Clone Name | rbasd19o11 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1441 bits (727), Expect = 0.0 Identities = 741/743 (99%), Gaps = 2/743 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 76 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1548 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1489 Query: 77 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1488 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1429 Query: 137 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1369 Query: 197 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1309 Query: 257 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1249 Query: 317 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1189 Query: 377 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1129 Query: 437 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 497 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 557 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcc 616 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagcc 950 Query: 617 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 676 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 890 Query: 677 aattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcattt 736 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 889 aattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-tt 831 Query: 737 caagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 caagtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1441 bits (727), Expect = 0.0 Identities = 741/743 (99%), Gaps = 2/743 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 76 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1548 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1489 Query: 77 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1488 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1429 Query: 137 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1369 Query: 197 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1309 Query: 257 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1249 Query: 317 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1189 Query: 377 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1129 Query: 437 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 497 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 557 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcc 616 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagcc 950 Query: 617 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 676 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 890 Query: 677 aattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcattt 736 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 889 aattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-tt 831 Query: 737 caagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 caagtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1441 bits (727), Expect = 0.0 Identities = 741/743 (99%), Gaps = 2/743 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 76 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1427 Query: 77 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1367 Query: 137 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1307 Query: 197 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 256 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1247 Query: 257 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1187 Query: 317 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1127 Query: 377 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1067 Query: 437 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagaca 1007 Query: 497 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 947 Query: 557 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcc 616 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 946 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagcc 888 Query: 617 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 676 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 aaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccct 828 Query: 677 aattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcattt 736 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 827 aattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-tt 769 Query: 737 caagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 768 caagtaatgccccttgatttcac 746
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1429 bits (721), Expect = 0.0 Identities = 738/741 (99%), Gaps = 2/741 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1546 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1487 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1427 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1367 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1307 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1247 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1187 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1127 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 1067 Query: 499 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1007 Query: 559 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaa 618 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 619 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 888 Query: 679 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttca 738 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 887 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttca 829 Query: 739 agtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 828 agtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1413 bits (713), Expect = 0.0 Identities = 730/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1413 bits (713), Expect = 0.0 Identities = 730/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1413 bits (713), Expect = 0.0 Identities = 730/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1413 bits (713), Expect = 0.0 Identities = 730/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1413 bits (713), Expect = 0.0 Identities = 730/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1413 bits (713), Expect = 0.0 Identities = 730/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1413 bits (713), Expect = 0.0 Identities = 730/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1413 bits (713), Expect = 0.0 Identities = 730/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 878 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 817 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 759 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 758 cccttgatttcac 746
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1411 bits (712), Expect = 0.0 Identities = 735/741 (99%), Gaps = 2/741 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1546 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1487 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1427 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1367 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1307 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1247 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1187 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1127 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 1067 Query: 499 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 558 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcaatgctttnnntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1007 Query: 559 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaa 618 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 619 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 888 Query: 679 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttca 738 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 887 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttca 829 Query: 739 agtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 828 agtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1407 bits (710), Expect = 0.0 Identities = 729/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1405 bits (709), Expect = 0.0 Identities = 729/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 830 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 711 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 710 cccttgatttcac 698
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1405 bits (709), Expect = 0.0 Identities = 728/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 ttkagstaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1405 bits (709), Expect = 0.0 Identities = 729/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1405 bits (709), Expect = 0.0 Identities = 729/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1405 bits (709), Expect = 0.0 Identities = 729/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1405 bits (709), Expect = 0.0 Identities = 729/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1405 bits (709), Expect = 0.0 Identities = 729/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1405 bits (709), Expect = 0.0 Identities = 729/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1405 bits (709), Expect = 0.0 Identities = 729/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 878 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 817 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 759 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 758 cccttgatttcac 746
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1404 bits (708), Expect = 0.0 Identities = 728/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatantatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctakttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1402 bits (707), Expect = 0.0 Identities = 728/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1402 bits (707), Expect = 0.0 Identities = 728/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 878 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 817 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 759 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 758 cccttgatttcac 746
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1400 bits (706), Expect = 0.0 Identities = 728/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggagcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1398 bits (705), Expect = 0.0 Identities = 728/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaagtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1398 bits (705), Expect = 0.0 Identities = 728/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1398 bits (705), Expect = 0.0 Identities = 728/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1398 bits (705), Expect = 0.0 Identities = 728/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1398 bits (705), Expect = 0.0 Identities = 728/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1398 bits (705), Expect = 0.0 Identities = 728/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1398 bits (705), Expect = 0.0 Identities = 728/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1396 bits (704), Expect = 0.0 Identities = 727/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccnnngtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1390 bits (701), Expect = 0.0 Identities = 727/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1388 bits (700), Expect = 0.0 Identities = 726/733 (99%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1386 bits (699), Expect = 0.0 Identities = 725/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1059 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 999 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 880 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 879 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 821 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 820 cccttgatttcac 808
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1384 bits (698), Expect = 0.0 Identities = 734/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 888 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 830 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 aagtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1384 bits (698), Expect = 0.0 Identities = 734/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 888 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 830 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 aagtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1384 bits (698), Expect = 0.0 Identities = 734/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 888 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 830 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 aagtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1384 bits (698), Expect = 0.0 Identities = 734/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 888 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 830 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 aagtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1382 bits (697), Expect = 0.0 Identities = 731/741 (98%), Gaps = 2/741 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 accttcttatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 1005 Query: 499 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 945 Query: 559 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaa 618 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 944 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaa 886 Query: 619 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 885 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 826 Query: 679 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttca 738 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 825 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttca 767 Query: 739 agtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 766 agtaatgccccttgatttcac 746
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1376 bits (694), Expect = 0.0 Identities = 732/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacat 1068 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatartgagcca 949 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 888 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 830 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 aagtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1376 bits (694), Expect = 0.0 Identities = 733/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 888 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 830 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 aagtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1376 bits (694), Expect = 0.0 Identities = 733/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 888 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 830 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 aagtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1376 bits (694), Expect = 0.0 Identities = 733/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 888 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 830 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 aagtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1376 bits (694), Expect = 0.0 Identities = 732/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1426 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1366 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1306 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1246 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1186 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1126 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1066 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1065 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggayatgatctcccccagacat 1006 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 946 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 945 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatartgagcca 887 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 886 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 827 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 826 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 768 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 767 aagtaatgccccttgatttcac 746
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1374 bits (693), Expect = 0.0 Identities = 731/741 (98%), Gaps = 2/741 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 1005 Query: 499 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 945 Query: 559 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaa 618 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 944 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaa 886 Query: 619 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 885 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 826 Query: 679 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttca 738 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 825 ttctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttca 767 Query: 739 agtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 766 agtaatgccccttgatttcac 746
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1374 bits (693), Expect = 0.0 Identities = 721/729 (98%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 814 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 813 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 755 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 754 tgatttcac 746
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1372 bits (692), Expect = 0.0 Identities = 727/736 (98%), Gaps = 2/736 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1000 Query: 504 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 940 Query: 564 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtag 623 |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 939 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtag 881 Query: 624 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 683 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 tatttgcggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 821 Query: 684 tcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaa 743 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 820 tcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaa 762 Query: 744 tgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||| Sbjct: 761 tgccccttgatttcac 746
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1370 bits (691), Expect = 0.0 Identities = 724/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctyg 818 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 817 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 759 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 758 cccttgatttcac 746
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1366 bits (689), Expect = 0.0 Identities = 730/741 (98%), Gaps = 2/741 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 499 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 559 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaa 618 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 619 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 887 Query: 679 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttca 738 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 886 ttctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttca 828 Query: 739 agtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 agtaatgccccttgatttcac 807
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1366 bits (689), Expect = 0.0 Identities = 730/741 (98%), Gaps = 2/741 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 499 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 559 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaa 618 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 619 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 887 Query: 679 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttca 738 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 886 ttctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttca 828 Query: 739 agtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 agtaatgccccttgatttcac 807
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1366 bits (689), Expect = 0.0 Identities = 721/729 (98%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 814 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 813 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 755 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 754 tgatttcac 746
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1366 bits (689), Expect = 0.0 Identities = 721/729 (98%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 814 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 813 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 755 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 754 tgatttcac 746
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1364 bits (688), Expect = 0.0 Identities = 726/736 (98%), Gaps = 2/736 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1431 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1371 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1311 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1251 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1191 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1131 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1071 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1011 Query: 504 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 951 Query: 564 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtag 623 |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 950 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtag 892 Query: 624 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 683 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 tatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 832 Query: 684 tcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaa 743 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 831 ttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaa 773 Query: 744 tgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||| Sbjct: 772 tgccccttgatttcac 757
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1364 bits (688), Expect = 0.0 Identities = 726/736 (98%), Gaps = 2/736 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56340 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 56281 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56280 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 56221 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56220 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 56161 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56160 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 56101 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56100 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 56041 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56040 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 55981 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55980 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 55921 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55920 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 55861 Query: 504 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55860 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 55801 Query: 564 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtag 623 |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55800 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtag 55742 Query: 624 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 683 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55741 tatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 55682 Query: 684 tcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaa 743 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 55681 ttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaa 55623 Query: 744 tgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||| Sbjct: 55622 tgccccttgatttcac 55607
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1364 bits (688), Expect = 0.0 Identities = 723/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ngctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtcaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 830 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 711 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 710 cccttgatttcac 698
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1364 bits (688), Expect = 0.0 Identities = 726/736 (98%), Gaps = 2/736 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1467 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1407 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1347 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1287 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1227 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1167 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1107 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1047 Query: 504 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 987 Query: 564 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtag 623 |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 986 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtag 928 Query: 624 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 683 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 868 Query: 684 tcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaa 743 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 ttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaa 809 Query: 744 tgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||| Sbjct: 808 tgccccttgatttcac 793
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1362 bits (687), Expect = 0.0 Identities = 720/729 (98%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggct 1365 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1305 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1185 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 766 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 765 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 707 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 706 tgatttcac 698
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1362 bits (687), Expect = 0.0 Identities = 725/735 (98%), Gaps = 2/735 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1539 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1480 Query: 85 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 144 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1420 Query: 145 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 204 ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 agatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1360 Query: 205 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 264 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1300 Query: 265 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1240 Query: 325 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1180 Query: 385 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1120 Query: 445 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 504 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 ccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 1060 Query: 505 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 1000 Query: 565 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 624 ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 999 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagt 941 Query: 625 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 684 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 881 Query: 685 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaat 744 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 880 tgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaat 822 Query: 745 gccccttgatttcac 759 ||||||||||||||| Sbjct: 821 gccccttgatttcac 807
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 729/741 (98%), Gaps = 2/741 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 499 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 559 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaa 618 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 619 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 887 Query: 679 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttca 738 |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 886 ttctcttgcaaatacagctctnttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttca 828 Query: 739 agtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 agtaatgccccttgatttcac 807
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1360 bits (686), Expect = 0.0 Identities = 724/736 (98%), Gaps = 2/736 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1000 Query: 504 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 940 Query: 564 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtag 623 |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 939 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtag 881 Query: 624 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 683 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 tatttgcggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 821 Query: 684 tcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaa 743 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 820 tcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaa 762 Query: 744 tgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||| Sbjct: 761 tgccccttgatttcac 746
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1358 bits (685), Expect = 0.0 Identities = 723/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1478 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 1058 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 998 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 997 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 939 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 938 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttg 879 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 878 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 820 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 819 cccttgatttcac 807
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1358 bits (685), Expect = 0.0 Identities = 719/729 (98%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 sscccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaa 814 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 813 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 755 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 754 tgatttcac 746
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1358 bits (685), Expect = 0.0 Identities = 722/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttg 818 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 817 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 759 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 758 cccttgatttcac 746
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1358 bits (685), Expect = 0.0 Identities = 720/729 (98%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaa 814 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 813 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 755 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 754 tgatttcac 746
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1356 bits (684), Expect = 0.0 Identities = 725/736 (98%), Gaps = 2/736 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1000 Query: 504 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 940 Query: 564 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtag 623 |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 939 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtag 881 Query: 624 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 683 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 tatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 821 Query: 684 tcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaa 743 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 820 ttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaa 762 Query: 744 tgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||| Sbjct: 761 tgccccttgatttcac 746
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1354 bits (683), Expect = 0.0 Identities = 727/741 (98%), Gaps = 2/741 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttyg 1126 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 499 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 559 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaa 618 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 619 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 887 Query: 679 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttca 738 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 886 ttctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttca 828 Query: 739 agtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 agtaatgccccttgatttcac 807
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1354 bits (683), Expect = 0.0 Identities = 723/735 (98%), Gaps = 2/735 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 84 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1419 Query: 85 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 144 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1359 Query: 145 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 204 ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 agatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1299 Query: 205 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 264 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1239 Query: 265 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1179 Query: 325 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1178 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacga 1119 Query: 385 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1059 Query: 445 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaat 999 Query: 505 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 939 Query: 565 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 624 ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 938 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagt 880 Query: 625 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 684 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 879 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 820 Query: 685 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaat 744 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 819 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaat 761 Query: 745 gccccttgatttcac 759 ||||||||||||||| Sbjct: 760 gccccttgatttcac 746
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 727/741 (98%), Gaps = 2/741 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1066 Query: 499 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 1006 Query: 559 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaa 618 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1005 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 619 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 887 Query: 679 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttca 738 |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 886 ttctcttgcaaatacagctctnttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttca 828 Query: 739 agtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 827 agtaatgccccttgatttcac 807
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 730/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1071 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1011 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1010 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagcca 952 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 892 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 891 attctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 833 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 832 aagtaatgccccttgatttcac 811
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 727/741 (98%), Gaps = 2/741 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 1005 Query: 499 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 945 Query: 559 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaa 618 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 944 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaa 886 Query: 619 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 885 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 826 Query: 679 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttca 738 |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 825 ttctcttgcaaatacagctctnttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttca 767 Query: 739 agtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 766 agtaatgccccttgatttcac 746
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0 Identities = 719/729 (98%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaa 814 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 813 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 755 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 754 tgatttcac 746
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1350 bits (681), Expect = 0.0 Identities = 722/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 caaatacagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 711 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 710 cccttgatttcac 698
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1350 bits (681), Expect = 0.0 Identities = 722/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttg 770 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 711 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 710 cccttgatttcac 698
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1350 bits (681), Expect = 0.0 Identities = 722/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1336 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1276 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1216 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1156 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1096 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1036 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1035 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 976 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 916 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 856 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 855 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 797 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 737 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 736 caaatacagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 678 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 677 cccttgatttcac 665
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1350 bits (681), Expect = 0.0 Identities = 722/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 817 caaatacagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 759 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 758 cccttgatttcac 746
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1350 bits (681), Expect = 0.0 Identities = 721/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 817 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 759 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 758 cccttgatttcac 746
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1350 bits (681), Expect = 0.0 Identities = 722/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 817 caaatacagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 759 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 758 cccttgatttcac 746
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1348 bits (680), Expect = 0.0 Identities = 724/736 (98%), Gaps = 2/736 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1209 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1149 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1089 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1029 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 969 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 909 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 849 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 789 Query: 504 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 788 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 729 Query: 564 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtag 623 |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 728 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgacgcaaagtag 670 Query: 624 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 683 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 669 tatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 610 Query: 684 tcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaa 743 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 609 ttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaa 551 Query: 744 tgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||| Sbjct: 550 tgccccttgatttcac 535
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1348 bits (680), Expect = 0.0 Identities = 729/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1071 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1011 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1010 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagcca 952 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 892 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 891 attctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 833 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 832 aagtaatgccccttgatttcac 811
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1346 bits (679), Expect = 0.0 Identities = 718/729 (98%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 814 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct: 813 nacngctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccctt 755 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 754 tgatttcac 746
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1346 bits (679), Expect = 0.0 Identities = 718/729 (98%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaa 814 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 813 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 755 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 754 tgatttcac 746
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 729/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1354 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1294 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1234 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1174 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1114 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1054 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 994 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 934 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 874 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccatt-gtcgcggcaataatgagcca 815 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 814 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 755 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 754 attctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 696 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 695 aagtaatgccccttgatttcac 674
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 728/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 888 actctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 830 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 aagtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 721/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1338 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1337 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1278 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1218 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1158 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1098 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 cggtataacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1038 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 978 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 918 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 858 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 857 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 799 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 739 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 738 caaatacagctctcttcatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 680 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 679 cccttgatttcac 667
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1344 bits (678), Expect = 0.0 Identities = 729/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1354 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1294 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1234 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1174 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1114 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1054 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 994 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 934 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 874 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccatt-gtcgcggcaataatgagcca 815 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 814 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 755 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 754 attctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 696 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 695 aagtaatgccccttgatttcac 674
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1342 bits (677), Expect = 0.0 Identities = 721/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 caaatacagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 711 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 710 cccttgatttcac 698
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1342 bits (677), Expect = 0.0 Identities = 718/729 (98%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1082 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct: 721 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgc 663 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 662 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaa 603 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 602 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 544 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 543 tgatttcac 535
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1342 bits (677), Expect = 0.0 Identities = 726/742 (97%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 888 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 830 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 aagtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1342 bits (677), Expect = 0.0 Identities = 720/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 818 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 817 caaatacagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 759 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 758 cccttgatttcac 746
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1342 bits (677), Expect = 0.0 Identities = 718/729 (98%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 atagtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1334 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1274 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1214 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1154 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1094 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1034 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 974 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 914 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 854 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 853 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 795 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 794 ggtaaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 735 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 734 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 676 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 675 tgatttcac 667
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1342 bits (677), Expect = 0.0 Identities = 721/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cgctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcacggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctag 818 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 817 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 759 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 758 cccttgatttcac 746
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1340 bits (676), Expect = 0.0 Identities = 728/742 (98%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1071 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1070 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataac 1011 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1010 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagcca 952 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 892 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 891 attctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 833 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 832 aagtaatgccccttgatttcac 811
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1334 bits (673), Expect = 0.0 Identities = 720/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 711 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 710 cccttgatttcac 698
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1334 bits (673), Expect = 0.0 Identities = 720/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcggccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 caaatacagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 711 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 710 cccttgatttcac 698
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1334 bits (673), Expect = 0.0 Identities = 727/742 (97%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgcnnnaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacat 1071 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1011 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct: 1010 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagcca 952 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 892 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 891 attctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 833 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 832 aagtaatgccccttgatttcac 811
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1334 bits (673), Expect = 0.0 Identities = 716/729 (98%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 874 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 873 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctygcaaa 814 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 813 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 755 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 754 tgatttcac 746
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1326 bits (669), Expect = 0.0 Identities = 719/733 (98%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgctgccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 997 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 937 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 936 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcacggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 877 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctag 818 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 817 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 759 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 758 cccttgatttcac 746
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1318 bits (665), Expect = 0.0 Identities = 717/733 (97%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 caaatacagctctcttaagcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 711 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 710 cccttgatttcac 698
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1318 bits (665), Expect = 0.0 Identities = 715/729 (98%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgacca 1082 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct: 721 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttgc 663 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 662 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaa 603 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 602 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 544 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 543 tgatttcac 535
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1318 bits (665), Expect = 0.0 Identities = 723/742 (97%), Gaps = 3/742 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 77 |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 78 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 138 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 197 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 198 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 257 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 258 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 318 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 378 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 438 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 497 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctannnctgtaccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgnnnnagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaaccccta 889 Query: 678 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttc 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 888 attctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttc 830 Query: 738 aagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 aagtaatgccccttgatttcac 808
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1300 bits (656), Expect = 0.0 Identities = 718/736 (97%), Gaps = 2/736 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 24 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1482 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1423 Query: 84 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1422 cgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagc 1363 Query: 144 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 203 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1303 Query: 204 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 263 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1302 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgga 1243 Query: 264 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 323 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 atcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1183 Query: 324 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1123 Query: 384 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1063 Query: 444 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 cccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1003 Query: 504 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 563 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1002 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatg 943 Query: 564 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtag 623 |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct: 942 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactag 884 Query: 624 tatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 683 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 883 tatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctc 824 Query: 684 tcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaa 743 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 823 tcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaa 765 Query: 744 tgccccttgatttcac 759 |||||||| ||||||| Sbjct: 764 tgccccttaatttcac 749
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 713/733 (97%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1388 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1329 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1328 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1269 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1268 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1209 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1208 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1149 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1089 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1029 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 969 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 909 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 849 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 848 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 790 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 ttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 730 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 729 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgc 671 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||| ||||||| Sbjct: 670 cccttaatttcac 658
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1279 bits (645), Expect = 0.0 Identities = 713/733 (97%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcat 889 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtat 830 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 770 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgc 711 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||| ||||||| Sbjct: 710 cccttaatttcac 698
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 709/729 (97%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1365 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1185 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 agcttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 826 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 766 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 765 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 707 Query: 751 tgatttcac 759 | ||||||| Sbjct: 706 taatttcac 698
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1271 bits (641), Expect = 0.0 Identities = 709/729 (97%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1522 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1463 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1462 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1403 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1343 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1342 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1283 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1223 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1163 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1103 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 agcttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1043 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 983 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 982 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 924 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 864 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 863 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 805 Query: 751 tgatttcac 759 | ||||||| Sbjct: 804 taatttcac 796
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1269 bits (640), Expect = 0.0 Identities = 657/660 (99%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 686
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1265 bits (638), Expect = 0.0 Identities = 677/689 (98%), Gaps = 1/689 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1371 Query: 85 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 144 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1311 Query: 145 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 204 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 205 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 264 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 265 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 324 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 325 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 384 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 385 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 445 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 504 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 505 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 891 Query: 565 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 624 ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagt 832 Query: 625 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 684 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctct 772 Query: 685 cgcaaatacagctctcttaatcatttctt 713 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 771 agcaaatacagctctcttaatcatttctt 743
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0 Identities = 708/729 (97%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1404 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggct 1345 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1285 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacca 1225 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcc 1165 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttct 985 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgc 806 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaa 746 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 745 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 687 Query: 751 tgatttcac 759 | ||||||| Sbjct: 686 taatttcac 678
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1261 bits (636), Expect = 0.0 Identities = 656/660 (99%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 910 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 850 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 849 tgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 791 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 731 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 730 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 672
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 663/670 (98%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 652 Query: 750 ttgatttcac 759 |||||||||| Sbjct: 651 ttgatttcac 642
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1257 bits (634), Expect = 0.0 Identities = 663/670 (98%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 890 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 830 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 829 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 770 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 711 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 710 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 652 Query: 750 ttgatttcac 759 |||||||||| Sbjct: 651 ttgatttcac 642
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0 Identities = 710/733 (96%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1428 atcgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 888 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtat 830 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 829 ttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttg 770 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgc 711 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||| ||||||| Sbjct: 710 cccttaatttcac 698
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1251 bits (631), Expect = 0.0 Identities = 711/735 (96%), Gaps = 2/735 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 84 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1430 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagcc 1371 Query: 85 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 144 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 145 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 204 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 205 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 264 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 265 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 324 || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 325 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcga 1071 Query: 385 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 444 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcc 1011 Query: 445 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 504 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctaacttacctactactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 505 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 891 Query: 565 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 624 ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaagcaggccatt-gtcacggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 625 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 684 |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 772 Query: 685 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaat 744 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 771 tgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaat 713 Query: 745 gccccttgatttcac 759 ||||||| ||||||| Sbjct: 712 gccccttaatttcac 698
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1247 bits (629), Expect = 0.0 Identities = 688/705 (97%), Gaps = 2/705 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 109 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 168 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 169 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 228 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 229 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 289 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 349 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 408 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 409 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 468 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 977 Query: 469 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 528 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 917 Query: 529 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagt 857 Query: 589 aagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaa 648 |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 856 aagccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaa 798 Query: 649 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcat 708 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| Sbjct: 797 gtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaaaatagctctcttcatcat 738 Query: 709 ttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 753 ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 737 ttcttcacatgtacccgcagttgca-ttcaagtaatgccccttga 694
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1243 bits (627), Expect = 0.0 Identities = 702/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtc 1284 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1224 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1223 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1164 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1163 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1104 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1044 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 984 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 924 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 923 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 864 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 863 gaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggta 805 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaataca 745 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 744 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 686 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 685 ttcac 681
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1229 bits (620), Expect = 0.0 Identities = 661/672 (98%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 448 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 508 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 568 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 627 |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 628 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 687 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagc 749 Query: 688 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 747 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 690 Query: 748 ccttgatttcac 759 |||||||||||| Sbjct: 689 ccttgatttcac 678
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1227 bits (619), Expect = 0.0 Identities = 658/669 (98%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 806 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 805 ggtgaatcccccagttaagtagtcrtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaa 746 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 745 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 687 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 686 tgatttcac 678
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1225 bits (618), Expect = 0.0 Identities = 659/670 (98%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaa 747 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 688 Query: 750 ttgatttcac 759 |||||||||| Sbjct: 687 ttgatttcac 678
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 702/725 (96%), Gaps = 4/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124637 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124636 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124577 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124576 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 124517 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124516 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 124458 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124457 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 124399 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124398 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124339 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124338 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124279 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124278 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 124219 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124218 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 124160 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124159 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 124100 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 124099 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 124041 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 124040 ttcac 124036 Score = 1223 bits (617), Expect = 0.0 Identities = 702/725 (96%), Gaps = 4/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30110 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30109 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30050 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30049 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 29990 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 29872 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29812 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29811 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29752 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29751 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 29692 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 29691 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 29633 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 29632 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 29573 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 29572 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 29514 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 29513 ttcac 29509
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1221 bits (616), Expect = 0.0 Identities = 651/660 (98%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtaaatcc 805 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 686
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 702/729 (96%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1411 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1352 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1351 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1292 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1291 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1232 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1231 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1172 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1171 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1112 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1052 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 992 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 932 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 872 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 871 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 813 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 812 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 753 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 752 tatagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 694 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 693 tgatttcac 685
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 702/729 (96%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1409 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1350 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1290 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1289 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1230 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1229 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1170 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1169 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1110 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1050 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 990 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 930 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 870 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 869 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 811 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 810 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 751 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 750 tatagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 692 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 691 tgatttcac 683
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 705/733 (96%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 acccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 888 tgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtat 830 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcg 770 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 caaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgc 711 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 710 cccttgatttcac 698
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1215 bits (613), Expect = 0.0 Identities = 702/729 (96%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1423 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1364 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1304 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1303 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1244 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1243 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1184 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1183 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1124 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1064 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1004 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 944 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 884 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 883 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 825 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 824 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 765 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 764 tatagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 706 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 705 tgatttcac 697
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 698/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55351 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55350 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55291 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55290 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55231 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55230 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55171 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55111 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55051 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55050 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 54991 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54990 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54931 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54930 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54872 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54871 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54812 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 54811 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 54753 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 54752 ttcac 54748
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 698/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 125692 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125691 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 125632 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 125631 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 125572 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 125571 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 125512 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125511 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 125452 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125451 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 125392 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125391 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 125332 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 125331 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 125272 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 125271 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 125213 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 125212 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 125153 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 125152 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 125094 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 125093 ttcac 125089 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 698/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30632 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30631 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30572 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30571 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30512 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30511 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 30452 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30451 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 30392 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 30332 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30331 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 30272 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 30271 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 30212 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 30211 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 30153 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 30152 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 30093 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 30092 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 30034 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 30033 ttcac 30029
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 698/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1181 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaact 1001 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 762 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 761 gctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcggtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 703 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 702 ttcac 698
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 701/729 (96%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 766 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 765 tatagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 707 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 706 tgatttcac 698
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 698/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1285 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1225 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1224 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1165 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1164 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1105 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1045 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 985 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 925 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 924 atacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggt 865 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 806 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct: 805 aatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatata 746 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 745 gctctcttcatcatatcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgat 687 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 686 ttcac 682
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 704/733 (96%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 atcgatagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgc 1284 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1283 ggcaagttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaag 1224 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1223 atcgcgcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgc 1164 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1163 acccggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1104 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 atccccaaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1044 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cggtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 984 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 924 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 ttctaacttacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 864 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 804 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 803 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 745 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 744 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttg 685 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||| Sbjct: 684 caaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtagctgcagttgca-ttcaagtaatgc 626 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 625 cccttgatttcac 613
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 698/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 33527269 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527270 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 33527329 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 33527330 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 33527389 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 33527390 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 33527449 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527450 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 33527509 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527510 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 33527569 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527570 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 33527629 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 33527630 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 33527689 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 33527690 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 33527748 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 33527749 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 33527808 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 33527809 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 33527867 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 33527868 ttcac 33527872 Score = 256 bits (129), Expect = 9e-65 Identities = 154/161 (95%), Gaps = 1/161 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 599 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 658 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgc 39115413 Query: 659 attacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacat 718 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 39115412 attacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcat 39115353 Query: 719 gtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 39115352 gtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 39115313
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 698/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 72466 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72467 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 72526 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 72527 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 72586 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 72587 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 72646 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72647 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 72706 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72707 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 72766 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72767 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 72826 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 72827 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 72886 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 72887 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 72945 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 72946 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 73005 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 73006 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 73064 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 73065 ttcac 73069
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0 Identities = 698/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55330 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55329 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55270 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55269 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55210 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55209 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55150 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55149 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55090 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55089 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55030 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55029 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 54970 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 54969 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54910 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54909 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54851 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54850 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54791 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 54790 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 54732 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 54731 ttcac 54727
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 1201 bits (606), Expect = 0.0 Identities = 698/726 (96%), Gaps = 2/726 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 34 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 93 |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334 Query: 94 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 153 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1274 Query: 154 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 213 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214 Query: 214 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 273 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154 Query: 274 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094 Query: 334 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 393 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034 Query: 394 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 974 Query: 454 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 513 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 914 Query: 514 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 913 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 854 Query: 574 tgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 633 |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 853 tgaatgtgaagaagtaagccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 795 Query: 634 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 693 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 794 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 735 Query: 694 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 753 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 734 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 676 Query: 754 tttcac 759 |||||| Sbjct: 675 tttcac 670
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 762 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 761 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 703 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 702 ttcac 698
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55043 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55042 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54983 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54982 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54924 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54923 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54864 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 54863 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 54805 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 54804 ttcac 54800
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55043 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55042 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54983 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54982 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54924 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54923 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54864 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 54863 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 54805 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 54804 ttcac 54800
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 673/693 (97%), Gaps = 2/693 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 126 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 127 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 186 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 187 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 246 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 247 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 306 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 307 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 366 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 367 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 427 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 486 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatct 949 Query: 487 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 889 Query: 547 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggca 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 888 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggca 830 Query: 607 atagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 666 ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 829 ataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 770 Query: 667 aggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgc 726 |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 769 aggaactcctaattctctcgcaaatacagctcttttaatcatttcttcacatgtacctgc 710 Query: 727 agtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 709 agtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 678
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124359 Query: 515 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(0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29778 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29777 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>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 124359 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 124358 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 124299 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 124298 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 124240 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 124239 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 124180 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 124179 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 124121 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 124120 ttcac 124116 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 29778 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 29777 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 29718 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 29717 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 29659 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 29658 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 29599 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 29598 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 29540 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 29539 ttcac 29535
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55395 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55394 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55335 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55334 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55275 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55274 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55215 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55155 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55095 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55094 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 55035 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 55034 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 54975 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 54974 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 54916 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 54915 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 54856 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 54855 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 54797 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 54796 ttcac 54792
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 941 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 940 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 881 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 880 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 822 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 821 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 762 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 761 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 703 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 702 ttcac 698
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 700/729 (96%), Gaps = 2/729 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 31 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 90 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 766 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 || ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 765 tatagctctcttcatcatttcttcgactgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 707 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 706 tgatttcac 698
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 53605 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53604 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 53545 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 53544 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 53485 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 53484 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 53425 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53424 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 53365 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53364 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 53305 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53304 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 53245 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 53244 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 53185 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 53184 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 53126 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 53125 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 53066 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 53065 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 53007 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 53006 ttcac 53002
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 128538 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128537 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 128478 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 128477 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 128418 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 128417 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 128358 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128357 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 128298 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128297 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 128238 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128237 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 128178 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 128177 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 128118 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 128117 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 128059 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 128058 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 127999 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 127998 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 127940 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 127939 ttcac 127935
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10347213 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347212 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10347153 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10347152 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10347093 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10347092 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10347033 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10346913 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346912 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 10346853 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10346852 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 10346793 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 10346792 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 10346734 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10346733 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 10346674 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 10346673 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 10346615 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 10346614 ttcac 10346610
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1356 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1296 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1295 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1236 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1056 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 996 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 995 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 936 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 935 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 877 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 876 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 817 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 816 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 758 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 757 ttcac 753
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1099 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1039 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1038 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 979 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 978 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 919 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 859 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 799 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 739 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 738 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 679 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 678 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 620 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 619 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 560 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 559 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 501 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 500 ttcac 496
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10353252 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353251 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10353192 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10353191 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10353132 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10353131 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10353072 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353071 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10353012 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353011 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10352952 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352951 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 10352892 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 10352891 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 10352832 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 10352831 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 10352773 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 10352772 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 10352713 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 10352712 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 10352654 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 10352653 ttcac 10352649
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1688 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1687 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1628 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1627 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1568 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1567 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1508 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1388 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 tacctactactgcaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1328 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1327 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 1268 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtg 1209 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1208 aatcccccggtcaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 1149 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1148 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 1090 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 1089 ttcac 1085
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 697/725 (96%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1721 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1720 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1661 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1660 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1601 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1421 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 1361 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1360 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 1301 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1300 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 1242 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1241 aaccccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 1182 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1181 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 1123 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 1122 ttcac 1118 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 117 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 648/660 (98%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 686
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1197 bits (604), Expect = 0.0 Identities = 657/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 448 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 508 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 568 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 627 |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809 Query: 628 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 687 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 688 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 747 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 690 Query: 748 ccttgatttcac 759 |||| ||||||| Sbjct: 689 ccttaatttcac 678
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 634/642 (98%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 118 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 177 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 178 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 238 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 297 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 298 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 358 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 418 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 477 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 478 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 538 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt- 821 Query: 598 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 657 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 658 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 701 Query: 718 tgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 700 tgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 660
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 655/670 (97%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 944 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 884 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 883 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 825 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 824 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 765 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 764 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 706 Query: 750 ttgatttcac 759 || ||||||| Sbjct: 705 ttaatttcac 696
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 634/642 (98%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 118 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 177 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 178 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 238 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 297 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 298 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 358 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 418 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 477 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 940 Query: 478 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 880 Query: 538 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 879 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt- 821 Query: 598 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 657 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 761 Query: 658 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 760 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 701 Query: 718 tgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 700 tgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 660
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0 Identities = 655/670 (97%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 737 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttcatcatgtcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 750 ttgatttcac 759 |||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcac 668
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1189 bits (600), Expect = 0.0 Identities = 647/660 (98%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 |||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccatt-gtcacggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttaagtagtcgtgcattacaataggaacccctaattctctagcaaatacagctct 745 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 686
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 654/670 (97%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 672 Query: 750 ttgatttcac 759 || ||||||| Sbjct: 671 ttaatttcac 662
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1185 bits (598), Expect = 0.0 Identities = 654/670 (97%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 672 Query: 750 ttgatttcac 759 || ||||||| Sbjct: 671 ttaatttcac 662
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 662/681 (97%), Gaps = 2/681 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 79 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 138 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 139 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 198 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 199 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 258 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 259 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 318 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 319 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 378 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 379 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 438 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 439 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacata 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacata 939 Query: 499 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 879 Query: 559 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaa 618 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 878 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaa 820 Query: 619 agtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaa 678 | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 819 actagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaa 760 Query: 679 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttca 738 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 759 ttctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttca 701 Query: 739 agtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||| ||||||| Sbjct: 700 agtaatgccccttaatttcac 680
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 671/693 (96%), Gaps = 2/693 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 126 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 127 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 186 ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 187 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 246 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 247 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 306 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 307 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 366 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 367 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 427 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatct 486 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatct 949 Query: 487 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 cccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgt 889 Query: 547 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggca 606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct: 888 ctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggca 830 Query: 607 atagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaat 666 ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct: 829 ataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaat 770 Query: 667 aggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgc 726 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 769 aggaacccctaattctcttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgc 710 Query: 727 agtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 709 agtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 678
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 701/733 (95%), Gaps = 2/733 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 atcgatggtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgc 1339 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1338 ggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaag 1279 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1158 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1099 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1098 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatc 1039 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 858 tgctcggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtat 800 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 799 ttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcg 740 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 739 caaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgc 681 Query: 747 cccttgatttcac 759 ||||||||||||| Sbjct: 680 cccttgatttcac 668
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 695/725 (95%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614443 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614442 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614383 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614382 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614323 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614143 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614142 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 5614083 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5614082 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 5614023 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 5614022 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 5613964 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 5613963 aatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 5613904 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 5613903 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 5613845 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 5613844 ttcac 5613840 Score = 692 bits (349), Expect = 0.0 Identities = 406/421 (96%), Gaps = 3/421 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 339 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 399 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 459 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 518 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13436925 Query: 519 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 578 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13436924 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13436865 Query: 579 gtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 638 ||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13436864 gtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 13436806 Query: 639 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctc 698 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 13436805 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctc 13436746 Query: 699 tcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttca 758 |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 13436745 tcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttca 13436687 Query: 759 c 759 | Sbjct: 13436686 c 13436686 Score = 289 bits (146), Expect = 7e-75 Identities = 171/178 (96%), Gaps = 1/178 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagcca 13397978 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 675 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13397977 aactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13397920 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 142 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 284 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 313 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 7e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 364 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 398 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.67 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 282 ggtcagagctggcatatgccaa 303 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 696/725 (96%), Gaps = 3/725 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 23203693 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203694 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 23203752 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 23203753 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 23203812 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 23203992 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203993 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 23204052 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 23204053 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 23204112 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 23204113 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 23204171 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 23204172 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 23204231 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 23204232 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 23204290 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 23204291 ttcac 23204295 Score = 117 bits (59), Expect = 6e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 147 atc 149 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 6e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 147 atc 149 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 696/725 (96%), Gaps = 3/725 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 154341 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154342 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 154400 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 154401 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 154460 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 154461 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 154520 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 154581 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 154640 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154641 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 154700 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 154701 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 154760 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 154761 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 154819 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 154820 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 154879 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 154880 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 154938 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 154939 ttcac 154943
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 696/725 (96%), Gaps = 3/725 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38455 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38456 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38514 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38515 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38574 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38575 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38634 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38635 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38694 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38695 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 38754 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38755 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 38814 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38815 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 38874 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 38875 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 38933 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 38934 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 38993 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 38994 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 39052 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 39053 ttcac 39057
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 695/725 (95%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614432 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614431 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614372 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614371 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614312 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614311 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614252 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614251 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614192 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614191 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614132 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614131 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 5614072 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 5614071 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 5614012 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 5614011 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 5613953 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 5613952 aatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 5613893 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 5613892 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 5613834 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 5613833 ttcac 5613829 Score = 692 bits (349), Expect = 0.0 Identities = 406/421 (96%), Gaps = 3/421 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 339 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 399 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 459 tactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 518 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 13391199 Query: 519 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 578 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13391198 acggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 13391139 Query: 579 gtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatc 638 ||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 13391138 gtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatc 13391080 Query: 639 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctc 698 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 13391079 ccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctc 13391020 Query: 699 tcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttca 758 |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 13391019 tcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttca 13390961 Query: 759 c 759 | Sbjct: 13390960 c 13390960 Score = 289 bits (146), Expect = 7e-75 Identities = 171/178 (96%), Gaps = 1/178 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 498 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 558 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagcca 617 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagcca 13352252 Query: 618 aagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 675 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352251 aactagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccc 13352194 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 142 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-05 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 284 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 313 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 7e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 364 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 398 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.67 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 282 ggtcagagctggcatatgccaa 303 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 1183 bits (597), Expect = 0.0 Identities = 695/725 (95%), Gaps = 2/725 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 35 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 94 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 95 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 154 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38442 Query: 155 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 214 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38443 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38502 Query: 215 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 274 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38503 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38562 Query: 275 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622 Query: 335 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682 Query: 395 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 38742 Query: 455 tacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 514 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38743 tacctactactgtaccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 38802 Query: 515 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 574 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 38803 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggt 38862 Query: 575 gaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtg 634 ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 38863 gaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtg 38921 Query: 635 aatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaataca 694 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 38922 aatcccctggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaataca 38981 Query: 695 gctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgat 754 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 38982 gctcttttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaat 39040 Query: 755 ttcac 759 ||||| Sbjct: 39041 ttcac 39045
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1181 bits (596), Expect = 0.0 Identities = 655/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 448 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 507 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 508 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 568 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 627 |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 810 Query: 628 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 687 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 809 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 750 Query: 688 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 747 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 749 aaatacagctcttttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 691 Query: 748 ccttgatttcac 759 |||| ||||||| Sbjct: 690 ccttaatttcac 679
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 653/670 (97%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 748 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 747 atacagctcttttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 689 Query: 750 ttgatttcac 759 || ||||||| Sbjct: 688 ttaatttcac 679
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 1178 bits (594), Expect = 0.0 Identities = 650/666 (97%), Gaps = 2/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 154 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 213 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 214 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 273 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 274 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 334 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 394 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 454 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 513 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 514 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 573 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 882 Query: 574 tgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 633 |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 823 Query: 634 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 693 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 822 gaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 763 Query: 694 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 753 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 762 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 704 Query: 754 tttcac 759 |||||| Sbjct: 703 tttcac 698
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1176 bits (593), Expect = 0.0 Identities = 679/705 (96%), Gaps = 2/705 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 475 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 534 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 535 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 594 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 846 Query: 595 ttggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 654 || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 845 tt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtc 787 Query: 655 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 714 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 786 atgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatatcttc 727 Query: 715 acatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 726 gcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 683
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 645/660 (97%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 926 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 866 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 807 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 806 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 747 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 746 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 688
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 1174 bits (592), Expect = 0.0 Identities = 654/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 448 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 507 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 933 Query: 508 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 873 Query: 568 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 627 |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 872 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 814 Query: 628 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 687 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 813 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 754 Query: 688 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 747 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 753 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 695 Query: 748 ccttgatttcac 759 |||| ||||||| Sbjct: 694 ccttaatttcac 683
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 698/731 (95%), Gaps = 2/731 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 86 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 87 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 146 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 147 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 206 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgc 1249 Query: 207 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 266 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 acctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 267 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 326 ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1129 Query: 327 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 386 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatc 1069 Query: 387 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 446 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 447 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 949 Query: 507 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 566 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 948 ttttgctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 889 Query: 567 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 626 ||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||| |||||| Sbjct: 888 tgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagataaactagtat 830 Query: 627 ttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcg 686 ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 829 ttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcg 770 Query: 687 caaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgc 746 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 769 caaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtagctgcagtcgca-ttcaagtaatgc 711 Query: 747 cccttgatttc 757 ||||||||||| Sbjct: 710 cccttgatttc 700
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 647/664 (97%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 155 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 156 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 215 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 216 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 275 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 276 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 336 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 395 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 396 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 456 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 515 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 516 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 576 aatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 635 |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtga 809 Query: 636 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 695 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749 Query: 696 ctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatt 755 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 748 ctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaaataatgccccttaatt 690 Query: 756 tcac 759 |||| Sbjct: 689 tcac 686
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 652/670 (97%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 910 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 850 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 849 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 790 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 731 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 730 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 672 Query: 750 ttgatttcac 759 || ||||||| Sbjct: 671 ttaatttcac 662
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 646/662 (97%), Gaps = 2/662 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 98 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 157 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 158 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 217 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 218 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 277 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 278 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 338 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 398 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 457 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 458 ctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 517 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 908 Query: 518 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 577 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 907 cacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 848 Query: 578 tgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaat 637 |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 847 tgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaat 789 Query: 638 cccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagct 697 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 788 cccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagct 729 Query: 698 ctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttc 757 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 728 ctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttc 670 Query: 758 ac 759 || Sbjct: 669 ac 668
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 653/672 (97%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 448 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 507 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 508 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 568 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 627 |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 628 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 687 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 tgcggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 749 Query: 688 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 747 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 748 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 690 Query: 748 ccttgatttcac 759 |||| ||||||| Sbjct: 689 ccttaatttcac 678
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 655/675 (97%), Gaps = 2/675 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 85 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 144 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 145 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 204 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 205 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 264 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 265 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 324 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 325 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 385 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 444 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 445 ccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaat 504 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaat 951 Query: 505 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgc 564 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 950 gctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgc 891 Query: 565 attgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 624 ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 890 attgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 625 atttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 684 |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 831 atttgcggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctct 772 Query: 685 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaat 744 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 771 cgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaat 713 Query: 745 gccccttgatttcac 759 ||||||| ||||||| Sbjct: 712 gccccttaatttcac 698
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 693/726 (95%), Gaps = 2/726 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 34 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 93 ||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1277 Query: 94 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 153 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1276 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217 Query: 154 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 213 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1157 Query: 214 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 273 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1097 Query: 274 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtata 1037 Query: 334 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1036 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttca 977 Query: 394 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917 Query: 454 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 513 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagct 857 Query: 514 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 856 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 797 Query: 574 tgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 633 |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 796 tgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggt 738 Query: 634 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 693 |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | Sbjct: 737 gaatcctccagttaaatagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatgc 678 Query: 694 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 753 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 677 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 619 Query: 754 tttcac 759 |||||| Sbjct: 618 tttcac 613
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 643/660 (97%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 686
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 648/667 (97%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 152 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 153 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 212 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 213 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 272 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 273 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 332 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 333 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 393 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 452 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 453 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 512 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 513 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 573 gtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 632 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 633 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 692 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 725 Query: 693 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttg 752 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 724 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctta 666 Query: 753 atttcac 759 ||||||| Sbjct: 665 atttcac 659
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 648/667 (97%), Gaps = 2/667 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 93 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 152 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 153 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 212 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 213 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 272 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 273 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 332 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 333 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 393 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 452 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 453 cttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 512 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 904 Query: 513 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 903 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 844 Query: 573 gtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcgg 632 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 843 gtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcgg 785 Query: 633 tgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 692 |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 784 tgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaata 725 Query: 693 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttg 752 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 724 cagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctta 666 Query: 753 atttcac 759 ||||||| Sbjct: 665 atttcac 659
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0 Identities = 657/679 (96%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcac 668
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 650/670 (97%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 806 cggtgaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaa 747 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 746 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 688 Query: 750 ttgatttcac 759 || ||||||| Sbjct: 687 ttaatttcac 678
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 647/666 (97%), Gaps = 2/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 154 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 213 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 214 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 273 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 274 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 334 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 393 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 394 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 454 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 513 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 931 Query: 514 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 573 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 930 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacgg 871 Query: 574 tgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 633 |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 870 tgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggt 812 Query: 634 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 693 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 811 gaatcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 752 Query: 694 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 753 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 751 agctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaa 693 Query: 754 tttcac 759 |||||| Sbjct: 692 tttcac 687
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 650/670 (97%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 797 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaagcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 750 ttgatttcac 759 |||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcac 668
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 650/670 (97%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaatcatttcgtcgactgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 750 ttgatttcac 759 |||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcac 668
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 1154 bits (582), Expect = 0.0 Identities = 683/714 (95%), Gaps = 2/714 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 105 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 106 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 165 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 166 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 225 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 226 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 286 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 345 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 346 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 406 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 465 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 466 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 525 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 526 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 585 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 929 tgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 870 Query: 586 agtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 645 |||| ||| || |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 869 agtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagt 811 Query: 646 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 705 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaat 751 Query: 706 catttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 750 catttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 698
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 1152 bits (581), Expect = 0.0 Identities = 670/697 (96%), Gaps = 2/697 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 122 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 123 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 182 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1273 Query: 183 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 242 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 243 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 302 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 303 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 362 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagt 1093 Query: 363 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 423 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1032 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatg 973 Query: 483 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 972 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattttt 913 Query: 543 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgc 602 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| Sbjct: 912 ctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgc 854 Query: 603 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 662 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 794 Query: 663 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 722 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| Sbjct: 793 caataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttgttcgcatgtac 734 Query: 723 ccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 733 ctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 698
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 656/679 (96%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcac 668
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 644/664 (96%), Gaps = 2/664 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 96 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 155 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 156 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 215 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 216 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 275 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 276 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 335 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 336 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 395 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 396 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 456 acctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 515 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 928 Query: 516 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 868 Query: 576 aatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtga 635 |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 867 aatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtga 809 Query: 636 atcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 695 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 808 atcccccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacag 749 Query: 696 ctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatt 755 |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 748 ctcttttaatcatttcttcacatgtagctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatt 690 Query: 756 tcac 759 |||| Sbjct: 689 tcac 686
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 649/670 (96%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 930 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 929 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgc 870 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 869 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 811 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 810 cggtgaatcccccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 751 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 750 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 692 Query: 750 ttgatttcac 759 || ||||||| Sbjct: 691 ttaatttcac 682
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 682/714 (95%), Gaps = 2/714 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 105 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 106 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 165 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 166 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 225 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 226 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 286 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 345 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 346 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 406 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 465 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 466 gtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 525 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gtaccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaa 930 Query: 526 tgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 585 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 929 tgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 870 Query: 586 agtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggt 645 |||| ||| || |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 869 agtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagt 811 Query: 646 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaat 705 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 810 taagtagtcatgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaat 751 Query: 706 catttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 750 catttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 698
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 675/705 (95%), Gaps = 2/705 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 968 Query: 475 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 534 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 967 tggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 908 Query: 535 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 594 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 907 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 848 Query: 595 ttggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 654 || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 847 tt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtc 789 Query: 655 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 714 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 788 atgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttc 729 Query: 715 acatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 728 gactgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 685
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 641/660 (97%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctct 745 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 744 cttcatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 686
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 641/660 (97%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 804 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctct 745 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 744 cttcatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 686
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 641/660 (97%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 934 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 874 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 873 tgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 815 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 814 cccagttatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 755 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 754 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 696
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 650/672 (96%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 448 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 507 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 935 Query: 508 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 875 Query: 568 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 627 |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 874 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816 Query: 628 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 687 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct: 815 tgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaatcggaacccctaattccctcgc 756 Query: 688 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 747 |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 755 aaatacggctcttttaatcatttcttcgcatgtagctgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 697 Query: 748 ccttgatttcac 759 |||||||||||| Sbjct: 696 ccttgatttcac 685
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 655/679 (96%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcac 668
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 627/642 (97%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 118 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 177 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 178 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 238 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 297 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 298 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 358 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 418 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 477 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 478 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 538 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt- 818 Query: 598 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 657 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 658 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 698 Query: 718 tgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 697 tgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 657
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 648/670 (96%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 927 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 867 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 tcggtgaatgtgaagaagtaagccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 807 cggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 748 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 747 atacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 689 Query: 750 ttgatttcac 759 |||||||||| Sbjct: 688 ttgatttcac 679
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 627/642 (97%), Gaps = 2/642 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 118 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 177 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 178 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 238 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 297 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 298 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 358 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 418 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 477 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtgg 937 Query: 478 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 atatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatga 877 Query: 538 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattg 597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 876 tttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt- 818 Query: 598 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatg 657 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgtagtcatg 758 Query: 658 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 757 cattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcaca 698 Query: 718 tgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 697 tgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 657
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 648/670 (96%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttg 797 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatccccctgttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaagcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 750 ttgatttcac 759 |||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcac 668
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1136 bits (573), Expect = 0.0 Identities = 653/677 (96%), Gaps = 2/677 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttc 757 ||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttc 670
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 640/660 (96%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 686
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 640/660 (96%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 745 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 686
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 654/679 (96%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 835 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 834 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 775 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 774 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaac 716 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 715 tagtatttgcggtgaatcctccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 656 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| Sbjct: 655 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtagctgcagtcgca-ttcaag 597 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 596 taatgccccttgatttcac 578
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 649/672 (96%), Gaps = 2/672 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 148 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 207 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 208 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 267 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 268 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 327 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 328 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 387 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 388 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 448 tctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 507 ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 508 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 567 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 568 gcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 627 |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 799 Query: 628 tgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgc 687 ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 798 tgcagtgaatccaccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgc 739 Query: 688 aaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcc 747 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 738 aaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcc 680 Query: 748 ccttgatttcac 759 |||||||||||| Sbjct: 679 ccttgatttcac 668
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 654/679 (96%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcac 668
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 631/649 (97%), Gaps = 2/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 111 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 170 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 171 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 230 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 231 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 290 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 291 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 350 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 351 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 411 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 969 Query: 471 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 909 Query: 531 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 849 Query: 591 gccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 650 |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 848 gccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 790 Query: 651 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 710 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 730 Query: 711 cttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 729 cttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 682
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 673/705 (95%), Gaps = 2/705 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 981 Query: 475 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 534 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 980 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 921 Query: 535 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 594 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 920 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 861 Query: 595 ttggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 654 || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 860 tt-gtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 802 Query: 655 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 714 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 801 atgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 742 Query: 715 acatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 741 gcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 698
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 673/705 (95%), Gaps = 2/705 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57854 Query: 475 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 534 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57853 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57794 Query: 535 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 594 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57793 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57734 Query: 595 ttggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 654 || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 57733 tt-gtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 57675 Query: 655 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 714 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57674 atgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 57615 Query: 715 acatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57614 gcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 57571
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 673/705 (95%), Gaps = 2/705 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 120062 Query: 475 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 534 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120061 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 120002 Query: 535 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 594 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 120001 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 119942 Query: 595 ttggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 654 || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 119941 tt-gtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 119883 Query: 655 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 714 ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119882 atgcattacaataggaacccctaattcctttgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 119823 Query: 715 acatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 119822 gcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 119779
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 673/705 (95%), Gaps = 2/705 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 57864 Query: 475 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 534 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57863 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 57804 Query: 535 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 594 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57803 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 57744 Query: 595 ttggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 654 || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 57743 tt-gtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 57685 Query: 655 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 714 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57684 atgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 57625 Query: 715 acatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57624 gcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 57581
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 673/705 (95%), Gaps = 2/705 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 58435 Query: 475 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 534 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58434 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 58375 Query: 535 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 594 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 58374 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 58315 Query: 595 ttggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 654 || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 58314 tt-gtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttgcggtgaatcctcctgttaagtagtc 58256 Query: 655 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 714 ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58255 atgcattacaataggaacccctaattcctttgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 58196 Query: 715 acatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58195 gcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 58152
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 639/660 (96%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgtaccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 924 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 864 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 |||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 863 tgaagaagcaggccatt-gtcacggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcc 805 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 804 cccagtgatgtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatacagctct 745 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 744 cttaatcatttcttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 686
>emb|X00630.1|CHHV02 Barley chloroplast genes rbcL and atpB Length = 2174 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 582/584 (99%), Gaps = 2/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 176 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2174 aagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtccta 2115 Query: 236 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2114 aagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggca 2055 Query: 296 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 2054 tatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagt 1995 Query: 356 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1994 cctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaat 1935 Query: 416 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1934 caacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagt 1875 Query: 476 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1874 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 1815 Query: 536 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1814 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccat 1755 Query: 596 tggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 655 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1754 t-gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtca 1696 Query: 656 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 715 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1695 tgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttca 1636 Query: 716 catgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1635 catgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 1593
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 639/660 (96%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgtaccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaataca 906 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 905 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatg 846 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 845 tgaagaagtaagccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 787 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 786 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatacagctct 727 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 726 cttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 668
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 653/679 (96%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattataataggagcccctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcac 668
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 688/726 (94%), Gaps = 2/726 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 34 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 93 ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1858 gtatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1799 Query: 94 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 153 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1798 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1739 Query: 154 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 213 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1738 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1679 Query: 214 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 273 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1678 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1619 Query: 274 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1618 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1559 Query: 334 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 393 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1558 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1499 Query: 394 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1498 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1439 Query: 454 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 513 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1438 ttacctactactgtaccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagct 1379 Query: 514 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1378 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1319 Query: 574 tgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 633 |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1318 tgaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaatacatagccaaactagtatttgcggt 1260 Query: 634 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 693 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1259 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatat 1200 Query: 694 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 753 ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1199 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgtcccttga 1141 Query: 754 tttcac 759 |||||| Sbjct: 1140 tttcac 1135
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 646/670 (96%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 797 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaa 737 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 750 ttgatttcac 759 |||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcac 668
>gb|AY632361.1| Brachypodium pinnatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; plastid Length = 1277 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 619/635 (97%), Gaps = 2/635 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 125 tttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttcta 184 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1277 tttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttcta 1218 Query: 185 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctc 244 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctc 1158 Query: 245 caccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 304 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 caccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaa 1098 Query: 305 catgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 364 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 catgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtga 1038 Query: 365 aaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 424 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaac 978 Query: 425 ctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgat 484 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 977 ctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgat 918 Query: 485 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttct 858 Query: 545 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcgg 604 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 857 gtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcgg 799 Query: 605 caatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattaca 664 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 caataatgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattaca 739 Query: 665 ataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtaccc 724 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 738 ataggaacccctaattctctcgcaaaaacagctctcttcatcatttcttcacatgtaccc 679 Query: 725 gcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 678 gcagttgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 645
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 652/679 (96%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgtt-atcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcac 668
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 635/657 (96%), Gaps = 2/657 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 103 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 162 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 163 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 222 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 223 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 282 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 283 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 343 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 402 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 403 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 462 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 463 actgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 522 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgg 913 Query: 523 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 582 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 912 aaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtga 853 Query: 583 agaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatccccc 642 ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 852 agaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatccccc 794 Query: 643 ggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctctt 702 |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 793 agttatgtagtcatgcattacaataggaacgcctaattctctcgcaaatacagctctctt 734 Query: 703 aatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 733 aatcatttcttcacatgtacctgcagttgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 678
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 652/679 (96%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgtt-atcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaattggaacccctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcac 668
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 652/679 (96%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatagg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccatt-gtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaactcctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatatcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcac 668
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 687/726 (94%), Gaps = 2/726 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 34 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 93 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 gtatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1779 Query: 94 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 153 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1778 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1719 Query: 154 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 213 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1718 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggt 1659 Query: 214 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 273 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1658 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1599 Query: 274 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1598 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1539 Query: 334 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 393 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1538 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1479 Query: 394 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1478 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1419 Query: 454 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 513 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1418 ttacctactactgtaccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagct 1359 Query: 514 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 573 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1358 aatacacggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1299 Query: 574 tgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 633 |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| || |||| ||||||||||||| Sbjct: 1298 tgaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaatacatagacaaactagtatttgcggt 1240 Query: 634 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 693 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | Sbjct: 1239 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctcttgcaaatgc 1180 Query: 694 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 753 ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1179 agctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgtcccttga 1121 Query: 754 tttcac 759 |||||| Sbjct: 1120 tttcac 1115
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 642/666 (96%), Gaps = 2/666 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 153 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 154 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 213 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 214 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 273 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 274 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 334 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 394 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 454 ttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 513 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 922 Query: 514 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 921 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 862 Query: 574 tgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggt 633 |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 861 tgaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcggt 803 Query: 634 gaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatac 693 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 802 gaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaatac 743 Query: 694 agctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttga 753 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 742 agctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttga 684 Query: 754 tttcac 759 |||||| Sbjct: 683 tttcac 678
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 629/649 (96%), Gaps = 2/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 111 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 170 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 171 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 230 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 231 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 290 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 291 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 351 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 410 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 411 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 471 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 530 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 531 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 591 gccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 650 |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 807 gccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 651 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 710 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcattt 689 Query: 711 cttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 688 cttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 641
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 629/649 (96%), Gaps = 2/649 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 111 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 170 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 171 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 230 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 231 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 290 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 291 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 351 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 410 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 411 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 470 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 928 Query: 471 ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 530 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcat 868 Query: 531 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaa 590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 accatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtag 808 Query: 591 gccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagt 650 |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct: 807 gccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttatgt 749 Query: 651 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcattt 710 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 748 agtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatatagctctcttcatcattt 689 Query: 711 cttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 688 cttcacatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 641
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 665/697 (95%), Gaps = 2/697 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 122 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 123 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 182 ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1257 Query: 183 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 242 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1197 Query: 243 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 302 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1137 Query: 303 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 362 ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 aacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagt 1077 Query: 363 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1017 Query: 423 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatg 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1016 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatg 957 Query: 483 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattttt 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 956 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgattttt 897 Query: 543 ctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgc 602 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| Sbjct: 896 ctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgc 838 Query: 603 ggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcatta 662 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 837 ggcaataatgagccaaactagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcatta 778 Query: 663 caataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtac 722 |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 777 caataggagcccctaattccctcgcaaatatagctctcttcatcatttcttcgcatgtac 718 Query: 723 ccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 717 cgcaagtcgca-ttcaagtaatgtcccttgatttcac 682
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 644/669 (96%), Gaps = 2/669 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 91 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 151 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 211 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 270 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 271 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 331 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 390 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 391 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 451 aacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 510 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 511 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 570 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 571 cggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgc 630 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgc 826 Query: 631 ggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 825 ggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaa 766 Query: 691 tacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccct 750 || ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 765 tatagctctcttcatcatatcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccct 707 Query: 751 tgatttcac 759 ||||||||| Sbjct: 706 tgatttcac 698
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 643/668 (96%), Gaps = 2/668 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 152 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 211 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 212 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 271 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 272 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 331 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 332 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 391 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 392 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 452 acttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 511 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 887 Query: 512 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 571 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 886 ctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgccc 827 Query: 572 ggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcg 631 |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 826 ggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttgcg 768 Query: 632 gtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaat 691 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 767 gtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaaat 708 Query: 692 acagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccctt 751 | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 707 atagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgcccctt 649 Query: 752 gatttcac 759 |||||||| Sbjct: 648 gatttcac 641
>emb|AJ746284.1| Arundo donax chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 651/679 (95%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcac 668
>gb|U31360.1|ADU31360 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 651/679 (95%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgaga 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggacatgatctcccccagacatacg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcac 668
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 651/679 (95%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcatggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 cccttgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcac 668
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 651/679 (95%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccagagtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacagc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 |||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | || ||||| Sbjct: 864 atgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataattagacaaag 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| Sbjct: 745 ctctcgcaaatgcagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtagca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcac 668
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 651/679 (95%), Gaps = 2/679 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 81 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 140 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 141 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 200 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 201 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 260 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 261 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 320 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 321 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 380 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 381 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 440 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 441 ttccccttctaacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacg 500 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacg 925 Query: 501 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 caatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgc 865 Query: 561 atgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaag 620 ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 atgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgtt-gtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 621 tagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaatt 680 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaatt 746 Query: 681 ctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaag 740 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 745 ccctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaag 687 Query: 741 taatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||| Sbjct: 686 taatgccccttgatttcac 668
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 644/670 (96%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 gggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccgg 1096 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactaccgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 855 acggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cagtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 ataccgctctcttcatcatttcttcgcatgtacccgcagtcgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 750 ttgatttcac 759 |||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcac 668
>gb|AY622888.1| Brachyelytrum erectum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 644/670 (96%), Gaps = 2/670 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1276 Query: 150 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 209 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 210 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 269 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 270 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 329 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 330 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 389 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 390 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 449 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcccgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 450 taacttacctactactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 509 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 916 Query: 510 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 569 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 915 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 856 Query: 570 acggtgaatgtgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 629 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 855 tcggtgaatgtgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Query: 630 cggtgaatcccccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaa 689 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 796 cggtgaatcccccagttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattccctcgcaa 737 Query: 690 atacagctctcttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgcccc 749 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct: 736 atacagctctcttcatcatttcttcgcatgtacctgcagttgca-ttcaagtaatgcccc 678 Query: 750 ttgatttcac 759 |||||||||| Sbjct: 677 ttgatttcac 668
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 670/705 (95%), Gaps = 2/705 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1789 aatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1730 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1729 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1670 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1669 caggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1610 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1609 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1550 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1549 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccag 1490 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1489 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1430 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 474 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1429 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 1370 Query: 475 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 534 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1369 tggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 1310 Query: 535 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 594 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1309 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccg 1250 Query: 595 ttggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 654 || |||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 1249 tt-gtcgcggcaataataagacaaactagtatttgcggtgaatcctccagttaagtagtc 1191 Query: 655 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctctcttaatcatttcttc 714 ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 atgcattacaataggaacccctaattcccttgcaaatgcagctctcttaatcatttcttc 1131 Query: 715 acatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1130 gcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttaatttcac 1087
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 617/636 (97%), Gaps = 1/636 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 115 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 174 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 175 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 235 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 294 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 295 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 354 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 355 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 415 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggag 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccggcg 966 Query: 475 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacca 534 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 965 tggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacca 906 Query: 535 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcca 594 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 905 tgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcca 846 Query: 595 ttggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcccccggttaagtagtc 654 || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 845 tt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcggtaaatcccccagttaagtagtc 787 Query: 655 atgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaa 690 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 786 atgcattacaataggagcccctaattctctcgcaaa 751 Score = 50.1 bits (25), Expect = 0.011 Identities = 25/25 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 735 ttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 707 ttcaagtaatgccccttgatttcac 683
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 1102 bits (556), Expect = 0.0 Identities = 636/660 (96%), Gaps = 2/660 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 100 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttca 1279 Query: 160 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 219 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattt 1219 Query: 220 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 279 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct: 1218 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagatt 1159 Query: 280 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 339 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1158 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacct 1099 Query: 340 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1039 Query: 400 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 979 Query: 460 actactgtaccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 519 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 actactgtaccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaataca 919 Query: 520 cggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatg 579 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 918 cgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatg 859 Query: 580 tgaagaagtaagccattggtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttgcggtgaatcc 639 |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct: 858 tgaagaagtaggccatt-gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttgcagtgaatcc 800 Query: 640 cccggttaagtagtcatgcattacaataggaacccctaattctctcgcaaatacagctct 699 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 799 cccagttaagtagtcatgcattacaataggagcccctaattccctcgcaaatacagctct 740 Query: 700 cttaatcatttcttcacatgtacccgcagtcgcatttcaagtaatgccccttgatttcac 759 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 739 cttaatcatttcttcgcatgtacctgcagtcgca-ttcaagtaatgccccttgatttcac 681 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 5,583,108 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 5583108 Number of successful extensions: 160827 Number of sequences better than 10.0: 15224 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15174 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 66 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 108120 Number of HSP's gapped (non-prelim): 25023 length of query: 759 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 736 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 12617467110144 effective search space used: 12617467110144 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 21 (42.1 bits)