Clone Name | rbasd20d09 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 559/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 559/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 559/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 889
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 558/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 889
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctakttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccy 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccy 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 889
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1239 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 841
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaagtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 556/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkagsta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 889
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 557/580 (96%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnnnta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 556/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccaggagc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 555/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatatttcgcaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 555/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 555/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 555/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 555/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 554/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaacncgaatntgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 553/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 canntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 554/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1476 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1419 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1418 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1359 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1299 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1298 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1240 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1239 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1180 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1179 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1120 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1119 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1060 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1059 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1000 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 940 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 939 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 900
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 553/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagc 951
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 554/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 554/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 554/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 553/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 554/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 554/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 553/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagc 889
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 553/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 554/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 554/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 554/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 56326 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 56269 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 56268 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 56209 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56208 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 56149 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 56148 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 56090 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 56089 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 56030 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 56029 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55970 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 55969 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55910 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55909 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55850 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55849 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 55790 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 55789 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 55750
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 554/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1512 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1455 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1454 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1395 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1394 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1335 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1334 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1276 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1216 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1156 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1155 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1096 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1095 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1036 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 976 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 975 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 936
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 549/574 (95%), Gaps = 3/574 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1197 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1196 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1137 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1077 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1076 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1018 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 958 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 898 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 838 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 837 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 778 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 777 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 718 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 574 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 717 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaata 684
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 549/574 (95%), Gaps = 3/574 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1197 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1196 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1137 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1077 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1076 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1018 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 958 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 898 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 838 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 837 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 778 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 777 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 718 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 574 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 717 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaata 684
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 553/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 553/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 553/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 553/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctactggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 553/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgattgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacann-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 551/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnccc-aa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1469 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1290 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1289 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1110 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1469 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1290 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1289 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1110 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1469 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1290 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1289 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1110 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1469 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1290 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1289 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1110 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1469 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1290 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1289 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1110 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1384 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1327 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1326 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1267 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1266 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1207 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1206 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1148 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1147 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1088 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1087 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1028 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1027 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaact 968 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 967 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 908 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 848 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 847 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 808
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 940 bits (474), Expect = 0.0 Identities = 552/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgccgctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagc 889
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 551/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaanntgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcngctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagata 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 caatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 841
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 551/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 551/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 551/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 550/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1469 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1290 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1289 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1110 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 550/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccsscgcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 551/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1530 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1473 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1413 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1353 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1352 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1294 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1293 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1234 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1233 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1174 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1173 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1114 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1113 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1054 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 994 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 993 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 954
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 550/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 550/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 550/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 551/580 (95%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1386 ctaccggcttgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1329 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1328 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1269 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1209 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1208 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1150 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1149 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1090 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1089 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1030 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1029 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 970 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 969 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 910 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 850 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 849 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 810
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 550/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 546/574 (95%), Gaps = 3/574 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1197 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1196 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1137 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1136 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccaggtgc 1077 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1076 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1018 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 958 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 898 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 838 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 837 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 778 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 777 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 718 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 574 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 717 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaata 684
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 549/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1526 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1469 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1468 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1409 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1349 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1348 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1290 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1289 agrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1230 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1170 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1169 taaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaact 1110 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1109 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1050 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 990 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 989 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 950
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 550/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1530 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1473 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1413 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1353 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1352 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1294 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1293 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1234 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1233 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1174 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1173 taaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1114 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1113 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1054 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 994 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 993 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 954
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 550/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 889
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 550/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1386 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1329 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1328 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1269 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1209 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1208 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1150 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1149 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1090 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1089 canctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1030 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1029 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 970 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 969 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 910 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 850 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 849 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 810
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 550/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggcccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 550/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1393 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1336 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1335 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1276 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1216 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1215 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1157 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1156 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1097 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1096 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1037 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 977 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 976 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 917 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 857 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 856 gaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagc 817
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 550/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1393 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1336 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1335 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1276 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1216 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1215 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1157 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1156 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1097 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1096 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1037 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 977 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 976 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 917 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 857 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 856 gaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagc 817
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 550/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1465 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1408 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || Sbjct: 1407 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgctgcc 1348 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1288 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1229 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1228 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1169 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1168 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1109 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1108 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1049 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 tacctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 989 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 929 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 928 gaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagc 889
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 547/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggctcgaacycgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsssccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1110 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 549/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1530 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1473 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1413 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1353 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1352 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1294 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1293 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1234 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1233 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1174 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1173 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1114 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1113 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1054 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 atacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 994 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 993 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 954
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 549/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 548/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1530 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1473 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1472 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgccc 1413 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1412 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccaggtgc 1353 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1352 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1294 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1293 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1234 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1233 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1174 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1173 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1114 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1113 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1054 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 994 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 993 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 954
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 548/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| Sbjct: 1468 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaagcc-gcggctagttc 1411 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1410 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1351 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1291 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| Sbjct: 1290 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ccccaa 1232 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1231 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1172 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1171 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1112 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1111 taaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1052 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1051 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 992 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgcacggt 932 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 931 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 892
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 547/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaattnnnncgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgccccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 498/516 (96%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaaagat 1165 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 829
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 544/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1527 ctaccggcgcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1470 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1469 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgssccc 1410 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1350 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct: 1349 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ccccaa 1291 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1111 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| Sbjct: 1110 tacctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnagcta 1051 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 991 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagc 951
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 497/516 (96%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaaagat 1151 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1150 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1091 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1090 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1031 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 971 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 970 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 911 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 851 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 815
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 894 bits (451), Expect = 0.0 Identities = 538/569 (94%), Gaps = 3/569 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 12 aactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactccatt 71 |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatt 1339 Query: 72 tgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgag 131 |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| Sbjct: 1338 tgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgag 1279 Query: 132 cttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaag 191 |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1278 cttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaag 1219 Query: 192 gatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtc 251 ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| Sbjct: 1218 gatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccccaaagatttcggtc 1160 Query: 252 agagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatg 311 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 1159 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatg 1100 Query: 312 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1099 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1040 Query: 372 ngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactact 431 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactact 980 Query: 432 gnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaa 491 | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 979 gtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 920 Query: 492 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 860 Query: 552 agtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 859 agtaagccattgtcgcggcaataatgagc 831
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 504/526 (95%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt- 1131 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagc 785
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 546/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| Sbjct: 1397 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaagcc-gcggctagttc 1340 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1339 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1280 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1279 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccaggtgc 1220 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||| Sbjct: 1219 atttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcat-ccccaa 1161 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1160 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1101 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1100 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1041 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1040 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaact 981 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 980 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 921 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 861 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 860 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 504/526 (95%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt- 1131 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagc 785
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 546/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaagcc-gcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| Sbjct: 1239 attcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 caccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 546/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatacttcacaagcc-gcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagct 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 546/580 (94%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||| Sbjct: 1515 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatacttcacaagcc-gcggctagttc 1458 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1457 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1398 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1338 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1337 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccccaa 1279 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1278 agatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1219 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1218 cacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1159 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || Sbjct: 1158 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagct 1099 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1098 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1039 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 979 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 978 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 939
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 503/526 (95%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt- 1167 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 987 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagc 821
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 503/526 (95%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt- 1167 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 987 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 545/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| Sbjct: 1377 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaagcc-gcggctagttc 1320 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1319 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1260 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgc 1200 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| Sbjct: 1199 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-caccaa 1141 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1140 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1081 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1080 cacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1021 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1020 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 961 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 960 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 901 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 900 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 841 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 840 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 801
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 545/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatacttcacaagcc-gcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 545/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| | || | |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcgcaagcc-gcagctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1180 agatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagc 841
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 502/525 (95%), Gaps = 1/525 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatca 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 116 cgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacca 175 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 176 ggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgc 235 |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-c 1166 Query: 236 cccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 296 tntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 356 ttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttc 415 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 416 taacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgcttt 475 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 476 anctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 544/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1400 ctaccggctcgaactcsaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1343 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || Sbjct: 1342 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtcc 1283 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1223 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| Sbjct: 1222 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ctccaa 1164 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1163 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1104 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1044 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 984 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 983 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 924 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 923 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 864 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 863 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 824
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 520/550 (94%), Gaps = 2/550 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataat 90 |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaag-cagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataat 1310 Query: 91 tncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaa 150 | |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| Sbjct: 1309 ttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 151 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctcc 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 211 accaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaa 270 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacagaatcat-ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1131 Query: 271 catgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtga 330 |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1071 Query: 331 aaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaac 390 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1070 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 1011 Query: 391 ctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgat 450 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1010 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgat 951 Query: 451 ctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 510 |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 891 Query: 511 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 890 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggc 831 Query: 571 aatagtgagc 580 |||| ||||| Sbjct: 830 aataatgagc 821
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 501/526 (95%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1225 aggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat- 1167 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 987 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 501/526 (95%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat- 1185 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1125 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1065 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1064 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctcccctt 1005 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1004 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 839
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 501/526 (95%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat- 1157 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1097 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 493/516 (95%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaaagat 1165 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 500/526 (95%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat- 1151 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 805
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 500/526 (95%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat- 1168 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1167 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactg 1108 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 822
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 500/526 (95%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat- 1151 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 805
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 529/563 (93%), Gaps = 3/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 aatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactccatttgcaag 77 ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaag 1328 Query: 78 ctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgna 137 |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | Sbjct: 1327 ctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgta 1268 Query: 138 cacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtc 197 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1267 cacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtc 1208 Query: 198 ctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagct 257 ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ctccaaagatttcggtcagagct 1149 Query: 258 ggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacc 317 ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 ggcatatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacc 1089 Query: 318 cagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaat 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct: 1088 cagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaat 1029 Query: 378 aaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccg 437 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1028 aaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccg 969 Query: 438 gagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcata 497 | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 968 gcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcata 909 Query: 498 ccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaag 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct: 908 ccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtagg 849 Query: 558 ccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 848 ccattgtcgcggcaataatgagc 826
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 499/526 (94%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1347 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1288 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1228 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1227 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat- 1169 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1168 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactg 1109 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1049 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1048 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 989 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 988 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 929 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 869 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 868 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 823
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 499/526 (94%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat- 1168 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1167 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactg 1108 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 822
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 541/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1401 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 1344 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1343 aggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1284 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1283 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgc 1224 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| Sbjct: 1223 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ctccaa 1165 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1164 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1105 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1104 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1045 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1044 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 985 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 984 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 925 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 924 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 865 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 825
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 499/526 (94%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat- 1157 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccg 1097 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 543/580 (93%), Gaps = 5/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 124753 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 124696 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 124695 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 124636 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124635 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 124576 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| Sbjct: 124575 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ccccaa 124517 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 124516 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 124458 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124457 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caa 124399 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124398 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124339 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124338 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124279 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124278 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 124219 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 124218 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 124179 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 543/580 (93%), Gaps = 5/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 30226 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 30169 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 30168 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 30109 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30108 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 30049 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| Sbjct: 30048 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ccccaa 29990 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caa 29872 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29812 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29811 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29752 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29751 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 29692 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 29691 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 29652
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 491/516 (95%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaaagat 1165 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagc 829
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 491/516 (95%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ccccaaagat 1167 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1166 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1107 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1106 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1047 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 987 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 986 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 927 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 867 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 866 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 831
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 539/578 (93%), Gaps = 3/578 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 accggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttcag 62 |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| Sbjct: 1415 accgcctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatacttcacaag-ctgcggctagttcag 1358 Query: 63 gactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 122 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1357 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1298 Query: 123 ngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 182 |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1238 Query: 183 tcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaag 242 | |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| | | |||||| Sbjct: 1237 ttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcat-ctccaaag 1179 Query: 243 atttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaaca 302 |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| Sbjct: 1178 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1119 Query: 303 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaata 362 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1118 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1059 Query: 363 aaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaactta 422 ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 1058 aaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaactta 999 Query: 423 cctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaat 482 |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 998 cctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 939 Query: 483 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 542 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 938 acacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 879 Query: 543 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 878 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 517/550 (94%), Gaps = 2/550 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 ttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataat 90 |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaag-cagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataat 1310 Query: 91 tncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaa 150 | |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| Sbjct: 1309 ttcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 151 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctcc 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 211 accaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaa 270 ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacggaatcat-ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1131 Query: 271 catgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtga 330 |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtga 1071 Query: 331 aaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaac 390 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1070 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 1011 Query: 391 ctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgat 450 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1010 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgat 951 Query: 451 ctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 510 |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 891 Query: 511 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggc 570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 890 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggc 831 Query: 571 aatagtgagc 580 |||| ||||| Sbjct: 830 aataatgagc 821
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 493/520 (94%), Gaps = 1/520 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccccaa 1169 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1109 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 988 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 55519 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 55462 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 55461 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 55402 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55401 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 55342 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 55341 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 55283 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55102 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55043 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55042 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54983 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 54982 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 54943
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 55519 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 55462 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 55461 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 55402 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55401 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 55342 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 55341 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 55283 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55102 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55043 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55042 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54983 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 54982 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 54943
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 55467 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 55410 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 55409 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 55350 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55349 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 55290 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 55289 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 55231 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 55230 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55171 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55170 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55111 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 55110 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55051 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55050 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 54991 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54990 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54931 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 54930 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 54891
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 498/526 (94%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1350 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1291 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1231 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1230 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat- 1172 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1112 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1052 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1051 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 992 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 991 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 932 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 872 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 871 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 826
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 125808 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 125751 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 125750 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 125691 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125690 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 125631 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 125630 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 125572 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 125571 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 125512 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 125511 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 125452 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 125451 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 125392 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 125391 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 125332 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 125331 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 125272 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 125271 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 125232 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 30748 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 30691 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 30690 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 30631 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30630 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 30571 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 30570 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 30512 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 30511 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 30452 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 30451 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 30392 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 30391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 30332 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 30331 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 30272 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 30271 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 30212 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 30211 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 30172
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 124835 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 124778 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 124777 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 124718 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124717 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 124658 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 124657 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 124599 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124418 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124359 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124358 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 124299 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 124298 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 124259 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 30254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 30197 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 30196 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 30137 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30136 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 30077 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 30076 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 30018 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29837 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29778 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29777 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 29718 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 29717 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 29678
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 124835 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 124778 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 124777 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 124718 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124717 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 124658 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 124657 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 124599 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124418 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124359 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124358 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 124299 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 124298 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 124259 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 30254 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 30197 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 30196 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 30137 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30136 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 30077 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 30076 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 30018 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29837 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29778 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29777 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 29718 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 29717 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 29678
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 55511 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 55454 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 55453 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 55394 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55393 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 55334 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 55333 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 55275 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 55274 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55215 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55214 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55155 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 55154 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55095 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55094 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55035 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55034 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54975 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 54974 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 54935
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 1239 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 498/526 (94%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat- 1151 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 970 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 805
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcaaatttgatcgc-cttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ctccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1404 ctaccggctcgaactcaaatttgatcgc-cttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 1347 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1346 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1287 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1286 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgc 1227 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| Sbjct: 1226 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ctccaa 1168 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1167 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1108 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1107 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1048 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1047 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 988 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 987 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 928 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 927 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 868 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 867 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 828
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1402 ctaccggctcgaactcaaatttgatcgc-cttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 1345 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1344 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1285 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1284 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgc 1225 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| Sbjct: 1224 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ctccaa 1166 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1165 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1106 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1105 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1046 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1045 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 986 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 985 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 926 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 925 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 866 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 865 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 826
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1416 ctaccggctcgaactcaaatttgatcgc-cttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 1359 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1358 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1299 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1298 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgc 1239 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| Sbjct: 1238 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ctccaa 1180 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1179 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1120 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1119 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1060 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1059 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1000 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 999 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 940 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 939 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 880 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 879 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 840
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 495/522 (94%), Gaps = 1/522 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 119 ccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 178 |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 179 gcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgcccc 238 ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-cccc 1183 Query: 239 aaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtnt 298 |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttn 358 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaa 418 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanc 478 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1002 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 479 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 538 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 539 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 33527153 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 33527210 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 33527211 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 33527270 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527271 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 33527330 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 33527331 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 33527389 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 33527390 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 33527449 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 33527450 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 33527509 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 33527510 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 33527569 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 33527570 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 33527629 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 33527630 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 33527689 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 33527690 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 33527729
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 72350 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 72407 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 72408 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 72467 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72468 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 72527 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 72528 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 72586 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 72587 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 72646 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 72647 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 72706 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 72707 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 72766 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 72767 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 72826 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 72827 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 72886 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 72887 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 72926
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1472 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 1415 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1414 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1355 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1354 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 1295 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 1294 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 1236 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1056 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1055 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 996 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 995 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 936 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 935 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 896
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1215 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 1158 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1157 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1098 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 1038 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 1037 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 979 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 978 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 919 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 918 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 859 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 799 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 798 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 739 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 738 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 679 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 678 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 639
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 55446 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 55389 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 55388 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 55329 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55328 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 55269 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 55268 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 55210 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 55209 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55150 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55149 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55090 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 55089 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55030 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55029 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 54970 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54969 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54910 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 54909 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 54870
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1804 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 1747 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1746 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1687 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1686 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 1627 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 1626 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 1568 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1567 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1508 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1388 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1387 tacctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1328 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1327 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 1268 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 1267 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 1228
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 540/580 (93%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1837 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 1780 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1779 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1720 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1719 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 1660 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 1659 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 1601 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1421 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1420 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1361 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1360 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 1301 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 1300 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 1261 Score = 52.0 bits (26), Expect = 0.002 Identities = 31/33 (93%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 |||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 490/516 (94%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ccccaaagat 1165 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatata 1045 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 501/531 (94%), Gaps = 1/531 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 50 gcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagca 109 |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 110 agatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgct 169 ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 170 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaa 229 |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 230 tcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagc 289 || | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcat-ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1132 Query: 290 taccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 349 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1072 Query: 350 atctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttc 409 |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1071 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1012 Query: 410 cccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaa 469 |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1011 cccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 470 tgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 529 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 530 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 495/523 (94%), Gaps = 1/523 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacg 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 118 cccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccagg 177 ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 178 tgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccc 237 |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccc 1145 Query: 238 caaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtn 297 ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 298 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 358 naataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttcta 417 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 418 acttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttan 477 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 478 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 538 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 802
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 495/523 (94%), Gaps = 1/523 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacg 117 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 118 cccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccagg 177 ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 178 tgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccc 237 |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccc 1145 Query: 238 caaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtn 297 ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 298 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 358 naataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttcta 417 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 418 acttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttan 477 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 478 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 538 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 802
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 539/580 (92%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 1239 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 492/520 (94%), Gaps = 1/520 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccccaa 1169 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataa 1109 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 988 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 539/580 (92%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| Sbjct: 1389 ctaccggcgcgaactcaaatttgatcgc-cttccatacttcgcaag-ctgcggctagttc 1332 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1331 aggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccc 1272 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 1271 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgc 1212 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| Sbjct: 1211 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ctccaa 1153 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| Sbjct: 1152 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataa 1093 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1092 cacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaa 1033 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1032 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaact 973 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 972 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 913 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 912 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 853 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 852 gaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagc 813
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 497/526 (94%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcat- 1167 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 987 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 497/526 (94%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1293 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1233 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1232 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat- 1174 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1173 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccg 1114 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1054 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1053 tttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 994 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 993 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 934 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 874 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 873 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 828
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 539/580 (92%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactccaatttgatcgc-cttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| Sbjct: 1239 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ctccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 539/580 (92%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| Sbjct: 1332 ctactggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatacttcacaag-ctgcggcaagttc 1275 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1274 agggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1215 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 1214 ttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgc 1155 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| Sbjct: 1154 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ccccaa 1096 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| Sbjct: 1095 agatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataa 1036 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1035 caccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 976 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 975 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 916 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 915 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 856 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 855 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 796 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 795 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 756
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 539/580 (92%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggcgcgaactcaaatttgatcgc-cttccatacttcgcaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| Sbjct: 1239 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ctccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 539/580 (92%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 53721 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 53664 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 53663 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 53604 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53603 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 53544 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 53543 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 53485 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 53484 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 53425 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 53424 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 53365 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 53364 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 53305 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 53304 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 53245 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 53244 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 53185 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 53184 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 53145
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 539/580 (92%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 128654 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 128597 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 128596 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 128537 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128536 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 128477 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 128476 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 128418 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 128417 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 128358 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 128357 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 128298 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 128297 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 128238 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 128237 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 128178 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 128177 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 128118 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 128117 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 128078
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 539/580 (92%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 10347329 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 10347272 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 10347271 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 10347212 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347211 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 10347152 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 10347151 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 10347093 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 10347092 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10347033 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10346913 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10346912 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 10346853 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10346852 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 10346793 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 10346792 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 10346753
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 491/518 (94%), Gaps = 1/518 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 gactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 122 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 123 ngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 182 |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 183 tcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaag 242 | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ccccaaag 1149 Query: 243 atttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaaca 302 |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| Sbjct: 1148 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataaca 1089 Query: 303 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaata 362 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1088 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1029 Query: 363 aaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaactta 422 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1028 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 969 Query: 423 cctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaat 482 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 968 cctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 483 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 542 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849 Query: 543 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 848 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 539/580 (92%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 10353368 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 10353311 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 10353310 acgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 10353251 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353250 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 10353191 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 10353190 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 10353132 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 10353131 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10353072 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 10353071 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10353012 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 10353011 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10352952 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10352951 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 10352892 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10352891 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 10352832 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 10352831 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 10352792
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 489/516 (94%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ccccaaagat 1165 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 489/516 (94%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ccccaaagat 1165 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 833 bits (420), Expect = 0.0 Identities = 489/516 (94%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccccaaagat 1165 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 831 bits (419), Expect = 0.0 Identities = 515/550 (93%), Gaps = 2/550 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 cttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1304 cttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttgataa 1246 Query: 90 ttncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttnta 149 || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| || Sbjct: 1245 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1186 Query: 150 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctc 209 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 1185 aagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1126 Query: 210 caccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaa 269 |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1125 caccaaattgtaatacggaatcgt-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1067 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 1007 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1006 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 947 Query: 390 cctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatga 449 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 946 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 887 Query: 450 tctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 509 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 886 tctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 827 Query: 510 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 569 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 826 tgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcgg 767 Query: 570 caatagtgag 579 ||||| |||| Sbjct: 766 caataatgag 757
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 475/498 (95%), Gaps = 1/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 cggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaa 142 ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 143 gcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctann 202 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 203 gntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcnt 262 | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 263 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacccagtc 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 323 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatc 382 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 383 aacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccggagtg 442 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 941 Query: 443 gatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatg 502 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 503 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 563 gtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagc 803
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 496/526 (94%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat- 1167 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 caccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 987 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 496/526 (94%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat- 1171 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1111 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1110 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatctt 1051 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1050 tttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 991 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 990 ctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 825
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 493/522 (94%), Gaps = 1/522 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 119 ccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 178 |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 179 gcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgcccc 238 ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-cccc 1172 Query: 239 aaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtnt 298 |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | Sbjct: 1171 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtat 1112 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttn 358 |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 aacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1052 Query: 359 aataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaa 418 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1051 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 992 Query: 419 cttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanc 478 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 991 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932 Query: 479 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872 Query: 539 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 830
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 475/498 (95%), Gaps = 1/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 cggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaa 142 ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 143 gcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctann 202 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 203 gntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcnt 262 | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 263 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacccagtc 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 323 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatc 382 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 383 aacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccggagtg 442 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 941 Query: 443 gatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatg 502 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 503 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 563 gtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagc 803
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 538/580 (92%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 5614559 ctaccggctcgaactcgaatttgatcact-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 5614502 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 5614501 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 5614442 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614441 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 5614382 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 5614381 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 5614323 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614143 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614142 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 5614083 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5614082 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 5614023 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 5614022 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 5613983 Score = 440 bits (222), Expect = e-120 Identities = 262/276 (94%), Gaps = 1/276 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 13436829 Score = 186 bits (94), Expect = 5e-44 Identities = 111/117 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 464 acgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 523 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 524 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 13397980 Score = 83.8 bits (42), Expect = 6e-13 Identities = 50/53 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 13424430 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 29/30 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 250 tcagagctggcntatgccaaacatgaatac 279 ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 48.1 bits (24), Expect = 0.032 Identities = 32/35 (91%) Strand = Plus / Minus Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 538/580 (92%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 5614548 ctaccggctcgaactcgaatttgatcact-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 5614491 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 5614490 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 5614431 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614430 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 5614371 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 5614370 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 5614312 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 5614311 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614252 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 5614251 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614192 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 5614191 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614132 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614131 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 5614072 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5614071 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 5614012 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 5614011 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 5613972 Score = 440 bits (222), Expect = e-120 Identities = 262/276 (94%), Gaps = 1/276 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 13391103 Score = 186 bits (94), Expect = 5e-44 Identities = 111/117 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 464 acgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 523 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 524 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 13352254 Score = 83.8 bits (42), Expect = 6e-13 Identities = 50/53 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 13378704 tagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 29/30 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 250 tcagagctggcntatgccaaacatgaatac 279 ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 48.1 bits (24), Expect = 0.032 Identities = 32/35 (91%) Strand = Plus / Minus Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 538/580 (92%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 38326 ctaccggctcgaactcgaatttgatcact-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 38383 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 38384 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 38443 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38444 ttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 38503 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 38504 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 38562 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 38742 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38743 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 38802 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38803 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 38862 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 38863 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 38902
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 501/533 (93%), Gaps = 1/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| Sbjct: 1162 aatcgt-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 827 bits (417), Expect = 0.0 Identities = 537/579 (92%), Gaps = 3/579 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1417 ctaccggctcgaactcgaatttgattgct-ttccatacttcacaag-ctgcggctagttc 1360 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1359 aggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1300 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1299 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggtgc 1240 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 1239 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ctccaa 1181 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1180 agatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttcaa 1061 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1060 tataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttgcta 941 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 579 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 842
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 827 bits (417), Expect = 0.0 Identities = 539/580 (92%), Gaps = 4/580 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 23203577 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 23203634 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 23203635 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 23203694 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203695 tt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 23203753 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 23203754 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 23203812 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 23203992 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 23203993 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 23204052 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 23204053 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 23204112 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 23204113 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 23204152 Score = 105 bits (53), Expect = 2e-19 Identities = 58/60 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 26711497 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 26711438 Score = 105 bits (53), Expect = 2e-19 Identities = 58/60 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 26711389 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 26711330
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 827 bits (417), Expect = 0.0 Identities = 495/525 (94%), Gaps = 1/525 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat- 1157 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 579 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgag 812
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 827 bits (417), Expect = 0.0 Identities = 539/580 (92%), Gaps = 4/580 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 154225 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 154282 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 154283 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 154342 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154343 tt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 154401 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 154402 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 154460 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 154461 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 154520 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct: 154581 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 154640 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 154641 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 154700 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 154701 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 154760 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 154761 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 154800
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 827 bits (417), Expect = 0.0 Identities = 539/580 (92%), Gaps = 4/580 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 38339 ctaccggctcgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 38396 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 38397 aggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 38456 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38457 tt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgc 38515 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| Sbjct: 38516 attaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcat-ctccaa 38574 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 38575 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38634 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 38635 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38694 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct: 38695 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 38754 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38755 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 38814 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38815 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 38874 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 38875 gaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 38914
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 825 bits (416), Expect = 0.0 Identities = 488/516 (94%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccccaaagat 1165 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1164 ttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagc 829
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 825 bits (416), Expect = 0.0 Identities = 525/563 (93%), Gaps = 3/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 aatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactccatttgcaag 77 ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgc-cttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaag 1328 Query: 78 ctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgna 137 || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | Sbjct: 1327 cttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgta 1268 Query: 138 cacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtc 197 ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1267 cacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtc 1208 Query: 198 ctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagct 257 ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ctccaaagatttcggtcagagct 1149 Query: 258 ggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacc 317 ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct: 1148 ggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacc 1089 Query: 318 cagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaat 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct: 1088 cagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaat 1029 Query: 378 aaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccg 437 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1028 aaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccg 969 Query: 438 gagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcata 497 | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 968 gcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcata 909 Query: 498 ccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaag 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct: 908 ccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtagg 849 Query: 558 ccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 848 ccattgtcgcggcaataatgagc 826
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 495/526 (94%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt- 1168 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1167 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccg 1108 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagc 822
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 500/533 (93%), Gaps = 1/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1162 aatcgt-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 819 bits (413), Expect = 0.0 Identities = 494/525 (94%), Gaps = 1/525 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat- 1157 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatctt 1037 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 579 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgag 812
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 817 bits (412), Expect = 0.0 Identities = 487/516 (94%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccccaaagat 1165 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1164 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 817 bits (412), Expect = 0.0 Identities = 487/516 (94%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccccaaagat 1165 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1164 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 984 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 829
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 817 bits (412), Expect = 0.0 Identities = 514/551 (93%), Gaps = 2/551 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 cttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 cttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 1331 Query: 90 ttncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttnta 149 || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || Sbjct: 1330 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 1271 Query: 150 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctc 209 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 1270 aagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1211 Query: 210 caccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaa 269 |||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1210 caccaaattgtaatacggaatcat-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1152 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1151 acatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtg 1092 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1091 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 1032 Query: 390 cctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatga 449 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| Sbjct: 1031 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatga 972 Query: 450 tctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 509 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttc 912 Query: 510 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 569 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 911 tgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcgg 852 Query: 570 caatagtgagc 580 ||||| ||||| Sbjct: 851 caataatgagc 841
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 473/498 (94%), Gaps = 1/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 cggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaa 142 ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 143 gcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctann 202 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 203 gntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcnt 262 | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 263 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacccagtc 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 323 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatc 382 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 383 aacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccggagtg 442 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 938 Query: 443 gatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatg 502 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 503 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 563 gtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagc 800
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 473/498 (94%), Gaps = 1/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 cggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaa 142 ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 143 gcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctann 202 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 203 gntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcnt 262 | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 263 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacccagtc 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 323 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatc 382 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 383 aacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccggagtg 442 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtg 938 Query: 443 gatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatg 502 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 503 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 563 gtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||| ||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagc 800
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 536/580 (92%), Gaps = 3/580 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 ctaccggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttc 60 ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| Sbjct: 1387 ctaccggcttgaactcgaatttgatcgct-ttccatatttcacaag-ctgcggctagttc 1330 Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccc 120 ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1329 aggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1270 Query: 121 ttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 180 || ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1210 Query: 181 attcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaa 240 |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| Sbjct: 1209 attcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ctccaa 1151 Query: 241 agatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaa 300 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| Sbjct: 1150 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1091 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaa 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1090 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttcaa 1031 Query: 361 taaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaact 420 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1030 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 971 Query: 421 tacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttancta 480 |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 970 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 911 Query: 481 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 910 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 851 Query: 541 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 850 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 499/533 (93%), Gaps = 1/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1162 aatcgt-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 494/526 (93%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1275 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1216 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1215 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt- 1157 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccg 1097 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 811 bits (409), Expect = 0.0 Identities = 478/505 (94%), Gaps = 1/505 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 76 agctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttg 135 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 136 nacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 195 ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 196 tcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagag 255 ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ccccaaagatttcggtcagag 1109 Query: 256 ctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggata 315 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 1049 Query: 316 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngca 375 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 cccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 989 Query: 376 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnac 435 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 988 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 929 Query: 436 cggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgca 495 ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 496 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 556 agccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagc 784
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 811 bits (409), Expect = 0.0 Identities = 478/505 (94%), Gaps = 1/505 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 76 agctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttg 135 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 136 nacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 195 ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 196 tcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagag 255 ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ccccaaagatttcggtcagag 1109 Query: 256 ctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggata 315 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggata 1049 Query: 316 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngca 375 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| Sbjct: 1048 cccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 989 Query: 376 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnac 435 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 988 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 929 Query: 436 cggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgca 495 ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 496 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 556 agccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagc 784
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 811 bits (409), Expect = 0.0 Identities = 529/571 (92%), Gaps = 3/571 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactcc 68 ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 69 atttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttac 128 |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 129 gagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 188 | ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 189 aaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttng 248 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ctccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggc 308 |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatca 368 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctact 428 ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacgg 488 |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 932 aaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 579 ||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 872 agaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 842
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 811 bits (409), Expect = 0.0 Identities = 529/571 (92%), Gaps = 3/571 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 9 tcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactcc 68 ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactcc 1352 Query: 69 atttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttac 128 |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct: 1351 atttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttac 1292 Query: 129 gagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattccccc 188 | ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1291 gggcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttcccc 1232 Query: 189 aaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttng 248 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | Sbjct: 1231 aaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ctccaaagatttcg 1173 Query: 249 gtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggc 308 |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct: 1172 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggc 1113 Query: 309 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatca 368 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1112 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatca 1053 Query: 369 tcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctact 428 ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctact 993 Query: 429 actgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacgg 488 |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 992 actgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgg 933 Query: 489 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 548 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 932 aaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtga 873 Query: 549 agaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 579 ||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 872 agaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 842
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 809 bits (408), Expect = 0.0 Identities = 486/516 (94%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-caccaaagat 1175 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1174 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1115 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1114 tggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1055 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 995 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 994 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 935 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 875 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 874 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 839
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 809 bits (408), Expect = 0.0 Identities = 523/563 (92%), Gaps = 3/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 aatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactccatttgcaag 77 ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1387 aatttgatcgc-cttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgctag 1330 Query: 78 ctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgna 137 |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | Sbjct: 1329 ctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgta 1270 Query: 138 cacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtc 197 ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1269 cacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtc 1210 Query: 198 ctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagct 257 ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||| Sbjct: 1209 ctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ctccaaagatttcggtcagagct 1151 Query: 258 ggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacc 317 ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct: 1150 ggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacc 1091 Query: 318 cagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaat 377 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct: 1090 cagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaat 1031 Query: 378 aaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccg 437 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1030 aaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccg 971 Query: 438 gagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcata 497 | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct: 970 gcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcata 911 Query: 498 ccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaag 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct: 910 ccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtagg 851 Query: 558 ccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 850 ccattgtcgcggcaataatgagc 828
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 809 bits (408), Expect = 0.0 Identities = 513/551 (93%), Gaps = 2/551 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 cttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1373 cttccatatttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 1315 Query: 90 ttncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttnta 149 || |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| || Sbjct: 1314 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 1255 Query: 150 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctc 209 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 1254 aagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1195 Query: 210 caccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaa 269 |||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 caccaaattgtaatacggaatcat-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1136 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 || |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 acgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtg 1076 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1075 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 1016 Query: 390 cctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatga 449 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1015 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatga 956 Query: 450 tctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 509 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 tctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttc 896 Query: 510 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 569 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 895 tgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcgg 836 Query: 570 caatagtgagc 580 ||||| ||||| Sbjct: 835 caataatgagc 825
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 483/513 (94%), Gaps = 1/513 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 68 catttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngtta 127 |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 128 cgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 187 |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 188 caaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttn 247 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccccaaagatttc 1154 Query: 248 ggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctgg 307 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| Sbjct: 1153 agtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctgg 1094 Query: 308 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatc 367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1093 catggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatc 1034 Query: 368 atcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctac 427 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 atcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctac 974 Query: 428 tactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacg 487 ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 973 tactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 488 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 548 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 853 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 821
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 498/533 (93%), Gaps = 1/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1252 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1193 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1192 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctg 1133 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1132 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacng 1073 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1072 aatcgt-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1014 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1013 gcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagca 954 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 953 cgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 894 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 893 tccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 834 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 833 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 774 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 773 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 721
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 805 bits (406), Expect = 0.0 Identities = 529/572 (92%), Gaps = 3/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 accggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttcag 62 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| Sbjct: 1832 accggctcgaactcaaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttcag 1775 Query: 63 gactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 122 |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1774 gactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccctt 1715 Query: 123 ngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 182 |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1714 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggtgcat 1655 Query: 183 tcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaag 242 | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1654 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt-ctccaaag 1596 Query: 243 atttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaaca 302 |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| Sbjct: 1595 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1536 Query: 303 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaata 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1535 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaata 1476 Query: 363 aaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaactta 422 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1475 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaactta 1416 Query: 423 cctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaat 482 |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| Sbjct: 1415 cctactactgtaccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagctaat 1356 Query: 483 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 542 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1355 acacggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 1296 Query: 543 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 574 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 1295 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaata 1264
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 805 bits (406), Expect = 0.0 Identities = 529/572 (92%), Gaps = 3/572 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 accggctcgaactngaatttgatcgcgcttccatacttcacaagtctgcggntagttcag 62 |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| Sbjct: 1852 accggcgcgaactcaaatttgatcgc-cttccatacttcacaag-ctgcggctagttcag 1795 Query: 63 gactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 122 |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1794 gactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgccctt 1735 Query: 123 ngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 182 |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1734 cgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcat 1675 Query: 183 tcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaag 242 | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| Sbjct: 1674 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ctccaaag 1616 Query: 243 atttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaaca 302 |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| Sbjct: 1615 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataaca 1556 Query: 303 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaata 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1555 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaata 1496 Query: 363 aaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaactta 422 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1495 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaactta 1436 Query: 423 cctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaat 482 |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1435 cctactactgtaccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaat 1376 Query: 483 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1375 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 1316 Query: 543 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 574 ||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 1315 atgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaata 1284
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 805 bits (406), Expect = 0.0 Identities = 498/533 (93%), Gaps = 1/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1162 aatcgt-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 805 bits (406), Expect = 0.0 Identities = 493/526 (93%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat- 1157 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccg 1097 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 805 bits (406), Expect = 0.0 Identities = 493/526 (93%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat- 1157 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 805 bits (406), Expect = 0.0 Identities = 498/533 (93%), Gaps = 1/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatacgg 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| Sbjct: 1162 aatcgt-ctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacataggc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagc 811
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 803 bits (405), Expect = 0.0 Identities = 492/525 (93%), Gaps = 1/525 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatca 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 116 cgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacca 175 ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 176 ggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgc 235 |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-c 1186 Query: 236 cccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 296 tntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 356 ttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttc 415 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 416 taacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgcttt 475 ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 476 anctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 535 | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 536 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 841
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 797 bits (402), Expect = 0.0 Identities = 497/533 (93%), Gaps = 1/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1162 aatcgt-ctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 797 bits (402), Expect = 0.0 Identities = 497/533 (93%), Gaps = 1/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 aatcgt-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 795 bits (401), Expect = 0.0 Identities = 476/505 (94%), Gaps = 1/505 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 76 agctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttg 135 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 136 nacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 195 ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 196 tcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagag 255 ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-caccaaagatttcggtcagag 1150 Query: 256 ctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggata 315 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | Sbjct: 1149 ctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaa 1090 Query: 316 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngca 375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| Sbjct: 1089 cccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgca 1030 Query: 376 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnac 435 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1029 ataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 970 Query: 436 cggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgca 495 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 969 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 910 Query: 496 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 850 Query: 556 agccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 849 ggccattgtcgcggcaataatgagc 825
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 795 bits (401), Expect = 0.0 Identities = 496/532 (93%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagcta 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1162 aatcgt-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaa 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgag 579 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgag 812
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 793 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 484/516 (93%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1279 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattt 1219 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| Sbjct: 1218 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ctccaaagat 1160 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| Sbjct: 1159 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1100 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1099 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1040 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 980 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 979 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 920 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 919 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaat 860 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 859 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 824
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 793 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 484/516 (93%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ccccaaagat 1147 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| Sbjct: 1146 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1087 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1086 cggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1027 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1026 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 967 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 966 tactactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaatac 907 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 906 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 847 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 846 gtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 793 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 490/524 (93%), Gaps = 1/524 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcac 116 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 117 gcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccag 176 |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 177 gtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgcc 236 ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ct 1128 Query: 237 ccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 296 |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1127 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1068 Query: 297 ntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 356 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1008 Query: 357 tnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttct 416 | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1007 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 948 Query: 417 aacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgcttta 476 |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 947 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 888 Query: 477 nctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 536 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 828 Query: 537 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 827 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 784
>gb|M91626.1|BAMCPRBCL Bamboo chloroplast ribulosebisphosphate (rbcL) gene, partial cds Length = 1324 Score = 793 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 483/516 (93%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttng 124 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1324 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1265 Query: 125 ttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 184 ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatty 1205 Query: 185 ccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagat 244 ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| Sbjct: 1204 ycccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat-ctccaaagat 1146 Query: 245 ttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtntaacacc 304 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| Sbjct: 1145 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1086 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaa 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1085 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1026 Query: 365 atcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacc 424 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 966 Query: 425 tactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanctaatac 484 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 965 tactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 906 Query: 485 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 544 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 905 acgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaat 846 Query: 545 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 845 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 810
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 793 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 492/527 (93%), Gaps = 1/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 |||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1162 aatcgt-ctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 574 ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaata 817
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 510/550 (92%), Gaps = 2/550 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 cttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 120470 cttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 120412 Query: 90 ttncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttnta 149 || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| || Sbjct: 120411 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 120352 Query: 150 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctc 209 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 120351 aagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 120292 Query: 210 caccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaa 269 |||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 120291 caccaaattgtaatacggaatcat-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 120233 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120232 acatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 120173 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 120172 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 120113 Query: 390 cctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatga 449 |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120112 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 120053 Query: 450 tctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 509 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120052 tctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 119993 Query: 510 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 569 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 119992 tgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcgg 119933 Query: 570 caatagtgag 579 ||||| |||| Sbjct: 119932 caataatgag 119923
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 510/550 (92%), Gaps = 2/550 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 cttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 58843 cttccatatttcacaag-ctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 58785 Query: 90 ttncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttnta 149 || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| || Sbjct: 58784 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 58725 Query: 150 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctc 209 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 58724 aagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 58665 Query: 210 caccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaa 269 |||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 58664 caccaaattgtaatacggaatcat-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 58606 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58605 acatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 58546 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 58545 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 58486 Query: 390 cctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatga 449 |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58485 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 58426 Query: 450 tctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 509 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58425 tctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 58366 Query: 510 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 569 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 58365 tgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcgg 58306 Query: 570 caatagtgag 579 ||||| |||| Sbjct: 58305 caataatgag 58296
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 499/534 (93%), Gaps = 3/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataattncattaccttcgcga 106 |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcacga 1284 Query: 107 gcaagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagct 166 |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 gcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagct 1224 Query: 167 gctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaataca 226 |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 gctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacg 1164 Query: 227 gaatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctga 286 ||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1163 gaatcat-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 287 agctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 346 ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 347 acgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncg 406 ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcg 985 Query: 407 ttccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacg 466 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 984 ctccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 467 caatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 526 |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 527 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 789 bits (398), Expect = 0.0 Identities = 488/522 (93%), Gaps = 1/522 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 118 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 119 ccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 178 |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 179 gcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgcccc 238 |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ctcc 1163 Query: 239 aaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtnt 298 |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | Sbjct: 1162 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1103 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttn 358 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1102 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttc 1043 Query: 359 aataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaa 418 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1042 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 983 Query: 419 cttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanc 478 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 982 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 923 Query: 479 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 538 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 863 Query: 539 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 862 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 821
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 789 bits (398), Expect = 0.0 Identities = 496/533 (93%), Gaps = 1/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1162 aatcat-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagc 811
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 789 bits (398), Expect = 0.0 Identities = 488/522 (93%), Gaps = 1/522 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1284 Query: 119 ccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 178 |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1283 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1224 Query: 179 gcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgcccc 238 ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | | || Sbjct: 1223 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat-ctcc 1165 Query: 239 aaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtnt 298 |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | Sbjct: 1164 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1105 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttn 358 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1045 Query: 359 aataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaa 418 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1044 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 985 Query: 419 cttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanc 478 |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 984 cttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 925 Query: 479 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 538 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 865 Query: 539 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 864 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 823
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 789 bits (398), Expect = 0.0 Identities = 496/533 (93%), Gaps = 1/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctg 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacag 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1162 aatcat-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagc 811
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 789 bits (398), Expect = 0.0 Identities = 491/526 (93%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1215 gggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat- 1157 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccg 1097 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 789 bits (398), Expect = 0.0 Identities = 491/526 (93%), Gaps = 1/526 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatc 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 115 acgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcacc 174 ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 175 aggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtg 234 ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat- 1157 Query: 235 ccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 295 gtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttcccctt 414 ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctt 474 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 475 tanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 534 || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 535 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagc 811
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 789 bits (398), Expect = 0.0 Identities = 496/533 (93%), Gaps = 1/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1162 aatcgt-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1043 cggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagc 580 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagc 811
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 789 bits (398), Expect = 0.0 Identities = 506/545 (92%), Gaps = 2/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 cttccatacttcacaagtctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1778 cttccatacttcacaag-ctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttgataa 1720 Query: 90 ttncattaccttcgcgagcaagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttnta 149 || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||| || Sbjct: 1719 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtacacaggcttcta 1660 Query: 150 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctc 209 ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 1659 aagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1600 Query: 210 caccaaattgtaatacagaatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaa 269 |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1599 caccaaattgtaatacagaatcgt-ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1541 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1540 acatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtg 1481 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1480 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 1421 Query: 390 cctaaagtcatttcncgttccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatga 449 |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1420 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatga 1361 Query: 450 tctcccccanacatacgcaatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 509 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1360 tctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttc 1301 Query: 510 tgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcgg 569 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct: 1300 tgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcgg 1241 Query: 570 caata 574 ||||| Sbjct: 1240 caata 1236
>gb|AY626351.1| Eriachne triseta ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1320 Score = 785 bits (396), Expect = 0.0 Identities = 483/516 (93%), Gaps = 1/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgagcaagatcacgc 118 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1320 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1261 Query: 119 ccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 178 |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1201 Query: 179 gcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacagaatcgtgcccc 238 |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | || Sbjct: 1200 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt-ctcc 1142 Query: 239 aaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtnt 298 |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | Sbjct: 1141 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagcaaccggtat 1082 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttn 358 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1081 aacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatccttttc 1022 Query: 359 aataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgttccccttctaa 418 ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1021 aataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 962 Query: 419 cttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgcaatgctttanc 478 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 961 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 902 Query: 479 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 538 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 901 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 842 Query: 539 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 574 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 841 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaata 806
>emb|AJ746283.1| Aristida congesta subsp. barbicollis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 785 bits (396), Expect = 0.0 Identities = 491/527 (93%), Gaps = 1/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1162 aatcgt-ccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 574 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaata 817
>gb|U31359.1|ACU31359 Aristida congesta subsp. barbicollis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 785 bits (396), Expect = 0.0 Identities = 491/527 (93%), Gaps = 1/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 ctgcggntagttcaggactccatttgcaagctgctcggataattncattaccttcgcgag 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| Sbjct: 1342 ctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacgag 1283 Query: 108 caagatcacgcccttngttacgagcttgnacacaagcttntaaagccactcgattagctg 167 ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1282 caagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctg 1223 Query: 168 ctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctanngntcctccaccaaattgtaatacag 227 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1222 ctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgg 1163 Query: 228 aatcgtgccccaaagatttnggtcagagctggcntatgccaaacatgaataccacctgaa 287 |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1162 aatcgt-ccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaa 1104 Query: 288 gctaccggtntaacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 347 || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 gccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagca 1044 Query: 348 cgatctttttnaataaaatcatcgngcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcncgt 407 |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1043 cgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgt 984 Query: 408 tccccttctaacttacctactactgnaccggagtggatatgatctcccccanacatacgc 467 ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 983 tccccttctaacttacctactactgtaccagaatggatatgatctcccccagacatacgc 924 Query: 468 aatgctttanctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgca 527 ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 aatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataactgca 864 Query: 528 tgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 574 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| Sbjct: 863 tgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaata 817 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 3,153,492 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 3153492 Number of successful extensions: 98159 Number of sequences better than 10.0: 14728 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 14709 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 28 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 57012 Number of HSP's gapped (non-prelim): 21118 length of query: 580 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 557 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 9548816821128 effective search space used: 9548816821128 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)