Sbjct: 751 atatagctctctt 739
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| Sbjct: 1421 agtatctaccgg-ctcgaactcaaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggc 1365 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1305 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1304 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1245 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1185 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1184 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1125 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1065 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1005 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 946 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 886 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 885 cccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 826 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 825 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 766 Query: 660 atacagctctctt 672 ||| ||||||||| Sbjct: 765 atatagctctctt 753
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 33527206 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 33527207 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 33527266 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 33527267 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 33527326 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 33527327 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 33527386 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 33527387 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 33527446 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527447 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 33527506 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527507 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 33527566 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527567 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 33527625 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527626 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 33527685 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 33527686 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 33527745 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 33527746 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 33527805 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 33527806 acagctcttttaa 33527818 Score = 180 bits (91), Expect = 4e-42 Identities = 102/106 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 569 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgc 628 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 39115413 Query: 629 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 674 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115412 attacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaa 39115367
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 72403 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 72404 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 72463 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 72464 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 72523 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 72524 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 72583 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 72584 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 72643 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72644 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 72703 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72704 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 72763 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72764 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 72822 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72823 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 72882 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 72883 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 72942 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 72943 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 73002 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 73003 acagctcttttaa 73015
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1074 bits (542), Expect = 0.0 Identities = 645/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 55393 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 55392 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 55333 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55332 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 55273 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 55272 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 55213 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 55212 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 55153 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55152 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 55093 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55092 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 55033 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55032 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 54974 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54973 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 54914 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54913 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 54854 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 54853 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 54794 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 54793 acagctcttttaa 54781
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 595/612 (97%), Gaps = 1/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 123 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 182 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 183 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 242 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 243 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 302 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 303 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 363 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 422 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 423 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 482 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 483 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 543 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 602 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 603 tgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 662 |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 725 Query: 663 cagctctcttaa 674 |||||||||||| Sbjct: 724 cagctctcttaa 713
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 1072 bits (541), Expect = 0.0 Identities = 595/612 (97%), Gaps = 1/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 123 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 182 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 183 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 242 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 243 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 302 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 303 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 363 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 422 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 423 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 482 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 483 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 543 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 602 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 603 tgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 662 |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 725 Query: 663 cagctctcttaa 674 |||||||||||| Sbjct: 724 cagctctcttaa 713
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 592/609 (97%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 66 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 125 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 126 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 185 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 186 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 245 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 246 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 305 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 306 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 365 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 366 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 426 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 485 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 486 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 546 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 605 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 809 Query: 606 atcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 665 ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749 Query: 666 ctctcttaa 674 |||| |||| Sbjct: 748 ctcttttaa 740
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 597/615 (97%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 747 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaa 732
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 594/611 (97%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 124 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 183 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 184 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 243 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 244 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 304 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 363 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 364 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 424 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 483 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932 Query: 484 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872 Query: 544 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 603 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 812 Query: 604 gaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 663 ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 752 Query: 664 agctctcttaa 674 ||||||||||| Sbjct: 751 agctctcttaa 741
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 646/675 (95%), Gaps = 5/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1337 agtatctactgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatacttcacaag-ctgcggc 1281 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1280 aagttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatc 1221 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1220 gcgcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1161 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1160 cggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1101 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1100 cccaaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1041 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 981 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 921 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 taacttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 862 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 802 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 801 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 742 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 741 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 682 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 681 atacagctctcttaa 667
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1070 bits (540), Expect = 0.0 Identities = 597/615 (97%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 797 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaa 722
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1304 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 1244 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1243 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 1184 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1124 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 885 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 825 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 824 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 765 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 764 acagctcttttaa 752
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 55466 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 55465 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 55406 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55405 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 55346 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 55345 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 55286 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 55285 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 55226 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55225 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 55166 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55165 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 55106 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55105 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 55047 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55046 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 54987 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54986 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 54927 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 54926 gtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 54867 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 54866 acagctcttttaa 54854
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 55466 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 55465 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 55406 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55405 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 55346 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 55345 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 55286 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 55285 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 55226 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55225 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 55166 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55165 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 55106 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55105 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 55047 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55046 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 54987 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54986 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 54927 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 54926 gtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 54867 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 54866 acagctcttttaa 54854
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 598/617 (96%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 118 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 177 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 178 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 237 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 238 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 298 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 358 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 417 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 418 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 477 ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 478 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 538 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 597 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816 Query: 598 tgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 657 ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 815 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgc 756 Query: 658 aaatacagctctcttaa 674 |||||| ||||| |||| Sbjct: 755 aaatacggctcttttaa 739
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 124782 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 124781 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 124722 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 124721 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 124662 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 124661 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 124602 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 124601 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 124542 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124541 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 124482 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124481 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 124422 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124421 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 124363 Query: 482 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tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 30201 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 30200 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 30141 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 30140 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 30081 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 30080 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 30021 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 30020 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 29961 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29960 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 29901 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29900 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 29841 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29840 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 29782 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 29722 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 29721 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 29662 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 29661 gtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 29602 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 29601 acagctcttttaa 29589
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 124782 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 124781 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 124722 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 124721 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 124662 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 124661 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 124602 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 124601 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 124542 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124541 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 124482 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124481 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 124422 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124421 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 124363 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124362 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 124303 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 124302 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 124243 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 124242 gtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 124183 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 124182 acagctcttttaa 124170 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 30201 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 30200 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 30141 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 30140 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 30081 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 30080 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 30021 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 30020 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 29961 Query: 302 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29721 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 29662 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 29661 gtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 29602 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 29601 acagctcttttaa 29589
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 55458 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 55457 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 55398 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 55397 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 55338 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 55337 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 55278 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 55277 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 55218 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55217 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 55158 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55157 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 55098 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55097 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 55039 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55038 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 54979 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 54978 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 54919 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 54918 gtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 54859 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 54858 acagctcttttaa 54846
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 1364 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1363 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1304 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 1244 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1243 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 1184 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1183 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1124 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1064 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 885 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 825 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 824 gtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 765 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 764 acagctcttttaa 752
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-ctcgaactccaatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 886 cccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 826 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 767 Query: 660 atacagctctctt 672 ||| ||||||||| Sbjct: 766 atatagctctctt 754
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 53668 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 53667 gttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 53608 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 53607 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 53548 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 53547 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 53488 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 53487 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 53428 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53427 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 53368 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53367 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 53308 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53307 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 53249 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53248 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 53189 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 53188 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 53129 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 53128 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 53069 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 53068 acagctcttttaa 53056
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 128601 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 128600 gttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 128541 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 128540 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 128481 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 128480 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 128421 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 128420 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 128361 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128360 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 128301 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128300 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 128241 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128240 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 128182 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128181 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 128122 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 128121 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 128062 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 128061 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 128002 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 128001 acagctcttttaa 127989
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 10347276 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 10347275 gttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 10347216 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 10347215 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 10347156 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 10347155 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 10347096 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 10347095 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 10347036 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347035 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 10346976 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346975 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 10346916 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346915 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 10346857 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346856 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 10346797 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10346796 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 10346737 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 10346736 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 10346677 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 10346676 acagctcttttaa 10346664
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 1419 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1418 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1359 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 1299 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1298 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 1239 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1238 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1179 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1119 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1059 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1000 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 940 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 939 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 880 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 879 gtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 820 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 819 acagctcttttaa 807
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 1162 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1161 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1102 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 1042 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1041 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 982 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 981 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 922 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 862 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 802 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 743 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 742 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 683 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 682 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 623 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 622 gtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 563 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 562 acagctcttttaa 550
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 10353315 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 10353314 gttcacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 10353255 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 10353254 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 10353195 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 10353194 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 10353135 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 10353134 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 10353075 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353074 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 10353015 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353014 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 10352955 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352954 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 10352896 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352895 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 10352836 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 10352835 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 10352776 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 10352775 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 10352716 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 10352715 acagctcttttaa 10352703
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 1751 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1750 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1691 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1690 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 1631 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1630 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 1571 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1570 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1511 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1510 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1451 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1450 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1391 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1390 acttacctactactgca-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1332 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1331 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 1272 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 1212 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1211 gtgaatcccccggtcaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 1152 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 1151 acagctcttttaa 1139
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1067 bits (538), Expect = 0.0 Identities = 644/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 1784 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1783 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1724 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1723 gcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 1664 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1663 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 1604 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1603 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1544 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1543 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1484 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1483 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 1424 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1423 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1365 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 1305 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1304 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 1245 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1244 gtgaaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 1185 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 1184 acagctcttttaa 1172 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 87 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1065 bits (537), Expect = 0.0 Identities = 600/620 (96%), Gaps = 1/620 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 587/603 (97%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctct 745 Query: 670 ctt 672 ||| Sbjct: 744 ctt 742
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 587/603 (97%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctct 745 Query: 670 ctt 672 ||| Sbjct: 744 ctt 742
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 596/615 (96%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 811 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 cggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 751 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 750 atacagctctcttaa 736
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1063 bits (536), Expect = 0.0 Identities = 596/615 (96%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttg 797 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaa 722
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 588/605 (97%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 935 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 875 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 874 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 815 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 814 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 755 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 754 cttaa 750
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1059 bits (534), Expect = 0.0 Identities = 643/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggc 59 |||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccgg-cgcgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcgcaag-ctgcggc 1366 Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1365 tagttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1306 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1305 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1246 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1245 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1186 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1126 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatcttt 1066 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttc 1006 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 886 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 827 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 826 cggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 767 Query: 660 atacagctctctt 672 ||||||||||||| Sbjct: 766 atacagctctctt 754
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 642/672 (95%), Gaps = 5/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggct 60 ||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccgg-cgcgaactcaaatttgat-cgccttccatacttcgcaag-ctgcggct 1337 Query: 61 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 120 |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1336 agttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatca 1277 Query: 121 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1276 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcaccc 1217 Query: 181 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1216 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtct 1157 Query: 241 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| Sbjct: 1156 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggt 1097 Query: 301 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 360 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1096 ataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttt 1037 Query: 361 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttct 977 Query: 421 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 480 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 918 Query: 481 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 858 Query: 541 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 600 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 857 tcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 798 Query: 601 ggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 660 ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 797 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 738 Query: 661 tacagctctctt 672 |||||||||||| Sbjct: 737 tacagctctctt 726
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 599/620 (96%), Gaps = 1/620 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 574/587 (97%), Gaps = 1/587 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 147 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 148 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 207 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 208 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 267 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 268 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 328 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 388 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 448 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 508 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 567 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 568 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatg 627 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 628 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 674 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 711
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 574/587 (97%), Gaps = 1/587 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 147 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 148 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 207 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 208 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 267 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 268 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 328 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 388 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 448 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 508 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 567 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 568 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatg 627 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 628 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 674 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 711
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 1055 bits (532), Expect = 0.0 Identities = 600/622 (96%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1252 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1193 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1192 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctg 1133 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1132 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacng 1073 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1072 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1013 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1012 caaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 953 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 gatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 893 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 892 ccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 834 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 833 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 774 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 773 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 714 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 713 gtatttgcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcc 654 Query: 653 ctcgcaaatacagctctcttaa 674 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 653 ctcgcaaatacagctctcttaa 632
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 624/650 (96%), Gaps = 4/650 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaag 82 |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaag 1328 Query: 83 ctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgta 142 || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 cttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgta 1268 Query: 143 cacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtc 202 ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1267 cacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtc 1208 Query: 203 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctg 262 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctg 1148 Query: 263 gcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccc 322 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1147 gcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccc 1088 Query: 323 agtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaata 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 agtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaata 1028 Query: 383 aatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccg 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1027 aatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccg 969 Query: 443 gagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcata 502 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 968 gcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcata 909 Query: 503 ccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaag 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct: 908 ccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtagg 849 Query: 563 ccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtag 622 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 848 ccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtag 789 Query: 623 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 672 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 788 tcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctctt 739
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 615/638 (96%), Gaps = 4/638 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaag 82 |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgat-cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaag 1328 Query: 83 ctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgta 142 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 ctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgta 1268 Query: 143 cacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtc 202 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1267 cacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtc 1208 Query: 203 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctg 262 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctg 1148 Query: 263 gcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccc 322 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 gcatatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggataccc 1088 Query: 323 agtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaata 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 agtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaata 1028 Query: 383 aatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccg 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1027 aatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccg 969 Query: 443 gagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcata 502 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 968 gcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcata 909 Query: 503 ccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaag 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct: 908 ccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtagg 849 Query: 563 ccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtag 622 ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||| Sbjct: 848 ccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtag 789 Query: 623 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 660 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 788 tcatgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaa 751
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 600/622 (96%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctcttaa 674 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatacagctctcttaa 722
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 587/605 (97%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 744 cttaa 740
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 587/605 (97%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 744 cttaa 740
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 593/613 (96%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 748 Query: 660 atacagctctctt 672 ||||||||||||| Sbjct: 747 atacagctctctt 735
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 606/629 (96%), Gaps = 2/629 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 44 ttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattac 103 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattac 1322 Query: 104 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 163 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1321 cttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1262 Query: 164 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 223 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1202 Query: 224 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 283 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 1142 Query: 284 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 343 | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1082 Query: 344 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1022 Query: 404 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccccca 463 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccca 963 Query: 464 gacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatca 523 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 gacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatca 903 Query: 524 ataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtga 583 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 902 ataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatga 843 Query: 584 gccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacc 643 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 842 gccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacc 783 Query: 644 cctaattctctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 782 cctaattccctcgcaaatatagctctctt 754
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 642/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaag-ctgcggcta 5614506 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 5614505 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 5614446 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 5614445 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 5614386 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 5614385 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 5614326 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 5614325 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 5614266 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614265 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 5614206 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614205 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 5614146 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614145 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 5614087 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614086 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 5614027 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614026 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 5613967 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 5613966 gtgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 5613907 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 5613906 acagctcttttaa 5613894 Score = 617 bits (311), Expect = e-173 Identities = 354/366 (96%), Gaps = 2/366 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 309 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 369 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 429 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 488 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13436926 Query: 489 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 548 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13436925 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13436866 Query: 549 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 608 |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13436865 tgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 13436806 Query: 609 ccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctc 668 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 13436805 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctc 13436746 Query: 669 tcttaa 674 |||||| Sbjct: 13436745 tcttaa 13436740 Score = 297 bits (150), Expect = 2e-77 Identities = 170/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 469 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 529 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 588 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13397977 Query: 589 agtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccc 645 | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13397976 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 57 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 254 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 283 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 334 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 368 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.59 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 252 ggtcagagctggcatatgccaa 273 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 643/673 (95%), Gaps = 6/673 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 23203630 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 23203631 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 23203690 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 23203691 gccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 23203749 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 23203750 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 23203809 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 23203810 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 23203869 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203870 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 23203929 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 23203930 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttcta 23203989 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203990 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 23204048 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204049 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 23204108 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 23204109 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 23204168 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 23204169 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 23204228 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 23204229 acagctcttttaa 23204241 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 57 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 117 atc 119 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 57 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 117 atc 119 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 643/673 (95%), Gaps = 6/673 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 154278 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 154279 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 154338 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 154339 gccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 154397 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 154398 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 154457 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 154458 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 154517 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154518 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 154577 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 154578 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttcta 154637 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154638 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 154696 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154697 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 154756 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 154757 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 154816 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 154817 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 154876 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 154877 acagctcttttaa 154889
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 643/673 (95%), Gaps = 6/673 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggcta 38392 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 38393 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 38452 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38453 gccctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 38511 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 38512 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 38571 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 38572 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 38631 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38632 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 38691 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 38692 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttcta 38751 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38752 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 38810 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38811 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 38870 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38871 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 38930 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 38931 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 38990 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 38991 acagctcttttaa 39003
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 587/605 (97%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgta-ccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaatac 907 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 906 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 847 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 846 gtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 787 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 786 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 727 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 726 cttaa 722
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 642/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaag-ctgcggcta 5614495 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 5614494 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 5614435 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 5614434 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 5614375 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 5614374 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 5614315 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 5614314 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 5614255 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614254 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 5614195 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614194 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 5614135 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614134 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 5614076 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614075 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 5614016 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 5614015 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 5613956 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 5613955 gtgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 5613896 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 5613895 acagctcttttaa 5613883 Score = 617 bits (311), Expect = e-173 Identities = 354/366 (96%), Gaps = 2/366 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 309 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 369 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 429 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 488 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13391200 Query: 489 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 548 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391199 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13391140 Query: 549 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 608 |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13391139 tgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 13391080 Query: 609 ccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctc 668 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 13391079 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctc 13391020 Query: 669 tcttaa 674 |||||| Sbjct: 13391019 tcttaa 13391014 Score = 297 bits (150), Expect = 2e-77 Identities = 170/177 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 469 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 529 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 588 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 589 agtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccc 645 | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13352194 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 57 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 254 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 283 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 334 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 368 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.59 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 252 ggtcagagctggcatatgccaa 273 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1051 bits (530), Expect = 0.0 Identities = 642/673 (95%), Gaps = 5/673 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggcta 61 |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||| || |||||||| ||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccgg-ctcgaactcgaatttgat-cactttccatatttcacaag-ctgcggcta 38379 Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 38380 gttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 38439 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38440 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccag 38499 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 38500 gtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctc 38559 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 38560 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 38619 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38620 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 38679 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38680 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 38739 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38740 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 38798 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38799 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 38858 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 38859 cggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcg 38918 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 38919 gtgaatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 38978 Query: 662 acagctctcttaa 674 |||||||| |||| Sbjct: 38979 acagctcttttaa 38991
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1049 bits (529), Expect = 0.0 Identities = 598/620 (96%), Gaps = 1/620 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 599/622 (96%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctcttaa 674 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatacagctctcttaa 722
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 578/594 (97%), Gaps = 1/594 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 140 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 141 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 200 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 201 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 260 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 261 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 320 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 321 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 381 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 970 Query: 441 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 910 Query: 501 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 850 Query: 561 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagt 620 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || Sbjct: 849 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 790 Query: 621 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 736
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 586/605 (96%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctct 745 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 744 cttaa 740
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1043 bits (526), Expect = 0.0 Identities = 595/617 (96%), Gaps = 1/617 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 118 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 177 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 178 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 238 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 298 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 357 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 358 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 418 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 477 ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 478 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 537 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 538 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 597 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 799 Query: 598 tgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 657 ||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 798 tgcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 658 aaatacagctctcttaa 674 ||||||||||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaa 722
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 583/602 (96%), Gaps = 1/602 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 132 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 133 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 192 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 193 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 253 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 313 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 373 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 433 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 492 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 493 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 553 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 612 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 853 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 794 Query: 613 ggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 672 | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 agttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctctt 734 Query: 673 aa 674 || Sbjct: 733 aa 732
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 591/612 (96%), Gaps = 1/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 121 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 181 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 240 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 241 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 301 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 360 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 361 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 421 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 480 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 481 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 540 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 541 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 660 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 766 Query: 661 tacagctctctt 672 || ||||||||| Sbjct: 765 tatagctctctt 754
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 640/672 (95%), Gaps = 5/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggct 60 ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||| Sbjct: 1391 gtatctaccgg-cttgaactcgaatttgat-cgctttccatatttcacaag-ctgcggct 1335 Query: 61 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 120 |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1334 agttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1275 Query: 121 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 180 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1274 cgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1215 Query: 181 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 240 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1214 ggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtct 1155 Query: 241 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1154 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1095 Query: 301 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1094 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttt 1035 Query: 361 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 975 Query: 421 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 480 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 481 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 541 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 600 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 796 Query: 601 ggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 660 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 795 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 736 Query: 661 tacagctctctt 672 |||||||||||| Sbjct: 735 tacagctctctt 724
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 593/615 (96%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 797 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaa 737 Query: 660 atacagctctcttaa 674 ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaa 722
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 641/674 (95%), Gaps = 5/674 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggnctcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggct 60 ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccgg-ctcgaactcgaatttgatt-gctttccatacttcacaag-ctgcggct 1365 Query: 61 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 120 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 121 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 180 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacct 1245 Query: 181 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtct 1185 Query: 241 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 300 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 301 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 360 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttt 1065 Query: 361 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 420 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 421 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 480 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 481 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 tgctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 541 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 600 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| Sbjct: 885 tcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtatttgc 826 Query: 601 ggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 660 ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 766 Query: 661 tacagctctcttaa 674 |||||||||||||| Sbjct: 765 tacagctctcttaa 752
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 622/650 (95%), Gaps = 4/650 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 aatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaag 82 |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1387 aatttgat-cgccttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgctag 1330 Query: 83 ctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgta 142 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgta 1270 Query: 143 cacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtc 202 ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1269 cacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtc 1210 Query: 203 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctg 262 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctg 1150 Query: 263 gcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggataccc 322 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1149 gcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagataccc 1090 Query: 323 agtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaata 382 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 agtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaata 1030 Query: 383 aatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccg 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1029 aatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccg 971 Query: 443 gagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcata 502 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 970 gcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcata 911 Query: 503 ccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaag 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct: 910 ccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtagg 851 Query: 563 ccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtag 622 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct: 850 ccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtag 791 Query: 623 tcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 672 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 790 tcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctctt 741
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 598/622 (96%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattataataggagcccctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctcttaa 674 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatacagctctcttaa 722
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1035 bits (522), Expect = 0.0 Identities = 591/613 (96%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 660 atacagctctctt 672 ||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctctt 724
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 575/592 (97%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 140 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 141 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 200 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 201 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 260 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 261 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 321 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 380 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 381 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 441 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 500 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 501 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 561 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagt 620 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 621 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctctt 697
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 575/592 (97%), Gaps = 1/592 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 140 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 141 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 200 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 201 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 260 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 261 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 321 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 380 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 381 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 441 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 500 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 501 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 561 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagt 620 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || || Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 621 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctctt 697
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1033 bits (521), Expect = 0.0 Identities = 596/620 (96%), Gaps = 1/620 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatacgg 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacataggc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatacagctctctt 724
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 589/611 (96%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 123 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 124 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 183 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 184 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 243 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 244 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 304 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 364 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 424 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 483 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 923 Query: 484 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 543 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 863 Query: 544 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 603 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 803 Query: 604 gaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 663 |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 802 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 743 Query: 664 agctctcttaa 674 ||||||||||| Sbjct: 742 agctctcttaa 732
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 615/643 (95%), Gaps = 3/643 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 33 cgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 91 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1307 cgccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttga 1249 Query: 92 taatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 151 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1248 taatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggctt 1189 Query: 152 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 211 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1129 Query: 212 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 271 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 ctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1069 Query: 272 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 331 ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 1009 Query: 332 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 391 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 tgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 949 Query: 392 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggata 451 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 948 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggata 890 Query: 452 tgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt 511 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 tgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattt 830 Query: 512 ttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcg 571 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 829 ttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcg 770 Query: 572 cggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcatt 631 |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||| Sbjct: 769 cggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaaatagtcatgcatt 710 Query: 632 acaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 674 |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| Sbjct: 709 acaataggaacccctaattcccttgcaaatgcagctctcttaa 667
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 589/611 (96%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 62 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 122 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 182 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 241 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 242 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 302 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 361 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 362 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 422 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 481 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 888 Query: 482 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 541 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 828 Query: 542 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 601 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 768 Query: 602 gtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 661 ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 767 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 708 Query: 662 acagctctctt 672 | ||||||||| Sbjct: 707 atagctctctt 697
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 564/578 (97%), Gaps = 1/578 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 95 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 154 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 155 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 215 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 274 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 275 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 334 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 335 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 394 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 395 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatga 454 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatga 919 Query: 455 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 859 Query: 515 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 799 Query: 575 caatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattaca 634 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 798 caataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattaca 739 Query: 635 ataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 738 ataggaacccctaattctctcgcaaaaacagctctctt 701
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 597/622 (95%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctcttaa 674 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatacagctctcttaa 722
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 597/622 (95%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaagta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctcttaa 674 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatacagctctcttaa 722
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 597/622 (95%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| Sbjct: 863 tgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaagta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctcttaa 674 ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatgcagctctcttaa 722
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 527/529 (99%), Gaps = 1/529 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 146 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 205 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115 Query: 206 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 265 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055 Query: 266 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995 Query: 326 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935 Query: 386 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggag 445 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggag 1876 Query: 446 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1875 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1816 Query: 506 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 565 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1815 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 1756 Query: 566 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtca 625 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1755 ttgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 1696 Query: 626 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 674 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1695 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 1647
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 603/629 (95%), Gaps = 2/629 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 44 ttcacaagnctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattac 103 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 ttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattac 1306 Query: 104 cttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactc 163 |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1305 cttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccaccc 1246 Query: 164 gattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 223 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaatt 1186 Query: 224 gtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatac 283 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1185 gtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaatac 1126 Query: 284 cacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 343 | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatac 1066 Query: 344 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca 1006 Query: 404 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccccca 463 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccccca 947 Query: 464 gacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatca 523 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 gacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatca 887 Query: 524 ataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtga 583 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct: 886 ataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatga 827 Query: 584 gccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacc 643 |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 826 gccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcc 767 Query: 644 cctaattctctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 766 cctaattccctcgcaaatatagctctctt 738
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 587/609 (96%), Gaps = 1/609 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1284 Query: 124 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1283 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1224 Query: 184 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 243 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1223 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1164 Query: 244 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1163 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1104 Query: 304 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 363 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1044 Query: 364 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 984 Query: 424 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 483 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 925 Query: 484 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 543 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 865 Query: 544 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 603 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 805 Query: 604 gaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 663 ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 804 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatat 745 Query: 664 agctctctt 672 ||||||||| Sbjct: 744 agctctctt 736
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 598/621 (96%), Gaps = 3/621 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgcga 111 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcacga 1284 Query: 112 gcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 171 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 172 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaataca 231 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 232 gaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 291 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1163 gaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 292 gctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 351 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 352 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgc 984 Query: 412 tccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacg 471 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 472 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 531 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 532 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagt 591 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 864 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagt 805 Query: 592 agtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattc 651 |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 804 agtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtcatgcattactataggaacccctaattc 745 Query: 652 tctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 629/661 (95%), Gaps = 4/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 tcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactcc 73 |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgat-ctccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 74 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 133 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 134 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 193 | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 194 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcgg 1172 Query: 254 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 313 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 314 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 374 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 433 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 434 ctgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 493 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 494 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 553 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 932 aaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 873 Query: 554 agaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccg 613 ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 872 agaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctcca 813 Query: 614 gntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctta 673 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 812 gttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctctta 753 Query: 674 a 674 | Sbjct: 752 a 752
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 595/620 (95%), Gaps = 1/620 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 595/620 (95%), Gaps = 1/620 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|AY622897.1| Olyra latifolia ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 591/615 (96%), Gaps = 1/615 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 118 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 177 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 178 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 237 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaactgtaatacggaatca 1158 Query: 238 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 297 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1157 tctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccacc 1098 Query: 298 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 357 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatct 1038 Query: 358 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 418 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 477 ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatcccccccagacatacgcaatgc 919 Query: 478 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 537 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 538 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 597 ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 858 tgctcgatgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 799 Query: 598 tgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 657 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 798 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 658 aaatacagctctctt 672 ||||||||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctctt 724
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 596/622 (95%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcatggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctcttaa 674 || ||||||||||||||||||| Sbjct: 743 cttgcaaatacagctctcttaa 722
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 596/622 (95%), Gaps = 1/622 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 ggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaacta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctcttaa 674 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatacagctctcttaa 722
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 583/605 (96%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1279 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattt 1219 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1218 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1159 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1158 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1099 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1039 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 979 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 920 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 919 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaat 860 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 859 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcagtgaatcc 800 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 799 cccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaaatacagctct 740 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 739 cttaa 735
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 589/613 (96%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 120 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 179 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 180 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 239 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 gggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 240 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 299 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccgg 1096 Query: 300 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 359 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 360 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 420 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 479 ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 480 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 539 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 540 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 599 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 600 cggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 659 | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cagtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 660 atacagctctctt 672 |||| |||||||| Sbjct: 736 ataccgctctctt 724
>gb|M91626.1|BAMCPRBCL Bamboo chloroplast ribulosebisphosphate (rbcL) gene, partial cds Length = 1324 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 582/605 (96%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1324 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1265 Query: 130 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 189 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatty 1205 Query: 190 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1204 ycccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1145 Query: 250 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 309 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1144 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1085 Query: 310 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1025 Query: 370 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 965 Query: 430 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 489 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 906 Query: 490 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 549 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 905 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaat 846 Query: 550 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 609 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 845 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcagtgaatcc 786 Query: 610 cccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 669 ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 785 cccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaaatacagctct 726 Query: 670 cttaa 674 ||||| Sbjct: 725 cttaa 721
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 628/661 (95%), Gaps = 4/661 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 15 tcgaactcgaatttgatacgccttcc-tacttcacaagnctgcggctagttcaggactcc 73 |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgat-ctccttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 74 atttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttac 133 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 134 gagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 193 | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 194 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcgg 253 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcgg 1172 Query: 254 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggca 313 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 tcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggca 1112 Query: 314 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcat 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 tggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcat 1052 Query: 374 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctacta 433 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 cgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctacta 992 Query: 434 ctgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 493 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 ctgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 494 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 553 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 932 aaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 873 Query: 554 agaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccg 613 ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || Sbjct: 872 agaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctcca 813 Query: 614 gntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctta 673 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 812 gttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctctta 753 Query: 674 a 674 | Sbjct: 752 a 752
>gb|U31441.1|RNU31441 Rytidosperma nudiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 594/620 (95%), Gaps = 1/620 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 112 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttggtagcttctcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 113 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctg 172 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 173 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 232 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatacgg 1163 Query: 233 aatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaag 292 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct: 1162 aatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaag 1103 Query: 293 ctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcac 352 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1102 ccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagacaccgcgagcac 1043 Query: 353 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgtt 412 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1042 gatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcacgtt 983 Query: 413 ccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 472 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 ccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 473 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 533 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagta 592 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaagta 804 Query: 593 gtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattct 652 ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 803 gtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcc 744 Query: 653 ctcgcaaatacagctctctt 672 |||||||||||||||||||| Sbjct: 743 ctcgcaaatacagctctctt 724
>gb|AY626351.1| Eriachne triseta ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1320 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 587/611 (96%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 123 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1320 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1261 Query: 124 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1201 Query: 184 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 243 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1200 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1141 Query: 244 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1140 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagcaaccggtata 1081 Query: 304 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 363 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1080 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatccttttca 1021 Query: 364 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 423 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 ataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 961 Query: 424 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 483 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 902 Query: 484 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 543 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 901 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 842 Query: 544 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 603 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| Sbjct: 841 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataattagacaaactagtatttgcggt 782 Query: 604 gaatcccccggntaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 663 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 781 gaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 722 Query: 664 agctctcttaa 674 ||||||||||| Sbjct: 721 agctctcttaa 711
>emb|AJ746280.1| Agrostis stolonifera chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1316 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 568/586 (96%), Gaps = 1/586 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 89 ggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaag 148 |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1316 ggataatttccttaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacagg 1257 Query: 149 cttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaag 208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1256 cttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgccctaaag 1197 Query: 209 ttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatat 268 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 ttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatat 1137 Query: 269 gccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcct 328 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1136 gccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataacaccaggcatggatgcccagtcct 1077 Query: 329 gagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 gagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaa 1017 Query: 389 caaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtgg 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1016 caaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtgg 958 Query: 449 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 508 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 957 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 898 Query: 509 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 568 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 897 tttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattg 838 Query: 569 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgc 628 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||| Sbjct: 837 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgc 778 Query: 629 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 777 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 732
>emb|AJ746279.1| Holcus lanatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1301 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 565/582 (97%), Gaps = 1/582 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 152 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1301 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttc 1242 Query: 153 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 212 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1182 Query: 213 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 272 ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 cccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1122 Query: 273 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 332 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1121 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcttgagt 1062 Query: 333 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1002 Query: 393 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatat 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1001 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtgaatat 943 Query: 453 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 883 Query: 513 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 882 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 823 Query: 573 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggntaagtagtcatgcatta 632 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| Sbjct: 822 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcatta 763 Query: 633 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 762 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaa 721 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,851,005 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4851005 Number of successful extensions: 137622 Number of sequences better than 10.0: 15120 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15052 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 80 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 94265 Number of HSP's gapped (non-prelim): 23511 length of query: 674 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 651 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 11160286805304 effective search space used: 11160286805304 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)