Clone Name | rbasd17k24 |
---|---|
Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 1053 bits (531), Expect = 0.0 Identities = 552/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1045 bits (527), Expect = 0.0 Identities = 551/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 550/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 ccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 1041 bits (525), Expect = 0.0 Identities = 550/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 1039 bits (524), Expect = 0.0 Identities = 550/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 550/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 550/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaag 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 548/553 (99%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctaktt 1471 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 1411 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1351 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 1291 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1231 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1171 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1052 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 993 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 992 gtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttka 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gstaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 550/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 1037 bits (523), Expect = 0.0 Identities = 550/555 (99%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1031 bits (520), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 agcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1481 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1422 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1421 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1362 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1302 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1242 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1182 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1122 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1121 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1063 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1004 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 944 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 943 cggtgaatgtgaaga 929
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1200 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1199 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1140 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1139 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1080 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1020 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 960 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 900 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 899 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 841 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 721 cggtgaatgtgaaga 707
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1200 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1199 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1140 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1139 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1080 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1020 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 960 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 900 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 899 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 841 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 721 cggtgaatgtgaaga 707
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaaratcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 56331 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 56272 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 56271 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 56212 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56211 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 56152 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56151 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 56092 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56091 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 56032 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56031 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 55972 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 55971 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 55913 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55912 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 55854 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55853 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 55794 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 55793 cggtgaatgtgaaga 55779
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 1029 bits (519), Expect = 0.0 Identities = 549/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1517 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1458 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1457 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1398 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1338 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1337 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1278 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1218 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1158 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1157 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1099 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1040 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 980 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 979 cggtgaatgtgaaga 965
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1027 bits (518), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttn 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 nntaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 1025 bits (517), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 1021 bits (515), Expect = 0.0 Identities = 548/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 1019 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 1017 bits (513), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1389 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1330 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1329 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1270 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1210 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1150 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1090 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1030 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1029 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttcta 971 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 912 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 852 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 851 cggtgaatgtgaaga 837
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 1013 bits (511), Expect = 0.0 Identities = 547/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 1007 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcc 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1200 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1199 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1140 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1139 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccagg 1080 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1020 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 960 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 900 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 899 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 841 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 840 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 782 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 781 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 722 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 721 cggtgaatgtgaaga 707
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1339 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1338 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1279 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1219 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1159 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1099 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1039 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1038 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 980 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 921 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 861 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 860 cggtgaatgtgaaga 846
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1476 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1475 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1416 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1356 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1117 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 997 cggtgaatgtgaaga 983
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1398 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1339 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1338 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1279 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1219 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1159 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1099 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1039 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1038 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 980 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 921 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 920 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 861 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 860 cggtgaatgtgaaga 846
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 agtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1332 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1331 ttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1272 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1212 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1211 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1152 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1092 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1032 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1031 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 973 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 914 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 854 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 853 cggtgaatgtgaaga 839
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsss 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 1005 bits (507), Expect = 0.0 Identities = 546/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgct 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 544/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1472 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1471 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1412 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtca-tttygcgttccccttcta 1113 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1054 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 994 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 993 cggtgaatgtgaaga 979
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1476 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1475 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1416 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1356 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1117 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 997 cggtgaatgtgaaga 983
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 1001 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1470 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1411 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1410 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1351 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1052 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 993 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 992 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 933 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 932 cggtgaatgtgaaga 918
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 999 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1332 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1331 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1272 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1212 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1211 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1152 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1092 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 aacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1032 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1031 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 973 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 914 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 913 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 854 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 853 cggtgaatgtgaaga 839
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 545/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcggc 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 997 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 544/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 995 bits (502), Expect = 0.0 Identities = 544/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gataatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 |||| |||||||||| Sbjct: 884 cggtcaatgtgaaga 870
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 993 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 544/555 (98%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1476 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1475 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1416 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1356 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1117 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgattnntctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 997 cggtgaatgtgaaga 983
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 541/555 (97%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcsss 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 987 bits (498), Expect = 0.0 Identities = 543/555 (97%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1535 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1476 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1475 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1416 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccagg 1356 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1117 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1058 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 998 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 997 cggtgaatgtgaaga 983
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 543/555 (97%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1473 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctag 1414 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1413 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1354 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1294 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1293 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1234 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1174 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1114 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1113 aataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1055 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 996 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 995 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcagtaactgcatgcattgca 936 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 935 cggtgaatgtgaaga 921
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 543/555 (97%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttctcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 981 bits (495), Expect = 0.0 Identities = 542/555 (97%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcc 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 541/555 (97%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1402 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctag 1343 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1342 ttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1283 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1282 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccagg 1223 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1222 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1163 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1103 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1043 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttcta 984 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 983 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 925 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 924 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 865 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 864 cggtgaatgtgaaga 850
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 541/555 (97%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 541/555 (97%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 gcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 541/555 (97%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1520 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctag 1461 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1460 ttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1401 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1341 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1340 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1281 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1221 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1161 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1160 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1102 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1101 gcttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 1043 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 983 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 982 cggtgaatgtgaaga 968
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 965 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 541/555 (97%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttctcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 963 bits (486), Expect = 0.0 Identities = 538/555 (96%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1532 agtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctag 1473 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1472 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgss 1413 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1114 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1113 acttacctannnctgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnna 1055 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 995 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 994 cggtgaatgtgaaga 980
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 957 bits (483), Expect = 0.0 Identities = 540/555 (97%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct: 1382 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctag 1323 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1322 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1263 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1262 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccagg 1203 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1202 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcacc 1143 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1142 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1083 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 aacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1023 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1022 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 964 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 963 acttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 905 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 904 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 845 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 844 cggtgaatgtgaaga 830
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 955 bits (482), Expect = 0.0 Identities = 539/554 (97%), Gaps = 3/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 60 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 61 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaagatcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 541 ggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 537/553 (97%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtc 1284 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1224 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1223 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1164 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1163 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1104 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1044 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 985 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 926 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 925 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 866 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 865 gtgaatgtgaaga 853
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 950 bits (479), Expect = 0.0 Identities = 527/539 (97%), Gaps = 3/539 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 17 aactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 75 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1396 aactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttg 1337 Query: 76 caagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagct 135 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1336 caagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagct 1277 Query: 136 tgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaagga 195 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1276 tgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaagga 1217 Query: 196 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcaga 255 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 tgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcaga 1157 Query: 256 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggat 315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 gctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggat 1097 Query: 316 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 375 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 acccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgc 1037 Query: 376 aataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 435 ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 aataaatcaacaaaacctaaagtga-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgt 978 Query: 436 acccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 495 | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 a-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaat 919 Query: 496 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 gcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 860
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 936 bits (472), Expect = 0.0 Identities = 495/500 (99%), Gaps = 2/500 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 1288 Query: 115 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 174 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 175 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 234 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 1168 Query: 235 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 295 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 355 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 989 Query: 415 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 474 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 475 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 870 Query: 535 ttgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||| Sbjct: 869 ttgcacggtgaatgtgaaga 850
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 537/553 (97%), Gaps = 5/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124637 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124636 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124577 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 124576 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 124517 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124516 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 124458 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 124457 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 124399 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124398 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 124340 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124339 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124281 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124280 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124221 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 124220 gtgaatgtgaaga 124208 Score = 930 bits (469), Expect = 0.0 Identities = 537/553 (97%), Gaps = 5/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30110 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30109 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30050 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 30049 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatccccaa 29990 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 29989 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtataa 29931 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 29930 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttcaa 29872 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29871 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 29813 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29812 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29754 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29753 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29694 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 29693 gtgaatgtgaaga 29681
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 928 bits (468), Expect = 0.0 Identities = 485/488 (99%), Gaps = 2/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 127 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 186 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1224 Query: 187 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 247 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 307 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 367 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 547 tgtgaaga 554 |||||||| Sbjct: 865 tgtgaaga 858
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 492/498 (98%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 951 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 892 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 832 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 831 gcacggtgaatgtgaaga 814
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 492/498 (98%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1250 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1190 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1189 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1130 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1070 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1010 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1009 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 951 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 892 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 891 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 832 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 831 gcacggtgaatgtgaaga 814
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 924 bits (466), Expect = 0.0 Identities = 492/498 (98%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 1286 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 1166 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 987 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaaga 850
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55045 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55044 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54985 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 54984 gtgaatgtgaaga 54972
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55403 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55402 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55343 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55342 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55283 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55282 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55223 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55222 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55163 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55162 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55045 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55044 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54985 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 54984 gtgaatgtgaaga 54972
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55351 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55350 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55291 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55290 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55231 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55230 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55171 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55170 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55111 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55110 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55052 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55051 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 54993 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 54992 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54933 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 54932 gtgaatgtgaaga 54920
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 125692 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 125691 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 125632 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 125631 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 125572 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 125571 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 125512 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125511 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 125452 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125451 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 125393 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125392 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 125334 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 125333 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 125274 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 125273 gtgaatgtgaaga 125261 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30632 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30631 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30572 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30571 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30512 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30511 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 30452 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30451 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 30392 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30391 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 30333 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30332 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 30274 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 30273 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 30214 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 30213 gtgaatgtgaaga 30201
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124361 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124360 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124301 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 124300 gtgaatgtgaaga 124288 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29780 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29720 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 29719 gtgaatgtgaaga 29707
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 124719 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 124718 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 124659 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 124658 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 124599 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 124598 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 124539 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124538 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 124479 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124478 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124361 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 124360 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 124301 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 124300 gtgaatgtgaaga 124288 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 30138 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 30137 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 30078 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 30077 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 30018 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 30017 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 29958 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29957 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 29898 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 29897 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29780 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 29779 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 29720 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 29719 gtgaatgtgaaga 29707
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55395 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55394 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55335 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55334 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55275 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55274 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55215 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55214 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55155 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55154 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55096 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55095 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55037 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 55036 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54977 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 54976 gtgaatgtgaaga 54964
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 491/497 (98%), Gaps = 2/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 117 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcg 1285 Query: 118 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 177 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 cgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 1225 Query: 178 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 237 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1224 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcc 1165 Query: 238 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 1105 Query: 298 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1045 Query: 358 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttc 417 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1044 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttc 986 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 867 Query: 538 cacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||| Sbjct: 866 cacggtgaatgtgaaga 850
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1285 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1284 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtg 1225 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1224 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1165 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1164 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1105 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 cacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1045 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 986 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 ttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 927 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 926 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccg 867 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 866 gtgaatgtgaaga 854
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 33527269 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527270 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 33527329 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 33527330 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 33527389 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 33527390 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 33527449 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527450 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 33527509 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527510 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 33527568 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527569 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 33527627 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 33527628 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 33527687 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 33527688 gtgaatgtgaaga 33527700
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 72466 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 72467 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 72526 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 72527 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 72586 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 72587 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 72646 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72647 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 72706 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72707 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 72765 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72766 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 72824 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 72825 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 72884 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 72885 gtgaatgtgaaga 72897
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1356 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1296 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1295 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1236 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1235 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1176 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1116 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1057 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 998 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 997 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 938 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 937 gtgaatgtgaaga 925
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1099 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1039 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1038 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 979 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 978 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 919 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 859 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 858 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 800 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 799 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 741 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 740 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 681 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 680 gtgaatgtgaaga 668
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 55330 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 55329 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 55270 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 55269 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 55210 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 55209 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 55150 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55149 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 55090 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55089 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 55031 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55030 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 54972 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 54971 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 54912 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 54911 gtgaatgtgaaga 54899
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 922 bits (465), Expect = 0.0 Identities = 534/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1721 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1720 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1661 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1660 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1601 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1600 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1541 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1540 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1481 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1422 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1363 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1362 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1303 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 1302 gtgaatgtgaaga 1290 Score = 58.0 bits (29), Expect = 3e-05 Identities = 32/33 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 84 tcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1914
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 484/488 (99%), Gaps = 2/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 1270 Query: 127 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 186 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 1210 Query: 187 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1150 Query: 247 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1090 Query: 307 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1030 Query: 367 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 971 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 912 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 852 Query: 547 tgtgaaga 554 |||||||| Sbjct: 851 tgtgaaga 844
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 920 bits (464), Expect = 0.0 Identities = 505/516 (97%), Gaps = 2/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 39 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 98 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 99 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 158 |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 159 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 218 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 219 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 278 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 279 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 338 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 339 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 399 cattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccc 458 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 1003 ca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccc 946 Query: 459 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 886 Query: 519 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 885 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 850
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 535/555 (96%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 535/555 (96%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 1409 agtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctag 1350 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1349 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1290 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1289 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1230 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1229 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1170 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1169 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1110 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1050 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1049 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 991 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 932 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 931 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 872 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 871 cggtgaatgtgaaga 857
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 535/555 (96%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 1407 agtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctag 1348 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1347 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1288 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1287 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1228 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1227 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1168 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1167 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1108 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1048 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 989 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 930 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 870 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 869 cggtgaatgtgaaga 855
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 918 bits (463), Expect = 0.0 Identities = 535/555 (96%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 1421 agtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctag 1362 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1361 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1302 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1301 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1242 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1241 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1182 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1181 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1122 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1062 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1061 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1003 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 944 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 gctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 884 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 883 cggtgaatgtgaaga 869
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 533/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1240 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1181 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 518/533 (97%), Gaps = 3/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 81 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 82 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1086 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 968 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 967 cgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 908 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 907 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaaga 855
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 533/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 53605 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 53604 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 53545 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 53544 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 53485 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 53484 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 53425 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53424 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 53365 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53364 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 53306 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53305 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 53247 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 53246 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 53187 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 53186 gtgaatgtgaaga 53174
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 533/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 128538 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 128537 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 128478 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 128477 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 128418 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 128417 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 128358 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128357 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 128298 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128297 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 128239 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128238 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 128180 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 128179 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 128120 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 128119 gtgaatgtgaaga 128107
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 533/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10347213 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347212 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10347153 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10347152 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10347093 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10347092 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10347033 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347032 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10346973 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10346972 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 10346914 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346913 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 10346855 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 10346854 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 10346795 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 10346794 gtgaatgtgaaga 10346782
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 533/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 10353252 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353251 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 10353192 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 10353191 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 10353132 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 10353131 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 10353072 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353071 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 10353012 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353011 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 10352953 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352952 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 10352894 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 10352893 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 10352834 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 10352833 gtgaatgtgaaga 10352821
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 914 bits (461), Expect = 0.0 Identities = 533/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1688 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1687 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 1628 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 1627 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 1568 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1567 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1508 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1507 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1448 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1447 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 1389 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 ttacctactactgca-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1330 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1329 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 1270 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 1269 gtgaatgtgaaga 1257
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 912 bits (460), Expect = 0.0 Identities = 492/500 (98%), Gaps = 2/500 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 115 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 174 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1228 Query: 175 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 234 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1168 Query: 235 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 295 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 354 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 355 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 989 Query: 415 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 474 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 475 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 870 Query: 535 ttgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||| Sbjct: 869 ttgcacggtgaatgtgaaga 850
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 534/555 (96%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1362 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacgaaaatgcataccatgttttttctgtctatcaataactgcatgcattgcc 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 910 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 534/555 (96%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| Sbjct: 1422 agtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctag 1363 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1362 ttcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1303 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccgg 1243 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1183 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtat 1123 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttc 1063 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttcta 1004 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1003 acttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 945 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 944 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgct 885 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 884 cggtgaatgtgaaga 870
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 533/554 (96%), Gaps = 3/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 60 |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334 Query: 61 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 120 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1274 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct: 1273 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccggt 1214 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1213 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1154 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct: 1153 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtata 1094 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1093 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttca 1034 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct: 1033 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaa 975 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 916 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 915 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 856 Query: 541 ggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||| Sbjct: 855 ggtgaatgtgaaga 842
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 490/498 (98%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1304 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1303 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1244 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1243 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1184 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1124 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1064 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct: 1063 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgctcccctt 1005 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 946 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 886 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 885 gcacggtgaatgtgaaga 868
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 533/554 (96%), Gaps = 3/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 60 ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 61 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1241 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 420 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 atataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttg 944 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 884 Query: 541 ggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 908 bits (458), Expect = 0.0 Identities = 490/498 (98%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1096 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 977 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaaga 840
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 532/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatccaccgcctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 1301 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1300 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1241 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct: 1240 catttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaa 1181 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 1180 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 1121 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1061 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 1060 taaaatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtca-tgtcgcgttccccttctaac 1002 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 942 taatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 883 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 882 gtgaatgtgaaga 870
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 532/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614443 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614442 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614383 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614382 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614323 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614322 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614263 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614262 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614203 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614202 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 5614144 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614143 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 5614085 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 5614084 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 5614025 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 5614024 gtgaatgtgaaga 5614012 Score = 414 bits (209), Expect = e-112 Identities = 242/249 (97%), Gaps = 3/249 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttac 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt-cgcgttccccttctaacttac 13436986 Query: 426 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 485 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436985 ctactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 13436927 Query: 486 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 545 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 13436926 acacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 13436867 Query: 546 atgtgaaga 554 ||||||||| Sbjct: 13436866 atgtgaaga 13436858 Score = 159 bits (80), Expect = 1e-35 Identities = 86/88 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 467 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13398037 Query: 527 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 13398036 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaaga 13398009 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 54 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 109 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 251 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 280 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 331 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.48 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 249 ggtcagagctggcatatgccaa 270 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 532/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 5614432 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614431 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 5614372 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 5614371 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 5614312 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 5614311 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 5614252 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614251 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 5614192 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614191 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 5614133 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614132 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 5614074 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 5614073 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 5614014 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 5614013 gtgaatgtgaaga 5614001 Score = 414 bits (209), Expect = e-112 Identities = 242/249 (97%), Gaps = 3/249 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 306 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 366 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttac 425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattt-cgcgttccccttctaacttac 13391260 Query: 426 ctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 485 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391259 ctactactgtaccagc-gtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaat 13391201 Query: 486 acacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtga 545 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 13391200 acacggaaatgcataccatgattattctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtga 13391141 Query: 546 atgtgaaga 554 ||||||||| Sbjct: 13391140 atgtgaaga 13391132 Score = 159 bits (80), Expect = 1e-35 Identities = 86/88 (97%) Strand = Plus / Minus Query: 467 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 13352311 Query: 527 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 13352310 tgcatgcattgcttggtgaatgtgaaga 13352283 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 54 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 109 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 8e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 251 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 280 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 331 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 365 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.48 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 249 ggtcagagctggcatatgccaa 270 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 906 bits (457), Expect = 0.0 Identities = 532/553 (96%), Gaps = 3/553 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38442 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38443 cttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38502 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38503 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38562 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38563 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38622 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38623 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38682 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38683 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaac 38741 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38742 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 38800 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 38801 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 38860 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 38861 gtgaatgtgaaga 38873
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 904 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 482/488 (98%), Gaps = 2/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 127 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 186 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 187 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 247 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 307 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 367 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 547 tgtgaaga 554 |||||||| Sbjct: 865 tgtgaaga 858
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 902 bits (455), Expect = 0.0 Identities = 533/555 (96%), Gaps = 3/555 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 agtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctag 59 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || Sbjct: 1337 agtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaag 1278 Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct: 1277 ttcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaagatcgcg 1218 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct: 1217 cccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccgg 1158 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1157 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1098 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1097 aaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtat 1038 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 978 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 977 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 919 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 918 acttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 860 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 800 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 799 cggtgaatgtgaaga 785
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 489/498 (98%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 971 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 852 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 851 gcacggtgaatgtgaaga 834
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 489/498 (98%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1227 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1226 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1167 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1166 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactgg 1107 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 988 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 868 gcacggtgaatgtgaaga 851
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 489/498 (98%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 971 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 852 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 851 gcacggtgaatgtgaaga 834
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 532/554 (96%), Gaps = 3/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 60 ||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1336 gtatccaccggcttgaaatcaaatgtgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1277 Query: 61 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1276 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1217 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1216 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1157 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1156 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1097 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 1096 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccagaagctaccggtata 1037 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1036 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttca 977 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 918 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttag 859 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 858 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 799 Query: 541 ggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||| Sbjct: 798 ggtgaatgtgaaga 785
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 497/509 (97%), Gaps = 2/509 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 105 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 106 cgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatta 165 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatta 1239 Query: 166 gctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 225 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1238 gctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaat 1179 Query: 226 acagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 285 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1178 acagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacct 1119 Query: 286 gaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 345 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1118 gaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcga 1059 Query: 346 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttc 405 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct: 1058 gcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttc 1000 Query: 406 gcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagaca 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagaca 941 Query: 466 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 tacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataa 881 Query: 526 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 880 ctgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 852
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 532/553 (96%), Gaps = 4/553 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 23203693 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203694 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 23203752 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 23203753 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 23203812 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 23203813 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 23203872 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203873 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 23203932 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 23203933 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tatcgcgttccccttctaac 23203991 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203992 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 23204050 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 23204051 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 23204110 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 23204111 gtgaatgtgaaga 23204123 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 54 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Query: 114 atc 116 ||| Sbjct: 26711440 atc 26711438 Score = 117 bits (59), Expect = 4e-23 Identities = 62/63 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 54 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 113 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333 Query: 114 atc 116 ||| Sbjct: 26711332 atc 26711330
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 532/553 (96%), Gaps = 4/553 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 154341 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 154342 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 154400 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 154401 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 154460 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 154461 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 154520 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154521 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 154580 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 154581 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tatcgcgttccccttctaac 154639 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154640 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 154698 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 154699 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 154758 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 154759 gtgaatgtgaaga 154771
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 898 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 532/553 (96%), Gaps = 4/553 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 3 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagtt 61 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 62 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcc 121 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcc 38455 Query: 122 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 181 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 38456 ctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtg 38514 Query: 182 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 241 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| Sbjct: 38515 cattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctccaa 38574 Query: 242 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct: 38575 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataa 38634 Query: 302 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38635 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 38694 Query: 362 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaac 421 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct: 38695 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tatcgcgttccccttctaac 38753 Query: 422 ttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 481 ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38754 ttacctactactgta-ccagcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 38812 Query: 482 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacg 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 38813 taatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcg 38872 Query: 542 gtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||| Sbjct: 38873 gtgaatgtgaaga 38885
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 481/488 (98%), Gaps = 2/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgtccttcg 1284 Query: 127 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 186 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 187 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 247 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 307 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 367 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 547 tgtgaaga 554 |||||||| Sbjct: 865 tgtgaaga 858
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 490/500 (98%), Gaps = 2/500 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1289 Query: 115 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 174 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1229 Query: 175 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 234 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatca 1169 Query: 235 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 294 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctact 1109 Query: 295 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 354 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 ggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1049 Query: 355 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1048 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 990 Query: 415 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 474 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 931 Query: 475 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 930 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 871 Query: 535 ttgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||| Sbjct: 870 ttgcacggtgaatgtgaaga 851
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 896 bits (452), Expect = 0.0 Identities = 502/516 (97%), Gaps = 2/516 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 39 tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 98 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1363 tacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcatt 1304 Query: 99 accttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccac 158 |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1303 accttcacgcgcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccac 1244 Query: 159 tcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 218 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1243 tcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaa 1184 Query: 219 ttgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 278 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1183 ttgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaat 1124 Query: 279 accacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagat 338 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1123 accacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagat 1064 Query: 339 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1063 accgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt 1004 Query: 399 cattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccc 458 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct: 1003 ca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccc 946 Query: 459 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 945 ccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtcta 886 Query: 519 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 885 tcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 850
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 488/498 (97%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1156 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccgg 1096 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 977 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaaga 840
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 480/488 (98%), Gaps = 2/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1286 Query: 127 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 186 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1226 Query: 187 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1225 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1166 Query: 247 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1106 Query: 307 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1046 Query: 367 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 987 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 tactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 928 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 868 Query: 547 tgtgaaga 554 |||||||| Sbjct: 867 tgtgaaga 860
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 489/500 (97%), Gaps = 2/500 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1293 Query: 115 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 174 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1233 Query: 175 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 234 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1232 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1173 Query: 235 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 294 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 tccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1113 Query: 295 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1053 Query: 355 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1052 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 994 Query: 415 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 474 ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 935 Query: 475 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 934 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 875 Query: 535 ttgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||| Sbjct: 874 ttgcacggtgaatgtgaaga 855
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 491/503 (97%), Gaps = 2/503 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 52 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 111 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 112 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgct 171 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 agatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgct 1251 Query: 172 gcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 231 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 gcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaa 1191 Query: 232 tcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 291 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1190 tcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagct 1131 Query: 292 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 accggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacga 1071 Query: 352 tctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttc 411 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1070 tctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttc 1012 Query: 412 cccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgca 471 |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cccttctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgca 953 Query: 472 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcat 531 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 952 atgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcat 893 Query: 532 gcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 892 gcattgcacggtgaatgtgaaga 870
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 482/492 (97%), Gaps = 2/492 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 122 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 123 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 182 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 183 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 242 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 243 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 1108 Query: 303 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 362 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 363 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaact 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaact 989 Query: 423 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 482 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 930 Query: 483 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 870 Query: 543 tgaatgtgaaga 554 |||||||||||| Sbjct: 869 tgaatgtgaaga 858
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 487/498 (97%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1270 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1210 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1209 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1150 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1090 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1030 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1029 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 971 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 852 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 851 gcacggtgaatgtgaaga 834
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 484/494 (97%), Gaps = 2/494 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1302 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1241 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1182 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtata 1122 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 ctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 884 Query: 541 ggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||| Sbjct: 883 ggtgaatgtgaaga 870
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 530/554 (95%), Gaps = 3/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 60 ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 gtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagt 1332 Query: 61 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 120 ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1331 tcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1272 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 ccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1212 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1211 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1152 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1151 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1092 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1091 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttca 1032 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 973 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 914 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 913 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 854 Query: 541 ggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||| Sbjct: 853 ggtgaatgtgaaga 840
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 521/542 (96%), Gaps = 3/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 14 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 72 |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 73 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 132 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 133 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 192 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 193 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 253 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 312 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 313 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 373 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactac 432 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 433 tgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 492 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 493 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 552 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 553 ga 554 || Sbjct: 871 ga 870
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 882 bits (445), Expect = 0.0 Identities = 514/533 (96%), Gaps = 3/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 81 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1385 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1326 Query: 82 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1325 tctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1266 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1265 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1206 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1205 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1146 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1145 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1086 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1085 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1026 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1025 tcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 968 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 967 cgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 908 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 907 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaaga 855
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 479/488 (98%), Gaps = 2/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 127 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 186 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 187 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 1164 Query: 247 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 307 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 366 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatataa 1044 Query: 367 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 547 tgtgaaga 554 |||||||| Sbjct: 865 tgtgaaga 858
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 880 bits (444), Expect = 0.0 Identities = 488/500 (97%), Gaps = 2/500 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1295 Query: 115 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 174 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgca 1235 Query: 175 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 234 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1234 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1175 Query: 235 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1174 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccacc 1115 Query: 295 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1055 Query: 355 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 414 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1054 ttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 996 Query: 415 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 474 |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 937 Query: 475 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 936 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 877 Query: 535 ttgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||| Sbjct: 876 ttgcacggtgaatgtgaaga 857
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 484/495 (97%), Gaps = 2/495 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 965 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 906 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 846 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 845 cggtgaatgtgaaga 831
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 484/495 (97%), Gaps = 2/495 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 60 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacg 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacg 1264 Query: 120 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 179 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1263 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1204 Query: 180 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 239 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1203 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1144 Query: 240 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 299 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1143 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1084 Query: 300 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1083 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1024 Query: 360 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttcta 419 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1023 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttcta 965 Query: 420 acttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 479 |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 906 Query: 480 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 905 gctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgca 846 Query: 540 cggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||| Sbjct: 845 cggtgaatgtgaaga 831
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 493/507 (97%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 493/507 (97%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/492 (97%), Gaps = 2/492 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccc 122 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccc 1288 Query: 123 ttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 182 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 ttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgc 1228 Query: 183 attcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaa 242 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1227 atttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaa 1168 Query: 243 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataac 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1167 gatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataac 1108 Query: 303 acctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 362 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 acctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaat 1048 Query: 363 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaact 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaact 989 Query: 423 tacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 482 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 930 Query: 483 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 aatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacgg 870 Query: 543 tgaatgtgaaga 554 |||||||||||| Sbjct: 869 tgaatgtgaaga 858
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 486/498 (97%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1286 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcacc 1226 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatc 1166 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 987 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 868 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 867 gcacggtgaatgtgaaga 850
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 529/554 (95%), Gaps = 3/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 60 ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 gtatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1779 Query: 61 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1778 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1719 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1718 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccaggt 1659 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1658 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcca 1599 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1598 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1539 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1538 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1479 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| Sbjct: 1478 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcacgttccccttctaa 1420 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1419 cttacctactactgta-ccggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttag 1361 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1360 ctaatacacggaaatggataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 1301 Query: 541 ggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||| Sbjct: 1300 ggtgaatgtgaaga 1287
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 529/554 (95%), Gaps = 3/554 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagt 60 ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1858 gtatccaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1799 Query: 61 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1798 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcacgc 1739 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1738 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggt 1679 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1678 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1619 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1618 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1559 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1558 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttca 1499 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| Sbjct: 1498 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcacgttccccttctaa 1440 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1439 cttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccccgacatacgcaatgctttag 1381 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1380 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 1321 Query: 541 ggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||| Sbjct: 1320 ggtgaatgtgaaga 1307
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 480/490 (97%), Gaps = 2/490 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgccctt 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgccctt 1268 Query: 125 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1267 cgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcat 1208 Query: 185 tcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaaga 244 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct: 1207 ttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaaga 1148 Query: 245 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacac 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1147 tttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataacac 1088 Query: 305 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 ctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataa 1028 Query: 365 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaactta 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1027 aatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaactta 969 Query: 425 cctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 484 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 cctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 910 Query: 485 tacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 544 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 909 tacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtg 850 Query: 545 aatgtgaaga 554 |||||||||| Sbjct: 849 aatgtgaaga 840
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 520/542 (95%), Gaps = 3/542 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 14 tcgaactcgaatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 72 |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1409 tcgaactcaaatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccat 1350 Query: 73 ttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacga 132 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1349 ttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgg 1290 Query: 133 gcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaa 192 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1289 gcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaa 1230 Query: 193 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtc 252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1229 ggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtc 1170 Query: 253 agagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatg 312 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 agagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatg 1110 Query: 313 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcg 372 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 gatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcg 1050 Query: 373 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactac 432 |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 cgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcacgttccccttctaacttacctactac 991 Query: 433 tgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgga 492 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 tgta-ccggagtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacgga 932 Query: 493 aatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaa 552 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 931 aatgtataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaa 872 Query: 553 ga 554 || Sbjct: 871 ga 870
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 478/488 (97%), Gaps = 2/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 127 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 186 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 187 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 247 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 306 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 307 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 366 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaaa 1044 Query: 367 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttctcgttccccttctaacttacc 985 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 547 tgtgaaga 554 |||||||| Sbjct: 865 tgtgaaga 858
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 478/488 (97%), Gaps = 2/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 127 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 186 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 187 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 247 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 307 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 367 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 547 tgtgaaga 554 |||||||| Sbjct: 865 tgtgaaga 858
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 478/488 (97%), Gaps = 2/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 127 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 186 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 187 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatt 1164 Query: 247 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 307 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 367 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 547 tgtgaaga 554 |||||||| Sbjct: 865 tgtgaaga 858
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 478/488 (97%), Gaps = 2/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1284 Query: 127 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 186 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 187 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 247 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1163 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacct 1104 Query: 307 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 367 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 547 tgtgaaga 554 |||||||| Sbjct: 865 tgtgaaga 858
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 487/500 (97%), Gaps = 2/500 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1288 Query: 115 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 174 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1287 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgca 1228 Query: 175 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 234 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1227 ccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1168 Query: 235 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 294 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 1108 Query: 295 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 354 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 ggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1048 Query: 355 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1047 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 989 Query: 415 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 474 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 475 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 870 Query: 535 ttgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||| Sbjct: 869 ttgcacggtgaatgtgaaga 850
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 485/498 (97%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1290 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 acgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1230 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1229 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatc 1170 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 cccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1110 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1109 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatcttt 1050 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1049 ttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 991 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ctagcttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 932 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 931 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcatt 872 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 871 gcacggtgaatgtgaaga 854
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 482/494 (97%), Gaps = 2/494 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1291 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1231 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct: 1230 gcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccca 1171 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1170 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtata 1111 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 acaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1051 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 992 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 933 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 932 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcgtgcattgcac 873 Query: 541 ggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||| Sbjct: 872 ggtgaatgtgaaga 859
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 485/498 (97%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 tggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 977 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaaga 840
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 512/533 (96%), Gaps = 3/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 81 |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1387 aatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagct 1328 Query: 82 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1327 gctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1268 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1267 caagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1208 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1207 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1148 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1147 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccag 1088 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1087 tcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1028 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1027 tcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 970 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 969 cgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcatac 910 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 909 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaaga 857
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 496/513 (96%), Gaps = 2/513 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 42 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1380 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1321 Query: 102 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 161 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1320 ttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1261 Query: 162 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 221 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1201 Query: 222 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 281 |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1200 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1141 Query: 282 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 341 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1140 ccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1081 Query: 342 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 401 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1080 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca- 1022 Query: 402 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccccca 461 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1021 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctccccca 963 Query: 462 gacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatca 521 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 gacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatca 903 Query: 522 ataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 902 ataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaaga 870
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 491/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1194 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1135 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1134 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1075 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1074 ngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1015 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1014 agcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 955 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 954 acgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 896 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 837 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 836 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 777 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 776 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 750
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 491/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 491/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 862 bits (435), Expect = 0.0 Identities = 491/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggacatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 463/470 (98%), Gaps = 2/470 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 85 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 144 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 145 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 204 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 205 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 264 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 265 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 325 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 385 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 444 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 942 Query: 445 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 882 Query: 505 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 832
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 484/498 (97%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1287 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1286 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacc 1227 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1226 cggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1167 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct: 1166 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccgg 1107 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1047 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1046 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 988 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 869 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 || ||||||||||||||| Sbjct: 868 gctcggtgaatgtgaaga 851
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 463/470 (98%), Gaps = 2/470 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 85 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 144 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1240 Query: 145 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 204 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1239 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1180 Query: 205 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 264 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 1120 Query: 265 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1060 Query: 325 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1059 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 1000 Query: 385 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 444 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 999 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 942 Query: 445 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 882 Query: 505 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 881 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 832
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 484/498 (97%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1216 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1155 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccgg 1096 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatcttt 1036 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcgcgttcccctt 977 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||| Sbjct: 857 gcacggtgaatgtgaaga 840
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 495/513 (96%), Gaps = 2/513 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 42 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1364 ttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacc 1305 Query: 102 ttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 161 ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1304 ttcacgagcaagatcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccg 1245 Query: 162 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 221 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1244 attagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1185 Query: 222 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 281 |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1184 taatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacgtgaatacc 1125 Query: 282 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 341 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 1065 Query: 342 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 401 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1064 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca- 1006 Query: 402 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctccccca 461 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccccca 947 Query: 462 gacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatca 521 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 gacatacgcaatgctttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatca 887 Query: 522 ataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 886 ataactgcatgcattgcccggtgaatgtgaaga 854
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 511/533 (95%), Gaps = 3/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 81 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 120481 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 120422 Query: 82 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120421 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 120362 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120361 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 120302 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120301 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 120242 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120241 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 120182 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120181 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 120122 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 120121 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 120064 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120063 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 120004 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 120003 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 119951
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 511/533 (95%), Gaps = 3/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 81 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58854 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58795 Query: 82 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58794 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58735 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58734 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58675 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58674 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58615 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58614 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 58555 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58554 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 58495 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 58494 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 58437 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58436 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 58377 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58376 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 58324
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 858 bits (433), Expect = 0.0 Identities = 511/533 (95%), Gaps = 3/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 81 ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1789 aatttgatctccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 1730 Query: 82 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1729 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgggcttgtaca 1670 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1669 caggcttctaaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1610 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1609 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggc 1550 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1549 atatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccag 1490 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1489 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1430 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1429 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 1372 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1371 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 1312 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1311 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 1259
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 476/488 (97%), Gaps = 2/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 126 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 127 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 186 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 187 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 247 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 306 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 307 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 367 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 547 tgtgaaga 554 |||||||| Sbjct: 865 tgtgaaga 858
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 856 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 476/488 (97%), Gaps = 2/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 126 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcacgcccttcg 1284 Query: 127 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 186 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1283 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1224 Query: 187 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1223 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatt 1164 Query: 247 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 306 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1163 tcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1104 Query: 307 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1103 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1044 Query: 367 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1043 tcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 925 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcgataactgcatgcattgcacggtgaa 866 Query: 547 tgtgaaga 554 |||||||| Sbjct: 865 tgtgaaga 858
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 854 bits (431), Expect = 0.0 Identities = 490/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 854 bits (431), Expect = 0.0 Identities = 490/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>emb|AJ746283.1| Aristida congesta subsp. barbicollis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 854 bits (431), Expect = 0.0 Identities = 490/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccagaatggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 854 bits (431), Expect = 0.0 Identities = 490/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 agaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31359.1|ACU31359 Aristida congesta subsp. barbicollis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 854 bits (431), Expect = 0.0 Identities = 490/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtta-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccagaatggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccattatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 854 bits (431), Expect = 0.0 Identities = 490/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcatggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 854 bits (431), Expect = 0.0 Identities = 490/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 462/470 (98%), Gaps = 2/470 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 85 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 144 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 145 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 204 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 205 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 264 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 265 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 325 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 385 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 444 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 939 Query: 445 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 879 Query: 505 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 878 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 829
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 462/470 (98%), Gaps = 2/470 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 85 cggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaa 144 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacag 1237 Query: 145 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaa 204 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1236 gcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaa 1177 Query: 205 gttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcata 264 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 gttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcata 1117 Query: 265 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 tgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcc 1057 Query: 325 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 tgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatca 997 Query: 385 acaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagt 444 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 996 acaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccggagt 939 Query: 445 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 504 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccat 879 Query: 505 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 878 gatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 829
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 850 bits (429), Expect = 0.0 Identities = 510/533 (95%), Gaps = 3/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 81 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1400 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 1341 Query: 82 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1340 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 1281 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1280 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 1221 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 1161 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 1101 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 1041 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1040 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 983 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 923 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 922 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 870
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 850 bits (429), Expect = 0.0 Identities = 510/533 (95%), Gaps = 3/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 81 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58273 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58214 Query: 82 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58213 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58154 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58153 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58094 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58093 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58034 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58033 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57974 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57973 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57914 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 57913 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 57856 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57855 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 57796 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 57795 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 57743
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 850 bits (429), Expect = 0.0 Identities = 510/533 (95%), Gaps = 3/533 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 23 aatttgatcgccttcc-tacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagct 81 ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 58283 aatttgatctccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagct 58224 Query: 82 gctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtaca 141 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58223 gctttgataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtaca 58164 Query: 142 caagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcct 201 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 58163 caggcttctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcct 58104 Query: 202 aaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggc 261 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58103 aaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggc 58044 Query: 262 atatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccag 321 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58043 atatgccaaacatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccag 57984 Query: 322 tcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 381 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57983 tcctgagtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaa 57924 Query: 382 tcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccgg 441 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 57923 tcaacaaaacctaaagtta-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccgg 57866 Query: 442 agtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 501 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57865 agtggatatgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcatac 57806 Query: 502 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 57805 catgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 57753
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 475/488 (97%), Gaps = 2/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 67 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcg 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcg 1294 Query: 127 ttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattc 186 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 ttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcattt 1234 Query: 187 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatt 246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct: 1233 ccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagatt 1174 Query: 247 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 tcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacct 1114 Query: 307 ggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 366 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 ggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaa 1054 Query: 367 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacc 426 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacc 995 Query: 427 tactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 486 |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 936 Query: 487 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 935 cacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaa 876 Query: 547 tgtgaaga 554 |||||||| Sbjct: 875 tgtgaaga 868
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 484/500 (96%), Gaps = 2/500 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaaga 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaaga 1278 Query: 115 tcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 174 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 tcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgca 1218 Query: 175 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcg 234 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1217 ccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatca 1158 Query: 235 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctacc 294 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct: 1157 tccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccacc 1098 Query: 295 ggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 354 ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 ggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatct 1038 Query: 355 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccc 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct: 1037 ttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccc 979 Query: 415 ttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 474 |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactaccgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 920 Query: 475 ctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgca 534 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 ctttcgctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataactgcatgca 860 Query: 535 ttgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ttgcacggtgaatgtgaaga 840
>emb|AJ746285.1| Briza media chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 472/485 (97%), Gaps = 2/485 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 70 catttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgtta 129 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1332 cattkgcaagttactcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgtta 1273 Query: 130 cgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccc 189 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1272 cgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccc 1213 Query: 190 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcg 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1212 caaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttca 1153 Query: 250 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggc 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1152 gtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggc 1093 Query: 310 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1092 atggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatca 1033 Query: 370 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctac 429 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 tcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctac 974 Query: 430 tactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 489 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 973 tactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 915 Query: 490 ggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 914 ggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgt 855 Query: 550 gaaga 554 ||||| Sbjct: 854 gaaga 850
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 489/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataaca 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||| || ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcatagctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 489/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31104.1|ECU31104 Eragrostis capensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 489/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcttgataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 482/498 (96%), Gaps = 2/498 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 57 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatc 116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatc 1276 Query: 117 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 176 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1275 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcacc 1216 Query: 177 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 236 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1215 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1156 Query: 237 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1155 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1096 Query: 297 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 356 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1095 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1036 Query: 357 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttcccctt 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1035 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttcccctt 977 Query: 417 ctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 476 |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgta-ccggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 477 ttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 536 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcatt 858 Query: 537 gcacggtgaatgtgaaga 554 || ||||||||||||||| Sbjct: 857 gctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|AY395555.1| Poa trivialis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1287 Score = 842 bits (425), Expect = 0.0 Identities = 466/477 (97%), Gaps = 2/477 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 78 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 137 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 138 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 197 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 198 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 257 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 258 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 318 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 377 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 378 taaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 437 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta- 930 Query: 438 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 497 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 870 Query: 498 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 813
>emb|AJ746301.1| Poa trivialis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1287 Score = 842 bits (425), Expect = 0.0 Identities = 466/477 (97%), Gaps = 2/477 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 78 agctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttg 137 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 agctgctcggataattccattaccttcacgagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttg 1228 Query: 138 tacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatg 197 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1227 tacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatg 1168 Query: 198 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagc 257 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1167 tcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagc 1108 Query: 258 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 tggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatac 1048 Query: 318 ccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 377 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 ccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaa 988 Query: 378 taaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaacttacctactactgtac 437 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 taaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaacttacctactactgta- 930 Query: 438 ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 497 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 929 ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgc 870 Query: 498 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 869 ataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 813
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 842 bits (425), Expect = 0.0 Identities = 481/497 (96%), Gaps = 2/497 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatca 117 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaagatcg 1305 Query: 118 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacca 177 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct: 1304 cgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacca 1245 Query: 178 ggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcc 237 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1244 ggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatct 1185 Query: 238 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggt 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1184 ccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggt 1125 Query: 298 ataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 357 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 ataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt 1065 Query: 358 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttc 417 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1064 tcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttc 1006 Query: 418 taacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 477 ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 478 tagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 537 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacacgaaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattg 887 Query: 538 cacggtgaatgtgaaga 554 | ||||||||||||||| Sbjct: 886 cccggtgaatgtgaaga 870
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 492/512 (96%), Gaps = 2/512 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 43 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 102 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 103 tcgcgagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcga 162 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaagatctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgg 1242 Query: 163 ttagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 222 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 ttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgt 1182 Query: 223 aatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacca 282 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccc 1122 Query: 283 cctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccg 342 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1121 cctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagataccg 1062 Query: 343 cgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatt 402 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1061 cgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-t 1003 Query: 403 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccag 462 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgta-ccagagtggatatgatctcccccag 944 Query: 463 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaa 522 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 acatacgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaa 884 Query: 523 taactgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 883 taactgcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 852
>gb|U31442.1|SDU31442 Stipa dregeana var. dregeana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 841 bits (424), Expect = 0.0 Identities = 491/508 (96%), Gaps = 4/508 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagct-gctcggataatttcattaccttcgc 106 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgctcg-ataatttcattaccttcac 1286 Query: 107 gagcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 166 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gagcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 167 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 226 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 227 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 286 | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 287 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 346 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 347 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcg 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttcg 987 Query: 407 cgttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacat 466 || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 cgctccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacat 928 Query: 467 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataac 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 927 acgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccgtgatttttctgtctatcaataac 868 Query: 527 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 867 tgcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 488/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagt-aatttccc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 ggcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataaca 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31105.1|GSU31105 Gynerium sagittatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 488/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctccccccgacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccataatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31103.1|ESU31103 Enneapogon scaber ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 488/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccaga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgaga 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaagataatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgtataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|U31101.1|CLU31101 Chasmanthium latifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 839 bits (423), Expect = 0.0 Identities = 488/507 (96%), Gaps = 2/507 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 48 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 107 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 108 agcaagatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagc 167 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1284 agcaagatcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagc 1225 Query: 168 tgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 227 | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tactgcaccaggtgcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatac 1165 Query: 228 agaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctga 287 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1164 ggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctga 1105 Query: 288 agctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 347 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 agccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagc 1045 Query: 348 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgc 407 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 acgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgc 986 Query: 408 gttccccttctaacttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacata 467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 468 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataact 867 Query: 528 gcatgcattgcacggtgaatgtgaaga 554 ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 866 gcatgcattgctcggtgaatgtgaaga 840
>gb|AY626351.1| Eriachne triseta ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1320 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 478/494 (96%), Gaps = 2/494 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1320 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1261 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1260 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1201 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1200 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1141 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1140 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagcaaccggtata 1081 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1080 acacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatccttttca 1021 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 420 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1020 ataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 962 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 961 cttacctactactgta-ccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 903 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 902 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 843 Query: 541 ggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||| Sbjct: 842 ggtgaatgtgaaga 829
>emb|AJ746299.1| Phragmites australis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1341 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 478/494 (96%), Gaps = 2/494 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagatcacgc 120 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacgagcaagatcgcgc 1282 Query: 121 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 180 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1281 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1222 Query: 181 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 240 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1221 gcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcca 1162 Query: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1161 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1102 Query: 301 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1101 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacggtctttttca 1042 Query: 361 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcattttcgcgttccccttctaa 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1041 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtca-tttcgcgttccccttctaa 983 Query: 421 cttacctactactgtacccggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 480 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 cttacctactactgta-ccggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 924 Query: 481 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgcac 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 923 ctaatacacggaaatgcataccatgatttttctgtctatcaataactgcatgcattgctc 864 Query: 541 ggtgaatgtgaaga 554 |||||||||||||| Sbjct: 863 ggtgaatgtgaaga 850 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 4,316,578 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 4316578 Number of successful extensions: 133679 Number of sequences better than 10.0: 15093 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 15018 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 86 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 85298 Number of HSP's gapped (non-prelim): 26061 length of query: 554 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 23 effective length of query: 531 effective length of database: 17,143,297,704 effective search space: 9103091080824 effective search space used: 9103091080824 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)