Clone Name | rbasd16i07 |
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Clone Library Name | barley_pub |
>gb|AY137456.1| Hordeum vulgare subsp. vulgare ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 484/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137453.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 484/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY836173.1| Hordeum vulgare subsp. spontaneum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3110 Score = 900 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 484/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY137459.1| Hordeum roshevitzii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137457.1| Hordeum patagonicum subsp. magellanicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137452.1| Hordeum pusillum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137445.1| Hordeum patagonicum subsp. setifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137444.1| Hordeum patagonicum subsp. patagonicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137442.1| Hordeum euclaston ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1606 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137441.1| Hordeum comosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137439.1| Hordeum flexuosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137438.1| Hordeum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1621 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137433.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H28 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137432.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H161 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137431.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H837 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137430.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H832 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137429.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H828 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137428.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H826 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137427.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H824 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137426.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H823 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137425.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H820 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137424.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H81 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137423.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum specimen-voucher H64 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY836169.1| Hordeum brachyantherum subsp. californicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 892 bits (450), Expect = 0.0 Identities = 483/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY137434.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1617 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 482/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 ccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY836171.1| Hordeum marinum subsp. gussoneanum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3108 Score = 888 bits (448), Expect = 0.0 Identities = 482/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 ccyttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY137455.1| Hordeum bogdanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1612 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 482/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137448.1| Hordeum stenostachys ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 886 bits (447), Expect = 0.0 Identities = 481/488 (98%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1530 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctaktt 1471 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1470 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgc 1412 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1352 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 1292 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 1232 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1172 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1112 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 ttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1053 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 1052 taatacac 1045
>emb|Z49841.1|HJCHRBPCX H.jubatum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 482/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggctgctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>gb|AY137450.1| Hordeum intercedens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1610 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 482/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaag 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137447.1| Hordeum patagonicum subsp. santacrucense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttkag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 |||||||| Sbjct: 1053 staatacac 1045
>gb|AY137440.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 482/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY836170.1| Hordeum erectifolium ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3102 Score = 884 bits (446), Expect = 0.0 Identities = 482/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY137443.1| Hordeum pubiflorum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 878 bits (443), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccnctcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 agcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY328025.1| Triticum aestivum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcl) mRNA, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1519 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1421 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1420 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1362 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1302 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1242 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1241 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1182 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1181 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1122 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1062 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1003 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1002 ctaatacac 994
>emb|X62118.1|CHACHSRG A.crassa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4811 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1199 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1198 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1140 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1139 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1080 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1020 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 960 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 900 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 899 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 840 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 839 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 781 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 780 ctaatacac 772
>emb|X62117.1|CHTAHSRA T.aestivum chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 4075 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1199 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1198 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1140 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1139 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1080 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1020 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 960 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 900 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 899 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 840 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 839 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 781 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 780 ctaatacac 772
>gb|AY137422.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H620 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137421.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H607 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137418.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H87 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137417.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H41 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY836184.1| Taeniatherum caput-medusae ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3179 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgss 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836177.1| Crithopsis delileana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2752 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836175.1| Aegilops tauschii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2136 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836164.1| Eremopyrum distans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2374 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacyttcgcgagcaar-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836161.1| Aegilops comosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3171 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836158.1| Australopyrum pectinatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2365 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>dbj|AB042240.3| Triticum aestivum chloroplast DNA, complete genome Length = 134545 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56330 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 56271 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 56270 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 56212 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56211 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 56152 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56151 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 56092 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56091 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 56032 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 56031 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 55972 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55971 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 55912 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55911 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 55853 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 55852 ctaatacac 55844
>dbj|D00206.1|WHTCPRBCL Triticum aestivum chloroplast gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (H-type), complete cds Length = 1755 Score = 876 bits (442), Expect = 0.0 Identities = 481/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1516 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1457 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1456 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1398 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1338 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1337 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1278 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1277 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1218 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1217 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1158 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1157 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1098 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1097 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1039 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1038 ctaatacac 1030
>gb|AY137454.1| Hordeum bulbosum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 874 bits (441), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttnn 1054 Query: 479 ctaatacac 487 |||||||| Sbjct: 1053 ntaatacac 1045
>gb|AY137437.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1628 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY836172.1| Hordeum murinum subsp. glaucum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3095 Score = 872 bits (440), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggayatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836162.1| Triticum monococcum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3192 Score = 870 bits (439), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY137449.1| Hordeum chilense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1616 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcgcaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137436.1| Hordeum marinum subsp. marinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137420.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY137419.1| Hordeum marinum subsp. marinum specimen-voucher H522 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY836183.1| Aegilops speltoides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; and rbcL-psaI intergenic spacer, partial sequence; chloroplast Length = 2360 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836181.1| Secale strictum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3155 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsss 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836178.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3089 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836176.1| Peridictyon sanctum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3106 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsss 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836167.1| Henrardia persica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2372 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctactggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836165.1| Eremopyrum triticeum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2366 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgattgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836154.1| Bromus arvensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3215 Score = 868 bits (438), Expect = 0.0 Identities = 480/489 (98%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgccgctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY137458.1| Hordeum cordobense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1615 Score = 866 bits (437), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaacncgaatntgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagcngctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcggttagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>emb|Z49845.1|PSCHRBPCX P.sanctum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacannctgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>gb|AY137446.1| Hordeum patagonicum subsp. mustersii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1614 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1352 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacanntggcatggatacccagtcnkgagtgaanaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY836159.1| Australopyrum retrofractum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2373 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsss 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836157.1| Amblyopyrum muticum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3183 Score = 864 bits (436), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgnnccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>emb|Z49846.1|PSPCHRBPC P.spicata chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>gb|AY137460.1| Psathyrostachys fragilis subsp. fragilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacac 1044
>gb|AY607060.1| Psathyrostachys caduca voucher H6702 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1617 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacac 1044
>gb|AY607057.1| Psathyrostachys huashanica voucher H3087 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1594 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacac 1044
>gb|AY607056.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4378 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacac 1044
>gb|AY607055.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus voucher H4375 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacac 1044
>gb|AY836185.1| Thinopyrum bessarabicum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3054 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1329 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1328 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1270 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1269 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1210 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1209 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1150 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1149 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1090 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1089 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1030 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1029 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaa 970 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 969 cttacctactactgtacc-ggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 911 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 910 ctaatacac 902
>gb|AY836182.1| Pseudoroegneria spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3138 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836163.1| Haynaldia villosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3190 Score = 860 bits (434), Expect = 0.0 Identities = 479/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>emb|Z49836.1|BICHRBPCX B.inermis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1434 Score = 854 bits (431), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgncaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgtgtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>emb|Z49843.1|LCCHRBPCX L.chinensis chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>emb|Z49837.1|EGCHRBPCX E.glaucescens chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcc 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>emb|X62119.1|CHASHSRA A.squarrosa chloroplast genes rbcL, psaI, ORF 185 and ORF 230 for large subunit of ribulose 1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase and apoprotein I Length = 3830 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1199 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1198 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1140 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1139 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcctgaccagg 1080 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1020 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1019 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 960 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 900 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 899 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 840 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 839 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 781 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 780 ctaatacac 772
>gb|AY137462.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1477 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1338 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1337 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1279 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1219 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1159 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1099 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1039 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 979 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 920 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 919 ctaatacac 911
>gb|AY137461.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1589 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 477/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1112 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacac 1044
>gb|AY607052.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate B voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1416 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1356 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1116 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1057 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1056 ctaatacac 1048
>gb|AY607050.1| Psathyrostachys juncea voucher H7544 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1416 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1356 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1116 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1057 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1056 ctaatacac 1048
>gb|AY836180.1| Psathyrostachys stoloniformis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2309 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1397 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1338 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1337 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1279 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1219 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1159 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1158 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1099 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1039 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 979 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 920 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 919 ctaatacac 911
>gb|AY836179.1| Psathyrostachys fragilis subsp. villosus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and psaI gene, partial sequence; chloroplast Length = 3071 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 477/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcmataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836174.1| Thinopyrum elongatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3158 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 477/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsss 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836166.1| Festucopsis serpentini ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3166 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 477/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgss 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836160.1| Australopyrum velutinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2268 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1390 gtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1331 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1330 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1272 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1212 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1211 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1152 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1092 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1032 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 972 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 913 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 912 ctaatacac 904
>gb|AY836156.1| Agropyron cristatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2360 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 477/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsss 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY836155.1| Bromus sterilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 3234 Score = 852 bits (430), Expect = 0.0 Identities = 478/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgct 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 gccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>emb|Z49842.1|HLCHRBPCX H.lechleri chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 850 bits (429), Expect = 0.0 Identities = 476/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga--tttgtcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaanntgatcgccttccatacttcacaagctgcngctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-agagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 |||||||| Sbjct: 943 ataatacac 935
>gb|AY607054.1| Psathyrostachys fragilis subsp. secaliformis voucher H4348 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1589 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 476/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1530 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1471 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1470 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1412 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1411 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1352 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1351 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1292 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 aaagrtttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1232 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1231 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1172 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1171 aataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttygcgttccccttctaa 1112 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1053 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1052 ctaatacac 1044
>gb|AY607053.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate C voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 477/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1416 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1356 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatyaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1116 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1057 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1056 ctaatacac 1048
>gb|AY836168.1| Heteranthelium piliferum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; rbcL-psaI intergenic spacer, complete sequence; and photosystem I subunit VIII (psaI) gene, partial cds; chloroplast Length = 2371 Score = 848 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 477/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1469 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1410 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1409 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1351 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1350 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1291 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1231 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1230 aaagatttcagtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1171 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1111 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1110 aataaaatcatcgcgcaataaatcnncaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1051 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 992 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 991 ctaatacac 983
>gb|AY607058.1| Psathyrostachys rupestris subsp. daghestanica voucher H6703 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1471 Score = 846 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 477/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1390 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1331 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1330 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1272 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1212 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1211 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1152 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1092 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 aacanctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1032 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1031 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 972 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 971 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 913 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 912 ctaatacac 904
>emb|Z49839.1|ETCHRBPCX E.trachycaulus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 477/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcggc 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>gb|AY601671.1| Hordeum capense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 844 bits (426), Expect = 0.0 Identities = 476/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccsscgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>emb|Z49838.1|EPCHRBPCX E.patagonicus chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 842 bits (425), Expect = 0.0 Identities = 475/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcgatttgt--cgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaattnnnncgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcc 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>gb|AY772669.1| Elymus sibiricus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) mRNA, complete cds; chloroplast Length = 1510 Score = 837 bits (422), Expect = 0.0 Identities = 476/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1472 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1413 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1412 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1354 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1353 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1294 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1293 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1234 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1233 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1174 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1114 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 aataaaatcatcgcgcaataaatcaccaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1054 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 995 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 994 ctaatacac 986
>gb|AY601672.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1619 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 473/489 (96%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggctcgaacycgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcsss 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacnnngcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacmgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1112 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>gb|AY607051.1| Psathyrostachys lanuginosa isolate A voucher H8803 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast Length = 1614 Score = 835 bits (421), Expect = 0.0 Identities = 475/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1534 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1475 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1474 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1416 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1415 cccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgcnnnaccagg 1356 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1355 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1296 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1236 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1235 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1176 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1175 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1116 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1057 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1056 ctaatacac 1048
>emb|Z49840.1|EECHRBPCX E.erianthum chloroplast rbcL gene for ribulosebiphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 829 bits (418), Expect = 0.0 Identities = 475/489 (97%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacagacttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccacgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>emb|AJ746261.1| Festuca rubra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 821 bits (414), Expect = 0.0 Identities = 474/489 (96%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>emb|AJ746271.1| Otatea acuminata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1409 Score = 815 bits (411), Expect = 0.0 Identities = 472/488 (96%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1403 tatctaccggctcgaactcsaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 1344 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1343 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgt 1285 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 1225 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1224 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1165 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1164 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1105 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1045 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 985 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 ttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 926 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 925 taatacac 918
>gb|AY395528.1| Alopecurus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit-like protein (rbcL) gene, partial sequence; chloroplast Length = 1408 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 473/489 (96%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1401 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1342 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1341 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1283 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1282 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcaccagg 1223 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1222 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1163 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1162 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1103 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1102 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1043 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1042 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaa 983 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 982 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 924 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 923 ctaatacac 915
>emb|AJ746257.1| Avena fatua chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 473/489 (96%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>gb|L15300.1|ASTCPRBCL Avena sativa ribulosbisphosphate dehydrogenase (rbcL) gene, complete cds Length = 1623 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 473/489 (96%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1519 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1460 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1459 tcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1401 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1400 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1341 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1340 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1281 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1280 aaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1221 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1220 aacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1161 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1160 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctag 1101 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1100 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 1042 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1041 ctaatacac 1033
>gb|L14621.1|PUZRBCL Puccinellia distans chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1484 Score = 813 bits (410), Expect = 0.0 Identities = 473/489 (96%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcgcaagccgcagctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 aaagatttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>gb|AY137435.1| Hordeum brevisubulatum subsp. violaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1619 Score = 811 bits (409), Expect = 0.0 Identities = 470/489 (96%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtatctaccggcgcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1472 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1471 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgss 1413 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1353 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1352 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtcccc 1293 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1292 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1233 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1232 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1173 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1172 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1113 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1112 cttacctannnctgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgnnnnag 1054 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1053 ctaatacac 1045
>emb|AJ746258.1| Brachypodium sylvaticum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1397 Score = 811 bits (409), Expect = 0.0 Identities = 450/461 (97%), Gaps = 2/461 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1383 tcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 1324 Query: 87 taatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagct 146 |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1323 taatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggct 1265 Query: 147 tctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagtt 206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 tctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagtt 1205 Query: 207 cctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 266 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1204 cctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 1145 Query: 267 caaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctga 326 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaacatgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctga 1085 Query: 327 gtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaaca 386 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 gtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaaca 1025 Query: 387 aaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggat 446 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1024 aaacctaaagtgatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggat 966 Query: 447 atgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 965 atgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 925
>gb|AY395531.1| Bromus hordeaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1350 Score = 807 bits (407), Expect = 0.0 Identities = 430/435 (98%), Gaps = 2/435 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag- 1289 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 472 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 473 ctttagctaatacac 487 ||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacac 915
>emb|AJ746268.1| Dactylis glomerata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1388 Score = 805 bits (406), Expect = 0.0 Identities = 472/489 (96%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1381 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagccgcggctagt 1322 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1321 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1263 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1262 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccagg 1203 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1202 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcacc 1143 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1142 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 1083 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1082 aacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1023 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1022 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 963 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 904 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 903 ctaatacac 895
>emb|AJ746256.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 805 bits (406), Expect = 0.0 Identities = 472/489 (96%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagccgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgcgcaag-atcgcg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>emb|AJ746269.1| Olmeca recta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 803 bits (405), Expect = 0.0 Identities = 449/461 (97%), Gaps = 2/461 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1378 tcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 1319 Query: 87 taatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagct 146 |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1318 taatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagct 1260 Query: 147 tctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagtt 206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 tctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagtt 1200 Query: 207 cctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 266 |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1199 cctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 1140 Query: 267 caaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctga 326 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1139 caaacatgaataccgcctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctga 1080 Query: 327 gtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaaca 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 gtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaaca 1020 Query: 387 aaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggat 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1019 aaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggat 961 Query: 447 atgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 atgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 920
>gb|AY395527.1| Agrostis capillaris ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1408 Score = 801 bits (404), Expect = 0.0 Identities = 445/456 (97%), Gaps = 2/456 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 32 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 91 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 92 tcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 151 ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 152 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 211 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 212 accaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 271 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 272 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 331 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 332 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 392 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgat 451 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgat 951 Query: 452 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 915
>gb|AY691640.1| Stenostachys laevis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 799 bits (403), Expect = 0.0 Identities = 420/423 (99%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 925 cac 923
>gb|AY395539.1| Glyceria fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1309 Score = 795 bits (401), Expect = 0.0 Identities = 427/433 (98%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1251 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 892 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 891 ttagctaatacac 879
>emb|AJ746290.1| Glyceria fluitans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1309 Score = 795 bits (401), Expect = 0.0 Identities = 427/433 (98%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1309 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1251 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1250 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1191 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1190 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1131 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1130 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1071 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1070 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1011 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1010 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 951 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 892 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 891 ttagctaatacac 879
>emb|AJ746286.1| Bromus erectus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 795 bits (401), Expect = 0.0 Identities = 427/433 (98%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-at 1287 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1227 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 1167 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 987 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacac 915
>emb|AJ746287.1| Bromus commutatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 793 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 426/432 (98%), Gaps = 2/432 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatc 115 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1344 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atc 1286 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1285 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 1226 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1225 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtc 1166 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 1106 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1046 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 986 Query: 416 taacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 taacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 927 Query: 476 tagctaatacac 487 |||||||||||| Sbjct: 926 tagctaatacac 915
>gb|AY691639.1| Stenostachys gracilis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1333 Score = 791 bits (399), Expect = 0.0 Identities = 419/423 (99%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1329 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcacgcccttc 1271 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1211 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1210 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1151 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1091 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1031 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 971 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 tactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 912 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 911 cac 909
>emb|AJ746267.1| Hibanobambusa tranquillans chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1412 Score = 787 bits (397), Expect = 0.0 Identities = 469/488 (96%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1404 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagtt 1345 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1344 caggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1286 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1285 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccaggt 1226 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct: 1225 gcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcca 1166 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1165 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1106 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 acacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1046 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 986 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 ttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 927 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 926 taatacac 919
>dbj|BA000029.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) mitochondrial DNA, complete genome Length = 490520 Score = 787 bits (397), Expect = 0.0 Identities = 471/488 (96%), Gaps = 6/488 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124756 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 124697 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 124696 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 124638 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124637 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124578 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 124577 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcccca 124518 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124517 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtata 124459 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 124458 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttca 124400 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124399 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124340 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124339 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124281 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 124280 taatacac 124273 Score = 787 bits (397), Expect = 0.0 Identities = 471/488 (96%), Gaps = 6/488 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30229 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 30170 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30169 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30111 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30110 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30051 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 30050 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatcccca 29991 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 29990 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc-cctgaagccaccggtata 29932 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 29931 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc-ttttca 29873 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29872 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29813 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29812 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29754 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 29753 taatacac 29746
>gb|AY395536.1| Schedonorus pratensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 783 bits (395), Expect = 0.0 Identities = 427/435 (98%), Gaps = 2/435 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1289 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1229 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1228 accaggtgcgtttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1169 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 472 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 473 ctttagctaatacac 487 ||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacac 915
>emb|AJ746277.1| Yushania maling chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 781 bits (394), Expect = 0.0 Identities = 469/489 (95%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>emb|AJ746272.1| Phyllostachys nigra chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1415 Score = 781 bits (394), Expect = 0.0 Identities = 469/489 (95%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1408 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1349 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1348 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1290 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1289 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1230 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1229 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1170 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1169 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1110 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1050 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 990 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 cttacctactactgtacc-ggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 931 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 930 ctaatacac 922
>emb|AJ746270.1| Oligostachyum oedogonatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 781 bits (394), Expect = 0.0 Identities = 469/489 (95%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactccaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>emb|AJ746265.1| Drepanostachyum falcatum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1413 Score = 781 bits (394), Expect = 0.0 Identities = 469/489 (95%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1406 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1347 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1346 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1288 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1287 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1228 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1227 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1168 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1167 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1108 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1048 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 988 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 cttacctactactgtacc-ggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 929 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 928 ctaatacac 920
>emb|AJ746259.1| Brachystachyum densiflorum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1427 Score = 781 bits (394), Expect = 0.0 Identities = 469/489 (95%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 gtatctaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatatttcacaagctgcggctagt 1361 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1360 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1302 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1301 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcaccagg 1242 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct: 1241 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatctcc 1182 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1181 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1122 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 aacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1062 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1002 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 cttacctactactgtacc-ggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 943 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 942 ctaatacac 934
>gb|AY522330.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55404 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55403 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55344 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55343 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55284 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55283 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55224 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55223 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55164 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55163 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55045 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 55044 taatacac 55037
>gb|AY522331.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S chloroplast, complete genome Length = 134551 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55522 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55463 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55462 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55404 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55403 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55344 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55343 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55284 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55283 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55224 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55223 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55164 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55163 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55104 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55103 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55045 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 55044 taatacac 55037
>gb|AY522329.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 chloroplast, complete genome Length = 134496 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55470 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55411 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55410 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55352 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55351 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55292 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55291 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55232 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55231 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55172 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55171 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55112 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55111 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55052 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55051 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 54993 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 54992 taatacac 54985
>emb|AJ784827.1| Phalaris arundinacea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1363 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 425/433 (98%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1363 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1305 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1304 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1245 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1244 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1185 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1184 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1125 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1124 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1065 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1064 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgctcccctt 1005 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1004 ctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 946 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 945 ttagctaatacac 933
>gb|DQ167399.1| Oryza sativa (indica cultivar-group) isolate 93-11 mitochondrion, complete genome Length = 491515 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 125811 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 125752 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 125751 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 125693 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 125692 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 125633 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 125632 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 125573 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 125572 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 125513 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125512 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 125453 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125452 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 125393 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 125392 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 125334 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 125333 taatacac 125326 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30751 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30692 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30691 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30633 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30632 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30573 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30572 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30513 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30512 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 30453 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30452 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 30393 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30392 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 30333 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 30332 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 30274 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 30273 taatacac 30266
>gb|DQ167807.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) isolate PA64S mitochondrion, complete genome Length = 490673 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 124720 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124719 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124660 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 124659 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 124600 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124599 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 124540 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124539 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 124480 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124479 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124361 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 124360 taatacac 124353 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30139 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30079 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30078 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30019 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 29959 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 29899 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29780 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 29779 taatacac 29772
>gb|DQ167400.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare mitochondrion, complete genome Length = 490669 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 124838 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 124779 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 124778 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 124720 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 124719 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 124660 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 124659 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 124600 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 124599 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 124540 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124539 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 124480 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124479 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 124420 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 124419 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 124361 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 124360 taatacac 124353 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 30257 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 30198 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 30197 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 30139 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 30138 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 30079 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 30078 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 30019 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 30018 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 29959 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29958 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 29899 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29898 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 29839 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 29838 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 29780 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 29779 taatacac 29772
>emb|X15901.1|CHOSXX Oryza sativa (japonica cultivar-group) chloroplast genome Length = 134525 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55514 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55455 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55454 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55396 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55395 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55336 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55335 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55276 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55275 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55216 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55215 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55156 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55155 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55096 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55095 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 55037 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 55036 taatacac 55029
>emb|AJ746297.1| Oryza sativa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1241 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 942 taatacac 935
>emb|AJ746264.1| Digitaria sanguinalis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 446/461 (96%), Gaps = 2/461 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1308 tcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttga 1249 Query: 87 taatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagct 146 |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1248 taatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggct 1190 Query: 147 tctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagtt 206 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 tctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagtt 1130 Query: 207 cctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 266 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 cctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 1070 Query: 267 caaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctga 326 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 caaacatgaatacccccagaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctga 1010 Query: 327 gtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaaca 386 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1009 gtgaaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaaca 950 Query: 387 aaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggat 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct: 949 aaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggat 891 Query: 447 atgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 890 atgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 850
>dbj|AP008207.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, complete sequence Length = 43261740 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 33527150 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 33527209 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 33527210 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 33527268 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527269 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 33527328 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 33527329 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 33527388 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 33527389 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 33527448 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527449 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 33527508 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527509 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 33527568 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 33527569 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 33527627 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 33527628 taatacac 33527635
>gb|AY622890.1| Diarrhena obovata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 425/433 (98%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1097 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacac 905
>dbj|AP003280.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 1, PAC clone:P0557A01 Length = 147201 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 72347 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 72406 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 72407 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 72465 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 72466 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 72525 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 72526 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 72585 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 72586 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 72645 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72646 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 72705 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72706 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 72765 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 72766 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 72824 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 72825 taatacac 72832
>dbj|AK105600.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-200-A05, full insert sequence Length = 2485 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1475 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1416 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1415 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1357 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1356 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1297 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1296 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1237 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1236 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1177 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1176 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1117 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1116 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1057 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1056 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 998 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 997 taatacac 990
>dbj|AK058623.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-018-B12, full insert sequence Length = 1243 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1218 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1159 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1158 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1100 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1040 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1039 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 980 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 979 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 920 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 919 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 860 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 859 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 800 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 799 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 741 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 740 taatacac 733
>dbj|AP006728.1| Oryza nivara chloroplast DNA, complete genome Length = 134494 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 55449 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 55390 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 55389 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 55331 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 55330 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 55271 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 55270 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 55211 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 55210 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 55151 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55150 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 55091 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55090 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 55031 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 55030 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 54972 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 54971 taatacac 54964
>dbj|D00207.1|RICCPRBCL Oryza sativa chloroplast gene for ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit, complete cds Length = 2062 Score = 779 bits (393), Expect = 0.0 Identities = 468/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1840 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1781 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1780 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1722 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1721 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1662 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1661 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1602 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1601 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1542 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1541 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1482 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1481 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1422 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1363 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 1362 taatacac 1355 Score = 52.0 bits (26), Expect = 0.002 Identities = 29/30 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 82 tcggataatttcattaccttcgcgagcaag 111 ||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1946 tcggataatttcattaccttcacgagcaag 1917
>emb|AJ746282.1| Anthoxanthum odoratum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1408 Score = 777 bits (392), Expect = 0.0 Identities = 442/456 (96%), Gaps = 2/456 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 32 ttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 91 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1368 ttccatacttcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatt 1309 Query: 92 tcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaa 151 ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1308 tcattaccttcacgcgcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaa 1250 Query: 152 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctcc 211 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1249 agccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcc 1190 Query: 212 accaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 271 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1189 accaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaac 1130 Query: 272 atgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaa 331 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1129 atgaataccacctgaagctactggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaa 1070 Query: 332 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 391 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1069 aaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacc 1010 Query: 392 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgat 451 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct: 1009 taaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgat 951 Query: 452 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 950 ctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 915
>gb|AY691636.1| Australopyrum calcis subsp. calcis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 775 bits (391), Expect = 0.0 Identities = 417/423 (98%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 925 cac 923
>ref|NM_195989.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) putative rbcL; RuBisCO large subunit from chromosome 10 chloroplast insertion (OSJNBb0075K12.39), mRNA Length = 1434 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 467/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1420 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1361 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1360 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1302 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1301 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1242 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1241 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1182 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1181 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1122 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1121 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1062 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1061 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1002 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1001 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 943 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 942 taatacac 935
>gb|AY395554.1| Phleum pratense ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1332 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 424/433 (97%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacac 899
>emb|AJ784835.1| Ammophila breviligulata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 424/433 (97%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1288 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1287 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1228 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1227 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1168 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1167 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactg 1108 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacac 916
>emb|AJ746298.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1332 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 424/433 (97%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccattggcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacac 899
>emb|AJ746278.1| Sasa palmata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1385 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 445/461 (96%), Gaps = 2/461 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 86 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1378 tcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcgga 1319 Query: 87 taatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagct 146 |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1318 taatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagct 1260 Query: 147 tctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagtt 206 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1259 tctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagtt 1200 Query: 207 cctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 266 |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1199 cctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 1140 Query: 267 caaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctga 326 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1139 caaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctga 1080 Query: 327 gtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaaca 386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1079 gtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaaca 1020 Query: 387 aaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggat 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct: 1019 aaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggat 961 Query: 447 atgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 960 atgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 920
>emb|AJ746275.1| Raddia brasiliensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 445/461 (96%), Gaps = 2/461 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 86 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1393 tcgctttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 1334 Query: 87 taatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagct 146 |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1333 taatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagct 1275 Query: 147 tctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagtt 206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1274 tctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagtt 1215 Query: 207 cctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 266 ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1214 cctcccccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 1155 Query: 267 caaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctga 326 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1154 caaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctga 1095 Query: 327 gtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaaca 386 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1094 gtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataagtcaaca 1035 Query: 387 aaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggat 446 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 1034 aaacctaaagtcatgtcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggac 976 Query: 447 atgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 975 atgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 935
>gb|AC122148.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10 clone OSJNAb0075K12, complete sequence Length = 125936 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 467/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 53724 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 53665 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 53664 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 53606 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 53605 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 53546 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 53545 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 53486 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 53485 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 53426 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53425 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 53366 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53365 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 53306 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 53305 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 53247 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 53246 taatacac 53239
>gb|AC092750.2| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cultivar Nipponbare from chromosome 10, complete sequence Length = 134933 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 467/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 128657 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 128598 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 128597 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 128539 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 128538 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 128479 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 128478 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 128419 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 128418 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 128359 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128358 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 128299 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128298 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 128239 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 128238 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 128180 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 128179 taatacac 128172
>dbj|AP008216.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 10, complete sequence Length = 22685906 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 467/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10347332 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10347273 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 10347272 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 10347214 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347213 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 10347154 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 10347153 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 10347094 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10347093 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 10347034 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10347033 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 10346974 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346973 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 10346914 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10346913 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 10346855 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 10346854 taatacac 10346847
>gb|AE016959.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 10, complete sequence Length = 22698374 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 467/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 10353371 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 10353312 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 10353311 cacgactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 10353253 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353252 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 10353193 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 10353192 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 10353133 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 10353132 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 10353073 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353072 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 10353013 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10353012 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 10352953 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 10352952 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 10352894 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 10352893 taatacac 10352886
>emb|X04789.1|CHOSRBCL Rice chloroplast DNA for ribulose-1,5-biphosphate carboxylase (clone pCT-1) Length = 1989 Score = 771 bits (389), Expect = 0.0 Identities = 467/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1807 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 1748 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 1747 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 1689 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1688 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 1629 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 1628 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 1569 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 1568 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 1509 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1508 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 1449 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1448 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 1389 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1388 ttacctactactgcacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 1330 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 1329 taatacac 1322
>emb|AJ784828.1| Hierochloe odorata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1358 Score = 769 bits (388), Expect = 0.0 Identities = 432/444 (97%), Gaps = 2/444 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 44 caagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcg 103 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1358 caagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttca 1299 Query: 104 cgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgatt 163 |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1298 cgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgatt 1240 Query: 164 agctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 223 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1239 agctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaa 1180 Query: 224 tacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 283 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1179 tacagaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacc 1120 Query: 284 tgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 343 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1119 tgaagctactggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcg 1060 Query: 344 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttc 403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1059 agcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttc 1000 Query: 404 gcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagaca 463 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 999 gcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagaca 941 Query: 464 tacgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 940 tacgcaatgctttagctaatacac 917
>emb|AJ746266.1| Fargesia dracocephala chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1392 Score = 769 bits (388), Expect = 0.0 Identities = 444/460 (96%), Gaps = 2/460 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 87 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1392 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1333 Query: 88 aatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 147 ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1332 aatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1274 Query: 148 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 207 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1273 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1214 Query: 208 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 267 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1213 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1154 Query: 268 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 327 ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1153 aaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctgag 1094 Query: 328 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1093 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1034 Query: 388 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggata 447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | Sbjct: 1033 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggaca 975 Query: 448 tgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 tgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 935
>gb|AY691632.1| Bromus arenarius ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 767 bits (387), Expect = 0.0 Identities = 416/423 (98%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgtccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtacc-ggaatggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 925 cac 923
>emb|AJ784820.1| Calamagrostis epigejos chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 767 bits (387), Expect = 0.0 Identities = 425/435 (97%), Gaps = 2/435 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1348 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1290 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1289 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1230 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1229 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 1170 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1169 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1110 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1109 tggtataacacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1050 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1049 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 990 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 472 |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 989 ttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 931 Query: 473 ctttagctaatacac 487 ||||||||||||||| Sbjct: 930 ctttagctaatacac 916
>gb|DQ005609.1| Cortaderia selloana ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1393 Score = 765 bits (386), Expect = 0.0 Identities = 467/489 (95%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1393 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1334 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1333 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacg 1275 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct: 1274 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccgg 1215 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1214 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1155 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| Sbjct: 1154 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtat 1095 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1094 aacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttc 1035 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1034 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 975 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 974 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 916 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 915 ctaatacac 907
>emb|AJ746274.1| Phragmites sp. TH-203 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 765 bits (386), Expect = 0.0 Identities = 467/489 (95%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggctcgaactcgaatttgattgctttccatacttcacaagctgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgcttggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcacctgg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgcgaacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttttg 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>emb|AJ746262.1| Koeleria cristata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1370 Score = 765 bits (386), Expect = 0.0 Identities = 427/438 (97%), Gaps = 2/438 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 50 gcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagca 109 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1370 gcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagca 1311 Query: 110 agnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgc 169 || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1310 ag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgc 1252 Query: 170 tgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 229 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1251 tgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacaga 1192 Query: 230 atcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 289 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1191 atcatccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagc 1132 Query: 290 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1131 taccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacg 1072 Query: 350 atctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 409 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1071 atctttttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttc 1012 Query: 410 cccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgca 469 |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1011 cccttctagcttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgca 953 Query: 470 atgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||| Sbjct: 952 atgctttagctaatacac 935
>emb|AJ746260.1| Cortaderia sp. TH-158 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1428 Score = 765 bits (386), Expect = 0.0 Identities = 467/489 (95%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1421 gtatctaccggcgcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcgcaagctgcggctagt 1362 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1361 tcaggactccatttggaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcacccgg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1242 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgactacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>gb|L14622.1|CEHRBCL Cenchrus setigerus chloroplast ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, complete cds Length = 1510 Score = 765 bits (386), Expect = 0.0 Identities = 442/458 (96%), Gaps = 2/458 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1390 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttgataa 1331 Query: 90 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1330 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgggcttgtacacaggcttct 1272 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 1212 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1211 ccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1152 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 acatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 1092 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 1032 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatg 449 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1031 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatg 973 Query: 450 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 935
>emb|AJ746172.1| Ampelodesmos mauritanica chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1362 Score = 763 bits (385), Expect = 0.0 Identities = 420/429 (97%), Gaps = 2/429 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1361 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1303 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1302 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1243 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1242 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1183 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1182 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtat 1123 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1122 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1063 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 1003 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 cttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 944 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 943 ctaatacac 935
>dbj|AP008218.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 12, complete sequence Length = 27566993 Score = 763 bits (385), Expect = 0.0 Identities = 466/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614562 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614503 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 5614502 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 5614444 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614443 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 5614384 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 5614383 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 5614324 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614323 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 5614264 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614263 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 5614204 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614203 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 5614144 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614143 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 5614085 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 5614084 taatacac 5614077 Score = 315 bits (159), Expect = 7e-83 Identities = 179/183 (97%), Gaps = 2/183 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13437103 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13437045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13437044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13436985 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13436984 tactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13436926 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 13436925 cac 13436923 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 52 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 107 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13424433 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13424378 Score = 60.0 bits (30), Expect = 7e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 250 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 279 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26145122 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26145093 Score = 54.0 bits (27), Expect = 4e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912996 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912962 Score = 46.1 bits (23), Expect = 0.11 Identities = 23/23 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 465 acgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13398096 acgcaatgctttagctaatacac 13398074 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.42 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 248 ggtcagagctggcatatgccaa 269 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26138934 ggtcagagctggcatatgccaa 26138913
>gb|AY622886.1| Anisopogon avenaceus ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 763 bits (385), Expect = 0.0 Identities = 423/433 (97%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1157 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccg 1097 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtacc-ggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacac 905
>gb|DP000011.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) chromosome 12, complete sequence Length = 27492551 Score = 763 bits (385), Expect = 0.0 Identities = 466/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 5614551 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 5614492 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 5614491 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 5614433 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614432 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 5614373 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 5614372 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 5614313 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 5614312 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 5614253 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614252 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 5614193 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614192 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 5614133 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 5614132 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 5614074 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 5614073 taatacac 5614066 Score = 315 bits (159), Expect = 7e-83 Identities = 179/183 (97%), Gaps = 2/183 (1%) Strand = Plus / Minus Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 13391377 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttt-caataaa 13391319 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391318 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 13391259 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13391258 tactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 13391200 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 13391199 cac 13391197 Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-16 Identities = 54/56 (96%) Strand = Plus / Minus Query: 52 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgag 107 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 13378707 ggctagttcaggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgag 13378652 Score = 60.0 bits (30), Expect = 7e-06 Identities = 30/30 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 250 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 279 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 26073298 tcagagctggcatatgccaaacatgaatac 26073269 Score = 54.0 bits (27), Expect = 4e-04 Identities = 33/35 (94%) Strand = Plus / Minus Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 6912875 aaaaagatatcgcgagcacgatctctttcaataaa 6912841 Score = 46.1 bits (23), Expect = 0.11 Identities = 23/23 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 465 acgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||||||||||||||||| Sbjct: 13352370 acgcaatgctttagctaatacac 13352348 Score = 44.1 bits (22), Expect = 0.42 Identities = 22/22 (100%) Strand = Plus / Minus Query: 248 ggtcagagctggcatatgccaa 269 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 26067110 ggtcagagctggcatatgccaa 26067089
>emb|BX000560.1|CNS08CE6 Oryza sativa chromosome 12, . BAC OSJNBa0021D06 of library OSJNBa from chromosome 12 of cultivar Nipponbare of ssp. japonica of Oryza sativa (rice), complete sequence Length = 139684 Score = 763 bits (385), Expect = 0.0 Identities = 466/488 (95%), Gaps = 4/488 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38323 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcactttccatatttcacaagctgcggctagtt 38382 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 38383 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 38441 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38442 ccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 38501 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 38502 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 38561 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38562 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 38621 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38622 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 38681 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38682 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 38741 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38742 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 38800 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 38801 taatacac 38808
>emb|AJ746254.1| Arthrostylidium sp. TH-53B chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1376 Score = 761 bits (384), Expect = 0.0 Identities = 443/460 (96%), Gaps = 2/460 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 28 cgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 87 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1376 cgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggat 1317 Query: 88 aatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagctt 147 ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1316 aatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtccttcgttacgagcttgtacacaagctt 1258 Query: 148 ctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttc 207 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1257 ctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttc 1198 Query: 208 ctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 267 ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1197 ctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgcc 1138 Query: 268 aaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgag 327 |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1137 aaacgtgaataccccctgaagccaccggtataacacccggcatggatacccagtcctgag 1078 Query: 328 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1077 tgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaa 1018 Query: 388 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggata 447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct: 1017 aacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggata 959 Query: 448 tgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 958 tgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 919
>dbj|AK062203.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) cDNA clone:001-046-G09, full insert sequence Length = 838 Score = 761 bits (384), Expect = 0.0 Identities = 461/482 (95%), Gaps = 4/482 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 480 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 421 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| Sbjct: 420 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaagg-tcgcgc 362 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 361 ccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 302 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 301 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 242 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 241 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 182 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 181 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 122 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 121 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 62 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 61 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 3 Query: 480 ta 481 || Sbjct: 2 ta 1
>emb|AJ784832.1| Phleum pratense chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 759 bits (383), Expect = 0.0 Identities = 415/423 (98%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1345 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1287 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1286 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1227 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1226 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1167 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1107 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1047 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1046 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 987 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 tactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 928 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 927 cac 925
>emb|AJ784823.1| Arrhenatherum elatius chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1360 Score = 759 bits (383), Expect = 0.0 Identities = 424/435 (97%), Gaps = 2/435 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1352 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1294 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1293 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1234 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1233 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1174 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1173 atccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1114 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1113 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1054 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1053 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 994 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 472 ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 993 ttctagcttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 935 Query: 473 ctttagctaatacac 487 ||||||||||||||| Sbjct: 934 ctttagctaatacac 920
>gb|U31440.1|PPU31440 Plinthanthesis paradoxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 757 bits (382), Expect = 0.0 Identities = 429/442 (97%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|U31438.1|MMU31438 Merxmuellera macowanii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 757 bits (382), Expect = 0.0 Identities = 429/442 (97%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcgaataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|L14623.1|PENCARBOXL Pennisetum glaucum ribulosebiphosphate carboxylase (rbcL) gene, complete cds Length = 1430 Score = 757 bits (382), Expect = 0.0 Identities = 441/458 (96%), Gaps = 2/458 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1390 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttgataa 1331 Query: 90 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1330 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgggcttgtacacaggcttct 1272 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 1212 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1211 ccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1152 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 acatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 1092 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 1032 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatg 449 |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1031 cctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatg 973 Query: 450 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 935
>gb|AY691631.1| Amphibromus fluitans ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 755 bits (381), Expect = 0.0 Identities = 417/427 (97%), Gaps = 2/427 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 120 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1289 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1229 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1228 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1169 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 1109 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 421 tacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 930 Query: 481 aatacac 487 ||||||| Sbjct: 929 aatacac 923
>emb|AJ746281.1| Alopecurus geniculatus chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1329 Score = 755 bits (381), Expect = 0.0 Identities = 422/433 (97%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1329 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1271 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1270 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1211 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1210 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1151 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1150 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1091 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1090 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1031 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1030 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 971 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 970 ctagcttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 912 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 911 ttagctaatacac 899
>emb|AJ746273.1| Pseudosasa amabilis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1387 Score = 755 bits (381), Expect = 0.0 Identities = 443/461 (96%), Gaps = 2/461 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 86 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1380 tcgccttccatatttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgctagctgctcgga 1321 Query: 87 taatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagct 146 |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1320 taatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagct 1262 Query: 147 tctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagtt 206 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1261 tctaaagccacccgattagctactgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagtt 1202 Query: 207 cctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 266 |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1201 cctccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 1142 Query: 267 caaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctga 326 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1141 caaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatagatacccagtcctga 1082 Query: 327 gtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaaca 386 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1081 gtgaaaaagacaccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaaca 1022 Query: 387 aaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggat 446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 1021 aaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggac 963 Query: 447 atgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 962 atgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 922
>dbj|AP008212.1| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, complete sequence Length = 30731886 Score = 755 bits (381), Expect = 0.0 Identities = 466/488 (95%), Gaps = 5/488 (1%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 23203574 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 23203633 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 23203634 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 23203692 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203693 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 23203751 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 23203752 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 23203811 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 23203812 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 23203871 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203872 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 23203931 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 23203932 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 23203991 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 23203992 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 23204050 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 23204051 taatacac 23204058 Score = 111 bits (56), Expect = 2e-21 Identities = 59/60 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 52 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 111 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711500 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711441 Score = 111 bits (56), Expect = 2e-21 Identities = 59/60 (98%) Strand = Plus / Minus Query: 52 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag 111 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 26711392 ggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag 26711333
>gb|AY622885.1| Ampelodesmos mauritanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1330 Score = 755 bits (381), Expect = 0.0 Identities = 416/425 (97%), Gaps = 2/425 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 63 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgccct 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| Sbjct: 1327 gactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgccct 1269 Query: 123 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1268 tcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgca 1209 Query: 183 ttcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaag 242 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct: 1208 tttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaag 1149 Query: 243 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataaca 302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1148 atttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtataaca 1089 Query: 303 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1088 cctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaata 1029 Query: 363 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1028 aaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaactta 969 Query: 423 cctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 482 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 968 cctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaa 910 Query: 483 tacac 487 ||||| Sbjct: 909 tacac 905
>dbj|AP004236.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0417D05 Length = 165752 Score = 755 bits (381), Expect = 0.0 Identities = 466/488 (95%), Gaps = 5/488 (1%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 154222 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 154281 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 154282 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 154340 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 154341 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 154399 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 154400 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 154459 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 154460 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 154519 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154520 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 154579 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 154580 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 154639 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 154640 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 154698 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 154699 taatacac 154706
>dbj|AP003623.3| Oryza sativa (japonica cultivar-group) genomic DNA, chromosome 6, PAC clone:P0642B07 Length = 139297 Score = 755 bits (381), Expect = 0.0 Identities = 466/488 (95%), Gaps = 5/488 (1%) Strand = Plus / Plus Query: 2 tatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagtt 59 |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 38336 tatctaccggctcgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagtt 38395 Query: 60 caggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgc 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct: 38396 caggactccatttgcaagctgatcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgc 38454 Query: 120 ccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggt 179 |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 38455 cctt-gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggt 38513 Query: 180 gcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccca 239 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct: 38514 gcattaccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgcaatacagaatcatctcca 38573 Query: 240 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtata 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct: 38574 aagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtata 38633 Query: 300 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38634 acacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttca 38693 Query: 360 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaac 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct: 38694 ataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatatcgcgttccccttctaac 38753 Query: 420 ttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 479 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 38754 ttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagc 38812 Query: 480 taatacac 487 |||||||| Sbjct: 38813 taatacac 38820
>gb|AY691642.1| Elymus solanderi ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 751 bits (379), Expect = 0.0 Identities = 414/423 (97%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaatata 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtacc-ggagtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 925 cac 923
>emb|AJ784824.1| Phaenosperma globosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1357 Score = 751 bits (379), Expect = 0.0 Identities = 423/435 (97%), Gaps = 2/435 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1354 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1296 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1295 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgc 1236 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1235 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1176 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1175 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccac 1116 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1115 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1056 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1055 tttttcaataaaatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 996 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 472 |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 995 ttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatg 937 Query: 473 ctttagctaatacac 487 ||||||||||||||| Sbjct: 936 ctttagctaatacac 922
>gb|AY395565.1| Trisetum flavescens ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1323 Score = 749 bits (378), Expect = 0.0 Identities = 419/430 (97%), Gaps = 2/430 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcac 117 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcac 1265 Query: 118 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 177 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1205 Query: 178 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 237 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1204 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1145 Query: 238 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 297 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 298 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 358 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 417 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 418 acttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 477 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 906 Query: 478 gctaatacac 487 |||||||||| Sbjct: 905 gctaatacac 896
>emb|AJ746276.1| Trisetum flavescens chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1323 Score = 749 bits (378), Expect = 0.0 Identities = 419/430 (97%), Gaps = 2/430 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 58 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcac 117 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1323 ttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcac 1265 Query: 118 gcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 177 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1264 gcccttcattacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccag 1205 Query: 178 gtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccc 237 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1204 gtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccc 1145 Query: 238 caaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 297 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1144 caaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggta 1085 Query: 298 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1084 taacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttttt 1025 Query: 358 caataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 417 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1024 caataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttcta 965 Query: 418 acttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 477 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 964 gcttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgcttta 906 Query: 478 gctaatacac 487 |||||||||| Sbjct: 905 gctaatacac 896
>emb|AJ746263.1| Melica uniflora chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1343 Score = 749 bits (378), Expect = 0.0 Identities = 465/489 (95%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 |||||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1336 gtatctactggctcgaactcgaatttgatcgctttccatacttcacaagctgcggcaagt 1277 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1276 tcagggctccatttgcaagctgctcgaataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1218 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct: 1217 cccttcgttacgagcttggacacaggcttctaaagccactcgattagctactgcacccgg 1158 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1157 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1098 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1097 aaagatttcggtaagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagccaccggtat 1038 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1037 aacaccaggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 978 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 977 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 918 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 917 cttacctactactgtacc-agcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 859 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 858 ctaatacac 850
>gb|AY691630.1| Agrostis magellanica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 747 bits (377), Expect = 0.0 Identities = 416/427 (97%), Gaps = 2/427 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 61 aggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcc 120 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| Sbjct: 1347 aggrctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcc 1289 Query: 121 cttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 180 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1288 cttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtg 1229 Query: 181 cattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaa 240 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1228 catttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaa 1169 Query: 241 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1168 agatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataa 1109 Query: 301 cacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 360 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cacctggcagggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaa 1049 Query: 361 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 taaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaact 989 Query: 421 tacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 480 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 tacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagct 930 Query: 481 aatacac 487 ||||||| Sbjct: 929 aatacac 923
>emb|AJ784837.1| Alopecurus pratensis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1345 Score = 747 bits (377), Expect = 0.0 Identities = 421/433 (97%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1345 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1287 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1286 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattcgctgctgcac 1227 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1226 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttccaccaccaaattgtaatacggaatcat 1167 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1166 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1107 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1106 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1047 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1046 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 987 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 986 ctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 928 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 927 ttagctaatacac 915
>emb|AJ784825.1| Koeleria pyramidata chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1349 Score = 747 bits (377), Expect = 0.0 Identities = 421/433 (97%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1349 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1291 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1290 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1231 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct: 1230 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcat 1171 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1170 ccccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 1111 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1110 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcactatctt 1051 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1050 tttcaataaaatcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 991 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 990 ctagcttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 932 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 931 ttagctaatacac 919
>emb|AJ784822.1| Festuca rubra subsp. juncea chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1350 Score = 747 bits (377), Expect = 0.0 Identities = 418/429 (97%), Gaps = 2/429 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1350 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1292 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1291 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1232 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct: 1231 tgcattcccccaaggatgccctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcccc 1172 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1171 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacccgaagctaccggtat 1112 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1111 aacaccaggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 1052 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1051 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 992 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 991 cttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 933 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 932 ctaatacac 924
>gb|AY622898.1| Piptatherum miliaceum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 747 bits (377), Expect = 0.0 Identities = 421/433 (97%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 ctggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacac 905
>gb|AY691643.1| Puccinellia stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 743 bits (375), Expect = 0.0 Identities = 413/423 (97%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttctgtcagagccggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcgcgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttctcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtacc-ggagtgaatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 925 cac 923
>gb|AY691641.1| Simplicia laxa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 743 bits (375), Expect = 0.0 Identities = 413/423 (97%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtacc-ggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 925 cac 923
>gb|AY691635.1| Deschampsia cespitosa ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 743 bits (375), Expect = 0.0 Identities = 413/423 (97%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtacc-ggcgtggatatgatctccaccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 925 cac 923
>gb|AY691634.1| Hierochloe brunonis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 743 bits (375), Expect = 0.0 Identities = 413/423 (97%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1164 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctactggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttccccttctaacttacc 985 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 925 cac 923
>gb|AY395535.1| Dactylis glomerata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1349 Score = 743 bits (375), Expect = 0.0 Identities = 422/435 (97%), Gaps = 2/435 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1347 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1289 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1288 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgc 1229 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1228 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1169 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1168 atcaccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 1109 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1108 cggtataacacctggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1049 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1048 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 989 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 472 |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 988 ttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 930 Query: 473 ctttagctaatacac 487 ||||||||||||||| Sbjct: 929 ctttagctaatacac 915
>gb|AF352580.1| Eriachne triodioides ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1254 Score = 743 bits (375), Expect = 0.0 Identities = 427/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1254 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1195 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1194 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1136 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1135 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1076 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1075 cngaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1016 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1015 aagcaaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 956 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 955 cacgatccttttcaataaaatcatcgcgcaatagatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 896 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 895 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacata 837 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 836 cgcaatgctttagctaatacac 815
>emb|X55828.1|CHNMRBCL Neurachne munroi chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 1990 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 464/489 (94%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||| ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1838 gtatccaccggctcgaactcaaatttgatcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 1779 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct: 1778 tcaggactccatttgcaagctgctttgataatttcattaccttcacgagcaag-atcacg 1720 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct: 1719 cccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacacgattagctactgcaccagg 1660 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1659 tgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtctcc 1600 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1599 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1540 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct: 1539 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttc 1480 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct: 1479 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcacgttccccttctaa 1420 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct: 1419 cttacctactactgtacc-ggagtggacatgatctccccccgacatgcgcaatgctttag 1361 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 1360 ctaatacac 1352
>emb|AJ746283.1| Aristida congesta subsp. barbicollis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 427/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-agaatggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|U29900.1| Phragmites australis ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 427/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|AE009947.2| Saccharum hybrid cultivar SP-80-3280 chloroplast, complete genome Length = 141182 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 439/458 (95%), Gaps = 2/458 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 120471 ccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 120412 Query: 90 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 120411 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 120353 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120352 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 120293 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120292 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 120233 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120232 acatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 120173 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120172 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 120113 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatg 449 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 120112 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatg 120054 Query: 450 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 120053 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 120016
>gb|U31359.1|ACU31359 Aristida congesta subsp. barbicollis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1344 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 427/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtccccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-agaatggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|U13226.1|ADU13226 Arundo donax ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast gene for chloroplast product Length = 1398 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 464/489 (94%), Gaps = 4/489 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 1 gtatctaccggctcgnactcga-tttg-tcgccttccatacttcacaagctgcggctagt 58 ||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1391 gtatctaccggcttgaactcgaatttgatcgctttccatatttcacaagctgcggctagt 1332 Query: 59 tcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacg 118 ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct: 1331 tcaggactccatttggaagcttgttggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcg 1273 Query: 119 cccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 178 ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1272 cccttcgttgcgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccagg 1213 Query: 179 tgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtcccc 238 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1212 tgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtctcc 1153 Query: 239 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtat 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct: 1152 aaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtat 1093 Query: 299 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttc 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1092 aacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagaacgatctttttc 1033 Query: 359 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1032 aataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaa 973 Query: 419 cttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 478 |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 cttacctactactgtacc-ggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgctttag 914 Query: 479 ctaatacac 487 ||||||||| Sbjct: 913 ctaatacac 905
>dbj|AP006714.1| Saccharum officinarum chloroplast DNA, complete genome Length = 141182 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 439/458 (95%), Gaps = 2/458 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 58844 ccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 58785 Query: 90 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 58784 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 58726 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58725 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 58666 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58665 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 58606 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58605 acatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 58546 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58545 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 58486 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatg 449 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 58485 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatg 58427 Query: 450 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58426 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 58389
>gb|U88406.1|SGU88406 Styppeiochloa gynoglossa ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 427/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|U31380.1|TMU31380 Thysanolaena maxima ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 427/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtaccggca-tggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|U31378.1|SZU31378 Stipagrostis zeyheri subsp. zeyheri ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 427/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttcgcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacggccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcaaagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-agagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|U31102.1|DSU31102 Danthonia spicata ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 427/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagttatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggacatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|U31100.1|CGU31100 Centropodia glauca ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 427/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>emb|X79900.1|SILCRBCL S.italica L. chloroplast rbcL gene Length = 1990 Score = 741 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 439/458 (95%), Gaps = 2/458 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1779 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttgataa 1720 Query: 90 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct: 1719 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgggcttgtacacaggcttct 1661 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1660 aaagccacacgattagctgccgtaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 1601 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1600 ccaccaaattgtaatacagaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1541 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1540 acatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatgcccagtcctgagtg 1481 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1480 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 1421 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatg 449 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1420 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatg 1362 Query: 450 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 1324
>emb|AJ784830.1| Cortaderia richardii chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1346 Score = 739 bits (373), Expect = 0.0 Identities = 420/433 (96%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1346 tagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1288 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1287 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcac 1228 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1227 ccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcgt 1168 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct: 1167 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccaccg 1108 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1107 gtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1048 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1047 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 988 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 987 ctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 929 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 928 ttagctaatacac 916
>emb|X55827.1|CHNTRBCL Neurachne tenuifolia chloroplast rbcL gene for the rubisco large subunit (EC 4.1.1.39) Length = 2010 Score = 739 bits (373), Expect = 0.0 Identities = 441/461 (95%), Gaps = 2/461 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 27 tcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcgga 86 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1830 tcgccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctttga 1771 Query: 87 taatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagct 146 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct: 1770 taatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaggct 1712 Query: 147 tctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagtt 206 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct: 1711 tctaaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagtt 1652 Query: 207 cctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 266 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1651 cctccaccaaattgtaatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgc 1592 Query: 267 caaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctga 326 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1591 caaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctga 1532 Query: 327 gtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaaca 386 |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1531 gtgaaaaagacaccgcgagatcgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaaca 1472 Query: 387 aaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggat 446 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct: 1471 aaacctaaagttatttcacgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggac 1413 Query: 447 atgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1412 atgatctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 1372
>gb|AY622896.1| Nassella viridula ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 739 bits (373), Expect = 0.0 Identities = 420/433 (96%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttggcagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 1217 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct: 1156 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccaccagaagccaccg 1097 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgagaacgatctt 1037 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacac 905
>gb|AY691646.1| Trisetum youngii ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 735 bits (371), Expect = 0.0 Identities = 412/423 (97%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 925 cac 923
>gb|AY691645.1| Koeleria aff. novozelandica AK28214 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1347 Score = 735 bits (371), Expect = 0.0 Identities = 412/423 (97%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct: 1343 ctccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcacgcccttc 1285 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1225 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct: 1224 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatccccaaagat 1165 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1164 ttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1105 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1104 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1045 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1044 atcatcgcgtaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctagcttacc 985 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 984 tactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 926 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 925 cac 923
>gb|AY640153.1| Merxmuellera rangei ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 733 bits (370), Expect = 0.0 Identities = 426/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccctcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggttagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataagtcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>emb|Z11973.1|CHZMRBCLG Z.mays chloroplast rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase Length = 1431 Score = 733 bits (370), Expect = 0.0 Identities = 438/458 (95%), Gaps = 2/458 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1390 ccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 1331 Query: 90 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1330 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 1272 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1271 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 1212 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1211 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1152 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1151 acatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 1092 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1091 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 1032 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatg 449 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1031 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatg 973 Query: 450 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 972 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 935
>emb|X86563.2|ZMA86563 Zea mays complete chloroplast genome Length = 140384 Score = 733 bits (370), Expect = 0.0 Identities = 438/458 (95%), Gaps = 2/458 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 58263 ccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 58204 Query: 90 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 58203 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 58145 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58144 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 58085 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58084 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 58025 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58024 acatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 57965 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57964 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 57905 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatg 449 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 57904 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatg 57846 Query: 450 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57845 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 57808
>emb|AJ746289.1| Elytrophorus globularis chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1344 Score = 733 bits (370), Expect = 0.0 Identities = 426/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|U88405.1|EGU88405 Elytrophorus globularis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 733 bits (370), Expect = 0.0 Identities = 426/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgttcgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cagaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|AY928077.1| Zea mays cultivar B73 chloroplast, complete genome Length = 140454 Score = 733 bits (370), Expect = 0.0 Identities = 438/458 (95%), Gaps = 2/458 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 58273 ccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 58214 Query: 90 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 58213 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 58155 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58154 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 58095 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58094 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 58035 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 58034 acatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 57975 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57974 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 57915 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatg 449 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 57914 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatg 57856 Query: 450 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 57855 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 57818
>gb|AY395541.1| Hordeum secalinum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1299 Score = 731 bits (369), Expect = 0.0 Identities = 398/405 (98%), Gaps = 2/405 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 142 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1241 Query: 143 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1240 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1181 Query: 203 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 262 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 263 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 323 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 383 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagt 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagt 942 Query: 443 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 897
>emb|AJ746292.1| Hordeum secalinum chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1299 Score = 731 bits (369), Expect = 0.0 Identities = 398/405 (98%), Gaps = 2/405 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 142 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1299 cggataatttcattaccttcccgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1241 Query: 143 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1240 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1181 Query: 203 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 262 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1180 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 1121 Query: 263 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1120 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1061 Query: 323 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1060 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 1001 Query: 383 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagt 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1000 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagt 942 Query: 443 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 941 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 897
>gb|AY622892.1| Eremitis sp. MRD-2004 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 731 bits (369), Expect = 0.0 Identities = 419/433 (96%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcac 1217 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtacc-ggcgtggacatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 475 ttagctaatacac 487 ||||||||||||| Sbjct: 917 ttagctaatacac 905
>gb|AY622891.1| Ehrharta calycina ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1342 Score = 731 bits (369), Expect = 0.0 Identities = 419/433 (96%), Gaps = 2/433 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 55 tagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnat 114 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1335 tagttcaggactccatttgcacgctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-at 1277 Query: 115 cacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcac 174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1276 cgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctactgcac 1217 Query: 175 caggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgt 234 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1216 caggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcat 1157 Query: 235 ccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccg 294 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct: 1156 ctccgaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccg 1097 Query: 295 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1096 gtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctt 1037 Query: 355 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1036 tttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccctt 977 Query: 415 ctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 474 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 976 ctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgct 918 Query: 475 ttagctaatacac 487 || |||||||||| Sbjct: 917 tttgctaatacac 905
>emb|AJ746179.1| Arundinaria tecta chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1364 Score = 729 bits (368), Expect = 0.0 Identities = 418/432 (96%), Gaps = 2/432 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 56 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatc 115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct: 1364 agttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atc 1306 Query: 116 acgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcacc 175 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct: 1305 gcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctactgcacc 1246 Query: 176 aggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtc 235 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct: 1245 aggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatc 1186 Query: 236 cccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccgg 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1185 tccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccgg 1126 Query: 296 tataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 355 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1125 tataacacctggcatagatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatcttt 1066 Query: 356 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1065 ttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttc 1006 Query: 416 taacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 475 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1005 taacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctt 947 Query: 476 tagctaatacac 487 |||||||||||| Sbjct: 946 tagctaatacac 935
>emb|AJ784836.1| Muhlenbergia racemosa chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1361 Score = 728 bits (367), Expect = 0.0 Identities = 429/447 (95%), Gaps = 2/447 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 41 tcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 100 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1361 tcacaagcagcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattacct 1302 Query: 101 tcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcg 160 || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct: 1301 tcacgagcaag-atctcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccg 1243 Query: 161 attagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 220 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1242 gttagctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattg 1183 Query: 221 taatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 280 |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1182 taatacggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacc 1123 Query: 281 acctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagatacc 340 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1122 ccctgaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgcgtgaaaaagatacc 1063 Query: 341 gcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 400 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1062 gcgagaacgatctttttcaatataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcat 1003 Query: 401 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccag 460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct: 1002 ttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-agagtggatatgatctcccccag 944 Query: 461 acatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 943 acatacgcaatgctttagctaatacac 917
>gb|AY622895.1| Nardus stricta ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 728 bits (367), Expect = 0.0 Identities = 420/435 (96%), Gaps = 2/435 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1279 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatc 1159 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct: 1158 atccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccggaagccac 1099 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1098 cggtataacaccaggcatggatacccaatcttgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 1039 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 472 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactaccgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 920 Query: 473 ctttagctaatacac 487 |||| |||||||||| Sbjct: 919 ctttcgctaatacac 905
>gb|AY506529.1| Zea mays strain NB mitochondrion, complete genome Length = 569630 Score = 726 bits (366), Expect = 0.0 Identities = 437/458 (95%), Gaps = 2/458 (0%) Strand = Plus / Plus Query: 30 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 349066 ccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 349125 Query: 90 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 349126 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 349184 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349185 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 349244 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349245 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 349304 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349305 acatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 349364 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349365 aaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 349424 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatg 449 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 349425 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatg 349483 Query: 450 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 349484 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 349521
>gb|DQ490952.1| Zea mays subsp. mays genotype male-fertile NA mitochondrion, complete genome Length = 701046 Score = 726 bits (366), Expect = 0.0 Identities = 437/458 (95%), Gaps = 2/458 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 206643 ccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 206584 Query: 90 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 206583 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 206525 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206524 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 206465 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206464 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 206405 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206404 acatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 206345 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206344 aaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 206285 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatg 449 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 206284 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatg 206226 Query: 450 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 206225 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 206188 Score = 726 bits (366), Expect = 0.0 Identities = 437/458 (95%), Gaps = 2/458 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 77951 ccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 77892 Query: 90 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 77891 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 77833 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77832 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 77773 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77772 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 77713 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77712 acatgaatacccccagaagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 77653 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77652 aaaaagataccgcgataacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 77593 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatg 449 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 77592 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatg 77534 Query: 450 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 77533 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 77496
>emb|AJ746253.1| Arthraxon sp. TH-111 chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1391 Score = 726 bits (366), Expect = 0.0 Identities = 437/458 (95%), Gaps = 2/458 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 30 ccttccatacttcacaagctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataa 89 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 1377 ccttccatatttcacaagctgcggctagttcagcactccatttgcaagctgctttgataa 1318 Query: 90 tttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttct 149 ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 1317 tttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttct 1259 Query: 150 aaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcct 209 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1258 aaagccacacgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcct 1199 Query: 210 ccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 269 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1198 ccaccaaattgtaatacggaatcatctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaa 1139 Query: 270 acatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtg 329 ||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1138 acatgaataccccctgaagccactggtacaacacctggcatggatacccagtcctgagtg 1079 Query: 330 aaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 389 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1078 aaaaagataccgcgagaacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaa 1019 Query: 390 cctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatg 449 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct: 1018 cctaaagttatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatg 960 Query: 450 atctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 959 atctccccccgacatacgcaatgctttagctaatacac 922
>gb|U31439.1|MJU31439 Moliniopsis japonica ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 726 bits (366), Expect = 0.0 Identities = 425/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgctagcttgttggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcattcccccaagggtgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacggtctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|U31437.1|KPU31437 Karroochloa purpurea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 726 bits (366), Expect = 0.0 Identities = 425/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct: 1225 ctactgcacccggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccgaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcagtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccgg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccaatcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtaatttccc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 ggcaatgctttagctaatacac 905
>gb|U31105.1|GSU31105 Gynerium sagittatum ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 726 bits (366), Expect = 0.0 Identities = 425/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagcttgtttgataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggatatgatctccccccgacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|U31103.1|ESU31103 Enneapogon scaber ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 726 bits (366), Expect = 0.0 Identities = 425/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct: 1344 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaatacccccag 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aacgatctttttcaagataatcatcacgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|U31104.1|ECU31104 Eragrostis capensis ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, chloroplast gene encoding chloroplast protein, partial cds Length = 1344 Score = 726 bits (366), Expect = 0.0 Identities = 425/442 (96%), Gaps = 2/442 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 46 agctgcggctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 105 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1344 agctgcagctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcg 1285 Query: 106 agcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattag 165 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct: 1284 agcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaggcttctaaagccacccgattag 1226 Query: 166 ctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 225 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1225 ctgctgcacctggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaata 1166 Query: 226 cagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctg 285 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct: 1165 cggaatcgtctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctg 1106 Query: 286 aagctaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgag 345 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 1105 aagccaccggtataacacctggcatggatacccagtcctgggtgaaaaagataccgcgag 1046 Query: 346 cacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 405 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1045 aacgatctttttcttgataatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgc 986 Query: 406 gttccccttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacata 465 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 985 gttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagtggatatgatctcccccagacata 927 Query: 466 cgcaatgctttagctaatacac 487 |||||||||||||||||||||| Sbjct: 926 cgcaatgctttagctaatacac 905
>gb|AY395547.1| Lolium perenne ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) gene, partial cds; chloroplast Length = 1296 Score = 724 bits (365), Expect = 0.0 Identities = 397/405 (98%), Gaps = 2/405 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 142 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1238 Query: 143 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1178 Query: 203 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 262 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 263 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 323 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 383 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagt 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagt 939 Query: 443 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 894
>emb|AJ746293.1| Lolium perenne subsp. perenne chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1296 Score = 724 bits (365), Expect = 0.0 Identities = 397/405 (98%), Gaps = 2/405 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 83 cggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttcgttacgagcttgtacaca 142 |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1296 cggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttcgttacgagcttgtacaca 1238 Query: 143 agcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcattcccccaaggatgtcctaa 202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct: 1237 ggcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatttccccaaggatgtcctaa 1178 Query: 203 agttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagatttcggtcagagctggcat 262 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1177 agttcctccaccaaattgtaatacggaatcatccccaaagatttcggtcagagctggcat 1118 Query: 263 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1117 atgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacctggcatggatacccagtc 1058 Query: 323 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1057 ctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaaatcatcgcgcaataaatc 998 Query: 383 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtaccgggagt 442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct: 997 aacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacctactactgtacc-ggagt 939 Query: 443 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 487 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 938 ggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaatacac 894
>emb|AJ784831.1| Dactylis marina chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1353 Score = 720 bits (363), Expect = 0.0 Identities = 410/423 (96%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| Sbjct: 1353 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgcccttc 1295 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1294 gttacgagcttgtacacaggcttctaaagcaactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 1235 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| Sbjct: 1234 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacggaatcatcaccaaagat 1175 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1174 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 1115 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1114 tggcaaggaaacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1055 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1054 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 995 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 994 tactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 936 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 935 cac 933
>emb|AJ746171.1| Bambusa valida chloroplast partial rbcL gene for ribulose bisphosphate carboxylase large chain Length = 1339 Score = 720 bits (363), Expect = 0.0 Identities = 410/423 (96%), Gaps = 2/423 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 65 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagnatcacgcccttc 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| Sbjct: 1338 ctccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag-atcgcgtccttc 1280 Query: 125 gttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgcaccaggtgcatt 184 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1279 attacgagcttgtacacaagcttctaaagccacccgattagctgctgcaccaggtgcatt 1220 Query: 185 cccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcgtccccaaagat 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct: 1219 tccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatcatctccaaagat 1160 Query: 245 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctaccggtataacacc 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct: 1159 ttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccaccggtataacacc 1100 Query: 305 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1099 tggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatctttttcaataaa 1040 Query: 365 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1039 atcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttccccttctaacttacc 980 Query: 425 tactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 484 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 979 tactactgtacc-ggcgtggatatgatctcccccagacatacgcaatgctttagctaata 921 Query: 485 cac 487 ||| Sbjct: 920 cac 918
>gb|AY622897.1| Olyra latifolia ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit gene, partial cds; chloroplast Length = 1344 Score = 720 bits (363), Expect = 0.0 Identities = 419/435 (96%), Gaps = 2/435 (0%) Strand = Plus / Minus Query: 53 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcgcgagcaagn 112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct: 1337 gctagttcaggactccatttgcaagctgctcggataatttcattaccttcacgagcaag- 1279 Query: 113 atcacgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 172 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1278 atcgcgcccttcgttacgagcttgtacacaagcttctaaagccactcgattagctgctgc 1219 Query: 173 accaggtgcattcccccaaggatgtcctaaagttcctccaccaaattgtaatacagaatc 232 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct: 1218 accaggtgcatttccccaaggatgtcctaaagttcctcccccaaactgtaatacggaatc 1159 Query: 233 gtccccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccacctgaagctac 292 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct: 1158 atctccaaagatttcggtcagagctggcatatgccaaacatgaataccccctgaagccac 1099 Query: 293 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagataccgcgagcacgatc 352 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct: 1098 cggtataacacctggcatggatacccagtcctgagtgaaaaagacaccgcgagcacgatc 1039 Query: 353 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct: 1038 tttttcaataaaatcatcgcgcaataaatcaacaaaacctaaagtcatttcgcgttcccc 979 Query: 413 ttctaacttacctactactgtaccgggagtggatatgatctcccccagacatacgcaatg 472 |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct: 978 ttctaacttacctactactgtacc-ggcgtggacatgatcccccccagacatacgcaatg 920 Query: 473 ctttagctaatacac 487 ||||||||||||||| Sbjct: 919 ctttagctaatacac 905 Database: nt Posted date: May 29, 2006 11:10 AM Number of letters in database: 3,984,495,279 Number of sequences in database: 917,343 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.01 Posted date: May 29, 2006 11:16 AM Number of letters in database: 3,988,174,986 Number of sequences in database: 835,257 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.02 Posted date: May 29, 2006 11:21 AM Number of letters in database: 3,991,246,324 Number of sequences in database: 771,481 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.03 Posted date: May 29, 2006 11:27 AM Number of letters in database: 3,990,718,311 Number of sequences in database: 977,174 Database: /shigen/export/home/twatanab/db/nt/nt.04 Posted date: May 29, 2006 11:29 AM Number of letters in database: 1,278,410,368 Number of sequences in database: 400,813 Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Gapped Lambda K H 1.37 0.711 1.31 Matrix: blastn matrix:1 -3 Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2 Number of Hits to DB: 3,526,375 Number of Sequences: 3902068 Number of extensions: 3526375 Number of successful extensions: 117167 Number of sequences better than 10.0: 14795 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 14711 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 93 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 70081 Number of HSP's gapped (non-prelim): 20031 length of query: 487 length of database: 17,233,045,268 effective HSP length: 22 effective length of query: 465 effective length of database: 17,147,199,772 effective search space: 7973447893980 effective search space used: 7973447893980 T: 0 A: 0 X1: 6 (11.9 bits) X2: 15 (29.7 bits) S1: 12 (24.3 bits) S2: 20 (40.1 bits)