Clone Name | rbasd21c20 |
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Clone Library Name | barley_pub |
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>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 510/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 510/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 509/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 508/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 508/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 508/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 508/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 508/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaagtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 507/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 || || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 ttkagstaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 508/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 508/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 507/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatantatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctakttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 507/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggagcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 504/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 504/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 504/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 504/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 507/517 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 506/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttnnntaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 503/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1483 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1424 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1423 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1364 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1304 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1303 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1244 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1184 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1124 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1064 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1004 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 971
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 503/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1082 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 749
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 503/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1082 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 749
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 506/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 503/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 503/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 503/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 502/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 sscccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 506/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 503/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 502/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcg 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 503/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 503/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 506/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cgctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 503/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56333 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 56274 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56273 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 56214 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56213 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 56154 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 56153 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 56094 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56093 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 56034 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56033 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 55974 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55973 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 55914 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55913 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 55854 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55853 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 55821
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 503/513 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1519 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1460 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1459 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1400 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1399 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1340 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1339 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1280 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1220 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1219 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1160 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1159 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1100 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1040 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1007
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 504/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 502/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1295 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 502/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 502/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1478 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1021
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1478 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1021
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1478 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1021
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1478 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1021
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1478 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1021
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1336 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1276 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1216 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1215 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1156 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1096 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1036 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1035 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 976 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 916 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 879
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 502/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 501/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcs 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 sscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 502/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 502/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 505/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 501/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggct 1365 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1305 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1185 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 500/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcs 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 sscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 501/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 504/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 504/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 504/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 504/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1345 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1285 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1225 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1224 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1165 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1105 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1045 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 985 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 925 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 888
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 503/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1478 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1021
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 504/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1541 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1482 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1481 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1422 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1362 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1361 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1302 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1242 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1182 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1122 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1062 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1025
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 504/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1345 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1285 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1225 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1224 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1165 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1105 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1045 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 985 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 925 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 888
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 503/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 503/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 503/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 504/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgctgccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 503/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ngctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagataatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 502/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1478 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttcccc 1118 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1021
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 503/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1541 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1482 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1481 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1422 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1362 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1361 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1302 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1242 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1182 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1122 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1062 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1025
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 503/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1338 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1337 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1278 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1218 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1217 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1158 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1098 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 cggtataacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1038 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 978 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 918 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 881
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 503/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1479 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1420 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1419 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1360 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1300 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1299 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1240 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1180 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1120 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1060 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1000 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 963
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 503/517 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcggccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 500/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgacca 1082 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 749
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 499/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 500/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1541 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1482 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1481 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1422 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1362 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1361 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1302 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1242 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1182 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1122 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1062 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatt 513 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatt 1029
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 500/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 atagtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1334 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1274 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1214 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1213 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1154 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1094 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1034 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 974 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 914 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 881
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 499/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcs 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 sscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 499/513 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 960
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 496/513 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcs 1415 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 sscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttt 1175 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 501/517 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1541 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1482 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1481 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1422 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnn 1362 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1361 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1302 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1242 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1182 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1122 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1062 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1025
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 501/517 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 500/517 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 501/517 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 497/513 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1365 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1185 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 agcttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 500/517 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1428 atcgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 497/513 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1522 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1463 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1462 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1403 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1343 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||| Sbjct: 1342 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1283 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1223 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1163 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1103 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 agcttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1043 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1010
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 496/513 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1404 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggct 1345 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1285 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacca 1225 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcc 1165 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttct 985 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 892
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 499/517 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1388 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1329 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1328 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1269 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1268 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1209 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1208 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1149 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1089 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1029 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 969 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 909 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 872
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 499/517 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 agctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 890 bits (449), Expect = 0.0 Identities = 493/513 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 atagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1475 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1474 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1415 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1414 sscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1355 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1354 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1295 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1235 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1234 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1175 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1115 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1114 aacttacctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnna 1055 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1022
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 491/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtc 1284 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1224 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||| Sbjct: 1223 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1164 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1163 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1104 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1044 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 984 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 924 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 atacacgaaaatgcataccatgatttttc 895
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 479/495 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 82 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 83 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 142 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 143 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaagga 202 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 203 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcaga 262 |||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 263 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 323 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 382 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 383 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 442 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 977 Query: 443 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 502 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 917 Query: 503 ataccatgatttttc 517 ||||||||||||||| Sbjct: 916 ataccatgatttttc 902
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55043 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55042 atacacggaaatgcataccatgatttttc 55014
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55043 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55042 atacacggaaatgcataccatgatttttc 55014
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55351 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55350 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55291 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 55290 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55231 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55230 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55171 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55111 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55051 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55050 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 54991 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54990 atacacggaaatgcataccatgatttttc 54962
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 125692 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125691 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 125632 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 125631 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 125572 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 125571 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 125512 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125511 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 125452 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125451 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 125392 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125391 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 125332 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125331 atacacggaaatgcataccatgatttttc 125303 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30632 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30631 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30572 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 30571 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30512 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30511 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 30452 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30451 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 30392 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 30332 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30331 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 30272 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30271 atacacggaaatgcataccatgatttttc 30243
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124359 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124358 atacacggaaatgcataccatgatttttc 124330 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29778 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29777 atacacggaaatgcataccatgatttttc 29749
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124359 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124358 atacacggaaatgcataccatgatttttc 124330 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29778 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29777 atacacggaaatgcataccatgatttttc 29749
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55395 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55394 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55335 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 55334 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55275 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55274 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55215 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55155 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55095 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55094 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55035 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55034 atacacggaaatgcataccatgatttttc 55006
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Plus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 33527269 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527270 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 33527329 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 33527330 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 33527389 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 33527390 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 33527449 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527450 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 33527509 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527510 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 33527569 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527570 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 33527629 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527630 atacacggaaatgcataccatgatttttc 33527658
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Plus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 72466 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72467 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 72526 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 72527 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 72586 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 72587 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 72646 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72647 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 72706 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72707 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 72766 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72767 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 72826 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72827 atacacggaaatgcataccatgatttttc 72855
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1356 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1296 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 1295 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1236 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1056 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 996 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 atacacggaaatgcataccatgatttttc 967
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1099 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1039 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 1038 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 979 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 978 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 919 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 859 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 799 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 739 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 738 atacacggaaatgcataccatgatttttc 710
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55330 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55329 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55270 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 55269 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55210 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55209 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55150 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55149 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55090 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55089 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55030 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55029 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 54970 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 54969 atacacggaaatgcataccatgatttttc 54941
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 489/509 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1721 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1720 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1661 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 1660 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1601 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1421 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1361 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1360 atacacggaaatgcataccatgatttttc 1332 Score = 58.0 bits (29), Expect = 3e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 91 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 488/509 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 491/513 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 488/509 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | || || |||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1181 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaact 1001 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacgaaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 494/517 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 acctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 ttttgctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 491/513 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1411 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1352 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1351 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1292 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1291 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1232 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1231 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1172 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1171 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1112 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1052 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 992 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 932 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttc 899
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 488/509 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1285 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1225 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||| Sbjct: 1224 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1165 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1164 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1105 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1045 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 985 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 925 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 atacacgaaaatgcataccatgatttttc 896
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 491/513 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1409 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1350 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1290 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1289 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1230 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1229 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1170 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1169 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1110 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1050 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 990 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 930 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttc 897
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 494/517 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 atcgatagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgc 1284 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1283 ggcaagttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaag 1224 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1223 atcgcgcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgc 1164 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1163 acccggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1104 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 atccccaaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1044 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cggtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 984 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 924 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 ttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 864 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 827
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 494/517 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgc 1369 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgc 1249 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1248 acccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1129 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatc 1069 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 491/513 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1423 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1364 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1304 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1303 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1244 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1243 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1184 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1183 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1124 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1064 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1004 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 944 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttc 911
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 488/509 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 53605 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53604 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 53545 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 53544 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 53485 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 53484 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 53425 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53424 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 53365 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53364 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 53305 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53304 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 53245 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53244 atacacggaaatgcataccatgatttttc 53216
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 488/509 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 128538 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128537 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 128478 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 128477 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 128418 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 128417 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 128358 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128357 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 128298 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128297 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 128238 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128237 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 128178 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128177 atacacggaaatgcataccatgatttttc 128149
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 488/509 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10347213 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347212 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10347153 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 10347152 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10347093 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10347092 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10347033 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10346913 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346912 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 10346853 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346852 atacacggaaatgcataccatgatttttc 10346824
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 488/509 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10353252 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353251 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10353192 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 10353191 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10353132 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10353131 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10353072 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353071 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10353012 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353011 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10352952 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352951 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 10352892 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352891 atacacggaaatgcataccatgatttttc 10352863
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 488/509 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1688 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1687 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1628 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 1627 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1568 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1567 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1508 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1388 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 tacctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1328 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 atacacggaaatgcataccatgatttttc 1299
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 490/509 (96%), Gaps = 2/509 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124637 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124636 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124577 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||| Sbjct: 124576 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 124517 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124516 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 124458 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124457 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 124399 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124398 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124339 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124338 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124279 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124278 atacacggaaatgcataccatgatttttc 124250 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 490/509 (96%), Gaps = 2/509 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30110 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30109 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30050 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||| Sbjct: 30049 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 29990 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 29872 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29812 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29811 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29752 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29751 atacacggaaatgcataccatgatttttc 29723
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 850 bits (429), Expect = 0.0 Identities = 448/456 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 62 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 122 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 181 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 182 ccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcg 241 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 242 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 302 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 362 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 422 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 482 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 892
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 446/454 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 856
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 464/478 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 40 tttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataat 99 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1369 tttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataat 1310 Query: 100 ttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 159 |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1309 ttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 160 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 219 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 220 accaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 279 ||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 280 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 339 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 340 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 400 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatc 459 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatc 950 Query: 460 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 892
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 446/454 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 856
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 445/453 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 892
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 490/513 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 5 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggct 64 ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgttttttc 912
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 472/489 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 29 aatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 88 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 89 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 148 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 149 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcct 208 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 209 aaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 268 |||||||||||||||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 269 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 328 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 329 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 389 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 449 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 508 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 509 tgatttttc 517 ||||||||| Sbjct: 905 tgatttttc 897
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 487/509 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614443 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614442 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614383 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 5614382 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614323 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614143 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614142 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 5614083 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614082 atacacggaaatgcataccatgatttttc 5614054 Score = 367 bits (185), Expect = 2e-98 Identities = 198/201 (98%), Gaps = 1/201 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 313 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 373 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 433 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 492 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 493 acggaaatgcataccatgatt 513 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgatt 13436904 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 116 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 91.7 bits (46), Expect = 2e-15 Identities = 46/46 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 472 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 13398051 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 258 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 287 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 338 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.45 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 256 ggtcagagctggcatatgccaa 277 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 487/509 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614432 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614431 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614372 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 5614371 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614312 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614311 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614252 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614251 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614192 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614191 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614132 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614131 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 5614072 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614071 atacacggaaatgcataccatgatttttc 5614043 Score = 367 bits (185), Expect = 2e-98 Identities = 198/201 (98%), Gaps = 1/201 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 313 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 373 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 433 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 492 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 493 acggaaatgcataccatgatt 513 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgatt 13391178 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 116 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 91.7 bits (46), Expect = 2e-15 Identities = 46/46 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 472 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 13352325 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 258 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 287 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 338 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 372 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.45 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 256 ggtcagagctggcatatgccaa 277 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 487/509 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38442 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38443 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38502 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 38503 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38562 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 38742 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38743 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 38802 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38803 atacacggaaatgcataccatgatttttc 38831
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 842 bits (425), Expect = 0.0 Identities = 438/444 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttc 193 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttc 900
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 487/510 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 8 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagt 67 |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334 Query: 68 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 127 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1274 Query: 128 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 187 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214 Query: 188 gcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcccca 247 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154 Query: 248 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094 Query: 308 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 367 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034 Query: 368 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 974 Query: 428 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 914 Query: 488 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 884
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 445/454 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 892
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 492/517 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 1 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgc 60 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 atcgatggtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgc 1339 Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1338 ggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaag 1279 Query: 121 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 180 ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 181 accaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantc 240 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 241 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 300 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1158 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1099 Query: 301 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1098 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatc 1039 Query: 361 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 421 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 481 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 487/509 (95%), Gaps = 1/509 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 23203693 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203694 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 23203752 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 23203753 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 23203812 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 23203992 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203993 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 23204052 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23204053 atacacggaaatgcataccatgatttttc 23204081 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 121 atc 123 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 121 atc 123 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 487/509 (95%), Gaps = 1/509 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 154341 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154342 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 154400 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 154401 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 154460 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 154461 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 154520 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 154581 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 154640 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154641 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 154700 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154701 atacacggaaatgcataccatgatttttc 154729
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 487/509 (95%), Gaps = 1/509 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38455 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38456 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38514 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 38515 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38574 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38575 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38634 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38635 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38694 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38695 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 38754 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38755 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 38814 Query: 489 atacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38815 atacacggaaatgcataccatgatttttc 38843
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 437/444 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttc 193 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttc 886
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 446/456 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 62 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 122 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 181 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 182 ccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcg 241 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 242 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 302 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 361 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 362 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 422 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 482 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 892
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 462/478 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 40 tttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataat 99 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1369 tttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataat 1310 Query: 100 ttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 159 |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1309 ttcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 160 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 219 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 220 accaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 279 ||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 280 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 339 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 340 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 400 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatc 459 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatc 950 Query: 460 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 892
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 486/510 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 8 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagt 67 ||||| ||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1277 Query: 68 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 127 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1276 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217 Query: 128 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 187 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1157 Query: 188 gcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcccca 247 || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1097 Query: 248 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtata 1037 Query: 308 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1036 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttca 977 Query: 368 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917 Query: 428 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagct 857 Query: 488 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 856 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 827
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 443/454 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 876
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 443/454 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 944 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 910
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 443/454 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 876
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 823 bits (415), Expect = 0.0 Identities = 443/454 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 819 bits (413), Expect = 0.0 Identities = 435/444 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttc 193 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttc 900
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 442/454 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 893
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 450/465 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 53 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 112 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 113 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 172 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 173 gctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 232 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 233 ncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 292 | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 293 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 352 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 353 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 412 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 413 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 472 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 939 Query: 473 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 894
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 468/489 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 29 aatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 88 |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 89 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 148 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 149 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcct 208 ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 209 aaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 268 |||||||||||||||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 269 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 328 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 329 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 389 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 449 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 508 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 509 tgatttttc 517 ||||||||| Sbjct: 905 tgatttttc 897
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 811 bits (409), Expect = 0.0 Identities = 434/444 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttc 193 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttc 900
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 811 bits (409), Expect = 0.0 Identities = 434/444 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttc 193 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttc 902
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 811 bits (409), Expect = 0.0 Identities = 443/456 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 62 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 122 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 181 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 182 ccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcg 241 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 242 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 301 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 302 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 362 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 422 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 481 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 933 Query: 482 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 897
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 811 bits (409), Expect = 0.0 Identities = 443/456 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 62 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 122 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 181 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 182 ccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcg 241 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 242 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 302 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 361 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 362 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 422 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 481 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 482 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 893
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 809 bits (408), Expect = 0.0 Identities = 445/459 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 59 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 118 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 119 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 178 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 179 gcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnan 238 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 239 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 298 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 299 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 359 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 418 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 419 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 478 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 479 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 809 bits (408), Expect = 0.0 Identities = 448/463 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 809 bits (408), Expect = 0.0 Identities = 448/463 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 483/510 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 8 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagt 67 ||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1858 gtatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1799 Query: 68 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 127 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1798 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1739 Query: 128 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 187 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1738 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1679 Query: 188 gcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcccca 247 || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| Sbjct: 1678 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1619 Query: 248 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1618 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1559 Query: 308 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 367 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1558 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1499 Query: 368 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1498 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1439 Query: 428 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 487 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1438 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagct 1379 Query: 488 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1378 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 1349
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 441/454 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 876
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 438/450 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 68 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 128 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 187 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 188 gcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcccca 247 || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 248 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 308 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 368 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 428 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 487 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 488 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccgtgatttttc 912
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 441/454 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 474/498 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 20 tcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 79 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 80 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 139 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 140 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaa 199 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 200 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtc 259 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 260 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 319 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 320 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 380 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 439 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 440 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 499 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 500 tgcataccatgatttttc 517 || ||||||||||||||| Sbjct: 929 tgtataccatgatttttc 912
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 805 bits (406), Expect = 0.0 Identities = 458/477 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 100 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 ttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1329 Query: 101 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 160 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 1269 Query: 161 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 220 ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 gccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1209 Query: 221 ccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 280 |||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 ccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1149 Query: 281 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 340 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 tgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaa 1089 Query: 341 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1029 Query: 401 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct: 1028 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatct 969 Query: 461 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 803 bits (405), Expect = 0.0 Identities = 442/456 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 62 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 122 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 181 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 182 ccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcg 241 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 242 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 302 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 362 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 421 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 422 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 481 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 935 Query: 482 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 899
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 435/448 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 70 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 129 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 130 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 189 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 190 nttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaa 249 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 250 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 310 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 369 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 370 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 430 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 489 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 490 tacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttc 900
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 440/454 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 892
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 437/450 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 68 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 128 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 187 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 188 gcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcccca 247 || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 248 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 308 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 367 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 368 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 428 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 931 Query: 488 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 901
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 482/510 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 8 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagt 67 ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 gtatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1779 Query: 68 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 127 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1778 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1719 Query: 128 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 187 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1718 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggt 1659 Query: 188 gcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcccca 247 || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| Sbjct: 1658 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1599 Query: 248 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1598 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1539 Query: 308 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 367 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1538 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1479 Query: 368 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1478 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1419 Query: 428 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 487 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1418 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagct 1359 Query: 488 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1358 aatacacggaaatggataccatgatttttc 1329
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 434/446 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 72 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 132 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnt 191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 192 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaaga 251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 252 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 312 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 372 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 432 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 491 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 492 cacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccgtgatttttc 882
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 473/498 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 20 tcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 79 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 80 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 139 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 140 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaa 199 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 200 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtc 259 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 260 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 319 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 320 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 379 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 380 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 439 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 440 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 499 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 500 tgcataccatgatttttc 517 || ||||||||||||||| Sbjct: 929 tgtataccatgatttttc 912
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 797 bits (402), Expect = 0.0 Identities = 466/489 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 29 aatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 88 |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 89 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 148 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 149 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcct 208 ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 209 aaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 268 |||||||||||||||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 269 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 328 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 329 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 388 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 389 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 968 Query: 449 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 508 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 967 tggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 908 Query: 509 tgatttttc 517 ||||||||| Sbjct: 907 tgatttttc 899
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 797 bits (402), Expect = 0.0 Identities = 457/477 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 100 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1372 ttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1313 Query: 101 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 160 ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1312 tcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 1253 Query: 161 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 220 ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1252 gccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1193 Query: 221 ccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 280 |||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1192 ccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacg 1133 Query: 281 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 340 |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1132 tgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaa 1073 Query: 341 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1072 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1013 Query: 401 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1012 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatct 953 Query: 461 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 952 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttc 896
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 795 bits (401), Expect = 0.0 Identities = 432/444 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttc 193 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttc 900
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 795 bits (401), Expect = 0.0 Identities = 432/444 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttc 193 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttc 900
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 795 bits (401), Expect = 0.0 Identities = 432/444 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttc 193 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttc 900
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 795 bits (401), Expect = 0.0 Identities = 441/456 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 62 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 122 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 181 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 182 ccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcg 241 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 242 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 301 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 302 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 361 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 362 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 422 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 481 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 482 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 892
>dbj|AK062203.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-046-G09, full insert sequence Length = 838 Score = 795 bits (401), Expect = 0.0 Identities = 459/480 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgttttccatacttcacaagctgcggctagtt 68 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 480 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 421 Query: 69 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 128 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| Sbjct: 420 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaaggtcgcgcc 361 Query: 129 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 188 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 360 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 301 Query: 189 cnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaa 248 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||| Sbjct: 300 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 241 Query: 249 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 240 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 181 Query: 309 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 180 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 121 Query: 369 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 61 Query: 429 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 488 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 60 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 793 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 437/451 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 126 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 127 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 186 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 187 tgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcccc 246 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 247 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 306 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 307 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 367 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 426 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 427 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 486 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 487 taatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttc 873
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 793 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 437/451 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 126 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 127 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 186 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 187 tgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcccc 246 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 247 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 306 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 307 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 367 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 426 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 427 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 486 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 487 taatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttc 873
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 793 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 447/463 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 792
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 793 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 446/463 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 793 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 446/463 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 793 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 446/463 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 793 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 446/463 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 434/448 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 70 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 129 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 130 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 189 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 190 nttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaa 249 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 250 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 309 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 310 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 369 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 370 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 430 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 489 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 490 tacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttc 900
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 439/454 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 893
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 439/454 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 896
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 439/454 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttc 882
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 789 bits (398), Expect = 0.0 Identities = 456/477 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 100 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 120469 ttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatt 120410 Query: 101 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 160 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 120409 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 120350 Query: 161 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 220 ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120349 gccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 120290 Query: 221 ccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 280 |||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120289 ccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 120230 Query: 281 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 340 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120229 tgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 120170 Query: 341 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 400 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120169 aagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 120110 Query: 401 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 460 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120109 aaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 120050 Query: 461 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120049 ccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 119993
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 789 bits (398), Expect = 0.0 Identities = 456/477 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 100 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 58842 ttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatt 58783 Query: 101 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 160 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 58782 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 58723 Query: 161 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 220 ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58722 gccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 58663 Query: 221 ccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 280 |||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58662 ccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 58603 Query: 281 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 340 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58602 tgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 58543 Query: 341 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 400 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58542 aagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 58483 Query: 401 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 460 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58482 aaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 58423 Query: 461 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58422 ccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 58366
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 787 bits (397), Expect = 0.0 Identities = 431/444 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttc 193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttc 900
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 787 bits (397), Expect = 0.0 Identities = 431/444 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttc 193 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttc 900
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 785 bits (396), Expect = 0.0 Identities = 445/463 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>emb|AJ746283.1| Aristida congesta subsp. barbicollis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 785 bits (396), Expect = 0.0 Identities = 445/463 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttc 882
>gb|U31359.1|ACU31359 Aristida congesta subsp. barbicollis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 785 bits (396), Expect = 0.0 Identities = 445/463 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttc 882
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 785 bits (396), Expect = 0.0 Identities = 445/463 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 785 bits (396), Expect = 0.0 Identities = 445/463 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttc 882
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 783 bits (395), Expect = 0.0 Identities = 417/426 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 92 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 151 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 152 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaa 211 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 212 gttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 271 ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 272 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 332 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 392 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 452 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 511 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 512 tttttc 517 |||||| Sbjct: 879 tttttc 874
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 783 bits (395), Expect = 0.0 Identities = 417/426 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 92 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 151 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 152 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaa 211 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 212 gttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 271 ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 272 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 332 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 392 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 452 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 511 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 512 tttttc 517 |||||| Sbjct: 879 tttttc 874
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 783 bits (395), Expect = 0.0 Identities = 438/454 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttc 882
>gb|AY622891.1| Ehrharta calycina ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 783 bits (395), Expect = 0.0 Identities = 438/454 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcacgctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1216 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccgaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 tgctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 781 bits (394), Expect = 0.0 Identities = 455/477 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 100 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1388 ttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatt 1329 Query: 101 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 160 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1328 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1269 Query: 161 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 220 ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 gccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1209 Query: 221 ccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 280 |||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 ccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1149 Query: 281 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 340 |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 tgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 1089 Query: 341 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 400 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 aagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1029 Query: 401 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 460 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 aaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 969 Query: 461 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 781 bits (394), Expect = 0.0 Identities = 455/477 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 100 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 58261 ttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatt 58202 Query: 101 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 160 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 58201 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 58142 Query: 161 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 220 ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58141 gccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 58082 Query: 221 ccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 280 |||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58081 ccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 58022 Query: 281 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 340 |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58021 tgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 57962 Query: 341 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 400 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57961 aagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 57902 Query: 401 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 460 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57901 aaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 57842 Query: 461 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57841 ccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 57785
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 781 bits (394), Expect = 0.0 Identities = 455/477 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 100 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 58271 ttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatt 58212 Query: 101 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 160 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 58211 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 58152 Query: 161 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 220 ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58151 gccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 58092 Query: 221 ccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 280 |||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58091 ccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 58032 Query: 281 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 340 |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58031 tgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 57972 Query: 341 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 400 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57971 aagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 57912 Query: 401 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 460 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57911 aaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 57852 Query: 461 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57851 ccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 57795
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 781 bits (394), Expect = 0.0 Identities = 455/477 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 100 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1777 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttgataatt 1718 Query: 101 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 160 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1717 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtacacaggcttctaaa 1658 Query: 161 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 220 ||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1657 gccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1598 Query: 221 ccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 280 |||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1597 ccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1538 Query: 281 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 340 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1537 tgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaa 1478 Query: 341 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 400 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 aagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1418 Query: 401 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 460 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 aaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 1358 Query: 461 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 ccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1301
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 430/444 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttc 193 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttc 900
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 430/444 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttc 193 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttc 900
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 777 bits (392), Expect = 0.0 Identities = 444/463 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 777 bits (392), Expect = 0.0 Identities = 444/463 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 777 bits (392), Expect = 0.0 Identities = 444/463 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 777 bits (392), Expect = 0.0 Identities = 444/463 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|U31104.1|ECU31104 Eragrostis capensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 777 bits (392), Expect = 0.0 Identities = 444/463 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcttgataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 775 bits (391), Expect = 0.0 Identities = 416/426 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 92 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 151 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 152 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaa 211 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 212 gttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 271 ||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 272 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 332 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 392 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 452 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 511 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 512 tttttc 517 |||||| Sbjct: 876 tttttc 871
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 775 bits (391), Expect = 0.0 Identities = 416/426 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 92 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 151 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 152 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaa 211 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 212 gttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 271 ||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 272 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 332 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 392 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 452 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 511 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 512 tttttc 517 |||||| Sbjct: 876 tttttc 871
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 775 bits (391), Expect = 0.0 Identities = 437/454 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 64 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 124 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 183 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 184 aggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtc 243 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 244 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 304 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 363 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 364 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 424 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 483 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 484 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|AY506529.1| Zea mays strain NB mitochondrion, complete genome Length = 569630 Score = 773 bits (390), Expect = 0.0 Identities = 454/477 (95%) Strand = Plus / Plus Query: 41 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 100 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 349068 ttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatt 349127 Query: 101 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 160 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 349128 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 349187 Query: 161 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 220 ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349188 gccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 349247 Query: 221 ccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 280 |||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349248 ccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 349307 Query: 281 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 340 |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349308 tgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 349367 Query: 341 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 400 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349368 aagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 349427 Query: 401 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 460 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349428 aaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 349487 Query: 461 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349488 ccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 349544
>gb|DQ490952.1| Zea mays subsp. mays genotype male-fertile NA mitochondrion, complete genome Length = 701046 Score = 773 bits (390), Expect = 0.0 Identities = 454/477 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 100 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 206641 ttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatt 206582 Query: 101 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 160 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 206581 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 206522 Query: 161 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 220 ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206521 gccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 206462 Query: 221 ccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 280 |||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206461 ccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 206402 Query: 281 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 340 |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206401 tgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 206342 Query: 341 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 400 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206341 aagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 206282 Query: 401 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 460 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206281 aaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 206222 Query: 461 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206221 ccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 206165 Score = 773 bits (390), Expect = 0.0 Identities = 454/477 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 41 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 100 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 77949 ttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataatt 77890 Query: 101 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 160 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 77889 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 77830 Query: 161 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 220 ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77829 gccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 77770 Query: 221 ccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 280 |||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77769 ccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 77710 Query: 281 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 340 |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77709 tgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 77650 Query: 341 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 400 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77649 aagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 77590 Query: 401 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 460 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77589 aaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 77530 Query: 461 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77529 ccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 77473
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 773 bits (390), Expect = 0.0 Identities = 436/453 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 65 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 125 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 184 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 185 ggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcc 244 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 245 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 305 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 364 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 365 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 425 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 484 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 485 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttc 912
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 447/468 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 50 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 109 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 110 tcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcga 169 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaagatctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgg 1242 Query: 170 ttagctgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 229 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 ttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 1182 Query: 230 aatncnnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacca 289 ||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccc 1122 Query: 290 cctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccg 349 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1121 cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagataccg 1062 Query: 350 cgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 409 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 cgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 1002 Query: 410 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagac 469 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 tcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagac 942 Query: 470 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 941 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttc 894
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 429/444 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 74 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 134 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcnttc 193 ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 194 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtccccaaagatt 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 254 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 314 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 373 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 374 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 434 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 493 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 494 cggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttc 910
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 438/456 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 62 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 122 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 181 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 182 ccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcg 241 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 242 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 302 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 361 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 362 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 422 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 481 ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 482 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 917 ttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttc 882
>gb|U31105.1|GSU31105 Gynerium sagittatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 769 bits (388), Expect = 0.0 Identities = 443/463 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctccccccgacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccataatttttc 882
>gb|U31103.1|ESU31103 Enneapogon scaber ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 769 bits (388), Expect = 0.0 Identities = 443/463 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccaga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaagataatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttc 882
>gb|U31101.1|CLU31101 Chasmanthium latifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 769 bits (388), Expect = 0.0 Identities = 443/463 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 55 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 114 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 115 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 174 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 175 tgctgcaccaggtgcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatnc 234 | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1224 tactgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 235 nnantcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 294 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 295 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 354 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 355 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 415 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 475 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 882
>gb|AY626351.1| Eriachne triseta ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1320 Score = 767 bits (387), Expect = 0.0 Identities = 433/450 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 68 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 127 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1320 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1261 Query: 128 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 187 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1201 Query: 188 gcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcccca 247 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| Sbjct: 1200 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1141 Query: 248 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1140 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagcaaccggtata 1081 Query: 308 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 367 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1080 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatccttttca 1021 Query: 368 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 427 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 ataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 961 Query: 428 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 901 Query: 488 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 900 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 871
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 767 bits (387), Expect = 0.0 Identities = 433/450 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 68 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 127 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 128 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 187 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 188 gcnttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatncnnantcgtcccca 247 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 248 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 308 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 368 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 428 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 487 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 922 Query: 488 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 517 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 921 aatacacggaaatgcataccatgatttttc 892 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 3,647,023 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 3647023 Number of successful extensions: 102406 Number of sequences better than 10.0: 15096 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15044 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 63 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 72016 Number of HSP's gapped (non-prelim): 20858 length of query: 517 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 494 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 8468789065776 effective search space used: 8468789065776 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)