Clone Name | rbasd18n23 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 612/613 (99%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 70 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1548 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1489 Query: 71 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1488 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1429 Query: 131 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 190 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1369 Query: 191 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1309 Query: 251 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1249 Query: 311 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1189 Query: 371 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1129 Query: 431 cgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagac 490 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagac 1070 Query: 491 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 1010 Query: 551 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 950 Query: 611 aaagtagtatttg 623 ||||||||||||| Sbjct: 949 aaagtagtatttg 937
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 612/613 (99%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 70 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1548 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1489 Query: 71 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1488 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1429 Query: 131 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 190 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1369 Query: 191 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1309 Query: 251 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1249 Query: 311 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1189 Query: 371 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1129 Query: 431 cgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagac 490 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagac 1070 Query: 491 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 1010 Query: 551 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 950 Query: 611 aaagtagtatttg 623 ||||||||||||| Sbjct: 949 aaagtagtatttg 937
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1199 bits (605), Expect = 0.0 Identities = 612/613 (99%), Gaps = 1/613 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 11 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 70 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 agaccttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatactt 1427 Query: 71 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacctt 1367 Query: 131 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 190 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 cgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgat 1307 Query: 191 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 tagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgta 1247 Query: 251 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 atacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccac 1187 Query: 311 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 ctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgc 1127 Query: 371 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 gagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt 1067 Query: 431 cgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagac 490 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 cgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagac 1008 Query: 491 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 atacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaata 948 Query: 551 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 610 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 947 actgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcc 888 Query: 611 aaagtagtatttg 623 ||||||||||||| Sbjct: 887 aaagtagtatttg 875
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1187 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 609/611 (99%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1546 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1487 Query: 73 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1427 Query: 133 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1367 Query: 193 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1307 Query: 253 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1247 Query: 313 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1187 Query: 373 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1127 Query: 433 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 492 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 493 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 553 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 612 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 613 agtagtatttg 623 ||||||||||| Sbjct: 947 agtagtatttg 937
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1172 bits (591), Expect = 0.0 Identities = 601/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 878 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 877 ttg 875
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1170 bits (590), Expect = 0.0 Identities = 606/611 (99%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1546 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1487 Query: 73 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1486 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1427 Query: 133 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1426 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1367 Query: 193 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1366 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1307 Query: 253 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1306 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1247 Query: 313 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1246 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1187 Query: 373 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1186 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1127 Query: 433 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 492 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1126 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacat 1068 Query: 493 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 552 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1067 acgcaatgctttnnntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1008 Query: 553 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 612 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1007 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 948 Query: 613 agtagtatttg 623 ||||||||||| Sbjct: 947 agtagtatttg 937
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 600/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1168 bits (589), Expect = 0.0 Identities = 600/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 878 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 877 ttg 875
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1166 bits (588), Expect = 0.0 Identities = 600/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 600/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 830 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 829 ttg 827
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 600/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaagtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 599/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cttkagstaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 600/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 600/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 600/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 600/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 600/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 600/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 600/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaaaccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1164 bits (587), Expect = 0.0 Identities = 600/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 878 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 877 ttg 875
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0 Identities = 599/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatantatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctakttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1158 bits (584), Expect = 0.0 Identities = 599/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggagcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 598/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0 Identities = 597/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1144 bits (577), Expect = 0.0 Identities = 596/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1538 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1479 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1419 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1359 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1299 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1239 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 cggtataacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatc 1179 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1119 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1060 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 1000 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 940 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 939 ttg 937
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 605/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttg 937
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 605/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttg 937
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 605/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttg 937
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1142 bits (576), Expect = 0.0 Identities = 605/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttg 937
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 603/611 (98%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 72 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 73 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 133 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 192 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 193 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 252 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 253 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 313 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 373 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 433 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 492 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacat 1006 Query: 493 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 946 Query: 553 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 612 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 945 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 886 Query: 613 agtagtatttg 623 ||||||||||| Sbjct: 885 agtagtatttg 875
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 597/603 (99%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 877 ttg 875
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1140 bits (575), Expect = 0.0 Identities = 602/611 (98%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 72 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 accttcttatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 73 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 133 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 192 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 193 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 252 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 253 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 313 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 373 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 433 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 492 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacat 1006 Query: 493 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 946 Query: 553 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 612 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 945 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 886 Query: 613 agtagtatttg 623 ||||||||||| Sbjct: 885 agtagtatttg 875
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 599/606 (98%), Gaps = 1/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 77 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1431 Query: 78 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1371 Query: 138 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 197 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1311 Query: 198 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 257 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1251 Query: 258 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1191 Query: 318 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1131 Query: 378 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1071 Query: 438 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 497 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1012 Query: 498 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 952 Query: 558 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 617 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 951 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtag 892 Query: 618 tatttg 623 |||||| Sbjct: 891 tatttg 886
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 599/606 (98%), Gaps = 1/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 77 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 78 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 138 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 197 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 198 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 257 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 258 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 318 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 378 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 438 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 497 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1001 Query: 498 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 941 Query: 558 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 617 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 940 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtag 881 Query: 618 tatttg 623 |||||| Sbjct: 880 tatttg 875
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 599/606 (98%), Gaps = 1/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 77 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56340 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 56281 Query: 78 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56280 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 56221 Query: 138 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 197 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56220 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 56161 Query: 198 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 257 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56160 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 56101 Query: 258 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56100 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 56041 Query: 318 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56040 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 55981 Query: 378 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55980 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 55921 Query: 438 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 497 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55920 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 55862 Query: 498 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55861 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 55802 Query: 558 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 617 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 55801 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtag 55742 Query: 618 tatttg 623 |||||| Sbjct: 55741 tatttg 55736
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1138 bits (574), Expect = 0.0 Identities = 599/606 (98%), Gaps = 1/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 77 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1526 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1467 Query: 78 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1466 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1407 Query: 138 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 197 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1347 Query: 198 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 257 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1346 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1287 Query: 258 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1227 Query: 318 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1167 Query: 378 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1107 Query: 438 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 497 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1048 Query: 498 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 988 Query: 558 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 617 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 987 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtag 928 Query: 618 tatttg 623 |||||| Sbjct: 927 tatttg 922
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 603/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagaca 1069 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagcca 949 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttg 937
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 604/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttg 937
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 604/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttg 937
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 604/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttg 937
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1134 bits (572), Expect = 0.0 Identities = 603/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1426 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1366 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1306 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1246 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1186 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1126 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1066 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1065 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagaca 1007 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 947 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 946 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatartgagcca 887 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 886 aagtagtatttg 875
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 602/611 (98%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 72 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 73 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 133 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 192 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 193 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 252 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 253 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 313 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 373 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 433 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 492 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 493 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 553 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 612 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 613 agtagtatttg 623 ||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttg 936
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 602/611 (98%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 72 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 73 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 133 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 192 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 193 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 252 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 253 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 313 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 373 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 433 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 492 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 493 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 553 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 612 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 613 agtagtatttg 623 ||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttg 936
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 602/611 (98%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 72 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 73 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 133 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 192 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 193 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 252 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 253 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 313 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 373 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 433 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 492 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 493 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 553 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 612 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 613 agtagtatttg 623 ||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttg 936
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 592/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 sscccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 595/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 877 ttg 875
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 593/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 592/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcg 1353 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1132 bits (571), Expect = 0.0 Identities = 593/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1130 bits (570), Expect = 0.0 Identities = 598/606 (98%), Gaps = 1/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 77 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 78 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 138 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 197 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 198 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 257 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 258 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 318 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 378 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 437 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 438 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 497 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1001 Query: 498 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 941 Query: 558 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 617 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 940 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtag 881 Query: 618 tatttg 623 |||||| Sbjct: 880 tatttg 875
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1128 bits (569), Expect = 0.0 Identities = 597/605 (98%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 78 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1539 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1480 Query: 79 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1420 Query: 139 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 198 ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 agatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1360 Query: 199 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 258 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1300 Query: 259 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1240 Query: 319 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1180 Query: 379 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1120 Query: 439 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 498 |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 ccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 1061 Query: 499 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 1001 Query: 559 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 618 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1000 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 941 Query: 619 atttg 623 ||||| Sbjct: 940 atttg 936
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 592/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1126 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 596/606 (98%), Gaps = 1/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 77 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1479 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1420 Query: 78 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1419 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1360 Query: 138 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 197 |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1359 aagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1300 Query: 198 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 257 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1240 Query: 258 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1180 Query: 318 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1120 Query: 378 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1060 Query: 438 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 497 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1001 Query: 498 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 941 Query: 558 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 617 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 940 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtag 881 Query: 618 tatttg 623 |||||| Sbjct: 880 tatttg 875
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 595/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 829 ttg 827
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 600/611 (98%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 72 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 73 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 133 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 192 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 193 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 252 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 253 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 313 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 373 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcg 1126 Query: 433 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 492 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 493 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 553 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 612 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 613 agtagtatttg 623 ||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttg 936
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 595/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1537 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1478 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1477 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1418 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1417 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1358 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1357 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1298 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1297 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1238 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1237 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1178 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1118 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 1059 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 999 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 998 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 939 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 938 ttg 936
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 595/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1395 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1336 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1335 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1276 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1216 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1215 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1156 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1096 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1036 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1035 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 976 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 917 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 857 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 856 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 797 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 796 ttg 794
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 595/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1057 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 877 ttg 875
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 600/611 (98%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 72 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1484 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1425 Query: 73 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1424 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1365 Query: 133 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 192 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1305 Query: 193 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 252 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1245 Query: 253 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1185 Query: 313 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1125 Query: 373 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 432 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcg 1065 Query: 433 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 492 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1006 Query: 493 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 946 Query: 553 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 612 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 945 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 886 Query: 613 agtagtatttg 623 ||||||||||| Sbjct: 885 agtagtatttg 875
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 592/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 592/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 595/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 877 ttg 875
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1124 bits (567), Expect = 0.0 Identities = 595/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 cgctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 877 ttg 875
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 597/606 (98%), Gaps = 1/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 77 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 cttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1209 Query: 78 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 1149 Query: 138 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 197 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1089 Query: 198 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 257 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1029 Query: 258 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 969 Query: 318 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 909 Query: 378 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 849 Query: 438 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 497 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 848 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 790 Query: 498 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 789 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 730 Query: 558 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 617 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 729 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtag 670 Query: 618 tatttg 623 |||||| Sbjct: 669 tatttg 664
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 594/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ngctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtcaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 830 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 829 ttg 827
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0 Identities = 596/605 (98%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 78 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1371 Query: 79 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1311 Query: 139 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 198 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 199 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 258 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 259 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 319 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 378 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 379 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 439 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 498 |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 499 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 892 Query: 559 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 618 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 832 Query: 619 atttg 623 ||||| Sbjct: 831 atttg 827
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 591/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggct 1365 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1305 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1185 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 885 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 599/611 (98%), Gaps = 1/611 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttcttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 72 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1545 acctttttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttca 1486 Query: 73 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1485 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 1426 Query: 133 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 192 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1425 cgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1366 Query: 193 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 252 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1365 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1306 Query: 253 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 312 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1305 acagaatcgtccccaaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1246 Query: 313 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1245 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1186 Query: 373 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 432 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct: 1185 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttyg 1126 Query: 433 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 492 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 1067 Query: 493 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 1007 Query: 553 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 612 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1006 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 947 Query: 613 agtagtatttg 623 ||||||||||| Sbjct: 946 agtagtatttg 936
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1120 bits (565), Expect = 0.0 Identities = 591/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnc 1233 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1118 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 602/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1072 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1012 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1011 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 952 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 951 aagtagtatttg 940
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 594/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 829 ttg 827
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 594/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 829 ttg 827
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 591/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1082 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 783 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 723 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 722 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttg 664
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 593/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1057 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 877 ttg 875
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1116 bits (563), Expect = 0.0 Identities = 593/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatc 1117 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 877 ttg 875
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1114 bits (562), Expect = 0.0 Identities = 601/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1072 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1012 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1011 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 952 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 951 aagtagtatttg 940
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1112 bits (561), Expect = 0.0 Identities = 594/605 (98%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 78 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1478 ttatcaatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 1419 Query: 79 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1418 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 1359 Query: 139 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 198 ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 agatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1299 Query: 199 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 258 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1239 Query: 259 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1179 Query: 319 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1178 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacga 1119 Query: 379 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1059 Query: 439 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 498 |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1058 ccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaa 1000 Query: 499 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 940 Query: 559 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 618 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 939 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagt 880 Query: 619 atttg 623 ||||| Sbjct: 879 atttg 875
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 601/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1354 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1294 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1234 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1174 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1114 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1054 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 994 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 935 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 875 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 874 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagcca 815 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 814 aagtagtatttg 803
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 600/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttg 937
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 593/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 atcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1338 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1337 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1278 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 atcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1218 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1158 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1098 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 cggtataacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1038 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 978 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 919 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 859 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 858 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 799 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 798 ttg 796
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1110 bits (560), Expect = 0.0 Identities = 601/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1413 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1354 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1294 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1234 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1174 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1114 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1054 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 994 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 935 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 875 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 874 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtagtccattgtcgcggcaataatgagcca 815 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 814 aagtagtatttg 803
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 593/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcggccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccc 1009 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 829 ttg 827
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 590/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 atagtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1334 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1274 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1214 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1154 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1153 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1094 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1034 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 974 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 aacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 915 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 914 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 855 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 854 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 796
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1108 bits (559), Expect = 0.0 Identities = 593/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1476 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1417 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1416 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1357 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 atcgctgccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1297 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1237 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1177 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1117 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1057 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttctaacttacctactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatg 998 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 997 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 938 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 937 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtat 878 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 877 ttg 875
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1106 bits (558), Expect = 0.0 Identities = 600/612 (98%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1072 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1071 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataa 1012 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1011 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 952 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 951 aagtagtatttg 940
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1104 bits (557), Expect = 0.0 Identities = 589/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1413 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1353 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1293 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1233 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 ccaaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1173 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1113 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1053 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 994 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 934 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 933 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 875
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 597/612 (97%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcssscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcg 1188 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttg 937
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1100 bits (555), Expect = 0.0 Identities = 599/612 (97%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1550 accttcttcatcgatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1491 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1490 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1431 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1430 gcgagcaagatcgcgcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1371 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 agctgcnnnaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1311 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1251 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1191 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1131 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 1072 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1012 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1011 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagcca 952 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 951 aagtagtatttg 940
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 591/603 (98%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatc 1069 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcccc 1009 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 829 ttg 827
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 590/603 (97%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 1309 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcccccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 830 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 829 ttg 827
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1092 bits (551), Expect = 0.0 Identities = 588/599 (98%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 1202 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1142 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1141 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgacca 1082 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 1022 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1021 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 962 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 902 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 901 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 842 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 841 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 783 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 782 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 723 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 722 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgacgcaaagtagtatttg 664
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0 Identities = 593/606 (97%), Gaps = 1/606 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 18 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 77 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1482 cttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagc 1423 Query: 78 tgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagc 137 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1422 cgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagc 1363 Query: 138 aagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 197 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 aagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1303 Query: 198 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 257 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1302 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacgga 1243 Query: 258 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 317 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 atcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1183 Query: 318 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1123 Query: 378 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1063 Query: 438 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 497 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 cccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 1004 Query: 498 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1003 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcat 944 Query: 558 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtag 617 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct: 943 gcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactag 884 Query: 618 tatttg 623 |||||| Sbjct: 883 tatttg 878
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1076 bits (543), Expect = 0.0 Identities = 594/612 (97%), Gaps = 2/612 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 13 accttctt-atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 71 |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1547 accttcttcatctatagtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttc 1488 Query: 72 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1487 acaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttc 1428 Query: 132 gcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 191 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1427 gcgagcaagatcgsscccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1368 Query: 192 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 251 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1367 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1308 Query: 252 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 311 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1307 tacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1248 Query: 312 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1247 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1188 Query: 372 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1187 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 1128 Query: 432 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 491 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1127 gcgttccccttctaacttacctannnctgta-ccggagtggatatgatctcccccagaca 1069 Query: 492 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 551 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tacgcaatgnnnnagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 1009 Query: 552 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagcca 611 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagcca 949 Query: 612 aagtagtatttg 623 |||||||||||| Sbjct: 948 aagtagtatttg 937
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 588/603 (97%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1388 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1329 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1328 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1269 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1268 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1209 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1208 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1149 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1148 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1089 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1029 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 969 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 910 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 850 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 849 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 790 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 789 ttg 787
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1068 bits (539), Expect = 0.0 Identities = 588/603 (97%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgc 1369 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctac 1129 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 cggtataacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgca 890 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 830 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 829 ttg 827
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 584/599 (97%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1404 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggct 1345 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1285 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacca 1225 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcc 1165 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttct 985 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 584/599 (97%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1365 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1245 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1185 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1125 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 agcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 885 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 827
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 1061 bits (535), Expect = 0.0 Identities = 584/599 (97%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1522 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggct 1463 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1462 agttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1403 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1402 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1343 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1342 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcc 1283 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1282 ccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1223 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1222 ataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1163 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1103 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 agcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 1044 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 984 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 983 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 925
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 570/581 (98%), Gaps = 1/581 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 43 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 102 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 103 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 162 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 163 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 222 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 223 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 282 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 283 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 343 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 402 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 403 aataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 462 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta 977 Query: 463 cccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 522 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 -ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatg 918 Query: 523 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 582 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaag 858 Query: 583 taagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 857 taagccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 817
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 1057 bits (533), Expect = 0.0 Identities = 588/605 (97%), Gaps = 1/605 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 19 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagct 78 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1430 ttatcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagcc 1371 Query: 79 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 138 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 139 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 199 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 258 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 259 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 318 || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 319 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcga 1071 Query: 379 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 438 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttcc 1011 Query: 439 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 498 |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctaacttacctactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 499 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 892 Query: 559 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 618 |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 619 atttg 623 ||||| Sbjct: 831 atttg 827
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 586/603 (97%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1428 atcgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgc 1369 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaag 1309 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1249 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1129 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1069 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 889 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 830 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 829 ttg 827
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 578/595 (97%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtc 1284 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1224 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1223 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1164 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1163 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1104 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1044 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 984 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 925 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 924 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 865 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 810
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 528/530 (99%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 815
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 579/599 (96%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 579/599 (96%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1411 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1352 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1351 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1292 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1291 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1232 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1231 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1172 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1171 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1112 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1052 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 992 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 933 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 932 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 873 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 872 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 814
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 576/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1285 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1225 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1224 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1165 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1164 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1105 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1045 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 985 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 926 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 925 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccgg 866 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 865 tgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 811
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 579/599 (96%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1409 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1350 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1290 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1289 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1230 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1229 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1170 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1169 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1110 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1050 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 990 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 931 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 871 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 870 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 812
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 579/599 (96%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1423 atagtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1364 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1304 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1303 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1244 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1243 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1184 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1183 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1124 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1064 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1004 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 945 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 885 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 884 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 826
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 527/530 (99%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 970 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 911 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 851 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 850 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 801
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 534/540 (98%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 534/540 (98%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 950 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 891 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 831 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 830 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 771
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 578/599 (96%), Gaps = 1/599 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 25 atagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggct 84 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1424 atagtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggct 1365 Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 581/603 (96%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 atcgatagtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgc 1284 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1283 ggcaagttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaag 1224 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1223 atcgcgcccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgc 1164 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1163 acccggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1104 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 atccccaaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1044 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 cggtataacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 984 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 924 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 923 ttctaacttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 865 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 864 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 805 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 804 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtat 745 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 744 ttg 742
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 581/603 (96%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1428 atcgatagtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgc 1369 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1308 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgc 1249 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1248 acccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1189 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1129 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatc 1069 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttcccc 1009 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 889 ttgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 830 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 829 ttg 827
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 577/595 (96%), Gaps = 3/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124637 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124636 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124577 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124576 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 124517 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124516 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 124458 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124457 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 124399 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124398 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124339 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124338 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124280 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124279 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124220 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 124219 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 124165 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 577/595 (96%), Gaps = 3/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30110 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30109 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30050 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30049 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 29990 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 29872 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29812 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29811 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29753 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29752 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29693 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 29692 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 29638
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 1011 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 535/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 142 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 201 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 202 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 261 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 262 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 322 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 382 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 442 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 501 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 502 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 562 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 621 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 622 tg 623 || Sbjct: 808 tg 807
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 533/540 (98%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 54929
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55103 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55102 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55044 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55043 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54984 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 54983 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 54929
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55351 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55350 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55291 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55290 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55231 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55230 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55171 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55111 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55051 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55050 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54992 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54991 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54932 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 54931 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 54877
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 550/563 (97%), Gaps = 1/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 120 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 121 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 180 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 181 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 241 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 300 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 301 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 360 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 361 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 421 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatc 950 Query: 481 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 541 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggca 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggca 830 Query: 601 atagtgagccaaagtagtatttg 623 ||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 829 ataatgagccaaactagtatttg 807
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 125692 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125691 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 125632 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 125631 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 125572 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 125571 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 125512 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125511 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 125452 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125451 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 125392 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125391 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 125333 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 125332 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 125273 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 125272 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 125218 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30632 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30631 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30572 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30571 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30512 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30511 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 30452 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30451 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 30392 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 30332 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30331 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 30273 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 30272 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 30213 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 30212 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 30158
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124359 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124300 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 124299 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 124245 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29779 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29719 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 29718 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 29664
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 124419 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124418 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 124360 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 124359 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 124300 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 124299 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 124245 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 29838 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29837 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 29779 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 29778 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 29719 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 29718 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 29664
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55395 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55394 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55335 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55334 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55275 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55274 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55215 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55155 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55095 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55094 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 55036 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 55035 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54976 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 54975 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 54921
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 827
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 532/539 (98%), Gaps = 1/539 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 985 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 aacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 926 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 866 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 865 acggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1181 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaact 1001 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 827
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 559/575 (97%), Gaps = 1/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 109 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 168 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 169 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 228 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 229 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 288 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 289 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 348 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 349 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 409 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 967 Query: 469 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 529 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 847 Query: 589 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 846 attgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 812
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 33527269 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527270 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 33527329 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 33527330 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 33527389 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 33527390 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 33527449 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527450 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 33527509 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527510 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 33527569 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527570 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 33527628 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 33527629 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 33527688 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 33527689 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 33527743 Score = 46.1 bits (23), Expect = 0.14 Identities = 29/31 (93%) Strand = Plus / Minus Query: 593 tcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 39115472 tcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 39115442
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 72466 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72467 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 72526 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 72527 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 72586 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 72587 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 72646 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72647 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 72706 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72707 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 72766 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72767 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 72825 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 72826 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 72885 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 72886 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 72940
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1356 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1296 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1295 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1236 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1056 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 997 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 996 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 937 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 936 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 882
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1099 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1039 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1038 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 979 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 978 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 919 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 859 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 799 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 798 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 740 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 739 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 680 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 679 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 625
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55330 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55329 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55270 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55269 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55210 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55209 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55150 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55149 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55090 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55089 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 55030 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55029 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 54971 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 54970 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 54911 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 54910 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 54856
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1688 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1687 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1628 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1627 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1568 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1567 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1508 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1388 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1387 tacctactactgca-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1329 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1328 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1269 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 1214
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 574/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1721 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1720 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1661 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1660 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1601 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1421 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 1362 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 1302 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1301 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 1247 Score = 58.0 bits (29), Expect = 4e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 111 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 574/596 (96%), Gaps = 1/596 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 87 |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334 Query: 88 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 147 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1274 Query: 148 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 207 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214 Query: 208 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 267 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154 Query: 268 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 327 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094 Query: 328 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 387 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034 Query: 388 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaac 974 Query: 448 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 507 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 915 Query: 508 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 567 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 914 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 855 Query: 568 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 854 gtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 799
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 573/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 1001 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1000 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 942 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 941 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 882 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 881 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 827
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 573/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 53605 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53604 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 53545 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 53544 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 53485 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 53484 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 53425 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53424 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 53365 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53364 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 53305 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53304 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 53246 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 53245 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 53186 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 53185 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 53131
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 573/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 128538 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128537 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 128478 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 128477 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 128418 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 128417 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 128358 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128357 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 128298 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128297 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 128238 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128237 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 128179 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 128178 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 128119 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 128118 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 128064
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 573/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10347213 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347212 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10347153 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10347152 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10347093 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10347092 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10347033 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10346913 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346912 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10346854 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10346853 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10346794 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 10346793 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 10346739
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 573/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10353252 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353251 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10353192 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10353191 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10353132 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10353131 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10353072 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353071 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10353012 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353011 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 10352952 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352951 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 10352893 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 10352892 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 10352833 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 10352832 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 10352778
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 991 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 531/540 (98%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 572/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614443 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614442 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614383 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614382 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614323 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614143 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614142 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atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 453 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 512 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13436926 Query: 513 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 572 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13436925 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13436866 Query: 573 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 13436865 tgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 13436815 Score = 212 bits (107), Expect = 1e-51 Identities = 125/131 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 493 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 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>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 572/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614432 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614431 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614372 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614371 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614312 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614311 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614252 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614251 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614192 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614191 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 5614132 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614131 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 5614073 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 5614072 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 5614013 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 5614012 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 5613958 Score = 482 bits (243), Expect = e-133 Identities = 281/291 (96%), Gaps = 2/291 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 333 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 393 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 453 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 512 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13391200 Query: 513 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 572 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391199 cacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaa 13391140 Query: 573 tgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 13391139 tgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 13391089 Score = 212 bits (107), Expect = 1e-51 Identities = 125/131 (95%) Strand = Plus / Minus Query: 493 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 553 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 612 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaa 13352251 Query: 613 agtagtatttg 623 | ||||||||| Sbjct: 13352250 actagtatttg 13352240 Score = 95.6 bits (48), Expect = 2e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 136 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 9e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 278 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 307 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 6e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 358 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 392 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.54 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 276 ggtcagagctggcatatgccaa 297 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 989 bits (499), Expect = 0.0 Identities = 572/595 (96%), Gaps = 1/595 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38442 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38443 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38502 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38503 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38562 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 38742 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38743 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38801 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38802 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38861 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 38862 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 38916
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 523/530 (98%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 815
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 532/542 (98%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 142 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 201 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 202 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 261 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 262 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 322 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 381 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 382 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 442 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 501 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 502 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 562 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 621 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 809 Query: 622 tg 623 || Sbjct: 808 tg 807
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 530/540 (98%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctccccttc 1004 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 945 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 885 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 884 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 825
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 983 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 572/596 (95%), Gaps = 1/596 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 87 ||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1277 Query: 88 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 147 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1276 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217 Query: 148 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 207 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1157 Query: 208 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 267 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1097 Query: 268 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 327 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtata 1037 Query: 328 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1036 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttca 977 Query: 388 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 917 Query: 448 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 507 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 916 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagc 858 Query: 508 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 567 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 857 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 798 Query: 568 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| Sbjct: 797 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttg 742
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 547/563 (97%), Gaps = 1/563 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 120 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 121 tcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaa 180 ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaa 1249 Query: 181 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 gccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcca 1189 Query: 241 ccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 300 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1188 ccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaaca 1129 Query: 301 tgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaa 360 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1128 tgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaa 1069 Query: 361 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 aagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacct 1009 Query: 421 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatc 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct: 1008 aaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatc 950 Query: 481 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 tcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctg 890 Query: 541 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggca 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 889 tctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggca 830 Query: 601 atagtgagccaaagtagtatttg 623 ||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 829 ataatgagccaaactagtatttg 807
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 556/575 (96%), Gaps = 1/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 108 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 109 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 168 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 169 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 228 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 229 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 288 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 289 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 348 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 349 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 409 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 967 Query: 469 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 528 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 966 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 907 Query: 529 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 906 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 847 Query: 589 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 846 attgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 812
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1428 atcgatggtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgc 1369 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1368 ggctagttcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaag 1309 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1308 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgc 1249 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1248 acctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1189 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1188 gtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1129 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1128 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatc 1069 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1068 tttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 1009 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1008 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 950 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 949 cttttgctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 890 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| Sbjct: 889 ttgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagataaactagtat 830 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 829 ttg 827
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 577/603 (95%), Gaps = 1/603 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 21 atcgatagtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgc 80 |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct: 1398 atcgatggtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgc 1339 Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1338 ggctagttcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaag 1279 Query: 141 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 200 ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 201 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 260 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 261 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 320 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1158 gtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1099 Query: 321 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1098 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatc 1039 Query: 381 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 441 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 500 |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 920 Query: 501 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 860 Query: 561 ttgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtat 620 |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct: 859 ttgctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtat 800 Query: 621 ttg 623 ||| Sbjct: 799 ttg 797
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 572/595 (96%), Gaps = 2/595 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 23203693 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203694 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 23203752 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 23203753 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 23203812 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 23203992 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203993 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 23204051 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 23204052 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 23204111 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 23204112 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 23204166 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 141 atc 143 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 5e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 81 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 141 atc 143 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 572/595 (96%), Gaps = 2/595 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 154341 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154342 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 154400 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 154401 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 154460 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 154461 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 154520 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 154581 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 154640 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154641 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 154699 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 154700 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 154759 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 154760 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 154814
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 572/595 (96%), Gaps = 2/595 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 29 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 88 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 89 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 148 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38455 Query: 149 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 208 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38456 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38514 Query: 209 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 268 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38515 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38574 Query: 269 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38575 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38634 Query: 329 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38635 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38694 Query: 389 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 38695 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaact 38754 Query: 449 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 508 |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38755 tacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 38813 Query: 509 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 38814 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcgg 38873 Query: 569 tgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 38874 tgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 38928
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 979 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 531/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 142 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 201 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 202 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 261 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 262 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 321 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 322 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 381 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 382 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 989 Query: 442 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 501 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 930 Query: 502 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 870 Query: 562 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 621 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 869 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 810 Query: 622 tg 623 || Sbjct: 809 tg 808
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 529/540 (97%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 529/540 (97%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 529/540 (97%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 975 bits (492), Expect = 0.0 Identities = 529/540 (97%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 973 bits (491), Expect = 0.0 Identities = 537/551 (97%), Gaps = 1/551 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 73 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 132 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 133 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 192 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 193 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 252 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 253 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 312 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 313 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 372 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 373 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcg 432 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcg 999 Query: 433 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 492 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 998 cgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 940 Query: 493 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 939 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 880 Query: 553 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaa 612 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 879 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaa 820 Query: 613 agtagtatttg 623 | ||||||||| Sbjct: 819 actagtatttg 809
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 971 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 521/530 (98%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcacggcaataatgagccaaagtagtatttg 815
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 523/534 (97%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 149 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 150 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 209 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 210 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 269 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 270 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 330 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 389 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 390 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 450 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 509 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 510 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 570 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 815
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 967 bits (488), Expect = 0.0 Identities = 525/536 (97%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 148 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 207 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 208 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 267 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 268 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 328 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 388 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 448 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 507 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 508 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 567 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 883 Query: 568 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 554/575 (96%), Gaps = 1/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 108 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 109 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 168 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 169 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 228 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 229 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 288 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 289 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 348 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 349 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 408 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 409 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggc 969 Query: 469 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 528 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 968 gtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatacc 909 Query: 529 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 908 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggcc 849 Query: 589 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 848 attgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 814
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 548/567 (96%), Gaps = 1/567 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 116 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 117 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 176 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1273 Query: 177 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 236 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1213 Query: 237 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 296 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1212 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1153 Query: 297 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 356 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1152 aacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagt 1093 Query: 357 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1033 Query: 417 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatat 476 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || Sbjct: 1032 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacat 974 Query: 477 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 973 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 914 Query: 537 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 596 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 913 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 854 Query: 597 ggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 853 ggcaataatgagccaaagtagtatttg 827
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 520/530 (98%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 815
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 520/530 (98%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 986 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 actactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 927 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 867 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 817
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 529/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 142 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 201 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 202 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 261 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 262 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 322 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 382 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 441 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 995 Query: 442 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 501 ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgc 936 Query: 502 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 876 Query: 562 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 621 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 875 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 816 Query: 622 tg 623 || Sbjct: 815 tg 814
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 529/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 142 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 201 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 202 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 261 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 262 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 321 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 322 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 382 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 993 Query: 442 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 501 |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 tctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 934 Query: 502 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 933 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 874 Query: 562 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 621 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 873 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatt 814 Query: 622 tg 623 || Sbjct: 813 tg 812
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 961 bits (485), Expect = 0.0 Identities = 531/545 (97%), Gaps = 1/545 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 79 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 138 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 139 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 198 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 199 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 258 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 259 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 318 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 319 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 379 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 438 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcc 1011 Query: 439 ccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaa 498 ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 ccttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaa 952 Query: 499 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatg 558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 951 tgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatg 892 Query: 559 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagt 618 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct: 891 cattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagt 832 Query: 619 atttg 623 ||||| Sbjct: 831 atttg 827
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 527/540 (97%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 970 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 911 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 910 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 851 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 850 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 791
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 521/532 (97%), Gaps = 1/532 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 92 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 152 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 211 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 212 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 272 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 332 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 392 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttac 968 Query: 452 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 511 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 967 ctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 909 Query: 512 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 571 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 908 acacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 849 Query: 572 atgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 848 atgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 959 bits (484), Expect = 0.0 Identities = 560/584 (95%), Gaps = 1/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 99 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 100 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 159 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 160 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 219 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 220 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 280 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 339 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 340 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 400 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 459 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 460 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 519 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 520 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 579 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 580 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttg 827
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 528/542 (97%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 142 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 201 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 202 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 261 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 262 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 321 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 322 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 381 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 382 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 988 Query: 442 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 501 ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 tctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 929 Query: 502 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 561 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 869 Query: 562 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 621 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 868 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 809 Query: 622 tg 623 || Sbjct: 808 tg 807
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 524/537 (97%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 87 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 147 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 206 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 207 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 266 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 267 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 326 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 327 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 387 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 446 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 447 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 506 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 507 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 567 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 788
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 524/537 (97%), Gaps = 1/537 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 87 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 147 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 206 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 207 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 266 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 267 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 326 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 327 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 387 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 446 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 964 Query: 447 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 506 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 905 Query: 507 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 566 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 845 Query: 567 ggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 844 ggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 788
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 954 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 533/549 (97%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttg 797
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 521/534 (97%), Gaps = 1/534 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 90 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 149 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 150 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 209 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 210 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 269 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 270 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 329 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 330 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 389 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 390 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactt 988 Query: 450 acctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 509 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 acctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagcta 929 Query: 510 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 atacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggt 869 Query: 570 gaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 868 gaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 815
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 505/512 (98%), Gaps = 1/512 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 112 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 171 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 172 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 231 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 232 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 291 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 292 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 352 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 412 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 471 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 472 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 532 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 591 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 592 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 789
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 526/540 (97%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 986 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 505/512 (98%), Gaps = 1/512 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 112 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 171 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 172 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 231 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 232 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 291 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 292 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 352 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 412 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 471 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 941 Query: 472 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 881 Query: 532 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 591 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 880 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 821 Query: 592 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 820 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 789
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 952 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 559/584 (95%), Gaps = 1/584 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 40 tcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 99 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 100 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 159 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 160 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 219 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 220 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 280 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 339 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 340 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 400 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactact 459 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactact 990 Query: 460 gtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 519 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 gta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaa 931 Query: 520 atgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaag 579 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 930 atgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaag 871 Query: 580 aagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| Sbjct: 870 aagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaactagtatttg 827
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 546/567 (96%), Gaps = 1/567 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 116 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 117 aatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 176 ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttc 1257 Query: 177 taaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcc 236 ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1256 taaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcc 1197 Query: 237 tccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 296 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1196 tccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcca 1137 Query: 297 aacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagt 356 ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1136 aacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagt 1077 Query: 357 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1076 gaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaa 1017 Query: 417 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatat 476 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct: 1016 acctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatat 958 Query: 477 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 957 gatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttt 898 Query: 537 tctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgc 596 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 897 tctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgc 838 Query: 597 ggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 837 ggcaataatgagccaaactagtatttg 811
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 518/530 (97%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 815
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 518/530 (97%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 815
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 948 bits (478), Expect = 0.0 Identities = 518/530 (97%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacct 984 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 815
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 946 bits (477), Expect = 0.0 Identities = 532/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttg 797
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 525/540 (97%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 990 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 tagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 931 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 930 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattg 871 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 870 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 811
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 522/536 (97%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 148 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 207 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 208 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 267 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 268 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 328 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 387 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 388 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 991 Query: 448 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 507 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 932 Query: 508 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 931 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcacg 872 Query: 568 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 871 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 816
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 567/596 (95%), Gaps = 1/596 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 87 ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1858 gtatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1799 Query: 88 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 147 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1798 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1739 Query: 148 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 207 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1738 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1679 Query: 208 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 267 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1678 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1619 Query: 268 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 327 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1618 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1559 Query: 328 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 387 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1558 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1499 Query: 388 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1498 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1439 Query: 448 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 507 ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1438 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttagc 1380 Query: 508 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 567 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1379 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1320 Query: 568 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct: 1319 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaatacatagccaaactagtatttg 1264
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 944 bits (476), Expect = 0.0 Identities = 525/540 (97%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 797
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 551/575 (95%), Gaps = 1/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 108 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 109 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 168 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 169 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 229 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 288 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 289 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 348 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 349 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 408 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 409 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 468 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 120063 Query: 469 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 528 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120062 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 120003 Query: 529 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 120002 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 119943 Query: 589 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 119942 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 119908
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 942 bits (475), Expect = 0.0 Identities = 551/575 (95%), Gaps = 1/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 108 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 109 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 168 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 169 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 229 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 288 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 289 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 348 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 349 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 408 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 409 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 468 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 58436 Query: 469 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 528 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58435 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 58376 Query: 529 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 58375 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 58316 Query: 589 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 58315 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 58281
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 531/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttg 797
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 531/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttg 797
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 938 bits (473), Expect = 0.0 Identities = 531/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcg 985 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatac 926 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttg 797
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 524/540 (97%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 987 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 928 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 868 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 867 ctcggtgaatgtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 808
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 551/576 (95%), Gaps = 1/576 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 87 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 gtatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1779 Query: 88 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 147 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1778 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1719 Query: 148 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 207 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1718 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggt 1659 Query: 208 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 267 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1658 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1599 Query: 268 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 327 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1598 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1539 Query: 328 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 387 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1538 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1479 Query: 388 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1478 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaac 1419 Query: 448 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 507 ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1418 ttacctactactgta-ccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttagc 1360 Query: 508 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 567 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1359 taatacacggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1300 Query: 568 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaata 603 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 1299 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaata 1264
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 524/540 (97%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttc 976 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaatattgagacaaagtagtatttg 797
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 550/575 (95%), Gaps = 1/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 108 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 109 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 168 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 169 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 229 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 288 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 289 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 348 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 349 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 408 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 409 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 468 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 982 Query: 469 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 528 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 922 Query: 529 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 921 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 862 Query: 589 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 861 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 827
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 550/575 (95%), Gaps = 1/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 108 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 109 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 168 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 169 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 229 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 288 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 289 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 348 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 349 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 408 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 409 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 468 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 57855 Query: 469 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 528 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57854 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 57795 Query: 529 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57794 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 57735 Query: 589 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 57734 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 57700
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 934 bits (471), Expect = 0.0 Identities = 550/575 (95%), Gaps = 1/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 108 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 109 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 168 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 169 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 229 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 288 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 289 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 348 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 349 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 408 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 409 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 468 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 57865 Query: 469 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 528 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57864 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 57805 Query: 529 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 57804 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 57745 Query: 589 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 57744 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 57710
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 516/530 (97%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 815
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 516/530 (97%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacct 984 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 815
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 516/530 (97%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacct 984 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 actactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 925 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 865 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 864 gtgaagaagcaggccattgtcacggcaataatgagccaaactagtatttg 815
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 516/530 (97%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 994 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 actactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 935 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 875 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 874 gtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 825
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 895 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 894 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatac 836 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 835 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 776 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 775 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 716 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 715 tagtatttg 707
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 932 bits (470), Expect = 0.0 Identities = 525/542 (96%), Gaps = 1/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 82 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 142 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 201 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 202 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 261 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 262 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 321 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 322 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 381 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 382 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccct 978 Query: 442 tctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 501 ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 tctaacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgc 919 Query: 502 tttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 561 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 tttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcat 859 Query: 562 tgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatt 621 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 858 tgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatt 799 Query: 622 tg 623 || Sbjct: 798 tg 797
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttg 797
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 530/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcccg 985 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatag 926 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttg 797
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 502/512 (98%), Gaps = 1/512 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 112 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 171 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 172 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 231 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 232 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 291 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 292 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 352 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 412 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 471 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 472 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 532 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 591 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 592 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 786
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 502/512 (98%), Gaps = 1/512 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 112 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 171 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 172 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 231 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 232 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 291 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 292 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 352 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 412 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtg 471 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtg 938 Query: 472 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 531 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 937 gatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatg 878 Query: 532 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccatt 591 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 877 atttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccatt 818 Query: 592 gtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 817 gtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 786
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 522/539 (96%), Gaps = 1/539 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 85 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 145 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 204 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 205 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 264 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 265 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 325 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 384 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 385 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttct 1005 Query: 445 aacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 504 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 aacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttt 946 Query: 505 agctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 564 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 agctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgc 886 Query: 565 acggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 885 ccggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 827
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 926 bits (467), Expect = 0.0 Identities = 549/575 (95%), Gaps = 1/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 108 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1789 aatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1730 Query: 109 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 168 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1729 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1670 Query: 169 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 228 || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1669 caggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1610 Query: 229 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 288 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1609 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1550 Query: 289 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 348 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1549 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccag 1490 Query: 349 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 408 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1489 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1430 Query: 409 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 468 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1429 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 1371 Query: 469 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 528 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1370 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 1311 Query: 529 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1310 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 1251 Query: 589 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||| | || |||| ||||||||| Sbjct: 1250 gttgtcgcggcaataataagacaaactagtatttg 1216
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 532/550 (96%), Gaps = 3/550 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 133 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 134 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 193 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 194 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 253 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 254 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 313 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 314 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 373 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 374 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgc 986 Query: 434 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 493 | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gctccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 494 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 553 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 554 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaa 613 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaa 807 Query: 614 gtagtatttg 623 |||||||||| Sbjct: 806 gtagtatttg 797
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttg 797
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 512/527 (97%), Gaps = 1/527 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 97 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 156 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 157 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 216 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 217 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 277 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 337 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 397 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctact 973 Query: 457 actgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 516 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 actgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacg 914 Query: 517 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 576 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtg 854 Query: 577 aagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 853 aagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 807
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttatcgcggcaataatgagccaaag 806 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttg 797
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 529/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcatggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttg 797
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 522/540 (96%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 856 ctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 797
>gb|AY506529.1| Zea mays strain NB mitochondrion, complete genome Length = 569630 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 548/575 (95%), Gaps = 1/575 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 49 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 108 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 349056 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 349115 Query: 109 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 168 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349116 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 349175 Query: 169 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 349176 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 349235 Query: 229 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 288 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349236 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 349295 Query: 289 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 348 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349296 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 349355 Query: 349 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 408 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349356 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 349415 Query: 409 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 468 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 349416 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 349474 Query: 469 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 528 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349475 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 349534 Query: 529 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 349535 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 349594 Query: 589 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 349595 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 349629
>gb|DQ490952.1| Zea mays subsp. mays genotype male-fertile NA mitochondrion, complete genome Length = 701046 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 548/575 (95%), Gaps = 1/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 108 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 206653 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 206594 Query: 109 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 168 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206593 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 206534 Query: 169 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 206533 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 206474 Query: 229 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 288 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206473 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 206414 Query: 289 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 348 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206413 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 206354 Query: 349 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 408 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206353 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 206294 Query: 409 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 468 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 206293 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 206235 Query: 469 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 528 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206234 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 206175 Query: 529 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 206174 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 206115 Query: 589 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 206114 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 206080 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 548/575 (95%), Gaps = 1/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 108 |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 77961 aattggatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 77902 Query: 109 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 168 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77901 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 77842 Query: 169 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 77841 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 77782 Query: 229 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 288 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77781 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 77722 Query: 289 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 348 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77721 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 77662 Query: 349 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 408 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77661 tcctgagtgaaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 77602 Query: 409 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 468 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 77601 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 77543 Query: 469 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 528 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77542 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 77483 Query: 529 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 77482 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 77423 Query: 589 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 77422 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 77388
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 506/519 (97%), Gaps = 1/519 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 105 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 164 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 165 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 224 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 225 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 284 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 285 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 345 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 404 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 405 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 465 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 524 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 525 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 584 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 585 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 770
>emb|AJ784834.1| Lamarckia aurea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1328 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 506/519 (97%), Gaps = 1/519 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 105 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 164 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1328 agctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1269 Query: 165 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 224 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1268 tacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1209 Query: 225 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 284 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1208 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatttcggtcagagc 1149 Query: 285 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 344 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1148 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcaaggaaac 1089 Query: 345 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 1029 Query: 405 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1028 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 970 Query: 465 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 910 Query: 525 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 584 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 850 Query: 585 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 849 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 811
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 506/519 (97%), Gaps = 1/519 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 105 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 164 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 165 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 224 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 225 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 284 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 285 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 344 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 345 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 404 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 405 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-c 929 Query: 465 cggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 524 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 cggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgca 869 Query: 525 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 584 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 868 taccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagta 809 Query: 585 agccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 808 ggccattgtcgcggcaataatgagccaaactagtatttg 770
>emb|AJ746253.1| Arthraxon sp. TH-111 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1391 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 548/575 (95%), Gaps = 1/575 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 49 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 108 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1387 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1328 Query: 109 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 168 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 169 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 228 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 229 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 288 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 289 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 348 |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccactggtacaacacctggcatggatacccag 1088 Query: 349 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 408 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 409 tcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgga 468 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgga 969 Query: 469 gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatacc 528 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 968 gtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtatacc 909 Query: 529 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagcc 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 908 atgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggcc 849 Query: 589 attgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 |||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct: 848 gttgtcgcggcaataatgagacaaagtagtatttg 814
>gb|L05043.2|ZIZCPRBCL Zizania texana ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1325 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 514/530 (96%), Gaps = 1/530 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 94 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 153 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1325 ctccagttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1266 Query: 154 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 213 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1265 ttacgggcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcattc 1206 Query: 214 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 273 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1205 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1146 Query: 274 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1145 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacaccc 1086 Query: 334 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1026 Query: 394 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1025 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacct 966 Query: 454 actactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatac 513 ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 actactgta-ccagagtggatatgatcccccccagacatacgcaatgctttagctaatac 907 Query: 514 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaat 573 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 906 acggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaat 847 Query: 574 gtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 846 gtgaagaagtaagccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797
>emb|AM110249.1| Fargesia sp. Asmussen 105 plastid partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large subunit, specimen voucher Asmussen 105 (CP) Length = 1306 Score = 916 bits (462), Expect = 0.0 Identities = 520/538 (96%), Gaps = 1/538 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 86 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcac 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct: 1306 gttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgc 1247 Query: 146 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 205 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct: 1246 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccag 1187 Query: 206 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 265 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct: 1186 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctc 1127 Query: 266 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 325 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct: 1126 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggta 1067 Query: 326 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 385 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1066 taacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1007 Query: 386 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1006 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 947 Query: 446 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 505 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 888 Query: 506 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 565 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 887 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 828 Query: 566 cggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 827 cggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 770
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 528/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataacag 866 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| Sbjct: 865 catgcatagctcggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataattagacaaag 806 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttg 797
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 528/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaac 806 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttg 797
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 528/549 (96%), Gaps = 1/549 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 75 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 134 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 135 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 194 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 195 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 254 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 255 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 314 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 315 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 374 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 375 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 434 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcg 985 Query: 435 ttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatac 494 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatac 926 Query: 495 gcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactg 554 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 gcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataactg 866 Query: 555 catgcattgcacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaag 614 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| Sbjct: 865 catgcattgctcggtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagacaaac 806 Query: 615 tagtatttg 623 ||||||||| Sbjct: 805 tagtatttg 797
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 518/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 147 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 148 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 207 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 208 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 267 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 268 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 327 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 328 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 388 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 982 Query: 448 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 507 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 981 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 923 Query: 508 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 567 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 922 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 863 Query: 568 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 862 gtgaatgtgaagaagtaggccgttgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 807
>emb|AJ746176.1| Chimonobambusa marmorea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 518/536 (96%), Gaps = 1/536 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 88 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1343 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1284 Query: 148 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 207 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1283 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1224 Query: 208 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 267 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1223 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1164 Query: 268 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 327 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1163 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1104 Query: 328 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 387 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1044 Query: 388 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 984 Query: 448 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 507 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 925 Query: 508 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 567 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 924 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 865 Query: 568 gtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 864 gtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 809
>gb|AY622894.1| Lygeum spartum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 521/540 (96%), Gaps = 1/540 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 144 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 204 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 263 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 gggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 264 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 323 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaatacctccggaagccaccgg 1096 Query: 324 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 383 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacaccaggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 384 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 976 Query: 444 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 503 ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 taacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 917 Query: 504 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 563 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 916 tagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 857 Query: 564 cacggtgaatgtgaagaagtaagccattgtcgcggcaatagtgagccaaagtagtatttg 623 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 856 cacggtgaatgtgaagaagtaggccattgtcgcggcaataatgagccaaagtagtatttg 797 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,636,055 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4636055 Number of successful extensions: 130535 Number of sequences better than 10.0: 15180 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15116 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 76 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 89800 Number of HSP's gapped (non-prelim): 22257 length of query: 623 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 600 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 10285978622400 effective search space used: 10285978622400 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)